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全基因组分析玉米MuDR转座因子插入突变体库(英文) 被引量:2
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作者 冯静 傅学乾 +3 位作者 王婷婷 陶勇生 高友军 郑用琏 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期772-777,共6页
在功能基因组研究中,插入诱变被广泛用于基因敲除。玉米Mutator转座子因其具有较高的转座活性常被用于构建大型玉米插入突变体库。本研究利用具有活性MuDR因子的玉米材料与优良玉米自交系Z31杂交,获得1000个M1单株,自交构建M2群体,研究M... 在功能基因组研究中,插入诱变被广泛用于基因敲除。玉米Mutator转座子因其具有较高的转座活性常被用于构建大型玉米插入突变体库。本研究利用具有活性MuDR因子的玉米材料与优良玉米自交系Z31杂交,获得1000个M1单株,自交构建M2群体,研究MuDR因子在基因组中插入位点特性。利用优化的MuTAIL-PCR方法分离出695条MuDR插入位点侧翼序列,经初步生物信息学分析得到374条非冗余的插入位点,其中的298条序列能够被定位在玉米基因组物理图谱单个位点上。实验结果揭示了MuDR因子插入的一些特性:在10条染色体上随机分布,偏向于插入到基因序列中,并在某些功能基因中有明显插入偏好。 展开更多
关键词 玉米 Mutator转座子 MuDR因子 侧翼序列 插入位点 mutail-pcr
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Mutator转座子介导的玉米胚大小突变体的遗传分析
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作者 王荣纳 李映辉 +1 位作者 杨伟峰 陶勇生 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期7-11,共5页
玉米胚大小是由多基因控制的数量性状。本研究以Mutator(Mu)转座子诱变的M5和BC2F2群体为材料,采用数码成像和Photoshop软件相结合的方法测定胚大小,计算胚面积与籽粒面积;以胚面积和籽粒面积的比值(SST)作为胚性状评价标准,对M5和BC2F... 玉米胚大小是由多基因控制的数量性状。本研究以Mutator(Mu)转座子诱变的M5和BC2F2群体为材料,采用数码成像和Photoshop软件相结合的方法测定胚大小,计算胚面积与籽粒面积;以胚面积和籽粒面积的比值(SST)作为胚性状评价标准,对M5和BC2F2诱变材料进行遗传分析。结果表明:在2种世代的诱变群体中共获得了8个胚大小突变体;用MuTail-PCR方法分析突变体材料Mu插入位点的侧翼序列,获得了Mu因子真实性插入的2个靶位点;经Blastn功能分析,该2个靶位点可能与编码鸟嘌呤核苷酸结合蛋白和一种泛素连接酶有关。这些突变体为进一步克隆控制胚大小的基因提供了宝贵的材料。 展开更多
关键词 玉米(Zea mays L ) Mutator 突变体 mutail-pcr
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Mutator转座子介导的玉米插入突变体库的构建及遗传评价 被引量:8
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作者 刘文婷 高友军 +2 位作者 腾峰 史卿 郑用琏 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2006年第17期2030-2036,共7页
以Q105,WW51,115F,V26-2,919J为Mutator转座子供体材料,与本地优良玉米自交系受体材料Hz85,W328以及S-Mo17Rf3Rf3杂交,获得26718单株的插入诱变F1群体(M1).田间鉴定M1单株的生物学特征及农艺学性状的表型突变,室内考察突变单株自交果穗M... 以Q105,WW51,115F,V26-2,919J为Mutator转座子供体材料,与本地优良玉米自交系受体材料Hz85,W328以及S-Mo17Rf3Rf3杂交,获得26718单株的插入诱变F1群体(M1).田间鉴定M1单株的生物学特征及农艺学性状的表型突变,室内考察突变单株自交果穗M2籽粒性状的突变类型,并以斑点籽粒出现的频率评价Mu因子的转座频率.结果表明,在所构建的Mu介导的玉米插入突变体库中,以W328为母本(BzBz)的M1群体平均田间表型突变频率为0.07;以W328×Mu的M2果穗斑点籽粒的出现频率评价的Mu转座频率为0.121802;在22500个S-Mo17Rf3Rf3×Mu单株中,发现了5个S型玉米细胞质雄性不育突变单株,突变频率为2.2×10?4.利用优化的MuTAIL-PCR技术分析了99条转座子插入位点的侧翼序列,归并整理后获得59条(每条约400核苷酸序列)非重复靶位点序列.对59条序列非重复的Mu因子插入产生的9bp靶位点正向重复序列进行同源性比较分析,结果表明,Mu的插入有序列热点.经生物信息学分析后注释了27条与玉米、水稻等植物核苷酸数据库中匹配值较高的功能序列.利用比较基因组学方法将36条单一基因序列定位在玉米遗传图谱上,有多条Mu插入靶位点序列定位在单个标记位点上.分析发现,8条Mu插入靶位点序列的预测功能与其相应的定位标记的功能具有一致性.Mu插入突变体库的构建与遗传评价为利用Mu转座子进一步发掘玉米基因、深入开展玉米功能基因组学研究搭建起重要的技术与材料平台. 展开更多
关键词 玉米 Mutator转座子 突变体库 mutail-pcr
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Construction and genetic analysis of mutator insertion mutant population in maize 被引量:4
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作者 LIU Wenting GAO Youjun TENG Feng SHI Qing ZHENG Yonglian 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2006年第21期2604-2610,共7页
A total of 26718 M1 plants were ob- tained by crossing the active mutator transposon donor parents (Q105, WW51, 115F, V26-2 and 919J) with the recipient parents (Hz85,W328 with Bz gene and S-Mo17Rf3Rf3). The phenotype... A total of 26718 M1 plants were ob- tained by crossing the active mutator transposon donor parents (Q105, WW51, 115F, V26-2 and 919J) with the recipient parents (Hz85,W328 with Bz gene and S-Mo17Rf3Rf3). The phenotypes of M1 plants were observed in the field. M1 plants were self-pollinated to develop the mutator insertion-mutagenized M2 seeds. The transposition frequency of the mutator in the genome was calculated based on the spotted aleurone phenotype of the M2 seeds. The results showed that: (1) the mutation frequency of M1 phe- notypes in the field was 0.07 in the population of W328×Mu; (2) the mutation frequency of spotted aleurone seeds on the M2 ears was 0.122 in the population of W328×Mu; (3) five S-cytoplasm male-sterile plants were found among 22500 M1 plants of S-Mo17Rf3Rf3×Mu, with the transposition frequency about 2.2×10?4 per locus. 99 flanking se- quences of mutator transposition were amplified by the modified MuTAIL-PCR, and 59 non-redundant sequences with length around 400 bp were obtained. After bioinformatic analysis, 27 sequences of them could be annotated, using non-redundant nucleotide database of maize, rice, and Arabidopsis. 36 se- quences of them were located on the genetic map of maize by comparative genomics, and several flank- ing sequences of mutator insertion were mapped on the single marker locus. Hotspot sequences of mu- tator transposition were revealed by comparing the homologies between the 9-bp target site duplication of the mutator insertion. The putative functions of 8 flanking sequences of mutator transposition had identity with the functions of their correspondingmarker. The constructed mutator insertion mutant population in maize will facilitate the new gene discovery and functional genomics study in maize. 展开更多
关键词 玉米 突变基因转位子 突变体种群 mutail-pcr
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