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Construction of cDNA Library from Populus euphratica 被引量:1
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作者 YuGuangjun WangYiqin ShenXin 《Forestry Studies in China》 CAS 2003年第2期7-9,共3页
In order to isolate and clone salt-tolerance involved genes of Populus euphratica, we constructed a cDNA library from salt-treated leaves of P. euphratica. In the experiment, double strand cDNA were synthesized by a b... In order to isolate and clone salt-tolerance involved genes of Populus euphratica, we constructed a cDNA library from salt-treated leaves of P. euphratica. In the experiment, double strand cDNA were synthesized by a beads-based method. The syntheses of the first strand and the second strand cDNA, adapter ligation and restriction reaction for releasing cDNA were all conducted on the beads. The double strand cDNA were released from magnetic beads by digestion with NotI, and cDNA fragments smaller than 500 bp and residual adapters were removed through cDNA size fractionation columns. Finally, double strand cDNA were directionally cloned intoλExcell vector. The results show that the primary titer of the cDNA library is 7.46×106 pfu per mL and the packaging efficiency reaches 1.47×107 recombinants per 靏 DNA. λDNA extracted from two clones of plaque were digested by EcoR I and NotI, both of the clones contained inserts larger than 900 bp. These results show that the cDNA library of salt-treated P. euphratica leaves has been successfully constructed. 展开更多
关键词 Populus euphratica salt tolerance magnetic beads cDNA library
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文冠果富集SSR文库的构建及特性分析 被引量:8
2
作者 程月琴 王红卫 +3 位作者 万惠霞 段景勉 张佩 韩卫丽 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期440-445,共6页
应用Dynal磁珠-生物素标记的微卫星探针(AC)8,(AG)8和(ATG)12与文冠果基因组DNA酶切片段杂交,捕获含有微卫星序列的DNA片段,连接到pMD18-T载体上,转入感受态细胞Trans5α,构建文冠果富集微卫星文库.利用M13F和M13R载体序列引物筛选文库... 应用Dynal磁珠-生物素标记的微卫星探针(AC)8,(AG)8和(ATG)12与文冠果基因组DNA酶切片段杂交,捕获含有微卫星序列的DNA片段,连接到pMD18-T载体上,转入感受态细胞Trans5α,构建文冠果富集微卫星文库.利用M13F和M13R载体序列引物筛选文库,对插入片段长度为400~1500bp的克隆进行测序.共获得123条序列,55条(44.7%)含有微卫星位点,其中完美型占63.7%,非完美型22.4%,混合型10.3%.微卫星重复基元中,二核苷酸(AC)n最为常见. 展开更多
关键词 文冠果 微卫星 磁珠 富集文库
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黑斑原(鱼兆)微卫星DNA富集文库构建与鉴定 被引量:7
3
作者 郭宝英 谢从新 +2 位作者 祁鹏志 吴常文 邓一兵 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期908-912,共5页
采用磁珠富集法,利用生物素标记的(CA)12寡核苷酸探针从黑斑原(鱼兆)基因组DNA MboI酶切的400—1000 bp片段中筛选CA/GT微卫星位点,洗脱的杂交片段克隆到pMD18-T载体上构建富集微卫星基因组文库后,通过PCR筛选检测出720个阳性克隆,占所... 采用磁珠富集法,利用生物素标记的(CA)12寡核苷酸探针从黑斑原(鱼兆)基因组DNA MboI酶切的400—1000 bp片段中筛选CA/GT微卫星位点,洗脱的杂交片段克隆到pMD18-T载体上构建富集微卫星基因组文库后,通过PCR筛选检测出720个阳性克隆,占所有克隆的89.2%,从阳性克隆中随机选取139个进行测序,序列分析发现,124个克隆含有7个以上的重复序列,其中完全的为80个(64.5%),不完全的为40个(32.3%),复合的为15个(3.2%),重复次数范围为7—165次,平均为52次。在124条序列中共59条可以设计引物。 展开更多
关键词 黑斑原 微卫星 磁珠富集 DNA文库 构建
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一种改进的构建杂交扣留cDNA文库的方法 被引量:4
4
作者 赵大中 陈民 +1 位作者 种康 谭克辉 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1998年第4期373-376,共4页
介绍了一种改进的利用减法杂交构建λ噬菌体cDNA文库的方法,该方法利用处理的scDNA减去两种对照的mRNA富集目的sscDNA并用磁珠法分离杂交单体,结果表明其增加了杂交单体的产量、简化了实验步骤,而且更有利于富集... 介绍了一种改进的利用减法杂交构建λ噬菌体cDNA文库的方法,该方法利用处理的scDNA减去两种对照的mRNA富集目的sscDNA并用磁珠法分离杂交单体,结果表明其增加了杂交单体的产量、简化了实验步骤,而且更有利于富集所需基因,是构建cDNA文库的一个有效改进. 展开更多
关键词 CDNA文库 磁珠 减法杂交 构建
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地黄微卫星富集文库构建及特性分析 被引量:5
5
作者 程月琴 焦振彬 +2 位作者 张佩 叶永忠 王红卫 《种子》 CSCD 北大核心 2013年第5期12-16,共5页
应用Dynal磁珠-生物素标记的微卫星探针(AC)8,(AG)8和(ATG)12与地黄基因组DNA酶切片段杂交,捕获含有微卫星序列的DNA片段,连接到pMD 18-T载体上,转入感受态细胞Trans 5α,构建地黄富集微卫星文库。利用M 13 F和M 13 R载体序列引物筛选文... 应用Dynal磁珠-生物素标记的微卫星探针(AC)8,(AG)8和(ATG)12与地黄基因组DNA酶切片段杂交,捕获含有微卫星序列的DNA片段,连接到pMD 18-T载体上,转入感受态细胞Trans 5α,构建地黄富集微卫星文库。利用M 13 F和M 13 R载体序列引物筛选文库,对插入片段长度为400~800 bp的克隆进行测序。共获得96条序列,48条(50%)含有微卫星位点,其中完美型占66%,非完美型22%,混合型12%。微卫星重复基元中,二核苷酸(AG)n和三核苷酸(CAT)n最为常见。 展开更多
关键词 地黄 微卫星 磁珠 富集文库
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苎麻基因组微卫星的分离与鉴定(英文) 被引量:10
6
作者 蒋彦波 揭雨成 +2 位作者 周建林 邢虎成 佘玮 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期158-162,共5页
以苎麻[Boehmeria nivea(L.)Gaud.]栽培品种芦竹青为材料,经Mse Ⅰ酶切并与相应接头连接,然后与生物素标记的探针(CT)15杂交,再用链亲和素包被磁珠(Dynabeads M-280)捕捉杂交产物,以21碱基接头寡核苷酸为引物经PCR扩增获得... 以苎麻[Boehmeria nivea(L.)Gaud.]栽培品种芦竹青为材料,经Mse Ⅰ酶切并与相应接头连接,然后与生物素标记的探针(CT)15杂交,再用链亲和素包被磁珠(Dynabeads M-280)捕捉杂交产物,以21碱基接头寡核苷酸为引物经PCR扩增获得了双链目的片段,回收300—1000bp DNA片段,然后克隆到pMD18-T载体上,转化至DH5α中,这样就构建了苎麻富含(GA)n微卫星的部分基因组文库。随机挑取36个克隆,以锚定简单重复序列为引物对其进行PCR筛选。测序分析了22个阳性克隆,每个克隆都含有微卫星DNA,阳性克隆率为61.1%,微卫星种类以与探针互补的(GA/CT)n为主,占83.3%,同时还存在(TG/AC)n和三碱基、六碱基为单元构成的苎麻微卫星,如(GAC)n、(ACG)n、(TCT)n、(TCG)n、(GAA)n、(CCGACG)n、(GAGAAA)n等。最后以18个微卫星位点设计了18对苎麻微卫星特异引物。GMCT重复单元的长度从7到40范围内变化,平均为19.2,显示了它们将产生良好多态性,为一种强有力的遗传标记。苎麻微卫星DNA标记可广泛应用于苎麻基因型鉴定,基因和QTL分析,分子标记辅助育种,系谱分析等。 展开更多
关键词 苎麻[Boehmeria nivea(L.)Gaud] 微卫星 磁珠 基因组文库 (CA)n重复序列
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磁珠富集法分离柿微卫星标记 被引量:10
7
作者 阮小凤 Gabi Krczal 杨勇 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2008年第5期97-102,共6页
【目的】分离柿属植物的微卫星标记,为柿种质资源的分类、进化等遗传研究奠定基础。【方法】提取磨盘柿(Diospyros kaki)基因组DNA后,用EcoRⅠ和MesⅠ2种内切酶酶切并连接接头,再用接头特异引物进行PCR扩增。扩增产物与生物素标记的... 【目的】分离柿属植物的微卫星标记,为柿种质资源的分类、进化等遗传研究奠定基础。【方法】提取磨盘柿(Diospyros kaki)基因组DNA后,用EcoRⅠ和MesⅠ2种内切酶酶切并连接接头,再用接头特异引物进行PCR扩增。扩增产物与生物素标记的(GA)15和(AC)15探针杂交,杂交复合物用链亲和素包裹磁珠进行结合,得到单链DNA目标片段,经PCR扩增,连接pGEM-T载体,转化入感受态大肠杆菌,得到微卫星富集小插入片段DNA文库。用Colony-PCR法筛选阳性克隆,进行测序分析。【结果】测序96个克隆,54个含微卫星序列,24个为有效微卫星序列,其中完美型(perfect)9个,占37.5%;非完美型(imperfect)7个,占29.2%;混合型(compound)8个,占33.3%(。GA)n重复最为常见。21条含微卫星序列已登录GenBank(Accession Number:EF567396~EF567416)。成功设计21对引物,经初步筛选,14对表现出多态性。【结论】试验方法分离柿基因组微卫星简便有效,得到的多态性引物可用于柿种质资源的遗传研究。 展开更多
关键词 微卫星 磁珠富集
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利用磁珠构建稻瘟菌cDNA文库 被引量:3
8
作者 徐锋 武晓丽 邱德文 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期806-810,共5页
本文以稻瘟菌菌丝体为材料提取RNA,【目的】改进张学敏等人的方法,通过磁珠构建稻瘟菌cDNA文库,并用于下一步研究稻瘟菌与水稻之间的互作关系。【方法】通过共价键连接的寡聚oligo(dT)磁珠纯化mRNA,并以磁珠上的oligo(dT)为引物引导第一... 本文以稻瘟菌菌丝体为材料提取RNA,【目的】改进张学敏等人的方法,通过磁珠构建稻瘟菌cDNA文库,并用于下一步研究稻瘟菌与水稻之间的互作关系。【方法】通过共价键连接的寡聚oligo(dT)磁珠纯化mRNA,并以磁珠上的oligo(dT)为引物引导第一链cDNA的合成,再利用末端转移酶加尾法合成第二链cDNA。构建过程中避免使用限制酶和连接接头。【结果】用此方法构建的文库容量为8.9×107cfu,滴度为8.9×106cfu/mL,随机挑取的25个克隆插入片断平均大小达到1380bp。【结论】实验结果表明用改进的方法可构建高质量的cDNA文库,并且方便快捷,所用材料少,构建时间短,利于大规模的功能基因分析。 展开更多
关键词 稻瘟菌 CDNA文库 磁珠
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亲和素磁珠分离毛竹SSR标记方法的优化 被引量:3
9
作者 苗元 李潞滨 +3 位作者 唐征 杨凯 刘贯水 朱宝成 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期51-55,共5页
在参考其它文献报道的基础上,构建毛竹SSR位点富集文库。用EcoRⅠ分别和DraⅠ、EcoRⅤ、SmaⅠ、PvuⅡ四种平端限制性内切酶对毛竹基因组DNA进行双酶切,酶切片段回收后与根据抑制性PCR原理设计的接头连接。在利用亲和素磁珠富集含有SSR... 在参考其它文献报道的基础上,构建毛竹SSR位点富集文库。用EcoRⅠ分别和DraⅠ、EcoRⅤ、SmaⅠ、PvuⅡ四种平端限制性内切酶对毛竹基因组DNA进行双酶切,酶切片段回收后与根据抑制性PCR原理设计的接头连接。在利用亲和素磁珠富集含有SSR序列的DNA片段过程中,对杂交、漂洗及洗脱步骤进行优化。通过三引物特异PCR筛选含有SSR序列的阳性克隆并结合测序结果对富集SSR文库进行评价,确定了一条简单、经济、高效分离竹类植物SSR标记的方法。 展开更多
关键词 毛竹 SSR 亲和素磁珠 富集文库 评价
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一种改进的cDNA文库固相构建法 被引量:2
10
作者 王义琴 李文彬 +1 位作者 张利明 孙勇如 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2000年第4期253-254,共2页
本文介绍一种新的cDNA文库固相构建法。文库构建过程中 ,cDNA的合成和修饰全部在固相介质———磁珠上完成,简便、迅速、文库质量高 ,能满足不同目的的cDNA文库构建 ,是一种值得借鉴和应用的好方法。
关键词 CDNA文库 固相构建 磁珠 天麻抗真菌蛋白
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cDNA文库固相构建法 被引量:2
11
作者 王义琴 孙勇如 《生物工程进展》 CSCD 2000年第5期72-74,共3页
本文介绍一种cDNA文库的固相构建法。文库构建过程cDNA的合成和修饰全部在固相介质—磁珠上完成 ,简便、迅速、文库质量高 ,能满足不同目的的cDNA文库构建 ,是一种值得借鉴和应用的好方法。
关键词 CDNA文库 固相构建 磁珠 CDNA合成 cDNA修饰
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关于图书馆磁条改造的思考 被引量:6
12
作者 唐亦玲 《金陵科技学院学报(社会科学版)》 2009年第3期94-96,共3页
图书馆磁条改造工作事关图书馆的长远发展,必须予以高度重视。就如何做好这项工作,从实际例子出发,提出了具体实施方案和解决办法。
关键词 图书馆 磁条改造 措施
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图书馆图书磁条改造新探——以无锡商业职业技术学院图书馆为例 被引量:1
13
作者 王静君 《四川图书馆学报》 2015年第6期88-91,共4页
图书馆"大流通"管理模式下,需要进行图书磁条改造工作。文章以无锡商业职业技术学院图书馆为例,提出适合该院的磁条改造技术,将原来的永久磁条改造为可充消磁的复合磁条,提出"原磁条相邻页加贴复合磁条"的新方法;... 图书馆"大流通"管理模式下,需要进行图书磁条改造工作。文章以无锡商业职业技术学院图书馆为例,提出适合该院的磁条改造技术,将原来的永久磁条改造为可充消磁的复合磁条,提出"原磁条相邻页加贴复合磁条"的新方法;并就磁条改造工作的前期准备、实施方案和过程进行了详细论述。 展开更多
关键词 图书馆 磁条改造 复合磁条 RFID 大流通
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机房管理软件的设计 被引量:1
14
作者 刘智 马冲 董世山 《大连大学学报》 1998年第6期10-12,共3页
采用模块化程序设计方法,对机房的一系列工作采用微机化管理,建立了现代化的机房管理软件,本文着重介绍该软件可行性、安全可靠性等系统特点和在软件设计过程中所采用的一些设计技巧。
关键词 磁卡 自动存盘 代码库 断电处理
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图书馆监测系统 被引量:2
15
作者 张辉 王洋 邓万鹏 《科技情报开发与经济》 2011年第3期23-25,共3页
论述了监测系统的分类,探讨了电磁波仪器的几个发展阶段,介绍了设备的日常维护和故障维修。
关键词 图书馆监测系统 电磁波系统 声磁系统 射频系统
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图书馆图书磁条及防盗问题探讨 被引量:2
16
作者 蒋镜源 《龙岩学院学报》 2012年第5期93-95,共3页
图书馆丢书较为普遍,大多数图书馆安装了图书监测仪以防图书被盗。然而对图书磁条及防盗问题进行探讨,笔者发现对图书磁条进行消磁有简易方法,制作多种消磁器并不困难,使得图书监测仪起不到防盗作用,存在图书大面积被盗可能,对此应引起... 图书馆丢书较为普遍,大多数图书馆安装了图书监测仪以防图书被盗。然而对图书磁条及防盗问题进行探讨,笔者发现对图书磁条进行消磁有简易方法,制作多种消磁器并不困难,使得图书监测仪起不到防盗作用,存在图书大面积被盗可能,对此应引起监测仪生产厂家、各类图书馆足够重视,提出图书防盗除技术防盗、警示防范以外,还应加强道德法治观念教育的观点。 展开更多
关键词 图书馆 图书磁条 图书防盗 图书消磁
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磁珠富集法构建播娘蒿SSR文库及特性分析
17
作者 王亚平 焦振彬 +2 位作者 裴宋雨 叶永忠 王红卫 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期186-190,共5页
为构建播娘蒿SSR文库,通过Dynal磁珠富集法富集生物素标记的(AC)8,(AG)8和(ATG)12探针与播娘蒿基因组的酶切片段杂交的片段,捕获含有SSR位点的DNA序列,连接到pMD18-T载体上,并转入感受态细胞DH5d,共获得778个克隆.挑选阳... 为构建播娘蒿SSR文库,通过Dynal磁珠富集法富集生物素标记的(AC)8,(AG)8和(ATG)12探针与播娘蒿基因组的酶切片段杂交的片段,捕获含有SSR位点的DNA序列,连接到pMD18-T载体上,并转入感受态细胞DH5d,共获得778个克隆.挑选阳性克隆,利用SuperSNX24一F引物对茵液克隆进行PCR检测.利用M13F,M13R载体引物和探针结合的方法对文库进行2次筛选,获得93个长度为400~1000bp的克隆并测序.结果表明,82条序列舍有SSR位点,占测序条数的88.17%.共有SSR位点数127个.其中完全型SSR位点102个,不完全型SSR位点10个.混合型SSR位点15个,分别占SSR位点总数的80.31%,7.87%,11.81%.SSR重复基元中,以二核苷酸(CT)n,(AC)n,(GT)n,三核苷酸(GAT)n最为常见,得率分别为20.47%,26.77%,21.26%和15.75%. 展开更多
关键词 播娘蒿 磁珠富集法 SSR文库
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乌苏里拟鲿微卫星文库的构建及分析 被引量:8
18
作者 朱传坤 潘正军 +4 位作者 王辉 吴楠 常国亮 丁怀宇 周凤建 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期473-478,共6页
乌苏里拟鲿(Pseudobagras ussuriensis)又名乌苏里逘(Leiocassis ussuriensis),隶属于鲶形目,鲿科,拟鲿属,主要分布于我国东北地区,但在我国其他各大水系也有分布。乌苏里拟鲿肉质细嫩、味道鲜美、风味独特、适口性好、市场价值高,... 乌苏里拟鲿(Pseudobagras ussuriensis)又名乌苏里逘(Leiocassis ussuriensis),隶属于鲶形目,鲿科,拟鲿属,主要分布于我国东北地区,但在我国其他各大水系也有分布。乌苏里拟鲿肉质细嫩、味道鲜美、风味独特、适口性好、市场价值高,深受广大消费者和养殖户青睐。在20世纪80年代,乌苏里拟鲿的天然捕捞量曾仅次于同科的黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidsco),然而由于捕捞强度的持续增长、环境污染及生境破坏等因素的影响,其野生资源量锐减,目前在很多自然分布区已很难捕获野生个体. 展开更多
关键词 乌苏里拟鲿 磁珠富集文库 微卫星
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香椿(Toona sinensis)微卫星富集文库构建及特性分析 被引量:4
19
作者 裴宋雨 任志勇 +2 位作者 焦振彬 程月琴 王红卫 《种子》 北大核心 2015年第2期13-16,23,共5页
采用Dynal磁珠富集法构建了香椿微卫星富集文库,通过测序结果对文库的特性进行了分析。实验使用改良CTAB法提取香椿基因组DNA,用(AC)8、(AG)8和(ATG)123种带有生物素标记的探针与香椿基因组DNA的酶切片段进行杂交,将磁珠捕获的含... 采用Dynal磁珠富集法构建了香椿微卫星富集文库,通过测序结果对文库的特性进行了分析。实验使用改良CTAB法提取香椿基因组DNA,用(AC)8、(AG)8和(ATG)123种带有生物素标记的探针与香椿基因组DNA的酶切片段进行杂交,将磁珠捕获的含有微卫星序列的DNA片段插入p MD 18-T载体,并转入感受态细胞Trans 5α构建克隆,经筛选后得到含356个克隆的香椿基因组微卫星富集文库。从富集文库中挑选插入片段长度为400-800 bp的128个克隆进行测序,其中含有SSR的序列77条,得率达60.16%,其中完美型占82.69%,非完美型8.65%,混合型8.65%。上述结果为SSR位点的进一步开发奠定了基础。 展开更多
关键词 香椿 微卫星 磁珠 富集文库
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磁珠富集法分离菠萝蜜(Artocarpus heterophyllus)微卫星标记及系列分析 被引量:5
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作者 王艳红 李映志 +1 位作者 丰锋 叶春海 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期1046-1051,共6页
利用磁珠富集法分离出菠萝蜜微卫星位点,并成功设计出菠萝蜜(Artocarpus heterophyllus Lam.)SSR(简单序列重复,Simple sequence repeat)分子标记引物。基因组DNA经MseI酶切后,用生物素标记的简单重复序列做探针与其杂交,杂交复合物固... 利用磁珠富集法分离出菠萝蜜微卫星位点,并成功设计出菠萝蜜(Artocarpus heterophyllus Lam.)SSR(简单序列重复,Simple sequence repeat)分子标记引物。基因组DNA经MseI酶切后,用生物素标记的简单重复序列做探针与其杂交,杂交复合物固定到包被有链霉亲和素的磁珠上,经过一系列的洗涤过程,含有SSR的酶切片段被吸附到磁珠表面。这些片段经洗脱下来后,先用对应的引物扩增,再进行克隆和测序。实验共挑出83个阳性克隆进行测序,成功设计合成SSR引物19对。并通过这19对SSR引物对20份菠萝蜜种质资源进行分析,全部能扩增出特异性条带,其中18对引物扩增的条带具有多态性,可以作为菠萝蜜分子标记使用。 展开更多
关键词 菠萝蜜 微卫星 磁珠富集法
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