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J、K亚群禽白血病病毒的分离和囊膜蛋白(gp85)基因序列分析
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作者 周钊灿 游广炬 +4 位作者 杨金易 苏晓娜 高丽 王永强 郑世军 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2024年第4期1-10,共10页
为了解现阶段我国禽白血病病毒(ALV)的流行特征和演化趋势,本试验于2021—2022年从国内某鸡场采集蛋清ALV衣壳蛋白(p27)抗原阳性的鸡血浆,接种鸡胚成纤维细胞(DF-1)分离病毒并进行亚群鉴定;采用聚合酶链式反应(PCR)技术扩增分离株的囊... 为了解现阶段我国禽白血病病毒(ALV)的流行特征和演化趋势,本试验于2021—2022年从国内某鸡场采集蛋清ALV衣壳蛋白(p27)抗原阳性的鸡血浆,接种鸡胚成纤维细胞(DF-1)分离病毒并进行亚群鉴定;采用聚合酶链式反应(PCR)技术扩增分离株的囊膜蛋白(gp85)基因片段,并对其进行测序,将基因序列与ALV不同亚群毒株进行比对和遗传进化分析;选取氨基酸变化差异较大的分离毒株进行间接免疫荧光鉴定。结果显示,共分离到7株ALV毒株(3株J亚群,4株K亚群),ALV-J分离毒株CAU4932、CAU4860和CAU2259的gp 85基因片段长度为918 bp,编码306个氨基酸,分离毒株之间gp 85基因核苷酸同源性为90.5%~95.2%,gp85蛋白氨基酸同源性为95.1%~99.3%;ALV-K分离毒株CAU7049、CAU5006、CAU7176和CAU7168的gp 85基因片段长度为1008 bp,编码336个氨基酸,分离毒株之间gp 85基因核苷酸同源性为89.4%~92.3%,gp85蛋白氨基酸同源性为94.0%~99.7%。gp85蛋白氨基酸序列同源性比对发现,分离株gp85蛋白氨基酸序列均会发生突变,但高变区hr1和hr2所占比例较多,证实了gp85的高变性。在gp85蛋白B细胞抗原表位中存在部分位点的氨基酸突变,可能导致gp85蛋白抗原性发生变化。间接免疫荧光鉴定结果显示,5株分离毒株均可在DF-1细胞内复制并存在可被抗体识别的p27抗原表位。结果表明,本试验分离的7株ALV毒株是国内ALV-J和ALV-K流行毒株的突变株,不仅丰富了ALV基因组库资源,且为后续研究ALV的遗传变异特征和流行趋势等提供参考依据。 展开更多
关键词 禽白血病病毒 j亚群 K亚群 gp 85基因 序列比较
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DEPOSITIONAL SEQUENCES AROUND J/K BOUNDARY IN THE QOMOLONGMA AREA, SOUTH TIBET
2
作者 Shi Xiaoying 1, Nicol Morton 2(1 China University of Geosciences, Beijing 100083,China 2.University of London, London WC1E 7HX,UK) 《地学前缘》 EI CAS CSCD 2000年第S1期21-22,共2页
The uppermost Jurassic to Lower Cretaceous in the Qomolongma (Mt. Everest) area were deposited in a strong subsiding setting on passive continental margin. From Tithonian to Valanginian, the area experienced an enviro... The uppermost Jurassic to Lower Cretaceous in the Qomolongma (Mt. Everest) area were deposited in a strong subsiding setting on passive continental margin. From Tithonian to Valanginian, the area experienced an environment shift from circum\|shelf margin carbonate platform to foreslope, then to deep continental slope [1] . Correspondingly, the sediments change in vertical succession from quartz sandstone, via carbonate grainstone to dark shale intercalated with lithic sandstone of gravity flow. From the Tithonian to Valanginian, eight 3rd\|order sequences have been recognized [1] with clearly delineated sequence boundaries and reasonable biostratigraphic controls of ammonites. From the angle of sequence stratigraphy and sedimentary cycles, the important change happened at ca. 138Ma [2] of the Lower Tithonian (about 120m above Aulacosphinctoides hybonotum zone), where a waved subaerial erosion surface occurs in massive bioclastic grainstone. The boundary at ca. 134 5Ma (latest Tithonian, about 60m below the FAD of \%Berriasella cf. jacobi [3] ) comes to the next. The third one is at ca 132Ma (some 170m above the FAD of Berriasella cf. jacobi [3] , but about 60m below the FAD of Berriasella cf. grandis [3] ). In terms of sea\|level change, the sequence boundary at 134 5Ma is probably the most distinctive one, above which some 60m gravel\|bearing massive medium\|grained quartz sandstone was laid down and obviously truncates the underlying strata. In the dark shale below the sandstone, abundant in ammonites, such as Virgatosphinctes, Aulacosphinctes, Haplophylloceras and Gymnosphinctes are recorded [3] . The quartz sandstone itself does not bear identifiable fossils. Above the quartz sandstone, the strata mainly consists of dark silty shale up to 180m thick, with an prominent marine transgression at the base. Just above the first flooding surface (FFS), quite a number of ammonites such as \%Berriasella\% cf. \%jacobi, Blanofordiceras, Hymalayaites\% and \%Pseudosubplanites \%are documented [3] . The third sequence, which is delineated by submarine truncation of slope fan complexes at bottom, is also characterized by dark shale and silts, yielding ammonites \%Berriasella \%cf. \%grandis\% and B. cf. \%berthei.\%>From the viewpoint of sequence stratigraphy, we herein suggest to take the FFS in the second sequence as the J/K boundary. The sequence boundary below it can be used as a nice auxiliary marker, which represents a large sea\|level fall, and can be correlated widely in the world. From the angle of paleontology, the FFS is also ideal for the boundary, where the most important faunal turnover happened. Theoretically, taking FFS as a chronostratigraphic boundary has more advantages than using sequence boundary. 展开更多
关键词 j/K BOUNDARY DEPOSITIONAL sequenceS SOUTH TIBET
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Isolation of Three Strains of Avian Leukosis Virus Subgroup J and gp85 Gene Sequence Analysis
3
作者 LIU Li-na LUO Qing-ping +5 位作者 CHENG Guo-fu HU Xue-ying YANG Jun ZHANG Lin SHAO Hua-bin LI Shao-wen 《Animal Husbandry and Feed Science》 CAS 2013年第1期11-13,52,共4页
[Objective] To isolate three strains of avian leukosis virus subgroup J(ALV -J) , and then amplify and sequence the gp85 gene. [ Method] Three strains of ALV- J were isolated from Hubei Province, which were identifi... [Objective] To isolate three strains of avian leukosis virus subgroup J(ALV -J) , and then amplify and sequence the gp85 gene. [ Method] Three strains of ALV- J were isolated from Hubei Province, which were identified by pathological anatomy, DF- 1 cell culture and RT- PCR. And then they were named HB1002, HB1003 and HB1009, respectively. [ Result] Test sequence analysis showed, the length of gp85 gene was 921 bp, consistent with expect result; the nucleotide homology between the three isolates was in 97.7% -99.7% ,the homology of amino acid was in 95.1% - 99%. The nucleotide homology between HPRS - 103 and the three isolates was in the 94.1% - 94.8% ; and the nucleotide homolo- gy between other ALV -J and the three isolates was in 87.6% -97.3%. The phylogenetic trees analysis showed that the homology of JS09GY6 vi- rus and the three isolates was nearest, in 95.2% -97.3%. [ Conclusion] In the test, the three strains of virus which were isolated were ALV- J. 展开更多
关键词 ALV - j gp85 gene sequence analysis
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Isolation and the Full-length Genome Sequencing of Subgroup J Avian Leukosis Virus ZH-08 Isolate Associated with Hemangioma 被引量:1
4
作者 ZHANG Xiao-tao SHI Wei-wei LIU Hong-bo ZHANG He-nan LIAO Ming XIN Chao-an CAO Wei-sheng 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第B12期51-56,共6页
A subgroup J avian leukosis virus (AVL-J), designated as ZH-08, was isolated from a breeder flock in Guangdong province with a novel hemangioma case. The identification results of ELISA test, PCR and immunofluoresecen... A subgroup J avian leukosis virus (AVL-J), designated as ZH-08, was isolated from a breeder flock in Guangdong province with a novel hemangioma case. The identification results of ELISA test, PCR and immunofluoresecence assay (IFA) specific for ALV-J were all positive. Based on the public full-length proviral genome sequence of ALV-J prototype strain HPRS-103, three pairs of primers were synthesized. The full-length proviral genome sequence of ZH-08 isolate is 7597 bp, which has a little difference with that of published full-length genome sequences, but its organization corresponds with typical retroviral genome structure; and known oncogenes were not included in its genome. According to the gp85 sequence comparison of ZH-08 isolate with those of the other reference strains in China and abroad, the highest similarity (93.7%) was with the YZ9901 isolate. Phylogenetic analysis, based on the gp85 gene, showed that the ZH-08 isolated here had the closest linkage to the SD07LK1 isolate. This study provides the basis for the biological characterization and pathogenesis research of the ZH-08 isolate. 展开更多
关键词 j亚群禽白血病病毒 全基因组测序 血管 全基因组序列 酶联免疫吸附试验 ALV-j 聚合酶链反应 GP85基因
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广东惠州地区46例血红蛋白J-Bangkok的分子诊断及血液学特征分析 被引量:2
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作者 徐志邦 官志扬 +2 位作者 叶健翔 曾惠华 陈剑虹 《分子诊断与治疗杂志》 2023年第3期489-492,共4页
目的分析血红蛋白J-Bangkok(Hb J-Bangkok)患者的血液学特征。方法收集2015年10月至2021年3月于惠州市第一妇幼保健院就诊的患者共86645例,使用全自动毛细管电泳仪检测其外周血样本,对筛查出Hb J条带的样本行血细胞分析和DNA测序。采用... 目的分析血红蛋白J-Bangkok(Hb J-Bangkok)患者的血液学特征。方法收集2015年10月至2021年3月于惠州市第一妇幼保健院就诊的患者共86645例,使用全自动毛细管电泳仪检测其外周血样本,对筛查出Hb J条带的样本行血细胞分析和DNA测序。采用悬浮阵列技术检测α和β地中海贫血(简称地贫)基因。结果共检出46例Hb J-Bangkok(HBB:c.170G>A)患者,人群发生率为0.053%。单纯Hb J-Bangkok杂合子患者无血液学表型;Hb J-Bangkok合并SEA杂合子患者表现为轻型α地贫特征。首次报道了两例罕见类型,分别为Hb J-Bangkok合并Hb New York杂合子和Hb J-Bangkok合并SEA及βCD81杂合子。前者患者无明显血液学改变,其Hb J、Hb K和Hb A2分别为59.7%、39.5%和0.8%;后者患者表现为轻型α地贫特征。结论惠州地区人群Hb J-Bangkok发生率高,本研究有助于为疾病筛查提供参考数据以及完善惠州地区的地贫防控工作。 展开更多
关键词 血红蛋白j-Bangkok 地中海贫血 血液学 基因型 DNA测序
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Geochemistry of Layered Ultramafic Rocks in J.C. Pura Schist Belt, Dharwar Craton, Karnataka, India
6
作者 S. Santhosh B. G. Dayanand B. C. Prabhakar 《Open Journal of Geology》 CAS 2023年第2期189-202,共14页
The Jayachamarajapura schist belt in western Dharwar craton, southern India, is predominantly an ultramafics dominant terrain. These rocks have been extensively metamorphosed and altered to serpentinite. The komatiite... The Jayachamarajapura schist belt in western Dharwar craton, southern India, is predominantly an ultramafics dominant terrain. These rocks have been extensively metamorphosed and altered to serpentinite. The komatiite nature of ultramafics is conspicuous. In most of the areas of the belt these ultramafics are massive in nature. However, some of the ultramafic units show layered nature. But, their outcrops are encompassed within the massive komatiitic bodies. These komatiitic ultramafics are predominantly Mg-rich in nature. The layered rocks are also Mg-rich, and their field setting and geochemistry suggest their intermittent occurrence as sills, during the differentiation of peridotitic magma. The layered rocks, which have been intensely serpentinisation show homogenous nature. They are almost wholly made of serpentine with occasional relics of pyroxene. Secondary carbonate mineral is often noticed. Their higher MgO content indicates Mg-rich ultramafic magmatism during Archaean orogeny. 展开更多
关键词 Western Dharwar Craton Layered sequences KOMATIITE j.C. Pura Belt
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基于ETAS模型的余震概率性地震危险性分析
7
作者 陈力波 陈良鹏 周健鸿 《自然灾害学报》 CSCD 北大核心 2024年第4期22-33,共12页
余震概率性地震危险性分析对主震发生后的地震风险评估至关重要。经典的余震概率性地震危险性分析框架基于Reasenberg-Jones(R-J)模型建立,但R-J模型对复杂的地震序列可能存在预测失效的问题,因此,将对真实余震序列描述较好的传染型余... 余震概率性地震危险性分析对主震发生后的地震风险评估至关重要。经典的余震概率性地震危险性分析框架基于Reasenberg-Jones(R-J)模型建立,但R-J模型对复杂的地震序列可能存在预测失效的问题,因此,将对真实余震序列描述较好的传染型余震序列模型(epidemic-type aftershock sequence,ETAS)结合到余震概率性地震危险性分析框架中,以2008年汶川7.9级余震序列和2014年鲁甸6.2级余震序列为例,评估余震危险性的重要性以及探讨ETAS模型相对于R-J模型在余震概率性地震危险性分析中的差异。结果表明:余震危险性水平与主震震级大小有关,主震震级越大,余震危险性水平越高,持续时间越久,对于震级较大的强主震事件,主震发生后早期的余震危险性不容忽略。对于汶川7.9级和鲁甸6.2级地震事件,在余震发生率预测效能上ETAS模型优于R-J模型,而在余震危险性评估中,余震危险性的大小取决于余震发生率,基于R-J模型计算的余震发生率大于ETAS模型计算的余震发生率,因此,在余震危险性评估中使用R-J模型相比于ETAS模型会造成对余震危险性水平的高估,ETAS模型可用于改进余震概率性地震危险性评估框架。 展开更多
关键词 ETAS模型 R-j模型 余震序列 余震概率性地震危险性分析
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鸡的J亚群白血病病毒的分离及部分序列比较 被引量:131
8
作者 杜岩 崔治中 +2 位作者 秦爱建 R.F.Silva L.F.Lee 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第4期341-346,共6页
通过接种鸡胚成纤维细胞、聚合酶链式反应 (PCR)技术及特异性单抗的间接荧光抗体反应 (IFA) ,从某大型肉用型种鸡场的疑似J亚群白血病的病鸡中 ,以及 2 5个临床健康的商品代肉鸡群的 2群中 ,分离鉴定出J亚群禽白血病病毒 (ALV J)。在用... 通过接种鸡胚成纤维细胞、聚合酶链式反应 (PCR)技术及特异性单抗的间接荧光抗体反应 (IFA) ,从某大型肉用型种鸡场的疑似J亚群白血病的病鸡中 ,以及 2 5个临床健康的商品代肉鸡群的 2群中 ,分离鉴定出J亚群禽白血病病毒 (ALV J)。在用抗ALV Jgp85单克隆抗体JE9的IFA中 ,来自病鸡群的两株病毒SD990 1和SD990 2呈强阳性反应 ,来自临床健康肉鸡群的YZ990 1和YZ990 2株呈弱阳性反应。对YZ990 1株和SD990 2株的PCR产物直接测序结果表明 ,这二个中国株的囊膜蛋白 gp85的氨基酸组成与原型株HPRS 10 3及美国分离株ADOL Hcl有 89%~ 93%的同源性 ,它们相互间的同源性是 92 %。其 3′端LTR区与原型株HPRS 10 3则有 95 %~ 97%的同源性 ,但中国的两株病毒在紧靠 3′端LTR的“E”成分中 ,出现了一个 139个碱基的缺失性突变 ,而代之以一个 11个碱基的插入序列。 展开更多
关键词 肉鸡 j亚群白血病病毒 序列比较
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我国2000~2001年J亚群禽白血病病毒分离株gp85基因的序列比较 被引量:18
9
作者 张志 崔治中 赵宏坤 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期25-27,共3页
以相当于 J亚群禽白血病病毒 (AL V- J)原型株 HPRS- 10 3基因组碱基 #5 394~ #5 416及 #7811~ #7794的 1对引物做 PCR,在 2 0 0 0~ 2 0 0 1年从山东、河南和宁夏分离的 8株 AL V- J中 ,有 6株可以扩增出含 gp85基因的 2 .2 kb左右... 以相当于 J亚群禽白血病病毒 (AL V- J)原型株 HPRS- 10 3基因组碱基 #5 394~ #5 416及 #7811~ #7794的 1对引物做 PCR,在 2 0 0 0~ 2 0 0 1年从山东、河南和宁夏分离的 8株 AL V- J中 ,有 6株可以扩增出含 gp85基因的 2 .2 kb左右的特异性片段。对其中 5株的扩增片段做了序列分析 ,结果表明 ,这 5个毒株的囊膜糖蛋白 gp85与原型株 HPRS-10 3有 93.4%~ 96 .8%的同源性 ,与我国最早的分离株 SD990 2有 93.7%~ 98.7%的同源性 ,它们相互之间的同源性为 91.2 %~ 98.7%。由此说明 ,我国 AL V- J的 gp85基因正在不断发生变异。 展开更多
关键词 2001年 j亚群禽白血病 病毒分离株 GP85基因 序列比较
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利用早期余震预测的Omi-R-J方法对2017年四川九寨沟M_S7.0地震的应用研究 被引量:9
10
作者 蒋长胜 毕金孟 +2 位作者 王福昌 隗永刚 龙锋 《地球物理学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2018年第5期2099-2110,共12页
在地震序列的早期阶段获得科学可靠的余震预测结果,始终是地震预测研究的前沿课题.针对新近发展的Omi-R-J方法的适用性问题,以及相比于传统的Reseanberg-Jones(R-J)模型在地震序列参数拟合、余震预测效能上的差异等问题,本文以2017年四... 在地震序列的早期阶段获得科学可靠的余震预测结果,始终是地震预测研究的前沿课题.针对新近发展的Omi-R-J方法的适用性问题,以及相比于传统的Reseanberg-Jones(R-J)模型在地震序列参数拟合、余震预测效能上的差异等问题,本文以2017年四川九寨沟M_S7.0地震序列为例,利用多时间窗的连续滑动拟合、预测和检验,以及通过构建重采样随机地震序列目录的系统检验等方式,开展了应用研究和比较研究.结果表明:相比于R-J模型,Omi-R-J方法可在余震记录较不完整的地震序列早期阶段获得稳定、可靠的序列参数,p值、c值和b值的标准差相比于R-J模型参数明显减小.N-test方法检验结果表明,在R-J模型等传统方法无法获得预测结果的地震序列早期阶段,Omi-R-J方法预测结果可以较高的比例通过N-test检验,在后续时段的预测效果也明显优于R-J模型.利用随机地震序列目录的测试结果表明,余震记录完整性下降对Omi-R-J方法预测结果的影响相对较小,在全部时段的完整性下降的影响高于在部分时段的完整性下降.上述结果对进一步地将Omi-R-J方法应用在震后早期余震预测中具有一定科学借鉴意义. 展开更多
关键词 地震序列 余震预测 Omi-R-j方法 R-j模型 统计检验
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J-亚群禽白血病JL-2株的分离鉴定 被引量:10
11
作者 宋素泉 付朝阳 +3 位作者 高宏雷 王笑梅 王英 魏萍 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期345-349,共5页
近年来 ,J_亚群禽白血病的暴发流行在国内时有报道 ,在本研究中 ,自吉林某患病鸡群分离出一株病毒 ,采用特异性引物 ,经RT_PCR扩增出长度为 5 4 5bp的J_亚群禽白血病病毒特异性核苷酸片段 ;将病毒经SPF鸡胚成纤维细胞增殖 ,获取其前病毒... 近年来 ,J_亚群禽白血病的暴发流行在国内时有报道 ,在本研究中 ,自吉林某患病鸡群分离出一株病毒 ,采用特异性引物 ,经RT_PCR扩增出长度为 5 4 5bp的J_亚群禽白血病病毒特异性核苷酸片段 ;将病毒经SPF鸡胚成纤维细胞增殖 ,获取其前病毒DNA ,依据原型毒株HPRS_10 3cDNA序列设计并合成一对引物 ,经PCR扩增得到包括gp85、gp37、E_element基因在内的近 1.8kb的DNA片段 ,将其连到pMD18_T载体上 ,转化大肠杆菌JM10 9,培养后提取质粒分别用HindIII,BamHI进行单酶切和双酶切鉴定 ,得到了阳性重组质粒pMD18_T_JL2 /env ,核苷酸序列测定结果表明 ,该片段为J_亚群禽白血病病毒囊膜基因 ,其中亚型特异性片段gp 85和标准对照毒株HPRS_10 3的同源率为 94 % ,所编码氨基酸的同源率为 87%。 展开更多
关键词 j-亚群禽自血病病毒 亚型特异性片段gp85 克隆及序列测定
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血管瘤相关J亚群禽白血病病毒ZH-08株的分离与全基因组序列测定 被引量:10
12
作者 张小桃 史伟伟 +4 位作者 刘红波 张贺楠 廖明 辛朝安 曹伟胜 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期193-199,共7页
本研究从临床表现为典型血管瘤型禽白血病病例的广东某肉种鸡场的病鸡中,分离到1株J亚群禽白血病病毒(ALV-J),命名为ZH-08。利用ELISA抗原检测、PCR和间接免疫荧光试验对分离株进行鉴定,结果都呈阳性。依据ALV-J原型株HPRS-103前病毒全... 本研究从临床表现为典型血管瘤型禽白血病病例的广东某肉种鸡场的病鸡中,分离到1株J亚群禽白血病病毒(ALV-J),命名为ZH-08。利用ELISA抗原检测、PCR和间接免疫荧光试验对分离株进行鉴定,结果都呈阳性。依据ALV-J原型株HPRS-103前病毒全基因组序列设计并合成3对引物,采用分段扩增的方法完成了分离株的全基因组序列测定。结果显示该分离株基因组序列全长7 597 bp,与已公开的全基因组序列大小比较略有差异,但符合典型的复制完全型反转录病毒的基因组结构,基因序列中不含已知致癌基因。将该分离株的亚群特异性gp85基因序列与国内外各参考株相应序列进行相似性比较,发现ZH-08与YZ9901株相似性最高(93.7%)。基于gp85核苷酸序列的系统进化分析表明:ZH-08株与SD07LK1株的亲缘关系最近。本研究为该毒株的生物学特性以及致病机制研究奠定了基础。 展开更多
关键词 血管瘤 j亚群禽白血病病毒 全基因组序列 gp85
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J亚群与E亚群禽白血病自然重组病毒的全基因组序列分析 被引量:8
13
作者 刘超男 高玉龙 +4 位作者 高宏雷 祁小乐 景龙 潘伟 王笑梅 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第12期978-981,共4页
为了解我国东北地区部分养鸡场禽白血病病毒(ALV)的基因组序列特征及其变异情况,本研究从具有典型血管瘤病变的禽白血病发病鸡中分离到一株J亚群ALV(ALV-J)命名为JL0901,并进行了全基因测序。将该序列与已发表的ALV-J毒株序列进行比较研... 为了解我国东北地区部分养鸡场禽白血病病毒(ALV)的基因组序列特征及其变异情况,本研究从具有典型血管瘤病变的禽白血病发病鸡中分离到一株J亚群ALV(ALV-J)命名为JL0901,并进行了全基因测序。将该序列与已发表的ALV-J毒株序列进行比较研究,结果表明JL0901基因组的gag和pol基因相对保守,而env基因和3'端非编码区(3'UTR)的变异较大。对JL0901的env基因核苷酸序列进一步分析发现,在其gp85基因和gp37基因交界位置发生J亚群和E亚群ALV重组现象。本研究证实国内鸡群中存在J亚群和其他亚群ALV的自然重组现象,并表明国内ALV已出现新的变异趋势。 展开更多
关键词 j亚群禽白血病病毒 血管瘤 全基因序列 重组
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商品蛋鸡J亚群禽白血病病毒分离鉴定及序列分析 被引量:10
14
作者 吴晓平 钱琨 +4 位作者 秦爱建 王平平 沈海玉 邵红霞 金文杰 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期351-355,共5页
为了解商品蛋鸡群中J亚群禽白血病病毒(ALV-J)流行情况和病毒特性,本实验对感染血管瘤与髓细胞瘤混合型ALV-J的商品海兰褐蛋鸡进行了病毒分离,对2个分离株的致瘤关键基因序列LTR与gp85进行了测定,并与参考毒株进行比对,分析结果表明这... 为了解商品蛋鸡群中J亚群禽白血病病毒(ALV-J)流行情况和病毒特性,本实验对感染血管瘤与髓细胞瘤混合型ALV-J的商品海兰褐蛋鸡进行了病毒分离,对2个分离株的致瘤关键基因序列LTR与gp85进行了测定,并与参考毒株进行比对,分析结果表明这两株病毒的LTR及gp85均存在显著的变异。在这两个基因的遗传进化树中均形成一个单独的分支:LTR的U3序列与参考毒株的同源性低至89.7%~92.4%,而参考毒株之间的同源性高达90.7%~99.6%,这两株病毒的U3区变异产生了一个与肿瘤形成与转移间接相关的调控元件TCF11(Transcription Factor11),但Y box、TATA box、CArG box都很保守;两株病毒的gp85氨基酸序列均在第179位缺失一个Lys,两个毒株的gp85蛋白序列与肉鸡分离毒株之间的同源性很低,为86%~89%,而与参考蛋鸡分离毒同源性相对较近,为89.2%。本研究证实从多种肿瘤类型并发的蛋鸡自然发病病例中分离到ALV-J病毒,其关键序列发生了显著的变异。 展开更多
关键词 商品蛋鸡 j亚群白血病病毒 分离鉴定 序列分析
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乌骨鸡J亚群白血病的综合诊断及病毒分子生物学特性研究 被引量:2
15
作者 秦四海 刘立涛 +5 位作者 岳瑞超 李宁 屈亚锦 王广文 胡东方 刘思当 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期458-462,共5页
乌骨鸡是中国特有的优良品种,近年来聊城地区死淘的产蛋种鸡常见肝、脾肿大的肿瘤性疾病。2012年12月收到聊城某乌骨种鸡场送检的6只病死鸡。通过剖检观察、病理组织学检查、PCR检测及病毒分离鉴定,最终确定为J亚群白血病病毒感染所致... 乌骨鸡是中国特有的优良品种,近年来聊城地区死淘的产蛋种鸡常见肝、脾肿大的肿瘤性疾病。2012年12月收到聊城某乌骨种鸡场送检的6只病死鸡。通过剖检观察、病理组织学检查、PCR检测及病毒分离鉴定,最终确定为J亚群白血病病毒感染所致的髓样细胞瘤和血管瘤。设计4对引物,对病毒全基因序列进行扩增,得到全长为7 647bp,其中gag长2 016bp,pol基因长2 622bp,env长1 689bp。跨rTM和DR区有205bp的缺失,相当于原型株HPRS-103的7 049—7 253bp位置;在先导区序列leader区域中有1个19bp的插入序列。分离株与英国原型株HPRS-103差异较大,但与近几年国内商品蛋鸡的分离株相似性很高,可能来自商品蛋鸡。 展开更多
关键词 乌骨鸡 j亚群禽白血病 髓样细胞瘤 血管瘤 全基因序列分析
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鸡内源性类J亚群禽白血病病毒gp85基因的克隆及分析 被引量:7
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作者 杨玉莹 秦爱建 +1 位作者 顾玉芳 赵振华 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期54-59,共6页
为深入探讨J亚群禽白血病病毒(AvianleukosisvirussubgroupJ,ALV J)的亚群特性,利用ALV Jgp85基因两侧的序列片段为引物,从正常SPF蛋鸡、商品肉鸡和DF1细胞基因组中完整地扩增了内源性类ALV Jgp85基因。肉鸡和DF1细胞内源性类ALV Jgp85... 为深入探讨J亚群禽白血病病毒(AvianleukosisvirussubgroupJ,ALV J)的亚群特性,利用ALV Jgp85基因两侧的序列片段为引物,从正常SPF蛋鸡、商品肉鸡和DF1细胞基因组中完整地扩增了内源性类ALV Jgp85基因。肉鸡和DF1细胞内源性类ALV Jgp85基因同源性达99 9%;SPF蛋鸡内源性类ALV Jgp85基因与肉鸡和DF1细胞的内源性类ALV Jgp85基因之间同源性达95 6%、95 3%。三种不同来源的内源性类ALV Jgp85基因DNA与IMC10200株ALV J的gp85基因的同源性分别为91 8%、94 1%、94 0%;与ALV J原型株HPRS 103gp85基因的同源性分别为95 6%、98 3%、99 9%。内源性类ALV Jgp85序列与外源性ALV Jgp85基因具有相似或一致的ORF和Jameson Worlf抗原表位优势。 展开更多
关键词 内源性反录病毒 GP85基因 基因克隆 j亚群禽白血病病毒
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印尼J区块层序地层与沉积相特征研究 被引量:9
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作者 刘亚明 薛良清 +1 位作者 杨福忠 张春雷 《西南石油大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期45-49,共5页
利用层序地层学理论,对印尼J区块古近系—新近系的层序地层和沉积相特征进行了研究。古近系—新近系可以分为7个中期基准面旋回(SQ1-SQ7)和17个短期基准面旋回。SQ1-SQ7沉积时期,沉积环境从陆相河流环境逐渐过渡到三角洲环境和浅海环境... 利用层序地层学理论,对印尼J区块古近系—新近系的层序地层和沉积相特征进行了研究。古近系—新近系可以分为7个中期基准面旋回(SQ1-SQ7)和17个短期基准面旋回。SQ1-SQ7沉积时期,沉积环境从陆相河流环境逐渐过渡到三角洲环境和浅海环境,再到河流环境,为一完整的水进-水退旋回。中下部层序上升旋回占主体,属海进式沉积组合序列;上部层序下降旋回占主体,多为海退式沉积组合序列。结合层序特征,指出区块西部凸起带SQ5旋回的浊积砂体、基底风化壳、碳酸盐岩台地和东部斜坡带的下切谷为区块的有利勘探区带。研究结果对该盆地的石油勘探具有指导意义。 展开更多
关键词 层序地层 基准面旋回 沉积相 有利勘探区带 印尼j区块
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华北太行—燕山—辽西地区燕山期(J—K)造山过程与成矿作用 被引量:25
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作者 邓晋福 苏尚国 +6 位作者 刘翠 赵国春 赵兴国 周肃 肖庆辉 吴宗絮 耿科 《现代地质》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期232-240,共9页
太行—燕山—辽西造山带是中国东部一个重要的燕山期(J—K)Au-Mo-Pb-Zn-Ag-Cu-Fe金属成矿带,亦是燕山期煤田分布的重要地带。讨论了该区18个燕山期金属矿床及其相关的侵入体的同位素年龄,两者在时间上的总体一致性,以及重要煤田的形成... 太行—燕山—辽西造山带是中国东部一个重要的燕山期(J—K)Au-Mo-Pb-Zn-Ag-Cu-Fe金属成矿带,亦是燕山期煤田分布的重要地带。讨论了该区18个燕山期金属矿床及其相关的侵入体的同位素年龄,两者在时间上的总体一致性,以及重要煤田的形成与特征时代的沉积建造相伴生,均从年代学的约束方面提供了成矿作用与燕山期岩浆—构造事件的成因联系。在已有的燕山造山带岩浆构造事件序列的基础上,把成矿作用纳入其中,提出了该造山带燕山期岩浆—沉积—构造—成矿事件序列的初步框架。进而,从物质组成的角度,讨论了该造山带金属成矿作用与火成岩组合的成因联系;同时也讨论了成矿作用可能的源区以及成矿作用的阶段性与造山带之间的成生联系。提出了造山带与成矿作用的初步框架模型。前造山幕—初始造山幕(J1)和后造山幕(K21)比较宁静的构造环境和湿热环境为煤田形成提供良好的动力学环境。同造山幕的大规模岩浆活动为金属矿床形成提供重要背景:早期造山幕(J2)伴随古老下地壳的熔融,生成以安山质为主的岩浆活动及伴生主要的Au和Pb、Zn矿床;峰期造山幕(J3),陆壳升温达峰值,导致上地壳岩石的大规模熔融作用,形成大规模花岗质岩浆的侵入,伴生大量Mo矿;晚期造山幕(K11),“过热的”上部地壳开始降温,壳幔深部的镁铁质岩浆更多地喷出和侵入,伴生Fe矿床的形成,同时,新形成的侏罗纪下地壳熔融,伴生Cu矿。 展开更多
关键词 燕山期(j—K) 太行-燕山-辽西造山带 岩浆-沉积-构造-成矿事件序列 造山幕与成矿作用
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安徽两个鸡场ALV-J分离株gp85基因的克隆及序列分析 被引量:3
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作者 戴银 赵瑞宏 +4 位作者 胡晓苗 侯宏艳 潘孝成 周学利 张丹俊 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2013年第12期38-41,共4页
为研究J-亚群禽白血病病毒(ALV-J)在安徽省鸡群中的遗传变异趋势,对分离到的2株安徽省ALV-J毒株,克隆了其gp85基因序列,并与国内外分离毒株的相应基因序列进行了比较。结果显示,ALVJ gp85基因序列具有高度的易变性,可变氨基酸残基占全... 为研究J-亚群禽白血病病毒(ALV-J)在安徽省鸡群中的遗传变异趋势,对分离到的2株安徽省ALV-J毒株,克隆了其gp85基因序列,并与国内外分离毒株的相应基因序列进行了比较。结果显示,ALVJ gp85基因序列具有高度的易变性,可变氨基酸残基占全长序列的22.8%。其中高变区hr1和hr2具有较多的可变位点,而可变区vr2和vr3相对较为保守。二级结构预测显示ALV-J gp85蛋白含有大量的无规则卷曲结构,尤其是hr2区域。同源性分析表明,毒株AH1103和AH1104的gp85氨基酸序列同源性为95.8%;毒株AH1103与毒株BJ090201J,ev/J的gp85序列同源性最高,毒株AH1104的gp85序列则与国内毒株HuB09JY04的同源性最高。进化分析显示,毒株AH1103和AH1104均与国内毒株NX0101和SD07LK1及美国分离株4817的遗传距离较远。 展开更多
关键词 j-亚群禽白血病病毒 GP85基因 序列分析
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J亚群白血病的病理学观察及基因分析 被引量:2
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作者 成子强 哈斯阿古拉 +1 位作者 张利 赵振华 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期56-60,共5页
内蒙古某肉种鸡场 4 0周龄种鸡发生肿瘤性疾病 ,死淘率 15 % ;经病理组织学检查 ,增生的肿瘤为典型的髓细胞瘤 ,因此怀疑此病是 J亚群白血病。取病鸡肝电镜观察 ,在肝细胞胞浆膜下见有圆形的类病毒粒子存在 ;将肝病料处理后接种于鸡胚... 内蒙古某肉种鸡场 4 0周龄种鸡发生肿瘤性疾病 ,死淘率 15 % ;经病理组织学检查 ,增生的肿瘤为典型的髓细胞瘤 ,因此怀疑此病是 J亚群白血病。取病鸡肝电镜观察 ,在肝细胞胞浆膜下见有圆形的类病毒粒子存在 ;将肝病料处理后接种于鸡胚成纤维细胞 (CEF) ,经电镜观察 ,可见正出芽的病毒粒子。为进一步确诊 ,以 AL V- J原型株 HPRS- 10 3囊膜 gp85基因为基础设计特异性引物 ,以感染的 CEF基因组 DNA为模板 ,体外扩增 (PCR) gp85基因 ,结果获得了92 4 bp的相应片段。将 PCR产物进行分子克隆和序列测定 ,结果表明 ,内蒙古地区 AL V- Jgp85蛋白的推测氨基酸与AL V- J原型株 HPRS- 10 3、山东 SD990 1株、美国 ADOL- R5 - 4株及内源性病毒 EAV- HP的 gp85蛋白的氨基酸同源性分别为 97.4 0 %、95 .13%、86 .6 9%和 85 .0 6 % ,其中与 HPRS- 10 3的同源性最高 ,与 EAV- HP同源性最低。因此可以确定本研究所克隆的基因为 AL V- Jgp85基因 ,暂命名为 AL V- J- NM876 展开更多
关键词 肿瘤 病理学观察 蛋白 基因分析 电镜观察 胞浆 髓细胞 ALV-j GP85基因 j亚群白血病
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