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Molecular Scaffold Growth of Two-Dimensional, Strong Interlayer-Bonding-Layered Materials
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作者 Mengqi Zeng Yunxu Chen +17 位作者 Enze Zhang Jiaxu Li Rafael G.Mendes Xiahan Sang Shulin Luo Wenmei Ming Yuhao Fu Mao-Hua Du Lijun Zhang David S.Parker Raymond R.Unocic Kai Xiao Chenglai Wang Tao Zhang Yao Xiao Mark H,Rummeli Faxian Xiu Lei Fu 《CCS Chemistry》 CAS 2019年第1期117-127,共11页
Currently,most two-dimensional(2D)materials that are of interest to emergent applications have focused on van der Waals–layered materials(VLMs)because of the ease with which the layers can be separated(e.g.,graphene)... Currently,most two-dimensional(2D)materials that are of interest to emergent applications have focused on van der Waals–layered materials(VLMs)because of the ease with which the layers can be separated(e.g.,graphene).Strong interlayer-bonding-layered materials(SLMs)in general have not been thoroughly explored,and one of the most critical present issues is the huge challenge of their preparation,although their physicochemical proper-ty transformation should be richer than VLMs and deserves greater attention.MAX phases are a classi-cal kind of SLM. 展开更多
关键词 2D MAX phase crystals strong interlayer bonding molecular scaffold chemical vapor deposition
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Effect of Molecular Weight of PCL on the Structure and Mechanical Properties of PCL/PET Composite Vascular Scaffold Prototype
2
作者 李超婧 MOHAMMED Abedalwafa +3 位作者 王富军 葛鹏 陈培峰 王璐 《Journal of Donghua University(English Edition)》 EI CAS 2013年第5期451-454,共4页
A new scaffold has been developed,which made from poly(ε-caprolactone)( PCL) membrane with porous structure,and reinforcement of PCL scaffold was achieved by embedding polyethylene terephthalate(PET) weft-knit tubula... A new scaffold has been developed,which made from poly(ε-caprolactone)( PCL) membrane with porous structure,and reinforcement of PCL scaffold was achieved by embedding polyethylene terephthalate(PET) weft-knit tubular fabric. The aim of this paper is to study the variation tendency of the morphology and the mechanical properties of the sample with the changing of molecular weight. Weighing method was used to analyze the porosity of the sample,and scanning electron microscopy( SEM) images were taken to observe porous structure. The tensile and compressive strengths of the samples were tested by the universal mechanical tester and radial compression apparatus, respectively. And the results showed that the porosity and compressive strength were improved when increasing the molecular weight,and the elastic recovery rate was also improved slightly. However, molecular weight has little impact on the tensile strength properties,because the PET tubular fabric provides most of the strength support rather than PCL membrane. 展开更多
关键词 poly(ε-caprolactone)(PCL) molecular weight porous STRUCTURE MECHANICAL properties VASCULAR scaffold
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生物质热解木醋液成分解析及分子结构研究
3
作者 秦涛 马翠翠 《北京联合大学学报》 CAS 2024年第2期66-71,共6页
[目的]分析生物质热解木醋液的成分并进行化学信息学解析,探究木醋液中化合物的结构与功能的关系。[方法]通过对木醋液的理化性质、不同前处理方法得到的有机组分进行测定并对其进行化学信息学分析、25种化学描述符的计算、化学空间的... [目的]分析生物质热解木醋液的成分并进行化学信息学解析,探究木醋液中化合物的结构与功能的关系。[方法]通过对木醋液的理化性质、不同前处理方法得到的有机组分进行测定并对其进行化学信息学分析、25种化学描述符的计算、化学空间的构建及分子骨架的聚类分析等。[结果]实验测定了松木锯末来源木醋液的组成成分,发现最佳的前处理方法为真空冷冻干燥法。化学描述符计算分析结果表明,木醋液以小分子活性物质为主,包括酸类、酚类、醛类、酯类等功能化合物;通过化学空间构建,印证了木醋液组分化学结构相似性高并存在较大的聚类性,还识别出苯环分子骨架是最大频率的分子片段等。以上结果为木醋液产品功能的深入研究提供了借鉴和指导。 展开更多
关键词 木醋液 成分解析 化学空间 分子骨架
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石墨烯及其衍生物对血管生成和血管化骨的影响机制
4
作者 高丽 刘浏 +2 位作者 任文燕 刘雪 王一宇 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2024年第17期2716-2722,共7页
背景:石墨烯是最薄、最强韧的一类二维新型晶体材料,在生物医学的应用中显示出巨大的优势。血管生成和血管化骨是组织修复和再生的关键,是解决血管和成骨问题的有效途径。目的:综述石墨烯及其衍生物促进血管生成和血管化骨的特性及机制... 背景:石墨烯是最薄、最强韧的一类二维新型晶体材料,在生物医学的应用中显示出巨大的优势。血管生成和血管化骨是组织修复和再生的关键,是解决血管和成骨问题的有效途径。目的:综述石墨烯及其衍生物促进血管生成和血管化骨的特性及机制,为其在血管化组织修复与再生的临床应用提供参考。方法:利用计算机检索PubMed、ScienceDirect、中国知网和万方数据库收录的相关文献,中文检索词为“石墨烯,血管生成,血管化,血管化骨,内皮细胞”,英文检索词为“graphene,Angiogenesis OR Vascularization,Vascularized bone,endothelial cells”。排除与文章主题不相关的文献,根据纳入标准和排除标准,最终纳入62篇文献进行结果分析。结果与结论:①目前氧化石墨烯在石墨烯及其衍生物中的研究较多,应用最为广泛。②石墨烯及其衍生物适用于心脏、骨、神经和创伤愈合等相关疾病。③石墨烯及其衍生物有优异的理化性能和生物学性能,但其存在潜在的细胞毒性,在应用中需注意其生物安全性。④石墨烯及其衍生物的应用还需要进一步的研究来证明其最适尺寸和浓度及降低毒性的措施。⑤就细胞层面而言,石墨烯及其衍生物可以通过促进尖端内皮细胞表型、间充质干细胞黏附和增殖、血管平滑肌细胞的生长,从而促进血管生成活性。⑥就分子层面而言,石墨烯及其衍生物可以增加血管内皮生长因子、碱性成纤维细胞生长因子及肝细胞生长因子等的表达并活化活性氧/一氧化氮合酶/一氧化氮信号通路、溶血磷脂酸R6/Hippo-YAP通路、基质细胞衍生因子1/血管内皮生长因子和ZEB1/Notch1通路。⑦氧化石墨烯和氧化石墨烯-铜可以磷酸化细胞外调节蛋白激酶并激活缺氧诱导因子1,进而促进血管内皮生长因子和骨形态生成蛋白2的表达上调,从而促进血管生成和血管化骨。⑧因此,石墨烯及其衍生物特别是氧化石墨烯由于具有优良的生物学性能、良好的促血管生成及促血管化骨能力,在血管化组织修复与再生方面有很大的应用前景。 展开更多
关键词 石墨烯及其衍生物 血管化 血管生成 血管化骨 内皮细胞 支架材料 分子机制 信号通路
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LncRNA的结构、功能及其与疾病的关系 被引量:33
5
作者 王婷梅 曲丽娜 李莹辉 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第7期659-666,共8页
70%的人类基因组能够被转录,而其中仅有1%~2%的转录本能够编码蛋白,余下98%均为非编码RNA(non-codingRNA,ncRNA).在ncRNA中,长度大于200核苷酸称为长链非编码RNA(long non-codingRNA,LncRNA),占全部ncRNA的80%-90%.L... 70%的人类基因组能够被转录,而其中仅有1%~2%的转录本能够编码蛋白,余下98%均为非编码RNA(non-codingRNA,ncRNA).在ncRNA中,长度大于200核苷酸称为长链非编码RNA(long non-codingRNA,LncRNA),占全部ncRNA的80%-90%.LncRNA除了数量庞大以外,还具有表达量较低、物种间保守性较差及细胞表达特异性等特点,使LncRNA结构及作用机制等研究充满挑战.目前关于LncRNA的研究主要集中于功能方面.LncRNA能够广泛参与生物体的各种生理及病理过程,如表观遗传学调控、癌症、神经系统功能等.LncRNA作用机制众多,能够以分子诱饵、分子向导、分子支架及信号通路的调节剂等多种角色参与调节机体各种生物学过程.解析LncRNA的分子结构、深入研究其在生物体生理及病理过程中所发挥的作用,并揭示其作用机制,不仅能够加深对生物体生理及病理过程的认识,同时也能给某些疾病的诊断、防治提供新的思路及解决途径.本文综述了近年来有关LncRNA结构、功能及作用机制相关研究进展,以期为后续LncRNA相关研究提供参考. 展开更多
关键词 长链非编码RNA 表观遗传学 可变剪切 分子支架 分子向导
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药物发现中常用化合物库特征描述与对比分析 被引量:2
6
作者 丁新强 武治印 +1 位作者 金宏威 刘振明 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2012年第10期2401-2410,共10页
随着计算技术的发展和分子模拟软件的日趋成熟,虚拟筛选已经在药物发现过程中发挥着越来越重要的作用.在虚拟筛选过程中,所使用化合物库的质量对先导化合物发现的成功率起着至关重要的作用.本文通过对已知药物库、天然产物库、中药原植... 随着计算技术的发展和分子模拟软件的日趋成熟,虚拟筛选已经在药物发现过程中发挥着越来越重要的作用.在虚拟筛选过程中,所使用化合物库的质量对先导化合物发现的成功率起着至关重要的作用.本文通过对已知药物库、天然产物库、中药原植物化学成分库、筛选常用商业化合物库以及研究者所在实验室建立的化合物库的分析比较,从化合物库的分子多样性、化学空间和分子骨架等多个方面提取并对比每一种化合物库的特征,发现了已知药物库与中药原植物化学成分库的特征相似性,揭示了中药原植物化学成分库作为筛选库的类药性优势,并且深化了对几种筛选用化合物库特征的认识和理解. 展开更多
关键词 虚拟筛选 化合物库 分子多样性 化学空间 分子骨架
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农药的化学信息学分析 被引量:1
7
作者 尤春 胡奔 +1 位作者 吴萍 孔德信 《农药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期482-488,共7页
从大英农作物生产研究会e-农药手册(The e-Pesticide Manual V5.0)中提取了1 478个各类农药,利用化学信息学方法对比了农药与临床药物在物理化学性质、分子骨架等方面的差异,分析了二者在化学空间中的分布特点。结果表明:农药具有相对... 从大英农作物生产研究会e-农药手册(The e-Pesticide Manual V5.0)中提取了1 478个各类农药,利用化学信息学方法对比了农药与临床药物在物理化学性质、分子骨架等方面的差异,分析了二者在化学空间中的分布特点。结果表明:农药具有相对较低的相对分子质量和较高的脂溶性,其F、Cl、P等元素含量明显高于临床药物;在分子骨架和化学空间分布上二者也有着显著差异。因此,在将医药研发的技术应用到农药研发时,应根据农药的特点适当调整设计或计算参数。 展开更多
关键词 农药 临床药物 化学空间 分子骨架 描述符
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利用蝎毒素分子骨架的蛋白质工程 被引量:6
8
作者 柴志芳 吉永华 《生命科学》 CSCD 2003年第5期317-320,共4页
利用蝎毒素的α/β骨架设计新的多肽和蛋白质,不仅对于研究毒素本身结构和功能多样性十分重要,同时也为设计和开发新的多肽类药物提供了广阔的前景。本文就该领域的一些概况做一简要的介绍。
关键词 蝎毒素 分子骨架 肽类药物
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The degradation behavior of silk fibroin derived from different ionic liquid solvents 被引量:6
9
作者 Renchuan You Ying Zhang +2 位作者 Yu Liu Guiyang Liu Mingzhong Li 《Natural Science》 2013年第6期10-19,共10页
Establishing an appropriate degradation rate is critical for tissue engineering scaffolds. In this study, the degradation rate of silk fibroin three-dimensional scaffolds was regulated by changing the molecular weight... Establishing an appropriate degradation rate is critical for tissue engineering scaffolds. In this study, the degradation rate of silk fibroin three-dimensional scaffolds was regulated by changing the molecular weight (MW) of the silk fibroin. The solubility of silk fibroin depends primarily on the ionic ability of the slovent to dissolve silk fibroin, therefore, we regulated the MW of the silk fibroin using LiBr, Ca(NO3)2 and CaCl2 to dissolve the silk fibers. SDS-PAGE analysis showed that the MW of the CaCl2-derived silk fibroin was lower than the MW produced using LiBr and Ca(NO3)2. In vitro and in vivo degradation results showed that the scaffolds prepared by low-MW silk fibroin were more rapidly degraded. Furthermore, FTIR and amino acid analysis suggested that the amorphous regions were preferentially degraded by Collagenase IA, while the SDS-PAGE and amino acid analysis indicated that the scaffolds were degraded into polypeptides (mainly at 10-30 kDa) and amino acids. Because the CaCl2-derived scaffolds contained abundant low MW polypeptides, inter-intramolecular entanglement and traversing of molecular chains in the crystallites reduced, which resulted in rapid degradation. The in vivo degradation results suggested that the degradation rate of the CaCl2-derived scaffolds was better matched to dermis regeneration, indicating that the degradation rate of silk fibroin can be effectively regulated by changing the MW to achieve a suitable dermal tissue regeneration rate. 展开更多
关键词 SILK Fibroin molecular WEIGHT scaffolds DEGRADATION SKIN TISSUE Engineering
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噻唑类葡萄糖激酶激动药的三维定量构效关系与理性设计 被引量:3
10
作者 梁佳龙 张悦弘 +3 位作者 吴永新 张鑫磊 张东旭 刘雪英 《中国药师》 CAS 2019年第9期1711-1716,共6页
目的:构建噻唑类葡萄糖激酶(GK)激动药的三维定量构效关系(3D-QSAR),并进行理性设计。方法:运用比较分子力场分析(Co MFA)的方法,构建噻唑类GK激动药的3D-QSAR模型,通过晶体复合物结构对模型进行验证。对复合物中配体激动剂进行基于片... 目的:构建噻唑类葡萄糖激酶(GK)激动药的三维定量构效关系(3D-QSAR),并进行理性设计。方法:运用比较分子力场分析(Co MFA)的方法,构建噻唑类GK激动药的3D-QSAR模型,通过晶体复合物结构对模型进行验证。对复合物中配体激动剂进行基于片段生长的理性设计,预测所设计分子的活性、药代动力学性质及毒性。结果:高精度的GK激动剂的3DQSAR模型为Co MFA:q^2=0.673,r^2=0.908;其中q^2为交叉验证系数,r^2为非交叉验证系数,激动药与受体蛋白之间的作用模式结果与构建的模型表现一致,18号化合物为全新化合物。结论:GK激动药的3D-QSAR模型可为GK激动药提供理性设计的理论基础,设计得到的分子口服吸收良好、生物预测活性较高,有望成为新的抗2型糖尿病药物分子。 展开更多
关键词 葡萄糖激酶 2型糖尿病 三维定量构效关系 比较分子力场分析 基于片段生长的理性分子设计
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基于药效团和分子对接的FLT3抑制剂筛选方法
11
作者 杨婷 付磊 +4 位作者 李燕楠 刘利 杨金波 初燕燕 邱培菊 《中国海洋药物》 CAS CSCD 2023年第3期10-22,共13页
目的建立虚拟筛选与生物检测相结合的方法来筛选FLT3抑制剂。方法建立了基于药效团和对接的虚拟筛选方法用于筛选靶向FLT3的化合物,并建立FLT3-ITD过表达的细胞模型进一步验证抑制剂的药效及作用机制。结果通过筛选商业化合物库,成功发... 目的建立虚拟筛选与生物检测相结合的方法来筛选FLT3抑制剂。方法建立了基于药效团和对接的虚拟筛选方法用于筛选靶向FLT3的化合物,并建立FLT3-ITD过表达的细胞模型进一步验证抑制剂的药效及作用机制。结果通过筛选商业化合物库,成功发现了1个含有3-苯基吡唑并[1,5-a]嘧啶骨架的化合物(命名74),可以选择性地抑制表达FLT3-ITD的BaF3细胞和AML细胞增殖。进一步研究表明,在细胞实验中,74也能克服FLT3-ITD-D835V、-D835Y、-F691L、-N676K等二次突变。机制研究表明,74通过抑制FLT3介导的通路抑制AML细胞的生长。结论74是1个潜在的抑制FLT3-ITD的苗头分子,它的发现验证了FLT3筛选方法的准确性,并可用来寻找海洋来源的FLT3抑制剂。 展开更多
关键词 急性髓系白血病 FLT3-ITD 3-苯基吡唑并[1 5-a]嘧啶骨架 分子对接 海洋药物
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信号转导系统中的蛋白质
12
作者 倪福太 范艳琴 《吉林师范大学学报(自然科学版)》 2005年第1期17-19,共3页
在信号转导系统中,存在许多重要的蛋白质,G蛋白,Ras蛋白起到分子开关的作用;CKI1和GCR1可能作为细胞分裂素的受体,参与细胞分裂素的信号转导;支架蛋白是本身不具有酶活性的蛋白质,作用类似于分子胶水,将功能相关的蛋白粘合在一起,保证... 在信号转导系统中,存在许多重要的蛋白质,G蛋白,Ras蛋白起到分子开关的作用;CKI1和GCR1可能作为细胞分裂素的受体,参与细胞分裂素的信号转导;支架蛋白是本身不具有酶活性的蛋白质,作用类似于分子胶水,将功能相关的蛋白粘合在一起,保证信号转导特异高效;接头蛋白c-Crk参与受体酪氨酸激酶的信号转导;卷须蛋白1,参与信号转导的上游事件,对分生组织进行调控. 展开更多
关键词 信号转导系统 蛋白质 受体酪氨酸激酶 细胞分裂素 RAS蛋白 分子开关 支架蛋白 分生组织 G蛋白 蛋白c
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基于天然产物骨架的分子离子识别体系 被引量:1
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作者 武金丹 巨勇 《化学进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2013年第11期1888-1897,共10页
具有结构多样性的天然产物,因其生理活性独特,在药物方面发挥了重要的作用。近年来,利用天然产物手性骨架、生物相容性以及多修饰位点的特性,进行结构改造和官能团的引入,设计合成的新型天然产物骨架有机功能分子,在阳离子识别、阴离子... 具有结构多样性的天然产物,因其生理活性独特,在药物方面发挥了重要的作用。近年来,利用天然产物手性骨架、生物相容性以及多修饰位点的特性,进行结构改造和官能团的引入,设计合成的新型天然产物骨架有机功能分子,在阳离子识别、阴离子识别、离子的双响应性识别及分子识别等领域中都发挥了重要作用,成为新型功能分子的研究热点之一。本文介绍近年来以天然产物为骨架设计合成的新型功能分子在分子、离子识别方面的研究现状及其发展前景。 展开更多
关键词 天然产物 手性识别 分子骨架 功能分子 分子离子识别
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分子骨架在族性结构处理中的应用研究(英文)
14
作者 杜世清 徐亮 程文堂 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期503-507,共5页
利用计算机表示、存储和匹配族性结构面临的一个难题是如何将族性结构展开到一个合适的程度,既能避免过度枚举又包含族性结构应有的信息,本文根据族性结构特点,设计了一个程序用来提取族性结构中的环和环之间的连接片段,然后生成族性结... 利用计算机表示、存储和匹配族性结构面临的一个难题是如何将族性结构展开到一个合适的程度,既能避免过度枚举又包含族性结构应有的信息,本文根据族性结构特点,设计了一个程序用来提取族性结构中的环和环之间的连接片段,然后生成族性结构的分子骨架及相应的还原图,利用SMILES线性编码存储族性结构主要信息,避免了大部分的枚举。 展开更多
关键词 分子骨架 结构处理 族性结构 应用 线性编码 计算机 结构面 存储 信息 枚举
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自组装肽纳米纤维支架用于骨修复的研究进展 被引量:2
15
作者 何彬 袁霄 +1 位作者 张华 蒋电明 《中国修复重建外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第10期1303-1306,共4页
目的对自组装肽纳米纤维支架的生物学特性及用于骨修复的研究进展进行综述。方法广泛查阅近年国内外有关自组装肽纳米纤维支架和骨修复研究的文献,并进行综合分析和总结。结果自组装肽纳米纤维支架由氨基酸构成,具有良好的生物相容性,... 目的对自组装肽纳米纤维支架的生物学特性及用于骨修复的研究进展进行综述。方法广泛查阅近年国内外有关自组装肽纳米纤维支架和骨修复研究的文献,并进行综合分析和总结。结果自组装肽纳米纤维支架由氨基酸构成,具有良好的生物相容性,其降解产物无毒性。自组装肽纳米纤维形成的微环境与细胞外基质高度相似,且生长因子的控释和功能基序的修饰显著提高了该材料的生物活性。大量体外细胞复合培养及动物体内骨缺损修复实验结果显示,该支架可促进细胞的黏附、增殖和分化,且有利于体内新骨组织形成。结论自组装肽纳米纤维支架有望成为理想的骨修复材料,但其生物力学性能有待进一步提高。 展开更多
关键词 分子自组装 自组装肽纳米纤维支架 骨修复
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铁蛋白的生物工程应用 被引量:5
16
作者 王玲 吴洋 +1 位作者 张盛 齐浩 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期77-85,共9页
铁蛋白是一种普遍存在于生物体内的储铁蛋白,具有铁离子代谢、抗氧化胁迫及消除其他过量金属离子毒害作用的功能。随着对铁蛋白结构和生化功能认识的深入,铁蛋白作为一个含有四氧化三铁核心的特殊蛋白复合体,被广泛应用于生物医学、纳... 铁蛋白是一种普遍存在于生物体内的储铁蛋白,具有铁离子代谢、抗氧化胁迫及消除其他过量金属离子毒害作用的功能。随着对铁蛋白结构和生化功能认识的深入,铁蛋白作为一个含有四氧化三铁核心的特殊蛋白复合体,被广泛应用于生物医学、纳米材料、生物分子成像等各种生物工程领域。该综述针对已知的主要铁蛋白分子,论述了铁蛋白的结构及酶活性机理,基于铁蛋白的多功能分子骨架应用,以及基于铁蛋白磁性的生物分子开关等热点研究,最后对铁蛋白生物工程、生物医学领域的应用和发展进行了展望。 展开更多
关键词 铁蛋白 磁性颗粒 分子骨架
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组织工程骨支架微宏观模拟分析 被引量:2
17
作者 赵光元 许燕 +1 位作者 周建平 徐国强 《机械设计与研究》 CSCD 北大核心 2018年第3期158-162,166,共6页
应用沉积挤出快速成型技术制备组织工程骨支架过程中,复合生物材料之间相互作用的稳定性、喷头装置中复合凝胶的流动状态及制备工艺参数影响组织工程骨支架成型及成型后骨支架力学性能和孔隙结构。针对以上问题,应用分子动力学模拟软件M... 应用沉积挤出快速成型技术制备组织工程骨支架过程中,复合生物材料之间相互作用的稳定性、喷头装置中复合凝胶的流动状态及制备工艺参数影响组织工程骨支架成型及成型后骨支架力学性能和孔隙结构。针对以上问题,应用分子动力学模拟软件Materials studio中经典力学工具Forcite对羟基磷灰石(HA)/聚乙烯醇(PVA)/丝素蛋白(SF)共混体系进行模拟,分析羟基磷灰石与生物复合凝胶聚乙烯醇/丝素蛋白相互作用后稳定性。结合三者混合材料特性,通过有限元模拟软件FLUENT分析复合生物材料的流动状态,依据流体分析结果,调整制备骨支架工艺参数。模拟结果表明,HA/PVA/SF三者混合材料具有良好粘结性及力学性能;有限元模拟计算出高粘度材料制备过程中流体状态分布。通过实验,结合流体分布状态,调整最佳制备参数,制备的骨支架具有良好的力学性能,混合生物材料成分基本未发生变化,表面微观孔隙能够达到生物因子驻留和营养物质交换的要求。 展开更多
关键词 快速成型技术 骨支架 力学性能 孔隙结构 分子动力学 有限元模拟
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新型冠状病毒木瓜样蛋白酶抑制剂的虚拟筛选与活性验证
18
作者 汪益妃 乔婧昕 +1 位作者 黎文培 李琳丽 《华西药学杂志》 CAS CSCD 2022年第1期1-5,共5页
目的通过分子对接的虚拟筛选和体外酶活性测试,获得具有新型骨架结构的新型冠状病毒木瓜样蛋白酶(PL^(pro))抑制剂。方法利用分子对接筛选商业化合物库与自有化合物库,根据打分排序以及相互作用模式分析,挑选苗头化合物,通过荧光共振能... 目的通过分子对接的虚拟筛选和体外酶活性测试,获得具有新型骨架结构的新型冠状病毒木瓜样蛋白酶(PL^(pro))抑制剂。方法利用分子对接筛选商业化合物库与自有化合物库,根据打分排序以及相互作用模式分析,挑选苗头化合物,通过荧光共振能量转移法测定化合物对PL^(pro)酶活性的抑制效力。结果从分子对接后的打分排序以及相互作用模式分析中,挑选了20个分子。通过FRET方法测试酶活性,发现了2个化合物(Y949、C528)对新型冠状病毒PL^(pro)具有抑制活性,其半数最大抑制浓度分别为97.7、145.0μmol·L^(-1)。结论通过虚拟筛选和体外酶活性测试,获得了两个具有新骨架结构的PL^(pro)抑制剂,为靶向PL^(pro)抗新型冠状病毒创新药物的研发提供了苗头化合物。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 非结构蛋白 木瓜样蛋白酶 虚拟筛选 分子对接 活性验证 小分子抑制剂 新型骨架
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套索肽研究进展
19
作者 李欣芮 陆美玲 《药物生物技术》 CAS 2020年第6期587-593,共7页
套索肽(Lassopeptide)是一类由核糖体合成并经过翻译后修饰的天然肽类产物(RiPPs),其C端穿过N端内酰胺环形成套索结构,这种刚性和折叠结构赋予了套索肽抗化学、热及蛋白酶水解等的强稳定性,同时这种特性也使得套索肽可作为生物活性化合... 套索肽(Lassopeptide)是一类由核糖体合成并经过翻译后修饰的天然肽类产物(RiPPs),其C端穿过N端内酰胺环形成套索结构,这种刚性和折叠结构赋予了套索肽抗化学、热及蛋白酶水解等的强稳定性,同时这种特性也使得套索肽可作为生物活性化合物的分子支架。研究表明套索肽具有受体拮抗、酶抑制及抗菌活性等一系列生物活性。目前通过异源表达获取套索肽生物合成相关蛋白进行体外反应实验,已帮助阐明了一小部分套索肽生物合成机制,但由于参与套索肽进行环化的C一直难于表达纯化,阻碍了对套索肽生物合成过程中最关键的成环机制的深入了解及阐明,仍需科研人员的进一步研究。 展开更多
关键词 套索肽 功能 生物活性 分子支架 生物合成基因簇 生物合成机制
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基于SW-100结构的新型HDAC6抑制剂的设计、合成及活性研究
20
作者 韩博 顾秀 +2 位作者 焦民茹 张浩 张庆伟 《中国医药工业杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期329-334,344,共7页
以已报道的组蛋白脱乙酰酶(HDAC)6抑制剂SW-100为先导化合物,采用骨架跃迁策略设计新型HDAC6抑制剂,共设计合成了Ⅰ和Ⅱ两类共8个未见文献报道的新化合物,结构均经MS、^(1)H NMR确证。对HDAC6和HDAC1的抑制试验结果显示,化合物Ⅰa和Ⅱa... 以已报道的组蛋白脱乙酰酶(HDAC)6抑制剂SW-100为先导化合物,采用骨架跃迁策略设计新型HDAC6抑制剂,共设计合成了Ⅰ和Ⅱ两类共8个未见文献报道的新化合物,结构均经MS、^(1)H NMR确证。对HDAC6和HDAC1的抑制试验结果显示,化合物Ⅰa和Ⅱa对HDAC6的抑制活性稍低于阳性对照SW-100,对HDAC6的选择性亦弱于SW-100。分子对接显示,化合物Ⅰa和Ⅱa均可较好地与HDAC6蛋白空腔中的关键氨基酸产生相互作用。 展开更多
关键词 组蛋白脱乙酰酶6抑制剂 SW-100 骨架跃迁 合成 活性 分子对接
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