同源建模构建ABLSH3突变体及其与RIN1蛋白结合能力的分析

Bcr-Abl SH3与RIN1富含脯氨酸的序列结合,激活Bcr-Abl酪氨酸激酶活性,引起慢粒患者对伊马替尼耐药,为改变两者结合方式解决耐药问题,笔者对Bcr-Abl SH3结构域活性位点进行分析。Pep Site2.0软件分析RIN1与Bcr-Abl SH3结合部位及特点,选择突变位点,VMD1.8.7和NAMD2.6软件动态模拟获取稳定的SH3突变体结构,Pep Site2.0分析突变体和RIN1结合能力大小。两者结合部位位于SH3 90-118氨基酸位点,3种突变方式中双位点突变效果明显优于单位点及缩短的片段,单位点突变中并非所有被选择的位点突变后结合能力都提高,说明RIN1与SH3结合不仅依赖结合部位的特异氨基酸,其周围的氨基酸对维持两者的结合有着至关重要的作用。