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大豆转录因子GmMYB52的克隆、表达及结合功能分析
被引量:
2
1
作者
许玲
王元琮
+4 位作者
何晓兰
黄益洪
徐照龙
邵宏波
张大勇
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第10期1458-1467,共10页
MYB类转录因子在植物的生长发育和逆境响应中有重要的调控作用。依据课题组前期获得的盐胁迫相关的数字表达谱(DGEP)数据,获得盐胁迫响应显著上调基因GmMYB52,利用RT-PCR方法从栽培大豆(Williams 82)中克隆该基因片段,并与已公布的Willi...
MYB类转录因子在植物的生长发育和逆境响应中有重要的调控作用。依据课题组前期获得的盐胁迫相关的数字表达谱(DGEP)数据,获得盐胁迫响应显著上调基因GmMYB52,利用RT-PCR方法从栽培大豆(Williams 82)中克隆该基因片段,并与已公布的Williams 82基因组数据库序列比对,该基因与GmMYB52序列一致。生物信息学分析表明,GmMYB52编码区(CDS)全长1083 bp,编码360个氨基酸。其编码的氨基酸序列具有MYB类转录因子的共同特征,其距N端110~160氨基酸残基处有MYB结构域;系统进化树分析表明,该基因编码的蛋白与GmMYB62、拟南芥AtMYBSt1、苜蓿Mt MYB52、水稻Os MYBS3及木豆Cc MYB-like protein J的亲缘关系最近;实时荧光定量PCR结果表明,大豆根部GmMYB52的转录水平受外界非生物逆境的调控,用脱落酸(ABA)和低温(4℃)处理后12 h明显上调,用氯化钠和PEG处理0.5~24.0 h后检测到GmMYB52的转录水平在50%~600%区间内呈现出先上调后下调再上调的趋势。GmMYB52为组成型表达,在大豆的幼苗期和开花期表达较多,在成熟期表达相对较低。GmMYB52在茎叶与开花期的花中表达较强,在根的表达较弱,而在成熟期的豆荚中几乎不表达。亚细胞定位的结果表明,GmMYB52定位于细胞核,符合典型转录因子的定位特征。酵母杂交系统检测表明,GmMYB52具有转录激活特征,并且能够与MYB相关顺式作用元件基序相结合。本研究结果表明,GmMYB52编码典型的MYB转录因子,具有转录激活活性及DNA结合活性,在大豆中的表达可能与大豆的非生物胁迫和ABA信号转导途径有关,推测其可能参与了大豆对非生物胁迫的响应。
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关键词
大豆
Gm
myb
52
表达分析
转录激活功能
结合功能
下载PDF
职称材料
丹参3个R2R3-MYB转录因子的亚细胞定位和自激活活性分析
被引量:
4
2
作者
丁恺
麻鹏达
+3 位作者
贾彦彦
裴天林
白朕卿
梁宗锁
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第4期586-594,共9页
R2R3-MYB转录因子能够有效调控丹参酚酸类物质的积累。将丹参的SmMYB33、SmMYB54和SmMYB93与拟南芥的R2R3-MYB进行比对,找到拟南芥中与丹参3个转录因子亲缘关系最近的功能已知的转录因子,根据这些功能已知的转录因子,对丹参3个转录因子...
R2R3-MYB转录因子能够有效调控丹参酚酸类物质的积累。将丹参的SmMYB33、SmMYB54和SmMYB93与拟南芥的R2R3-MYB进行比对,找到拟南芥中与丹参3个转录因子亲缘关系最近的功能已知的转录因子,根据这些功能已知的转录因子,对丹参3个转录因子的功能进行预测。构建含有绿色荧光报告基因的载体pA7-GFP-SmMYB33、pA7-GFP-SmMYB54和pA7-GFP-SmMYB93,使用基因枪方法将载体分别转化洋葱表皮细胞进行亚细胞定位分析,结果表明3个转录因子主要定位在细胞核,绿色荧光也有少部分出现在细胞质中。构建酵母表达载体pDEST-GBKT7-SmMYB33、pDEST-GBKT7-SmMYB54和pDESTGBKT7-SmMYB93用于酵母自激活活性分析,结果表明SmMYB33有自激活活性,SmMYB54和SmMYB93没有自激活活性。
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关键词
丹参
R2R3-
myb
转录因子
二级结构分析
亚细胞定位
自激活活性分析
下载PDF
职称材料
题名
大豆转录因子GmMYB52的克隆、表达及结合功能分析
被引量:
2
1
作者
许玲
王元琮
何晓兰
黄益洪
徐照龙
邵宏波
张大勇
机构
江苏省农业科学院农业资源与环境研究所/盐土农业研究中心
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第10期1458-1467,共10页
基金
国家自然科学基金项目(31600211
31101166)
+1 种基金
江苏省自然科学基金项目(BK20151364)
江苏省农业科技自主创新项目(CX(15)1005)资助~~
文摘
MYB类转录因子在植物的生长发育和逆境响应中有重要的调控作用。依据课题组前期获得的盐胁迫相关的数字表达谱(DGEP)数据,获得盐胁迫响应显著上调基因GmMYB52,利用RT-PCR方法从栽培大豆(Williams 82)中克隆该基因片段,并与已公布的Williams 82基因组数据库序列比对,该基因与GmMYB52序列一致。生物信息学分析表明,GmMYB52编码区(CDS)全长1083 bp,编码360个氨基酸。其编码的氨基酸序列具有MYB类转录因子的共同特征,其距N端110~160氨基酸残基处有MYB结构域;系统进化树分析表明,该基因编码的蛋白与GmMYB62、拟南芥AtMYBSt1、苜蓿Mt MYB52、水稻Os MYBS3及木豆Cc MYB-like protein J的亲缘关系最近;实时荧光定量PCR结果表明,大豆根部GmMYB52的转录水平受外界非生物逆境的调控,用脱落酸(ABA)和低温(4℃)处理后12 h明显上调,用氯化钠和PEG处理0.5~24.0 h后检测到GmMYB52的转录水平在50%~600%区间内呈现出先上调后下调再上调的趋势。GmMYB52为组成型表达,在大豆的幼苗期和开花期表达较多,在成熟期表达相对较低。GmMYB52在茎叶与开花期的花中表达较强,在根的表达较弱,而在成熟期的豆荚中几乎不表达。亚细胞定位的结果表明,GmMYB52定位于细胞核,符合典型转录因子的定位特征。酵母杂交系统检测表明,GmMYB52具有转录激活特征,并且能够与MYB相关顺式作用元件基序相结合。本研究结果表明,GmMYB52编码典型的MYB转录因子,具有转录激活活性及DNA结合活性,在大豆中的表达可能与大豆的非生物胁迫和ABA信号转导途径有关,推测其可能参与了大豆对非生物胁迫的响应。
关键词
大豆
Gm
myb
52
表达分析
转录激活功能
结合功能
Keywords
Soybean
Gm
myb
52
Expression analysis
myb motif
Transcriptional activation activity
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
S565.1 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
丹参3个R2R3-MYB转录因子的亚细胞定位和自激活活性分析
被引量:
4
2
作者
丁恺
麻鹏达
贾彦彦
裴天林
白朕卿
梁宗锁
机构
西北农林科技大学生命科学学院
浙江理工大学生命科学学院
出处
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第4期586-594,共9页
基金
国家自然科学基金(81373908
31670295)
中央高校基本科研业务费专项资金(2452017159)~~
文摘
R2R3-MYB转录因子能够有效调控丹参酚酸类物质的积累。将丹参的SmMYB33、SmMYB54和SmMYB93与拟南芥的R2R3-MYB进行比对,找到拟南芥中与丹参3个转录因子亲缘关系最近的功能已知的转录因子,根据这些功能已知的转录因子,对丹参3个转录因子的功能进行预测。构建含有绿色荧光报告基因的载体pA7-GFP-SmMYB33、pA7-GFP-SmMYB54和pA7-GFP-SmMYB93,使用基因枪方法将载体分别转化洋葱表皮细胞进行亚细胞定位分析,结果表明3个转录因子主要定位在细胞核,绿色荧光也有少部分出现在细胞质中。构建酵母表达载体pDEST-GBKT7-SmMYB33、pDEST-GBKT7-SmMYB54和pDESTGBKT7-SmMYB93用于酵母自激活活性分析,结果表明SmMYB33有自激活活性,SmMYB54和SmMYB93没有自激活活性。
关键词
丹参
R2R3-
myb
转录因子
二级结构分析
亚细胞定位
自激活活性分析
Keywords
Salvia miltiorrhiza Bunge
R2R3-
myb
transcription factor
motif
analysis
Subcellularlocalization
Transactivation analysis
分类号
S330.3 [农业科学—作物遗传育种]
Q781 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大豆转录因子GmMYB52的克隆、表达及结合功能分析
许玲
王元琮
何晓兰
黄益洪
徐照龙
邵宏波
张大勇
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
2
下载PDF
职称材料
2
丹参3个R2R3-MYB转录因子的亚细胞定位和自激活活性分析
丁恺
麻鹏达
贾彦彦
裴天林
白朕卿
梁宗锁
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
4
下载PDF
职称材料
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