期刊文献+
共找到6篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
Association between Gene Polymorphisms and SNP-SNP Interactions of the Matrix Metalloproteinase 2 Signaling Pathway and the Risk of Vascular Senescence
1
作者 LIAO Zhen Yu YANG Shuo +3 位作者 HU Song LIU Jia MAO Yong Jun SUN Shu Qin 《Biomedical and Environmental Sciences》 SCIE CAS CSCD 2024年第2期146-156,共11页
Objective This study aimed to explore the association of single nucleotide polymorphisms(SNP)in the matrix metalloproteinase 2(MMP-2)signaling pathway and the risk of vascular senescence(VS).Methods In this cross-sect... Objective This study aimed to explore the association of single nucleotide polymorphisms(SNP)in the matrix metalloproteinase 2(MMP-2)signaling pathway and the risk of vascular senescence(VS).Methods In this cross-sectional study,between May and November 2022,peripheral venous blood of151 VS patients(case group)and 233 volunteers(control group)were collected.Fourteen SNPs were identified in five genes encoding the components of the MMP-2 signaling pathway,assessed through carotid-femoral pulse wave velocity(cf PWV),and analyzed using multivariate logistic regression.The multigene influence on the risk of VS was assessed using multifactor dimensionality reduction(MDR)and generalized multifactor dimensionality regression(GMDR)modeling.Results Within the multivariate logistic regression models,four SNPs were screened to have significant associations with VS:chemokine(C-C motif)ligand 2(CCL2)rs4586,MMP2 rs14070,MMP2rs7201,and MMP2 rs1053605.Carriers of the T/C genotype of MMP2 rs14070 had a 2.17-fold increased risk of developing VS compared with those of the C/C genotype,and those of the T/T genotype had a19.375-fold increased risk.CCL2 rs4586 and MMP-2 rs14070 exhibited the most significant interactions.Conclusion CCL2 rs4586,MMP-2 rs14070,MMP-2 rs7201,and MMP-2 rs1053605 polymorphisms were significantly associated with the risk of VS. 展开更多
关键词 Vascular senescence Pulse wave velocity(PWV) Single nucleotide polymorphism(SNP) Matrix metalloproteinase 2(MMP-2) Extracellular matrix(ECM) Structural degradation multifactor dimensionality reduction(mdr)
下载PDF
利用多因子降维法研究CXCR1和IL-8基因交互作用与中国荷斯坦牛乳房炎的关系 被引量:4
2
作者 毛永江 陈仁金 +4 位作者 陈莹 常玲玲 施雪奎 张亚琴 杨章平 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第9期1908-1915,共8页
【目的】运用多因子降维法(MDR)分析中国荷斯坦牛CXCR1和IL-8两个基因多态性与乳房炎易感性的交互作用,并评价MDR模型的具体应用。【方法】以上海光明乳业集团金山种奶牛场634头(其中有228头患乳房炎)中国荷斯坦牛为试验材料,采用PCR-S... 【目的】运用多因子降维法(MDR)分析中国荷斯坦牛CXCR1和IL-8两个基因多态性与乳房炎易感性的交互作用,并评价MDR模型的具体应用。【方法】以上海光明乳业集团金山种奶牛场634头(其中有228头患乳房炎)中国荷斯坦牛为试验材料,采用PCR-SSCP和直接测序法分析CXCR1基因-5′端和编码区及IL-8基因编码区共7个SNP位点的遗传多态性,并用MDR法和Logistic回归分析CXCR1和IL-8基因各位点突变及其基因型组合对奶牛乳房炎易感性的影响。【结果】CXCR1基因5′端-1 830、-1 768、-344和编码区783共4处发生突变,IL-8基因的2 789(A/G)位点与2 862(T/C)位点发生连锁突变,并导致两位点分别发生Ser→Gly和Cys→Arg的突变。单因素Logistic回归分析结果表明,CXCR1基因和IL-8基因5个SNP位点变异对该牛场奶牛乳房炎易感性均没有达到显著水平,但MDR分析发现CXCR1-(-1 768)-IL-8两位点、CXCR1-(-1 768)-(783)-IL-8三位点及CXCR1-(-1 768)-(–344)-(783)-IL-8四位点交互作用均达到显著水平,且交叉验证一致性均为最大(10/10)。CXCR1-(-1 768)-(783)-IL-8三位点互作模型和CXCR1-(-1 768)-IL-8两位点互作模型检验样本准确度较高(分别为0.5457和0.5485),但4个位点联合效应分级图表明CXCR1-(-1 768)-IL-8两易感基因型为强正交互作用,同时将CXCR1-(-1 768)-(783)-IL-8三位点互作效应和CXCR1-(-1 768)-IL-8两位点互作效应引入Logistic回归分析表明,CXCR1-(-1 768)-IL-8两位点互作效应对该牛场奶牛乳房炎易感性达到显著水平。【结论】CXCR1-(-1 768)-IL-8两位点交互模型作为奶牛乳房炎易感性相关的基因联合选择模型最佳,MDR和Logistic回归均可用于奶牛乳房炎易感性多基因分析模型,MDR发现交互作用的能力比Logistic回归强,但两者有着各自的适用条件和优点。遇到有交互作用分析要求时,二者的联合应用效果更佳。 展开更多
关键词 多因子降维法 LOGISTIC回归 CXCR1 IL-8 乳房炎易感性
下载PDF
自杀行为中5-HT基因和GAD1基因的交互作用
3
作者 黄缤慧 于振剑 +3 位作者 冯小键 董树平 褚成静 马文有 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期61-65,126,共6页
目的初步探讨5-羟色胺受体2C(5-HTR2C)基因、单胺氧化酶A(MAOA)基因和谷氨酸脱羧酶(GAD1)基因多态性与自杀行为的关系,并分析基因-基因之间的交互作用。方法对中国人群中21例有自杀行为史病例样本和50例健康对照者进行基因型分型;采用... 目的初步探讨5-羟色胺受体2C(5-HTR2C)基因、单胺氧化酶A(MAOA)基因和谷氨酸脱羧酶(GAD1)基因多态性与自杀行为的关系,并分析基因-基因之间的交互作用。方法对中国人群中21例有自杀行为史病例样本和50例健康对照者进行基因型分型;采用多因子降维法进行交互作用分析。结果对照组符合哈温平衡(HWE)检验,病例组中5-HTR2C位点不符合HWE检验(P<0.05),经过性别矫正检验显示与自杀行为正相关;两组的5-HTR2C基因型频率差别有统计学意义(χ~2=6.18,P=0.04);病例组和对照组MAOA、GAD1基因型频数差异均无显著统计学意义(P>0.05)。在MDR模型分析得到最优模型组合为rs5953210-rs769391位点构建的交互模型OR=20.19,95%CI4.19~97.38,P<0.01,交互作用显著。结论 5-HTR2C基因rs3813928、rs518147位点多态性可能与自杀行为存在关联,与GAD1基因rs3749034、rs769391位点和MAOA基因rs5953210、rs979605位点无关联。在MDR模型中,5-HTR2C基因与MAOA基因在自杀行为发病中具有显著交互效应,可增加自杀行为的发病风险。 展开更多
关键词 自杀行为 多因子降维法 5-HT受体2C基因 单胺氧化酶A γ-氨基丁酸 谷氨酸脱羧酶交互分析
下载PDF
福州郊区儿童青少年低体重影响因素的MDR分析
4
作者 张晓阳 贾海梅 林馨 《海峡预防医学杂志》 CAS 2013年第6期16-18,共3页
目的分析儿童青少年低体重影响因素间的交互作用。方法对福州郊区3 297名中、小学生的生长发育、营养状况及影响因素进行问卷调查。用多因子降维法(MDR)分析因素间的交互作用。据MDR模型,用多因素logistic回归模型估计交互项及其他危险... 目的分析儿童青少年低体重影响因素间的交互作用。方法对福州郊区3 297名中、小学生的生长发育、营养状况及影响因素进行问卷调查。用多因子降维法(MDR)分析因素间的交互作用。据MDR模型,用多因素logistic回归模型估计交互项及其他危险因素的危险度。结果 MDR最佳模型为食肉、吃青菜和吃水果的交互作用,该模型的检验样本平衡检验准确度为62.5%,交叉验证一致性为10/10。调整父亲文化、母亲文化、父亲BMI、母亲BMI等10个因素后,多吃肉类、水果类和青菜的交互作用有统计学意义。结论在低体重儿童青少年中,肉类是主要保护因素,水果是辅助因素,与肉类起着协调作用,青菜和它们有拮抗作用。 展开更多
关键词 低体重 儿童青少年 多因子降维法(mdr) LOGISTIC回归模型 交互作用
原文传递
应用Logistic回归与多因子降维法分析胃癌易感基因多态性 被引量:3
5
作者 张文涛 梁平 +5 位作者 代鹏 王伟华 汪钦 孙建斌 王伟 颜真 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2014年第5期679-683,共5页
目的应用Logistic回归与多因子降维法(multifactor dimensionality reduction,MDR)分析胃癌易感基因多态性,为胃癌的早期诊断和预警奠定基础。方法采用病例-对照研究,以中国西北476例汉族胃癌患者为病例组,361名非肿瘤、非消化系统疾病... 目的应用Logistic回归与多因子降维法(multifactor dimensionality reduction,MDR)分析胃癌易感基因多态性,为胃癌的早期诊断和预警奠定基础。方法采用病例-对照研究,以中国西北476例汉族胃癌患者为病例组,361名非肿瘤、非消化系统疾病个体为对照组;通过候选基因策略,应用MassARRAY质谱平台分析与代谢、炎症相关的18个基因的37个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点;利用Logistic回归与MDR对基因分型结果进行分析。结果 Logistic回归分析显示,磷脂酶Cε1(phospholipase C epsilon 1,PLCE1)_rs3765524[OR=1.341,95%CI(1.003,1.792)]、还原型辅酶Ⅰ/Ⅱ醌氧化还原酶1[NAD(P)H:quinone oxidoreductase 1,NQO1]_rs1800566[OR=0.615,95%CI(0.418,0.903)]、X线修复交叉互补基因1(X ray repair cross complementing gene 1,XRCC1)_rs25487[OR=0.688,95%CI(0.490,0.967)]3个SNP位点的基因型分布与胃癌易感性显著相关(P<0.05);MDR分析显示,PSCA_rs10216533-XRCC1_rs25487[模型Ⅰ:OR=3.566,95%CI(2.614,4.863)]、MTHFR_rs1801131-PSCA_rs2976392-CYP17A1_rs6163-CYP19A1_rs4646-CYP19A1_rs1902586-MMP2_rs243865[模型Ⅱ:OR=7.257,95%CI(5.337,9.870)]、IL1B_rs16944-PSCA_rs10216533-CYP17A1_rs6163-NQO1_rs1800566-ENOSF1_rs2298581-XRCC1_rs25487[模型Ⅲ:OR=15.837,95%CI(11.252,22.289)]3个模型内部各位点之间具有显著交互作用(P<0.000 1)。结论 PLCE1、NQO1、XRCC1、PSCA、MTHFR、CYP17A1、CYP19A1、MMP2、IL1B、ENOSF1等基因多态性与我国西北地区汉族人群胃癌发病风险相关;在胃癌的早期诊断与预警中应联合Logistic回归和MDR等方法,兼顾单因素与多因素交互的影响进行综合分析。 展开更多
关键词 胃癌 单核苷酸多态性 LOGISTIC回归 多因子降维法
原文传递
炎性基因与环境交互作用及胃癌易感性分析 被引量:4
6
作者 高丽君 宋春花 +6 位作者 李海霞 冯云霞 曹小琴 崔姝沥 代丽萍 张建营 王凯娟 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期799-801,共3页
目的探讨胃癌患病风险的炎性基因白介素1(IL-1)、肿瘤坏死因子(TNF)及巨噬细胞转移抑制因子(MIF)与环境间交互作用。方法用多因子降维法(MDR)模型分析基因-环境的交互作用对胃癌易感性影响,结合logistic回归分析进行补充验证。结果最佳... 目的探讨胃癌患病风险的炎性基因白介素1(IL-1)、肿瘤坏死因子(TNF)及巨噬细胞转移抑制因子(MIF)与环境间交互作用。方法用多因子降维法(MDR)模型分析基因-环境的交互作用对胃癌易感性影响,结合logistic回归分析进行补充验证。结果最佳交互作用模型是IL-1B-511、IL-1RN、TNF-A-308和肿瘤家族史的联合作用(P<0.01),交叉验证一致性10/10,检验样本准确度为0.72;根据模型将研究对象划分为高危、低危人群,胃癌发病风险交互效应的危险度估计OR=13.49,95%CI=8.62~21.10,且交互作用有统计学意义(P<0.01);将危险因素按结合数量进行分析,结果显示含有1、2、3个危险因素组在病例和对照中分布差异均有统计学意义(P<0.05),OR值分别为2.17、11.61、27.19。结论 IL-1B-511、IL-1RN、TNF-A-308和肿瘤家族史的交互作用可能增加胃癌患病风险。 展开更多
关键词 多因子降维法(mdr) 基因-环境交互作用 胃癌
原文传递
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部