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一种新的短链脱氢/还原酶家族新成员:NADP(H)-依赖的视黄醇脱氢酶基因的克隆和分析 被引量:1
1
作者 王桂玲 黄东阳 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第4期403-410,共8页
从牛的肝脏中快速抽提总RNA ,根据GenBank已发表NADP(H) 依赖的视黄醇脱氢酶基因 (NRDR)的cDNA序列 ,设计并合成特异引物 ,利用cDNA末端快速扩增 (RACE)方法和反转录 聚合酶链式反应 (RT PCR) ,得到牛肝内的NRDRcDNA的全长序列。经测... 从牛的肝脏中快速抽提总RNA ,根据GenBank已发表NADP(H) 依赖的视黄醇脱氢酶基因 (NRDR)的cDNA序列 ,设计并合成特异引物 ,利用cDNA末端快速扩增 (RACE)方法和反转录 聚合酶链式反应 (RT PCR) ,得到牛肝内的NRDRcDNA的全长序列。经测序证实 ,牛肝NRDR的全长cDNA序列为 12 6 6bp ,其开放读码框架在 2 4~ 80 6bp ,编码 2 6 0个氨基酸 (GenBank登录号 :AF4 874 5 4 )。根据NRDR基因推导出的氨基酸序列与人、鼠、兔有高度同源性 ,并含有SDR超家族成员的两个高度保守的模序 ,在其C 端含有过氧化物酶体的靶向序列为SHL。结果表明 ,牛的NRDR应属于过氧化物酶体内SDR超家族成员并在维甲酸合成的限速步骤起作用的酶 ,也为维甲酸合成的传统通路提供一个补充。 展开更多
关键词 nadp(h)-依赖的视黄醇脱氢酶基因(NRDR) 克隆 cDNA末端快速扩增(RACE) 序列分析 短链脱氢/还原酶(SDR)
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正常肝和肝癌细胞中DHRS4L2基因选择性剪接亚型的克隆及其表达调控研究 被引量:1
2
作者 甘雪琼 宋旭红 +3 位作者 李蕊 张巧霞 杜牡丹 黄东阳 《癌变.畸变.突变》 CAS CSCD 2010年第5期329-334,共6页
目的:鉴定正常肝细胞HL-7702和肝癌细胞Hep-G2中DHRS4L2基因的选择性剪接新亚型,并探讨其表达调控机制。方法:应用RT-PCR,3′RACE和生物信息学方法发现并鉴定DHRS4L2基因的选择性剪接新亚型;去甲基化药物5-aza-dC处理HL-7702和Hep-G2细... 目的:鉴定正常肝细胞HL-7702和肝癌细胞Hep-G2中DHRS4L2基因的选择性剪接新亚型,并探讨其表达调控机制。方法:应用RT-PCR,3′RACE和生物信息学方法发现并鉴定DHRS4L2基因的选择性剪接新亚型;去甲基化药物5-aza-dC处理HL-7702和Hep-G2细胞,通过RT-PCR和real-time PCR方法检测DHRS4L2的表达情况。结果:发现了2个新的DHRS4L2剪接亚型DHRS4L2A和DHRS4L2A3,2个新亚型均出现了新的第1个外显子,命名为Ea,前者缺失外显子1,后者缺失外显子1和3;在正常肝细胞中去甲基化后含DHRS4L2外显子1的转录产物比处理前明显增加,在肝癌细胞中则比处理前减少。结论:获得2个新的DHRS4L2剪接亚型,并发现DHRS4L2的表达和甲基化调控相关,且甲基化的调控作用在正常肝与肝癌细胞之间存在差异,其机制尚待进一步探讨。 展开更多
关键词 辅酶Ⅱ-依赖性视黄醇脱氢/还原酶 表达调控 DhRS4L2基因 选择性剪接
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一种人神经母细胞瘤辅酶II-依赖性视黄醇脱氢酶cDNA的克隆及特征分析 被引量:5
3
作者 李一凡 刘戈飞 +2 位作者 宋旭红 杜昆 黄东阳 《癌变.畸变.突变》 CAS CSCD 2005年第6期321-326,共6页
背景与目的:检测神经母细胞瘤中新的辅酶II_依赖性视黄醇脱氢/还原酶[NADP(H)_dependen tretinold ehydrogenase/reductase,NRDR]选择性剪接亚型。材料与方法:我们用NRDR特异引物,从人神经母细胞瘤细胞系SK_N_SH和SK_SY_5YcDNA中分别经... 背景与目的:检测神经母细胞瘤中新的辅酶II_依赖性视黄醇脱氢/还原酶[NADP(H)_dependen tretinold ehydrogenase/reductase,NRDR]选择性剪接亚型。材料与方法:我们用NRDR特异引物,从人神经母细胞瘤细胞系SK_N_SH和SK_SY_5YcDNA中分别经PCR扩增出635bp和429bpDNA片段,测序证实635bp片段是NRDR,而429bp片段是选择性剪接新亚型。再用快速cDNA末端扩增(Rapidamplification of cDN Aends,RACE)方法得到429bp片段cDNA全长序列。用绿色荧光蛋白与新亚型的融合蛋白做亚细胞定位。结果:得到新亚型全长并命名为humanNRDRA2(hum NRDRA2)(AY616182)。已知NRDR有8个外显子,而新亚型hum NRDRA2由选择性剪接造成了第4和第6外显子丢失,从第5外显子开始读码框架前移1bp,导致随后的编码区框码漂移(frameshift),同时蛋白翻译终止信号提前出现,产生仅有188个氨基酸的蛋白,其中第137氨基酸以后的序列相对于NRDR完全发生改变,同时C_末端的过氧化物酶体定位信号_SRL丢失,却在160~176氨基酸处出现了一个细胞核定位信号。我们在ESTs库中未找到与其相同的剪接形式,提示它可能是神经母细胞瘤特有的一种NRDR剪接亚型。用GFP_NRDRA2融合蛋白做该蛋白的亚细胞定位,发现发绿色荧光的细胞均已悬浮,但悬浮状态不佳,而作为对照的NRDR另一亚型则能定位成功,提示NRDRA2蛋白可能具有一定的细胞毒性。结论:人神经母细胞瘤NRDRA2选择性剪接亚型羧基端框移突变并有核定位序列;该蛋白可能是一种细胞毒性蛋白。 展开更多
关键词 nadp(h)-依赖的视黄醇脱氢酶 选择性剪接 框移突变
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牛肝辅酶Ⅱ依赖性视黄醇脱氢酶cDNA的克隆及组织表达 被引量:3
4
作者 王桂玲 黄东阳 +1 位作者 刘戈飞 杜晶 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期811-815,共5页
NADP(H) dependent retinol dehydrogenase/reductase (NRDR) was an important retinoic acid synthase, which was first purified from rabbit liver in 1997. In order to study the function of the NRDR gene,the full length cDN... NADP(H) dependent retinol dehydrogenase/reductase (NRDR) was an important retinoic acid synthase, which was first purified from rabbit liver in 1997. In order to study the function of the NRDR gene,the full length cDNA of bovine NRDR was cloned. According to the conserved sequences of human, mouse and rabbit NRDR cDNA, a pair of primers was designed to amplify a 294 bp DNA fragment of bovine liver NRDR, and then the full length of NRDR cDNA (AF487454) was cloned by using 3′ RACE and 5′ RACE. All the cloned NRDR proteins consist of 260 amino acid residues and showed high identity among them. The tri peptide of human, mouse and rabbit NRDR C end was SRL and that of bovine NRDR C end was SHL, but both were considered to be peroxisomal target signal 1 (PTS1). RT PCR demonstrated that NRDR gene was expressed in liver, heart, lung, kidney, stomach and intestine, and was not found in pancreas, muscle, artery and skin. The full length bovine NRDR cDNA has been successfully cloned and the sequence was analyzed. It provided a reliable foundation to investigate the biological function of this protein. 展开更多
关键词 牛肝辅酶Ⅱ依赖性视黄醇脱氢酶 克隆 组织表达 CDNA
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辅酶Ⅱ依赖性视黄醇脱氢/还原酶的表达与多克隆抗体制备 被引量:1
5
作者 刘戈飞 宋旭红 +2 位作者 梁斌 杜昆 黄东阳 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期227-229,共3页
目的制备辅酶Ⅱ依赖性视黄醇脱氢/还原酶(NRDR)多克隆抗体。方法应用大肠杆菌BL21-AI表达NRDR,制备NRDR包涵体,使用从SDS-PAGE凝胶中回收的重组NRDR作为免疫原,采用肩胛骨下注射作为免疫途径免疫兔。斑点杂交测定抗血清效价,HiTrapProte... 目的制备辅酶Ⅱ依赖性视黄醇脱氢/还原酶(NRDR)多克隆抗体。方法应用大肠杆菌BL21-AI表达NRDR,制备NRDR包涵体,使用从SDS-PAGE凝胶中回收的重组NRDR作为免疫原,采用肩胛骨下注射作为免疫途径免疫兔。斑点杂交测定抗血清效价,HiTrapProteinG柱纯化兔IgG,免疫印迹鉴定抗体特异性。结果BL21-AI对NRDR进行了高效表达。回收的NRDR蛋白溶液的浓度为0.36mg/ml,回收率为48.5%。所有免疫的动物在第2次追加免疫之后都产生了高效价的抗血清,血清的效价是1∶500,检测极限是8ngNRDR蛋白。纯化后的NRDR抗体具有较高的免疫活性和特异性。结论建立了高效制备辅酶Ⅱ依赖性视黄醇脱氢/还原酶多克隆抗体的方法。 展开更多
关键词 辅酶Ⅱ依赖性视黄醇脱氢/还原酶 基因表达 多克隆抗体 免疫
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人宫颈癌细胞辅酶Ⅱ依赖性视黄醇脱氢/还原酶选择性剪接新亚型的表达及多克隆抗体制备 被引量:1
6
作者 宋旭红 梁斌 +3 位作者 刘戈飞 谢健平 李蕊 黄东阳 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第8期983-986,共4页
目的制备宫颈鳞癌细胞中辅酶Ⅱ依赖性视黄醇脱氢/还原酶(NRDR)选择性剪接新亚型NRDRB1多克隆抗体,为NRDRB1的功能研究奠定基础。方法扩增NRDRB1开放阅读框,重组入Gateway原核表达系统pDEST14,并在大肠杆菌BL21-AI中诱导表达,制备NRDRB1... 目的制备宫颈鳞癌细胞中辅酶Ⅱ依赖性视黄醇脱氢/还原酶(NRDR)选择性剪接新亚型NRDRB1多克隆抗体,为NRDRB1的功能研究奠定基础。方法扩增NRDRB1开放阅读框,重组入Gateway原核表达系统pDEST14,并在大肠杆菌BL21-AI中诱导表达,制备NRDRB1包涵体,使用从SDS-PAGE凝胶中回收的NRDRB1重组蛋白作为免疫原,经肩胛骨下注射免疫新西兰白兔。斑点杂交测定抗血清效价,HiTrapProteinG柱纯化兔IgG,免疫印迹和免疫组织化学鉴定抗体特异性。结果NRDRB1在大肠杆菌BL21-AI中高效表达,回收的NRDRB1蛋白溶液浓度为0.42mg/ml。所有免疫的动物在第2次追加免疫之后都产生了高效价的抗血清。血清效价为l∶2000,对NRDRB1蛋白的检测极限是6.4ng。纯化后的NRDRB1抗体具有较高的免疫活性和特异性。结论NRDRB1原核表达载体的构建、蛋白表达、纯化及多克隆抗体的制备为今后研究该蛋白的功能奠定了良好的基础。 展开更多
关键词 辅酶Ⅱ依赖性视黄醇脱氢/还原酶B1 基因表达 宫颈肿瘤
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兔辅酶Ⅱ依赖性视黄醇脱氢/还原酶的功能性表达、纯化及活性鉴定 被引量:3
7
作者 谢健平 刘戈飞 +5 位作者 宋旭红 杜昆 李蕊 梁斌 张巧霞 黄东阳 《汕头大学医学院学报》 2007年第1期10-14,共5页
目的:用原核蛋白表达系统对兔辅酶Ⅱ依赖性视黄醇脱氢/还原酶(NRDR)进行功能性表达,并对其活性进行鉴定。方法:从兔肝中克隆出NRDR全长序列,运用Gateway表达系统将其编码区序列构建到表达载体(pDEST 17)上,再转化到大肠杆菌(E.coli)(BL2... 目的:用原核蛋白表达系统对兔辅酶Ⅱ依赖性视黄醇脱氢/还原酶(NRDR)进行功能性表达,并对其活性进行鉴定。方法:从兔肝中克隆出NRDR全长序列,运用Gateway表达系统将其编码区序列构建到表达载体(pDEST 17)上,再转化到大肠杆菌(E.coli)(BL21-AI)中表达出兔NRDR蛋白并鉴定其表达形式;取工程菌裂解上清通过金属离子亲和层析纯化出目的蛋白,再运用反相高效液相色谱法(HPLC)测定该酶的Km值和Vmax值。结果:构建出含兔NRDR编码区(768 bp)的表达克隆,转化到BL21-AI中表达出氨基端含6×His标签的重组兔NRDR蛋白,诱导表达4 h后目的蛋白可占总蛋白量的41.4%;经一步亲和层析得到的兔NRDR纯度为97.2%,比活性提高了64倍;经HPLC测定,该酶对视黄醛的Km值为(4.55±0.33)μmol/L,Vmax为(0.307±0.065)μmol/(min.mg)。结论:应用pDEST 17可在BL21-AI中对兔肝NRDR进行高效的功能性表达。 展开更多
关键词 辅酶Ⅱ依赖性视黄醇脱氢/还原酶 表达 纯化 类视黄醇代谢
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宫颈癌细胞中辅酶Ⅱ依赖性视黄醇脱氢/还原酶及其选择性剪接亚型真核表达载体的构建和表达 被引量:2
8
作者 宋旭红 李蕊 +3 位作者 刘戈飞 梁斌 谢建平 黄东阳 《汕头大学医学院学报》 2008年第2期71-73,75,共4页
目的:构建宫颈癌细胞中辅酶Ⅱ依赖性视黄醇脱氢/还原酶(NRDR)及选择性剪接亚型NRDRB1真核表达载体,并转染HeLa细胞表达融合蛋白和native蛋白。方法:分别以pDONR-NRDR、pDONR-NRDRB1载体为模板,用PCR方法扩增两端带有酶切位点的NRDR及NRD... 目的:构建宫颈癌细胞中辅酶Ⅱ依赖性视黄醇脱氢/还原酶(NRDR)及选择性剪接亚型NRDRB1真核表达载体,并转染HeLa细胞表达融合蛋白和native蛋白。方法:分别以pDONR-NRDR、pDONR-NRDRB1载体为模板,用PCR方法扩增两端带有酶切位点的NRDR及NRDRB1编码区序列,酶切后连接到pCDNA3、pCMV-Myc真核表达载体上,经酶切、测序鉴定后,转染HeLa细胞16 h,Western blot检测蛋白表达情况,蛋白质谱分析鉴定表达蛋白。结果:成功构建NRDR、NRDRB1真核表达载体,转染HeLa细胞后,可表达带有Myc标签的蛋白和不带标签的native蛋白;质谱分析结果进一步证实所表达的蛋白为NRDR和NRDRB1。结论:获得了在真核细胞中表达的NRDR、NRDRB1蛋白,为进一步研究其功能提供了实验材料。 展开更多
关键词 辅酶Ⅱ依赖性视黄醇脱氢/还原酶 选择性剪接 宫颈癌 真核表达
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兔辅酶Ⅱ依赖性视黄醇脱氢/还原酶多克隆抗体的制备
9
作者 谢健平 刘戈飞 +3 位作者 宋旭红 李蕊 梁斌 杜昆 《汕头大学医学院学报》 2009年第1期26-28,共3页
目的:制备兔辅酶Ⅱ依赖性视黄醇脱氢/还原酶(NRDR)多克隆抗体。方法:应用原核表达的兔NRDR免疫豚鼠,制备豚鼠抗兔NRDR多克隆抗体,并以Western blot法分析抗体特异性。结果:免疫豚鼠获得了高效价抗血清,效价为1∶2 000时检测极限为160 n... 目的:制备兔辅酶Ⅱ依赖性视黄醇脱氢/还原酶(NRDR)多克隆抗体。方法:应用原核表达的兔NRDR免疫豚鼠,制备豚鼠抗兔NRDR多克隆抗体,并以Western blot法分析抗体特异性。结果:免疫豚鼠获得了高效价抗血清,效价为1∶2 000时检测极限为160 ng蛋白,与NRDR蛋白能特异性结合。结论:获得的多克隆抗体应用于Western blot中检测兔NRDR效果良好,为NRDR的进一步研究打下基础。 展开更多
关键词 辅酶Ⅱ依赖性视黄醇脱氢/还原酶 多克隆抗体
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人辅酶Ⅱ依赖性视黄醇脱氢/还原酶在新疆汉族妇女宫颈病变中的表达及意义
10
作者 邓田园 张莉 +5 位作者 张鑫 王玉兰 刘帆 丁建花 王瑞 周瑾 《现代肿瘤医学》 CAS 2017年第14期2294-2297,共4页
目的:探讨人辅酶Ⅱ依赖性视黄醇脱氢/还原酶在新疆汉族妇女宫颈病变中的表达及临床意义,为新疆地区宫颈癌高危人群的识别、预防及诊断提供依据。方法:依据病理诊断结果,将80例新疆地区汉族妇女宫颈组织标本分为4组,正常及慢性炎症组20例... 目的:探讨人辅酶Ⅱ依赖性视黄醇脱氢/还原酶在新疆汉族妇女宫颈病变中的表达及临床意义,为新疆地区宫颈癌高危人群的识别、预防及诊断提供依据。方法:依据病理诊断结果,将80例新疆地区汉族妇女宫颈组织标本分为4组,正常及慢性炎症组20例、CINⅠ组20例、CINⅡ-Ⅲ组20例、宫颈鳞癌组20例,采用免疫组化SP法检测不同级别宫颈病变中DHRS4基因的表达。结果:DHRS4基因在正常及慢性炎症组、CINⅠ组、CINⅡ-Ⅲ组、宫颈鳞癌组标本中阳性表达有统计学意义(P<0.05),分别进行组间比较,正常宫颈及慢性炎症组与宫颈CINⅠ组有统计学差异(P<0.05),正常宫颈及慢性炎症组与宫颈CINⅡ-Ⅲ组有统计学差异(P<0.05),正常宫颈及慢性炎症组与宫颈癌组有统计学差异(P<0.05),宫颈CINⅠ组与宫颈癌组无统计学差异(P>0.05),CINⅡ-Ⅲ组与宫颈癌组无统计学差异(P>0.05)。结论:DHRS4基因在人体宫颈鳞癌组织中高表达,且随着宫颈病变的进展表达阳性率逐渐升高,可能与宫颈疾病及其癌变的发生有关。 展开更多
关键词 宫颈鳞癌 宫颈病变 人辅酶Ⅱ依赖性视黄醇脱氢/还原酶 DhRS4基因 免疫组化
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人肝癌细胞辅酶Ⅱ-依赖性视黄醇脱氢/还原酶选择性剪接新亚型的鉴定和分析
11
作者 钱程 刘婷 +2 位作者 闫银侠 宋旭红 黄东阳 《汕头大学医学院学报》 2010年第3期138-141,共4页
目的:鉴定人肝癌细胞HepG2中辅酶Ⅱ-依赖性视黄醇脱氢/还原酶(NRDR)的选择性剪接新亚型DHRS4L1A1,并检测其在不同细胞中的表达情况。方法:采用快速cDNA末端扩增方法,从HepG2中克隆选择性剪接亚型的cDNA序列;通过查找开放阅读框架,预测... 目的:鉴定人肝癌细胞HepG2中辅酶Ⅱ-依赖性视黄醇脱氢/还原酶(NRDR)的选择性剪接新亚型DHRS4L1A1,并检测其在不同细胞中的表达情况。方法:采用快速cDNA末端扩增方法,从HepG2中克隆选择性剪接亚型的cDNA序列;通过查找开放阅读框架,预测并分析剪接新亚型的蛋白质序列和功能;用半定量RT-PCR法检测8种不同细胞株中新剪接亚型的相对表达量。结果:DHRS4L1A1全长1 117 bp,为NRDR选择性剪接新亚型;该亚型在卵巢癌细胞SKOV3中的表达量显著高于其他细胞。结论:DHRS4L1A1表达的蛋白属于SDR家族,该亚型可能参与生殖系统相关酶类的代谢。 展开更多
关键词 nadp(h)-依赖性视黄醇脱氢/还原酶 选择性剪接 hEPG2细胞
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人辅酶Ⅱ依赖性视黄醇脱氢/还原酶在宫颈癌中的研究进展
12
作者 邓田园 周瑾 张艺峰 《海南医学》 CAS 2017年第15期2502-2504,共3页
视黄酸(rRA)是维生素A的活性代谢产物,在胚胎发育和细胞的生长及分化过程中发挥重要作用。视黄酸相关物质与肿瘤细胞的分化、增殖或凋亡等密切相关。作为视黄酸代谢酶的一种,人辅酶Ⅱ依赖性视黄醇脱氢/还原酶(NRDR)被证实了其剪接的异... 视黄酸(rRA)是维生素A的活性代谢产物,在胚胎发育和细胞的生长及分化过程中发挥重要作用。视黄酸相关物质与肿瘤细胞的分化、增殖或凋亡等密切相关。作为视黄酸代谢酶的一种,人辅酶Ⅱ依赖性视黄醇脱氢/还原酶(NRDR)被证实了其剪接的异常及蛋白酶活性变化和宫颈鳞状细胞癌的发生和发展密切相关。本文,我们将详述NRDR的研究现状和未来前景。 展开更多
关键词 维甲酸 人辅酶Ⅱ依赖性视黄醇脱氢/还原酶 宫颈癌
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