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内蒙古地区刺叶柄棘豆(Oxytropis aciphylla Ledeb.)种群遗传多样性分析 被引量:4
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作者 卢萍 赵萌莉 +3 位作者 韩国栋 李翠 刘惠 刘秋艳 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期741-745,共5页
用ISSR分子标记对内蒙古地区刺叶柄棘豆(Oxytorpis aciphylla Ledeb.)5个地理种群进行了种群遗传多样性分析。结果表明:刺叶柄棘豆种群具有较高的遗传多样性,11个ISSR引物扩增出215条带,总的多态位点百分率为98.14%,Shannon多样性指数I=... 用ISSR分子标记对内蒙古地区刺叶柄棘豆(Oxytorpis aciphylla Ledeb.)5个地理种群进行了种群遗传多样性分析。结果表明:刺叶柄棘豆种群具有较高的遗传多样性,11个ISSR引物扩增出215条带,总的多态位点百分率为98.14%,Shannon多样性指数I=0.2108,Nei基因多样性指数H=0.341 6,种内总基因多样性(Ht)为0.2108,种群内基因多样性(Hs)为0.160 4,大部分遗传变异(76.11%)的遗传变异存在于种群内,23.89%的遗传变异存在于种群间。遗传分化系数(Gst)为0.238 9,基因流(Nm)为1.592 9。5个居群间已有遗传分化趋势,遗传漂变不会引起遗传分化。UPGMA遗传距离聚类结果表明,5个地理种群中,植被类型为荒漠草原的4个种群之间遗传距离较近,与1个荒漠种群距离较远。 展开更多
关键词 刺叶柄棘豆 IssR 遗传多样性 nei指数
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Exotic Plant Alnus trabeculosa Alters the Composition and Diversity of Native Rhizosphere Bacterial Communities of Phragmites australis 被引量:1
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作者 CHEN Xueping ZHANG Xuanxuan +4 位作者 ZHU Xi'e ZHANG Hui LIANG Xia LEI Yanru HE Chiquan 《Pedosphere》 SCIE CAS CSCD 2016年第1期108-119,共12页
Alnus trabeeulosa, a rhizobia-nodulating tree, was introduced into the Chongxi tidal wetland in the Yangtze River estuary of China to increase the biodiversity of plants and restore tidal wetland functions. However, t... Alnus trabeeulosa, a rhizobia-nodulating tree, was introduced into the Chongxi tidal wetland in the Yangtze River estuary of China to increase the biodiversity of plants and restore tidal wetland functions. However, the effect of the introduced plant on soil bacterial communities and restoration outcomes remains unknown. In this study, the rhizosphere bacterial community structure and diversity were compared between Phragrnites australis monospecific community and A. trabeculosa-P, australis mixed communities, aiming to assess whether A. trabeculosa influenced the rhizosphere bacterial communities of P. australis and to investigate whether different taxonomic groups within a soil community may respond similarly to the presence of an introduced exotic plant. Among the 14 phylogenetic phyla detected, Proteobacteria and Acidobacteria were the dominant bacterial taxa in the rhizosphere. Phylogenetic analysis of the predominant Proteobacteria showed that the clones from the rhizosphere soils of A. trabeculosa and P. australis in A. trabeculosa-P, australis mixed communities were more diverse than those in the rhizosphere soil of P. australis in P. australis monospecific community. The rhizosphere community in the wetland potentially included active microbial community related to carbon, nitrogen, and sulfur cycling in the Yangtze River estuary. The rhizosphere soil of P. australis in A. trabeculosa-P, australis mixed communities exhibited the highest Shannon diversity index (Hr) and Simpson diversity index (l/D) (H = 4.52, 1/D = 253). Correspondence analyses revealed that the bacterial community structures were altered after A. trabeculosa was introduced. 展开更多
关键词 clone library phylogenetic group restoration outcomes rhizosphere soil microbial index shannon diversity index simpson diversity index 16s rRNA gene wetland restoration
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西林水牛群体的RAPD遗传多样性分析 被引量:3
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作者 陈集成 蒋钦扬 +1 位作者 陈宝剑 韦英明 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期2270-2273,共4页
【目的】了解西林水牛群体的遗传变异和遗传结构,为其辅助标记育种、遗传资源保护及利用提供参考依据。【方法】从广西西林县的8个乡(镇)采集184份西林水牛血样,采用优化后的RAPD技术检测其多态性DNA,统计多态性条带数,并应用Popgene3... 【目的】了解西林水牛群体的遗传变异和遗传结构,为其辅助标记育种、遗传资源保护及利用提供参考依据。【方法】从广西西林县的8个乡(镇)采集184份西林水牛血样,采用优化后的RAPD技术检测其多态性DNA,统计多态性条带数,并应用Popgene32软件对西林水牛群体的有效等位基因数、Nei氏基因多样性指数及Shannon多样性指数进行分析。【结果】从18条RAPD引物中筛选出8条扩增产物稳定、条带清晰可辨的引物,扩增出的DNA片段分子量为100-1000 bp;从184个样本中共扩增出4968个多态性条带,平均每条引物可扩增出621个多态性条带,多态性频率达60.0%-100.0%,平均为89.7%。西林水牛群体的平均有效等位基因数为1.6745,平均Nei氏基因多样度指数为0.3583,平均Shannon多样性指数为0.5510。【结论】西林水牛群体的遗传变异、遗传分化及遗传多样性均较高,但选育程度较低,育种潜力较大,有待进一步保种和开发利用。 展开更多
关键词 西林水牛 RAPD 多态性条带 有效等位基因数 nei氏基因多样性指数 sHANNON多样性指数
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河南益母草野生居群遗传多样性的SCoT分析 被引量:10
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作者 张维瑞 韩远记 +2 位作者 薛愧玲 袁王俊 尚富德 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2013年第8期1022-1026,共5页
目的研究河南益母草野生居群遗传多样性。方法利用SCoT分子标记对位于河南伏牛、太行、大别和桐柏4大山脉的8个益母草居群66个样品进行遗传多样性分析。结果 10对引物共扩增出240条带,其中多态性条带为238条,多态性百分率(PPB)为99.17%... 目的研究河南益母草野生居群遗传多样性。方法利用SCoT分子标记对位于河南伏牛、太行、大别和桐柏4大山脉的8个益母草居群66个样品进行遗传多样性分析。结果 10对引物共扩增出240条带,其中多态性条带为238条,多态性百分率(PPB)为99.17%。Nei’s遗传多样性指数(H)平均值为0.264 2,Shannon’s多态性信息指数(I)平均值为0.39,遗传分化系数(Gst)为0.294 6,种群间基因流为1.197。Mantel Test分析表明,河南益母草居群间的亲缘关系与它们之间的地理距离有着明显的相关性(r=0.366 3,P<0.05)。结论河南野生益母草种群具有较高的遗传多样性,其遗传距离与地理距离存在明显的相关性。 展开更多
关键词 益母草 遗传多样性 neis遗传多样性指数 遗传分化系数 基因流
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我国黄花蒿天然群体遗传多样性的SRAP分析 被引量:7
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作者 陈大霞 彭锐 +2 位作者 李隆云 崔广林 吴叶宽 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2011年第8期1591-1595,共5页
目的研究我国黄花蒿天然群体种质资源的遗传多样性,并对其进行SRAP分析。方法采用SRAP分子标记技术,以我国天然群体主要分布区域的60份黄花蒿种质资源为试验材料,运用Popgene version 1.31软件和Treeconw软件计算相关参数,UPGMA方法聚类... 目的研究我国黄花蒿天然群体种质资源的遗传多样性,并对其进行SRAP分析。方法采用SRAP分子标记技术,以我国天然群体主要分布区域的60份黄花蒿种质资源为试验材料,运用Popgene version 1.31软件和Treeconw软件计算相关参数,UPGMA方法聚类,构建亲缘关系树状图。结果 24对SRAP引物组合扩增出232条带,多态性比率(PPB)为81.47%。SRAP标记的Nei’s基因多样性(H)为0.190 5,Shannon’s信息指数(I)为0.300 0。青蒿素量高的4个地区之间,多态位点百分率在50.00%~61.21%,平均为55.82%,SRAP标记的H值为0.155 7~0.179 3,I值为0.237 9~0.276 6;SRAP检测不同材料间遗传相似系数为0.643 2~0.872 7,平均为0.754 7。结论 SRAP标记能有效地揭示我国野生黄花蒿丰富的遗传多样性,为黄花蒿新品种选育提供了物质基础。 展开更多
关键词 黄花蒿 sRAP 遗传多样性 neis基因多样性(H) shannon’s信息指数(I)
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