烟草NtRAX基因的克隆和序列分析

根据GenBank中拟南芥RAX基因序列,在烟草EST数据库中进行Blastp检索,获得与之同源性较高的蛋白质序列,选取同源性最高的蛋白质序列所对应的核酸序列,设计引物,获得中间片段,再运用中间片段设计引物,应用RACE方法获得其5′和3′末端cDNA序列,将获得的3段序列拼接,结合全长克隆测序验证,获得一个新的普通烟草基因,将其命名为NtRAX(NCBI登录号为JQ228591)。NtRAX的cDNA全长为1112 bp,5′端非编码区96 bp,3′端非编码区62 bp,编码区长度为954 bp,编码317个氨基酸,预测的分子量是35.42 KDa。对该基因进行序列分析和功能预测,得出该基因属于MYB基因家族,是具有转录激活活性的烟草腋芽分生组织形成的调控基因。