为了解贵州省部分鸭场环境中细菌群落结构多样性概况,试验采用变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术对贵州省三穗县8个鸭场24份水样样本中细菌群落组成和优势菌群进行分析,并建立DGGE指纹图谱,细菌16S r DNA V3区特异性片段经DGGE凝胶分离...为了解贵州省部分鸭场环境中细菌群落结构多样性概况,试验采用变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术对贵州省三穗县8个鸭场24份水样样本中细菌群落组成和优势菌群进行分析,并建立DGGE指纹图谱,细菌16S r DNA V3区特异性片段经DGGE凝胶分离、切胶、测序及Quantity One软件分析。结果表明:共有30条特异性条带,测序可见17条条带归属于变形菌门(Proteobacteria)细菌种属,3条条带属于厚壁菌门(Firmicutes)细菌种属,2条条带属于酸杆菌门(Acidobacteria)细菌种属,另外有8条条带未确定细菌种属。DGGE图谱可见条带5,11,12出现在1~6号鸭场水样样本中,表明该细菌种属为1~6号鸭场的优势菌属;而条带1,2,3均出现在1~8号鸭场水样样本中,表明这三种细菌种属均为8个鸭场的优势细菌种属。说明应用PCR-DGGE技术能够客观反映出鸭场环境中真实的细菌群落结构信息,鸭场环境中微生物多样性十分丰富。展开更多
目的比较老年人不同大便性状与肠道菌群间的相关性。方法将23例老年患者根据bristol大便分型分成便秘组(13例)及便溏组(10例),并同期选择9例健康人群为对照组。留取新鲜粪便样本并提取DNA,对细菌16S r DNA基因V4区进行粪便微生物DNA测序...目的比较老年人不同大便性状与肠道菌群间的相关性。方法将23例老年患者根据bristol大便分型分成便秘组(13例)及便溏组(10例),并同期选择9例健康人群为对照组。留取新鲜粪便样本并提取DNA,对细菌16S r DNA基因V4区进行粪便微生物DNA测序,对测序结果进行生物信息学分析。同时,采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测肿瘤坏死因子α(TNF-α)、白细胞介素10(IL-10)、IL-17、IL-22、白三烯B4(LTB-4)及前列腺素E2(PGE2)水平。采用Spearman法分析肠道菌群相对丰度与大便性状的相关性。结果三组患者间Shannon指数和Simpson指数比较,差异均有统计学意义(H=8.449,P=0.015;H=6.884,P=0.032),且便秘组患者Shannon指数[6.4(5.8,6.6)vs. 5.0(4.8,5.6)]和Simpson指数[0.95(0.93,0.97)vs. 0.88(0.83,0.94)]均显著高于便溏组患者(P均<0.05)。但三组患者间Ace指数和Chao指数比较,差异均无统计学意义(H=3.821,P=0.148;H=3.516,P=0.172)。三组患者间柯林斯均属(H=6.599,P=0.037)、丁酸弧菌属(H=8.707,P=0.013)、嗜胆菌属(H=7.354,P=0.025)、厌氧棍状均属(H=6.179,P=0.046)、巨球形均属(H=6.095,P=0.047)的相对丰度比较,差异均有统计学意义。而三组患者间TNF-α、IL-10、IL-17、IL-22、LTB-4及PGE2的比较,差异均无统计学意义(F=0.442、1.034、3.217、0.957、0.595、1.440,P均> 0.05)。同时,柯林斯菌属、丁酸弧菌属、嗜胆菌属、厌氧棍状菌属与大便稠度显著正相关(r=0.455、0.415、0.449、0.411,P=0.009、0.018、0.010、0.019)。结论在老年人中,大便性状的不同与肠道菌群的变化有关。展开更多
文摘为了解贵州省部分鸭场环境中细菌群落结构多样性概况,试验采用变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术对贵州省三穗县8个鸭场24份水样样本中细菌群落组成和优势菌群进行分析,并建立DGGE指纹图谱,细菌16S r DNA V3区特异性片段经DGGE凝胶分离、切胶、测序及Quantity One软件分析。结果表明:共有30条特异性条带,测序可见17条条带归属于变形菌门(Proteobacteria)细菌种属,3条条带属于厚壁菌门(Firmicutes)细菌种属,2条条带属于酸杆菌门(Acidobacteria)细菌种属,另外有8条条带未确定细菌种属。DGGE图谱可见条带5,11,12出现在1~6号鸭场水样样本中,表明该细菌种属为1~6号鸭场的优势菌属;而条带1,2,3均出现在1~8号鸭场水样样本中,表明这三种细菌种属均为8个鸭场的优势细菌种属。说明应用PCR-DGGE技术能够客观反映出鸭场环境中真实的细菌群落结构信息,鸭场环境中微生物多样性十分丰富。