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内蒙古小花棘豆遗传多样性的ISSR分析 被引量:19
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作者 卢萍 赵萌莉 +2 位作者 韩国栋 曹雪松 张丽 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期1102-1107,共6页
应用ISSR分子标记对内蒙古西部地区小花棘豆(Oxytropis glabra DC.)6个地理种群进行了遗传多样性研究.结果表明:小花棘豆具有较高的遗传多样性;14个引物共扩增出327个位点,物种水平上Nei's基因多样性指数为0.1972,Shannon多样性指数... 应用ISSR分子标记对内蒙古西部地区小花棘豆(Oxytropis glabra DC.)6个地理种群进行了遗传多样性研究.结果表明:小花棘豆具有较高的遗传多样性;14个引物共扩增出327个位点,物种水平上Nei's基因多样性指数为0.1972,Shannon多样性指数为0.3287;种内总基因多样性为0.1976,种群内基因多样性为0.1653,83.67%的遗传变异存在于种群内,16.33%的遗传变异存在于种群间,种群间的遗传分化系数为0.1633,基因流为2.5613,6个种群间有一定遗传分化,但遗传漂变不会引起遗传分化.UPGMA遗传距离聚类结果表明,生态地理条件相似的种群优先聚集. 展开更多
关键词 小花棘豆 IssR 遗传多样性 PCR nei指数 shannon指数
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内蒙古扁蓿豆遗传多样性的ISSR分析 被引量:9
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作者 李鸿雁 李志勇 +2 位作者 王小丽 师文贵 邢建军 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期52-56,共5页
应用ISSR分子标记对分布于内蒙古不同地区的扁蓿豆(Medicago ruthenica)8个地理种群进行了遗传多样性研究.结果表明:扁蓿豆具有较高的遗传多样性;15个引物共扩增出363个位点,物种水平上Nei s基因多样性指数为0.198 9,Shannon多样性指数... 应用ISSR分子标记对分布于内蒙古不同地区的扁蓿豆(Medicago ruthenica)8个地理种群进行了遗传多样性研究.结果表明:扁蓿豆具有较高的遗传多样性;15个引物共扩增出363个位点,物种水平上Nei s基因多样性指数为0.198 9,Shannon多样性指数为0.303 7;种内总基因多样性为0.308 6,种群内基因多样性为0.198 9,64.45%的遗传变异存在于种群内,35.55%的遗传变异存在于种群间,种群间的遗传分化系数为0.355 5,基因流为0.906 4,8个种群间基因交流较少,遗传分化较强.UPGMA遗传距离聚类结果表明,生态地理条件相似的种群优先聚集. 展开更多
关键词 扁蓿豆 IssR 遗传多样性 neis指数 shannon指数
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内蒙古地区刺叶柄棘豆(Oxytropis aciphylla Ledeb.)种群遗传多样性分析 被引量:4
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作者 卢萍 赵萌莉 +3 位作者 韩国栋 李翠 刘惠 刘秋艳 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期741-745,共5页
用ISSR分子标记对内蒙古地区刺叶柄棘豆(Oxytorpis aciphylla Ledeb.)5个地理种群进行了种群遗传多样性分析。结果表明:刺叶柄棘豆种群具有较高的遗传多样性,11个ISSR引物扩增出215条带,总的多态位点百分率为98.14%,Shannon多样性指数I=... 用ISSR分子标记对内蒙古地区刺叶柄棘豆(Oxytorpis aciphylla Ledeb.)5个地理种群进行了种群遗传多样性分析。结果表明:刺叶柄棘豆种群具有较高的遗传多样性,11个ISSR引物扩增出215条带,总的多态位点百分率为98.14%,Shannon多样性指数I=0.2108,Nei基因多样性指数H=0.341 6,种内总基因多样性(Ht)为0.2108,种群内基因多样性(Hs)为0.160 4,大部分遗传变异(76.11%)的遗传变异存在于种群内,23.89%的遗传变异存在于种群间。遗传分化系数(Gst)为0.238 9,基因流(Nm)为1.592 9。5个居群间已有遗传分化趋势,遗传漂变不会引起遗传分化。UPGMA遗传距离聚类结果表明,5个地理种群中,植被类型为荒漠草原的4个种群之间遗传距离较近,与1个荒漠种群距离较远。 展开更多
关键词 刺叶柄棘豆 IssR 遗传多样性 nei指数
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内蒙古西部地区砂珍棘豆(Oxytropis racemosa Turcz.)遗传多样性分析 被引量:5
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作者 卢萍 赵萌莉 +3 位作者 韩国栋 曹珍 陈曦 王中南 《内蒙古大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期160-165,共6页
用ISSR分子标记对内蒙古西部地区砂珍棘豆(Oxytropis racemosa Turcz)3个不同生境的地理种群进行了种群遗传多样性分析.结果表明砂珍棘豆种群具有较高的遗传多样性,14个ISSR引物扩增出284条带,Shannon多样性指数I=0.3630,Nei′s多样性指... 用ISSR分子标记对内蒙古西部地区砂珍棘豆(Oxytropis racemosa Turcz)3个不同生境的地理种群进行了种群遗传多样性分析.结果表明砂珍棘豆种群具有较高的遗传多样性,14个ISSR引物扩增出284条带,Shannon多样性指数I=0.3630,Nei′s多样性指数H=0.2234,物种总基因多样性(HT)为0.2236,种群内基因多样性(Hs)为0.2085,大部分遗传变异(93.27%)存在于种群内,6.73%的遗传变异存在于种群间.遗传分化系数(Gst)为0.0673,基因流(Nm)为6.9318,说明种群间有很强的基因交流,遗传漂变不会引起遗传分化.UPGMA遗传距离聚类结果表明,3个地理种群中,乌审旗和伊金霍洛种群先聚在一起,然后与鄂托克种群聚在一起,遗传距离与地理距离相关, 展开更多
关键词 砂珍棘豆 IssR 遗传多样性 nei指数 shannon指数
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基于SSR标记的厚朴亲本及其子代群体的遗传多样性分析 被引量:6
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作者 麦静 杨志玲 +1 位作者 杨旭 汪丽娜 《植物资源与环境学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期10-17,共8页
以来自浙江遂昌的5株厚朴(Magnolia officinalis Rehd.et Wils.)单株为母本,来自浙江磐安和富阳、江西分宜以及湖南沅陵的厚朴群体为父本,获得7个杂交授粉子代群体;并对5株母本单株进行自由授粉,获得5个自由授粉后代群体;在此基础上,... 以来自浙江遂昌的5株厚朴(Magnolia officinalis Rehd.et Wils.)单株为母本,来自浙江磐安和富阳、江西分宜以及湖南沅陵的厚朴群体为父本,获得7个杂交授粉子代群体;并对5株母本单株进行自由授粉,获得5个自由授粉后代群体;在此基础上,采用SSR标记技术对厚朴亲本群体以及杂交和自由授粉子代群体的遗传多样性进行分析。结果表明:13对SSR引物扩增的片段长度为105~297 bp,共检测到54个等位基因,每个位点的观测等位基因数和有效等位基因数分别为4.2和2.6。总体上,杂交授粉子代群体的遗传多样性最高,其Shannon多样性指数(I)、Nei’s基因多样性指数(h)和期望杂合度(He)平均值分别为1.049 3、0.577 3和0.638 2;亲本群体的遗传多样性略低于其杂交授粉子代群体,其I、h和He平均值分别为1.022 1、0.559 7和0.601 3;自由授粉子代群体的遗传多样性最低,其I、h和He平均值分别为0.813 8、0.480 8和0.530 0。7个杂交授粉子代群体亲本间的Nei’s遗传距离为0.576 2~1.181 1,且与杂交授粉子代群体的遗传多样性呈正相关,但相关性不显著(R=0.392 4)。7个杂交授粉子代群体间的Nei’s遗传距离和遗传一致度分别为0.274 9~0.804 6和0.446 4~0.759 6,其中来源于同一父本的杂交授粉子代群体间的遗传一致度最高,且Nei’s遗传距离越大其遗传一致度越小。聚类分析结果表明:在Nei’s遗传距离为0.93处,供试的5个母本单株以及3个父本群体、7个杂交授粉子代群体和5个自由授粉子代群体可分成3类,其中来源于同一父本的杂交授粉子代群体及其父本群体具有较近的亲缘关系。研究结果显示:厚朴杂交授粉子代群体的遗传多样性水平明显高于其自由授粉子代群体,并且总体上高于其亲本,说明杂交授粉可加速厚朴群体间的基因交流,丰富其群体的遗传多样性。 展开更多
关键词 厚朴 ssR标记 杂交授粉 遗传多样性 neis遗传距离 聚类分析
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生态旅游型乡村的乡土景观植物遗传多样性
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作者 冯致 姚志 +10 位作者 孙全 李萌 吴秀忠 陈大华 蒋龙 范开放 唐建路 李锴 米小琴 于咏 王义强 《中国生态农业学报(中英文)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期1896-1908,共13页
乡村景观植物是生态旅游型乡村营建中的关键因素,研究乡村景观植物遗传多样性,揭示其群体内遗传变异的丰富度和遗传结构的稳定性,为乡村生态景观营建和生物多样性维护提供重要理论依据,对美丽乡村建设具有重要意义。本文以两个生态旅游... 乡村景观植物是生态旅游型乡村营建中的关键因素,研究乡村景观植物遗传多样性,揭示其群体内遗传变异的丰富度和遗传结构的稳定性,为乡村生态景观营建和生物多样性维护提供重要理论依据,对美丽乡村建设具有重要意义。本文以两个生态旅游型乡村为研究对象,选取了8个乡土景观物种,采集了整体村域的植物样品,对表型性状进行了测量并开展了ISSR-PCR试验:通过表型性状和分子标记遗传多样性检测分析,计算植物表型Shan-non指数和Nei’s基因多样性指数等,揭示乡土景观植物在不同区域的遗传多样性水平。研究结果表明:基于表型性状聚类分析划分出5类枫香、6类福建青冈、4类青冈、16类榉树、7类香椿、10类马兰、5类野菊和6类蓬蘽的品系资源。8个乡土景观植物的表型变异系数为0.23~0.58,Shannon指数为1.51~6.74。8种植物在整体村域、人工区域和自然区域的Nei’s基因多样性指数分别为0.240~0.536、0.244~0.540和0.193~0.367,多态性位点百分率范围为45.00%~100.00%,等位基因数范围为1.45~2.00,有效等位基因数范围为1.30~1.64。讨论分析表明,8个乡土景观植物的表型(Shannon指数)和分子(Nei’s基因多样性指数)遗传多样性水平总体高于多种景观植物的平均水平,遗传变异丰富;部分乡土植物总体遗传多样性高,但自然区域和人工区域的遗传多样性水平有所差异。在乡村景观建设中应关注乡土景观植物群体的遗传多样性水平的变化,采取相应措施提高群体的遗传多态性和基因分布均匀度,维护乡土景观植物遗传多样性水平,保证乡村生态景观的稳定性和长效性。 展开更多
关键词 生态旅游型乡村 乡土景观植物 遗传多样性 表型shannon指数 neis基因多样性指数
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Fuzzy Genetic Sharing for Dynamic Optimization
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作者 Khalid Jebari Abdelaziz Bouroumi Aziz Ettouhami 《International Journal of Automation and computing》 EI 2012年第6期616-626,共11页
Recently,genetic algorithms(GAs) have been applied to multi-modal dynamic optimization(MDO).In this kind of optimization,an algorithm is required not only to find the multiple optimal solutions but also to locate a dy... Recently,genetic algorithms(GAs) have been applied to multi-modal dynamic optimization(MDO).In this kind of optimization,an algorithm is required not only to find the multiple optimal solutions but also to locate a dynamically changing optimum.Our fuzzy genetic sharing(FGS) approach is based on a novel genetic algorithm with dynamic niche sharing(GADNS).FGS finds the optimal solutions,while maintaining the diversity of the population.For this,FGS uses several strategies.First,an unsupervised fuzzy clustering method is used to track multiple optima and perform GADNS.Second,a modified tournament selection is used to control selection pressure.Third,a novel mutation with an adaptive mutation rate is used to locate unexplored search areas.The effectiveness of FGS in dynamic environments is demonstrated using the generalized dynamic benchmark generator(GDBG). 展开更多
关键词 genetic algorithms unsupervised learning fuzzy clustering dynamic optimization evolutionary algorithms dynamic niche sharing Hill s diversity index multi-modal function optimization.
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尼罗罗非鱼RAPD标记及其遗传多样性分析 被引量:17
8
作者 胡隐昌 宋平 +1 位作者 李懋 胡珈瑞 《华中科技大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2002年第5期94-97,共4页
采用 4 18个引物对尼罗罗非鱼进行了RAPD分析 ,筛选出 4 6个重复性好、可用于尼罗罗非鱼RAPD标记的引物 .另用 12个引物对尼罗罗非鱼群体 (2 3尾 )进行了遗传多样性分析 :共检出 5 8个位点 ,其中 18个位点表现出多态性 ,多态位点比例达 ... 采用 4 18个引物对尼罗罗非鱼进行了RAPD分析 ,筛选出 4 6个重复性好、可用于尼罗罗非鱼RAPD标记的引物 .另用 12个引物对尼罗罗非鱼群体 (2 3尾 )进行了遗传多样性分析 :共检出 5 8个位点 ,其中 18个位点表现出多态性 ,多态位点比例达 31.0 3% ,其群体的Nei&Li氏遗传相似率为 90 .2 3% ,申农信息指数为0 .10 0 5bit.上述三项指标表明 ,该尼罗罗非鱼群体保持着较高水平的遗传变异 . 展开更多
关键词 尼罗罗非鱼 RAPD标记 遗传多样性 申农信息指数
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西林水牛群体的RAPD遗传多样性分析 被引量:3
9
作者 陈集成 蒋钦扬 +1 位作者 陈宝剑 韦英明 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期2270-2273,共4页
【目的】了解西林水牛群体的遗传变异和遗传结构,为其辅助标记育种、遗传资源保护及利用提供参考依据。【方法】从广西西林县的8个乡(镇)采集184份西林水牛血样,采用优化后的RAPD技术检测其多态性DNA,统计多态性条带数,并应用Popgene3... 【目的】了解西林水牛群体的遗传变异和遗传结构,为其辅助标记育种、遗传资源保护及利用提供参考依据。【方法】从广西西林县的8个乡(镇)采集184份西林水牛血样,采用优化后的RAPD技术检测其多态性DNA,统计多态性条带数,并应用Popgene32软件对西林水牛群体的有效等位基因数、Nei氏基因多样性指数及Shannon多样性指数进行分析。【结果】从18条RAPD引物中筛选出8条扩增产物稳定、条带清晰可辨的引物,扩增出的DNA片段分子量为100-1000 bp;从184个样本中共扩增出4968个多态性条带,平均每条引物可扩增出621个多态性条带,多态性频率达60.0%-100.0%,平均为89.7%。西林水牛群体的平均有效等位基因数为1.6745,平均Nei氏基因多样度指数为0.3583,平均Shannon多样性指数为0.5510。【结论】西林水牛群体的遗传变异、遗传分化及遗传多样性均较高,但选育程度较低,育种潜力较大,有待进一步保种和开发利用。 展开更多
关键词 西林水牛 RAPD 多态性条带 有效等位基因数 nei氏基因多样性指数 sHANNON多样性指数
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云南常见药用红景天的RAPD分析 被引量:19
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作者 虞泓 朱荣勋 +1 位作者 李永谊 和云峰 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期96-99,共4页
目的研究云南常见药用植物红景天的遗传背景。方法采用RAPD技术对3种6个居群59个红景天样品进行了遗传关系研究。结果大花红景天3个居群的多态位点百分率(PPB)分别为37.97%、46.15%、39.45%,Nei's基因多样性(h)分别为0.1103、0.1437... 目的研究云南常见药用植物红景天的遗传背景。方法采用RAPD技术对3种6个居群59个红景天样品进行了遗传关系研究。结果大花红景天3个居群的多态位点百分率(PPB)分别为37.97%、46.15%、39.45%,Nei's基因多样性(h)分别为0.1103、0.1437、0.1371,Shannon's信息指数(I)分别为0.1736、0.2221、0.2067,物种水平的PPB为70.47%,I为0.2583,基因分化系数Gst为0.2630;长鞭红景天2个居群的PPB分别为43.67%、44.42%,I分别为0.2153、0.2174,物种水平的PPB为65.51%,Gst为0.3132,I为0.3139;云南红景天的PPB为36.97%,I为0.1881。结论RAPD分子标记可很好地用于红景天物种的分子鉴定和遗传背景研究。 展开更多
关键词 大花红景天 常见 PPB 药用 s基因 遗传背景 分化 RAPD分析 居群 RAPD分子标记
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五个山羊群体微卫星标记的遗传多样性分析 被引量:3
11
作者 常新建 任有蛇 +5 位作者 岳文斌 姚继广 杨子森 王慧生 赵兴财 白海全 《草食家畜》 2009年第1期22-27,共6页
利用微卫星标记技术,分析了山西黎城大青羊、吕梁黑山羊、波尔山羊、南江黄羊(黑)、南江黄羊(黄)五个山羊群体的分子水平上的遗传多样性,结果表明:7个微卫星位点均为高度多态位点。可以用于山羊群体遗传多样性的评估;平均多态... 利用微卫星标记技术,分析了山西黎城大青羊、吕梁黑山羊、波尔山羊、南江黄羊(黑)、南江黄羊(黄)五个山羊群体的分子水平上的遗传多样性,结果表明:7个微卫星位点均为高度多态位点。可以用于山羊群体遗传多样性的评估;平均多态信息含量(PIC)达0.8341~0.9026;5个山羊群体平均观察杂合度(0.6258-0.8629)均低于平均期望杂合度(0.8594—0.9115),证明5个山羊种群具有丰富的遗传多样性和广泛的遗传基础,但品种内存在着一定程度的近交,尤其波尔山羊近交较严重。以Nei氏标准遗传距离为基础的UPGMA和N-J聚类结果表明:吕粱黑山羊与南江黄羊(黑)首先聚为一类,而没和黎城大青羊先聚:国内四个山羊群体与国外品种波尔山羊亲缘关系较远。 展开更多
关键词 山羊 微卫星标记 遗传多样性 杂合度 nei氏遗传距离
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河南益母草野生居群遗传多样性的SCoT分析 被引量:10
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作者 张维瑞 韩远记 +2 位作者 薛愧玲 袁王俊 尚富德 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2013年第8期1022-1026,共5页
目的研究河南益母草野生居群遗传多样性。方法利用SCoT分子标记对位于河南伏牛、太行、大别和桐柏4大山脉的8个益母草居群66个样品进行遗传多样性分析。结果 10对引物共扩增出240条带,其中多态性条带为238条,多态性百分率(PPB)为99.17%... 目的研究河南益母草野生居群遗传多样性。方法利用SCoT分子标记对位于河南伏牛、太行、大别和桐柏4大山脉的8个益母草居群66个样品进行遗传多样性分析。结果 10对引物共扩增出240条带,其中多态性条带为238条,多态性百分率(PPB)为99.17%。Nei’s遗传多样性指数(H)平均值为0.264 2,Shannon’s多态性信息指数(I)平均值为0.39,遗传分化系数(Gst)为0.294 6,种群间基因流为1.197。Mantel Test分析表明,河南益母草居群间的亲缘关系与它们之间的地理距离有着明显的相关性(r=0.366 3,P<0.05)。结论河南野生益母草种群具有较高的遗传多样性,其遗传距离与地理距离存在明显的相关性。 展开更多
关键词 益母草 遗传多样性 neis遗传多样性指数 遗传分化系数 基因流
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蒲公英遗传多样性的ISSR分析 被引量:7
13
作者 李喜凤 邱天宝 +4 位作者 张红梅 胡春月 胡利欣 郑楠楠 唐露 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2012年第10期2025-2029,共5页
目的分析蒲公英的遗传多样性。方法采用ISSR分子标记对21个居群蒲公英遗传多样性进行分析,用软件Popgen32分析Nei’s基因多样性指数(H)和Shannon信息指数(I),采用NTSYS 2.10e软件进行聚类分析和主坐标分析。结果 16条ISSR引物共扩增出16... 目的分析蒲公英的遗传多样性。方法采用ISSR分子标记对21个居群蒲公英遗传多样性进行分析,用软件Popgen32分析Nei’s基因多样性指数(H)和Shannon信息指数(I),采用NTSYS 2.10e软件进行聚类分析和主坐标分析。结果 16条ISSR引物共扩增出166条条带,其中多态性条带152条,平均多态性百分率为90.4%,平均H为0.286 5,平均I为0.437 0;遗传距离和遗传一致度分别为0.156 2~0.590 2和0.554 2~0.855 4;UPMGA法进行聚类分析显示,聚类结果与地理来源有较强的一致性,可以看出来源于同一地区的蒲公英种质聚在一起,呈现出一定的地域性分布规律。结论采用ISSR分析蒲公英遗传多样性,蒲公英表现出丰富的多态性,表明可以用ISSR标记技术对蒲公英进行分子水平的遗传多样性分析。 展开更多
关键词 蒲公英 IssR 聚类分析 遗传多样性 neis基因多样性指数(H) shannon信息指数(I)
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壮药战骨种质资源遗传多样性ISSR分析 被引量:7
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作者 熊忠臣 史艳财 +3 位作者 漆小雪 邹蓉 蒋运生 韦记青 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2012年第10期2040-2044,共5页
目的对壮药战骨种质资源的遗传多样性进行研究。方法采用ISSR分子标记技术分析9个战骨种群的遗传多样性。结果 13条引物共检测到73个位点,其中65个位点具有多态性,多态位点百分率(PPL)为89.04%。战骨总的Nei’s基因多样度指数(H)为0.226... 目的对壮药战骨种质资源的遗传多样性进行研究。方法采用ISSR分子标记技术分析9个战骨种群的遗传多样性。结果 13条引物共检测到73个位点,其中65个位点具有多态性,多态位点百分率(PPL)为89.04%。战骨总的Nei’s基因多样度指数(H)为0.226 5,Shannon’s多样性信息指数(I)为0.357 2,各种群的平均H、I为0.147 6、0.221 9。种群间基因分化系数(Gst)为0.348 4,基因流(Nm)为0.935 1。9个种群可聚类划分为2个大种群组。结论战骨种群遗传多样性为中等偏低水平;战骨种群的遗传变异主要存在于种群内;战骨的生物学特性和分布区域的片段化是导致种群间出现一定的遗传分化和种群遗传多样性较低的主要原因。 展开更多
关键词 战骨 种质资源 遗传多样性 neis基因多样度指数 shannon’s多样性信息指数 IssR
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我国黄花蒿天然群体遗传多样性的SRAP分析 被引量:7
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作者 陈大霞 彭锐 +2 位作者 李隆云 崔广林 吴叶宽 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2011年第8期1591-1595,共5页
目的研究我国黄花蒿天然群体种质资源的遗传多样性,并对其进行SRAP分析。方法采用SRAP分子标记技术,以我国天然群体主要分布区域的60份黄花蒿种质资源为试验材料,运用Popgene version 1.31软件和Treeconw软件计算相关参数,UPGMA方法聚类... 目的研究我国黄花蒿天然群体种质资源的遗传多样性,并对其进行SRAP分析。方法采用SRAP分子标记技术,以我国天然群体主要分布区域的60份黄花蒿种质资源为试验材料,运用Popgene version 1.31软件和Treeconw软件计算相关参数,UPGMA方法聚类,构建亲缘关系树状图。结果 24对SRAP引物组合扩增出232条带,多态性比率(PPB)为81.47%。SRAP标记的Nei’s基因多样性(H)为0.190 5,Shannon’s信息指数(I)为0.300 0。青蒿素量高的4个地区之间,多态位点百分率在50.00%~61.21%,平均为55.82%,SRAP标记的H值为0.155 7~0.179 3,I值为0.237 9~0.276 6;SRAP检测不同材料间遗传相似系数为0.643 2~0.872 7,平均为0.754 7。结论 SRAP标记能有效地揭示我国野生黄花蒿丰富的遗传多样性,为黄花蒿新品种选育提供了物质基础。 展开更多
关键词 黄花蒿 sRAP 遗传多样性 neis基因多样性(H) shannon’s信息指数(I)
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