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宫颈癌前病变患者阴道微生物群落的构成研究
被引量:
15
1
作者
丁晖
唐玲丽
+6 位作者
杨佳锦
蒋传好
吴宜林
陈建林
郭鑫武
陈明
邓中平
《中华检验医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第7期505-510,共6页
目的 探讨妇女阴道微生物群落构成与宫颈癌前病变的关系.方法 采集2014年7月至2015 年7月于中南大学湘雅二医院就诊的22名健康女性(对照)及宫颈上皮内瘤变Ⅰ级(CINⅠ)患者18例和宫颈上皮内瘤变Ⅱ/Ⅲ级(CINⅡ/Ⅲ)患者24例的阴道分...
目的 探讨妇女阴道微生物群落构成与宫颈癌前病变的关系.方法 采集2014年7月至2015 年7月于中南大学湘雅二医院就诊的22名健康女性(对照)及宫颈上皮内瘤变Ⅰ级(CINⅠ)患者18例和宫颈上皮内瘤变Ⅱ/Ⅲ级(CINⅡ/Ⅲ)患者24例的阴道分泌物,分别对每份标本进行细菌基因组DNA提取、16S rRNA V3、V4区基因扩增及采用高通量测序技术对扩增的PCR产物进行测序等步骤,再采用Uparse软件、Mothur分析流程和LefSe统计软件,分析阴道微生物群落物种丰度和结构,并对各组女性的阴道微生物群落构成进行比较.结果 CINⅡ/Ⅲ组标本的Alpha多样性指标(Chao:63±32;ACE:72±38;辛普森指数:0.70±0.27;香农指数:0.70±0.63)与对照组(Chao:48±24;ACE:54±25;辛普森指数:0.71±0.27;香农指数:0.65±0.58)比较,差异均无统计学意义(W=192,P=0.11;W=189,P=0.10;W=281,P=0.72;W=241,P=0.62);CINⅠ组样本的ACE值(85±37)和Chao值(66±25)与对照组(ACE:54±25;Chao:48±24)比较,差异有统计学意义(W=99,P=0.006;W=113,P=0.02).在门水平,对照组中阴道菌群78.69%(309 020/392 722)由厚壁菌门组成,放线菌门占16%(62 846/392 722).CINⅠ组中厚壁菌门减少至64.86%(208 422/321 318),放线菌门增加至27.71%(89 040/321 318).CINⅡ/Ⅲ组阴道菌群构成和对照组相似.在属水平,CINⅡ/Ⅲ组和对照组菌群结构相似,以乳酸杆菌为优势菌属[71.81%(307 658/418 424)],同时还包括加德纳菌属[12.91%(55 299/428 424)],其他如普雷沃菌属、奇异菌属等含量较少.在CINⅠ组中,乳酸杆菌属含量下降[56.26%(180 787/321 318)],加德纳菌属相对丰度上升[19.62%(63 057/321 318)],奇异菌属含量上升[7.7%(24 746/321 318)].本研究发现大部分样本阴道菌群类型(CST)为CSTⅢ、CSTⅠ,分别以惰性乳杆菌、卷曲乳杆菌为优势菌.3组间阴道菌群类型差异无统计学意义(χ2=2.72, P=0.949).LEfSe分析发现CIN组和对照组中某些细菌类群丰度发生变化.在属水平,地杆菌属、奇异菌属、脲原体属等丰度差异有统计学意义(P〈0.05;P〈0.05;P〈0.01).在种水平,血清9型解脲脲原体丰度差异有统计学意义(P〈0.01).结论 不同级别CIN患者阴道菌群多样性及菌群类型与健康妇女相似,但部分细菌类群丰度发生了改变;解脲脲原体等条件致病菌在CIN患者丰度增加.
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关键词
宫颈肿瘤
宫颈上皮内瘤样病变
阴道
微生物群落
高通量核苷酸序列分析
原文传递
题名
宫颈癌前病变患者阴道微生物群落的构成研究
被引量:
15
1
作者
丁晖
唐玲丽
杨佳锦
蒋传好
吴宜林
陈建林
郭鑫武
陈明
邓中平
机构
中南大学湘雅二医院妇产科
中南大学湘雅二医院检验科
湖南圣维基因科技有限公司
湖南圣湘生物科技有限公司
出处
《中华检验医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第7期505-510,共6页
基金
国家自然科学基金(31670178)
湖南省发改委课题(201583)
湖南省卫计委课题(B2015-026)
文摘
目的 探讨妇女阴道微生物群落构成与宫颈癌前病变的关系.方法 采集2014年7月至2015 年7月于中南大学湘雅二医院就诊的22名健康女性(对照)及宫颈上皮内瘤变Ⅰ级(CINⅠ)患者18例和宫颈上皮内瘤变Ⅱ/Ⅲ级(CINⅡ/Ⅲ)患者24例的阴道分泌物,分别对每份标本进行细菌基因组DNA提取、16S rRNA V3、V4区基因扩增及采用高通量测序技术对扩增的PCR产物进行测序等步骤,再采用Uparse软件、Mothur分析流程和LefSe统计软件,分析阴道微生物群落物种丰度和结构,并对各组女性的阴道微生物群落构成进行比较.结果 CINⅡ/Ⅲ组标本的Alpha多样性指标(Chao:63±32;ACE:72±38;辛普森指数:0.70±0.27;香农指数:0.70±0.63)与对照组(Chao:48±24;ACE:54±25;辛普森指数:0.71±0.27;香农指数:0.65±0.58)比较,差异均无统计学意义(W=192,P=0.11;W=189,P=0.10;W=281,P=0.72;W=241,P=0.62);CINⅠ组样本的ACE值(85±37)和Chao值(66±25)与对照组(ACE:54±25;Chao:48±24)比较,差异有统计学意义(W=99,P=0.006;W=113,P=0.02).在门水平,对照组中阴道菌群78.69%(309 020/392 722)由厚壁菌门组成,放线菌门占16%(62 846/392 722).CINⅠ组中厚壁菌门减少至64.86%(208 422/321 318),放线菌门增加至27.71%(89 040/321 318).CINⅡ/Ⅲ组阴道菌群构成和对照组相似.在属水平,CINⅡ/Ⅲ组和对照组菌群结构相似,以乳酸杆菌为优势菌属[71.81%(307 658/418 424)],同时还包括加德纳菌属[12.91%(55 299/428 424)],其他如普雷沃菌属、奇异菌属等含量较少.在CINⅠ组中,乳酸杆菌属含量下降[56.26%(180 787/321 318)],加德纳菌属相对丰度上升[19.62%(63 057/321 318)],奇异菌属含量上升[7.7%(24 746/321 318)].本研究发现大部分样本阴道菌群类型(CST)为CSTⅢ、CSTⅠ,分别以惰性乳杆菌、卷曲乳杆菌为优势菌.3组间阴道菌群类型差异无统计学意义(χ2=2.72, P=0.949).LEfSe分析发现CIN组和对照组中某些细菌类群丰度发生变化.在属水平,地杆菌属、奇异菌属、脲原体属等丰度差异有统计学意义(P〈0.05;P〈0.05;P〈0.01).在种水平,血清9型解脲脲原体丰度差异有统计学意义(P〈0.01).结论 不同级别CIN患者阴道菌群多样性及菌群类型与健康妇女相似,但部分细菌类群丰度发生了改变;解脲脲原体等条件致病菌在CIN患者丰度增加.
关键词
宫颈肿瘤
宫颈上皮内瘤样病变
阴道
微生物群落
高通量核苷酸序列分析
Keywords
Uterine cervical neoplasms
Cervical intraepitheliai neoplasi
Vagina
microbialconsortia
High-throughput nucleotide sequencing
分类号
R737.33 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
宫颈癌前病变患者阴道微生物群落的构成研究
丁晖
唐玲丽
杨佳锦
蒋传好
吴宜林
陈建林
郭鑫武
陈明
邓中平
《中华检验医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2017
15
原文传递
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