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MedPortal:面向精准医学的生物医学本体资源存储和应用平台
被引量:
7
1
作者
郭靖文
杨晟
+4 位作者
史涪仁
邵晨
张璐璐
王恒
杨啸林
《中国生物医学工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第5期557-564,共8页
在过去10余年中,本体广泛应用于生物医学数据分析、检索、整合和再利用中。本体作为一种特殊类型的数据资源,数据量也在迅速增加。为了促进精准医疗领域数据集的整合,并为国内用户提供本体数据资源服务,构建MedPortal本体资源存储和应...
在过去10余年中,本体广泛应用于生物医学数据分析、检索、整合和再利用中。本体作为一种特殊类型的数据资源,数据量也在迅速增加。为了促进精准医疗领域数据集的整合,并为国内用户提供本体数据资源服务,构建MedPortal本体资源存储和应用平台。通过复用NCBO BioPortal技术,搭建MedPotal软件框架。遴选精准医学相关本体,建立本体资源库。对原框架中的代码和本体处理工具进行修正和完善,使之能够在本体稳定运行的基础上满足大批量数据的自动化处理。目前,该平台已整合42个生物医学本体,建立了本体之间术语映射关系,通过页面和REST API方式,提供术语检索、本体映射、数据标准化注释等本体应用服务(http://medportal.bmicc.cn)。MedPortal本体平台将为生物医学数据整合提供帮助。
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关键词
生物医学本体
medportal
数据库
本体映射
本体注释
下载PDF
职称材料
题名
MedPortal:面向精准医学的生物医学本体资源存储和应用平台
被引量:
7
1
作者
郭靖文
杨晟
史涪仁
邵晨
张璐璐
王恒
杨啸林
机构
中国医学科学院基础医学研究所
出处
《中国生物医学工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第5期557-564,共8页
基金
国家国际科技合作专项(2014DFB30030)
文摘
在过去10余年中,本体广泛应用于生物医学数据分析、检索、整合和再利用中。本体作为一种特殊类型的数据资源,数据量也在迅速增加。为了促进精准医疗领域数据集的整合,并为国内用户提供本体数据资源服务,构建MedPortal本体资源存储和应用平台。通过复用NCBO BioPortal技术,搭建MedPotal软件框架。遴选精准医学相关本体,建立本体资源库。对原框架中的代码和本体处理工具进行修正和完善,使之能够在本体稳定运行的基础上满足大批量数据的自动化处理。目前,该平台已整合42个生物医学本体,建立了本体之间术语映射关系,通过页面和REST API方式,提供术语检索、本体映射、数据标准化注释等本体应用服务(http://medportal.bmicc.cn)。MedPortal本体平台将为生物医学数据整合提供帮助。
关键词
生物医学本体
medportal
数据库
本体映射
本体注释
Keywords
biomedical ontology
medportal
database
ontology mapping
ontology annotation
分类号
R318 [医药卫生—生物医学工程]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
MedPortal:面向精准医学的生物医学本体资源存储和应用平台
郭靖文
杨晟
史涪仁
邵晨
张璐璐
王恒
杨啸林
《中国生物医学工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
7
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职称材料
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