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题名红麻Ms5基因的克隆及多转录本分析
被引量:3
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作者
唐向民
金刚
李刚
周琼
陈鹏
周瑞阳
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机构
广西大学农学院
广西亚热带作物研究所
广西药用植物园
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出处
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第5期536-540,共5页
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基金
现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-19-E16)
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文摘
为研究Ms5基因在红麻(Hibiscus canabius L.)花药中的转录特征,以L23A不育系为试材,基于已知的红麻Ms5基因5′端cDNA序列,采用3′RACE和RT-PCR技术对该基因全长cDNA序列进行克隆。序列比对分析结果表明,红麻花药组织中同时存在Ms5基因2种不同的转录本,其长度分别为972和1 105bp,依次命名为HcMs5-α和HcMs5-β。这2种转录本均包含了完整且一致的编码序列,其编码序列(CDS)全长为858bp,预测编码的蛋白质含有285个氨基酸残基,分子质量为32.4ku,理论等电点为7.62;两者5′端前972bp序列完全一致,但3′端的非编码区(UTR)长度有所不同,HcMs5-β在第972bp以后比HcMs5-α多出133bp的序列,具有选择性转录终止的特征。这种转录终止信号的可选择性可能与该基因转录后水平的调控有关。
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关键词
红麻
ms5基因
3′RACE
多转录本
选择性转录终止
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Keywords
kenaf(Hibiscus canabius L. )
ms5 gene
3'RACE
multiple transcript
alternative ter-mination
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分类号
S563.5
[农业科学—作物学]
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题名陆地棉MS5同源基因的电子克隆及序列分析
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作者
金刚
唐向民
刘冬梅
陈鹏
韦丽君
周瑞阳
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机构
广西大学农学院
广西壮族自治区亚热带作物研究所
广西农业科学院
商丘师范学院
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出处
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2014年第2期243-247,共5页
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基金
国家自然科学基金项目(31360348)
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文摘
高等植物MS5基因的异常表达可导致雄性不育的发生。本研究利用EST数据库,在陆地棉隐性雄性不育系洞A中通过电子克隆获得1个棉花MS5同源基因,命名为GhMS5。采用RT-PCR方法验证GhMS5基因的cDNA序列,并利用在线分析平台和生物软件对该基因进行生物信息学分析。结果显示,RT-PCR验证编码区序列与电子克隆序列一致;获得的GhMS5基因cDNA长1 631 bp,包含一个长1 437 bp的完整开放阅读框,编码478个氨基酸;其分子量为53 240,等电点为9.25;GhMS5蛋白质具有典型的TPR保守结构域;此蛋白质不存在信号肽及跨膜结构,可能定位于叶绿体,二级结构主要以α-螺旋和无规则卷曲为主。表明电子克隆能用于棉花基因的分离。
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关键词
陆地棉
ms5同源基因
电子克隆
序列分析
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Keywords
Gossypium hirsutum
ms5 gene
insilico cloning
sequence analysis
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分类号
S562
[农业科学—作物学]
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