猪圆环病毒2型湖南分离株HNLYYA1全基因组的多引物滚环扩增和序列分析

首先采用常规PCR法对7份湖南省某地区猪病料进行猪圆环病毒2型(PCV2)的检测,然后对1份PCV2阳性病料的总DNA进行多引物滚环扩增(MPRCA)反应,最后利用限制性内切酶(Eco RⅠ和NcoⅠ)酶切MPRCA产物。结果显示,酶切后的MPRCA产物条带与PCV2基因组或片段的大小一致。将回收的目的条带与Psp72载体连接,转化DH5α菌,最后对提取的重组质粒进行测序和序列比对。获得的PCV2分离株HNLYYA1提交于Gen Bank(登录号KJ867555),其全基因组大小为1 767 bp,基因型为PCV2b-1C。该株PCV2 Cap蛋白与其他毒株进行比对,发现其具有独特的氨基酸突变,NLS区34位组氨酸(H)突变为酪氨酸(Y)、LOOP GH区169位精氨酸(R)突变为甘氨酸(G)、LOOP HI区206位赖氨酸(K)突变为异亮氨酸(I)。本研究揭示了湖南PCV2分离株HNLYYA1的全基因组特征,并为环状病毒的全基因组分离研究提供新的技术途径。