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Development of Nucleic Acid Sequence-Based Amplification Assay for Detection of Macrobrachium rosenbergii Nodavirus 被引量:2
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作者 Feng LIN Li LIU +5 位作者 Dong QIAN Guijie HAO Pengcheng SHENG Zheng CAO Xuemei YUAN Jinyu SHEN 《Agricultural Biotechnology》 CAS 2014年第3期42-45,共4页
A nucleic acid sequence-based amplification(NASBA)assay was established for the detection of Macrobrachium rosenbergii Nodavirus(MrNV).The specific primers were designed according to the high conserved region of R... A nucleic acid sequence-based amplification(NASBA)assay was established for the detection of Macrobrachium rosenbergii Nodavirus(MrNV).The specific primers were designed according to the high conserved region of RNA2 sequence of MrNV.The 224 bp specific amplification product was obtained in positive sample determined with 3%agarose gel electrophoresis,while no product was generated from shrimp infected with other viruses including DNA viruses(IHHNV,WSSV)and RNA viruses(TSV,IMNV,YHV).The detecting limit of the assay was 8pg nucleic acid,which is more sensitive than that of PCR method. 展开更多
关键词 Macrobrachium rosenbergii Nodavirus nucleic acid sequence-based amplification DETECTION
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Research progress and prospects of nucleic acid isothermal amplification technology
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作者 SHUHUI WU PING XU +1 位作者 XIANGBIN XU SONG-BAI LIU 《BIOCELL》 SCIE 2023年第11期2385-2395,共11页
Nucleic acid(DNA and RNA)detection and quantification methods play vital roles in molecular biology.With the development of molecular biology,isothermal amplification of DNA/RNA,as a new molecular biology technology,c... Nucleic acid(DNA and RNA)detection and quantification methods play vital roles in molecular biology.With the development of molecular biology,isothermal amplification of DNA/RNA,as a new molecular biology technology,can be amplified under isothermal condition,it has the advantages of high sensitivity,high specificity,and high efficiency,and has been applied in various fields of biotechnology,including disease diagnosis,pathogen detection,food hygiene and safety detection and so on.This paper introduces the progress of isothermal amplification technology,including rolling circle amplification(RCA),nucleic acid sequence-dependent amplification(NASBA),strand displacement amplification(SDA),loop-mediated isothermal amplification(LAMP),helicase-dependent amplification(HDA),recombinase polymerase amplification(RPA),cross-priming amplification(CPA),and its principle,advantages and disadvantages,and application development are briefly summarized. 展开更多
关键词 Isothermal amplification Rolling circle amplification nucleic acid sequence-based amplification Strand displacement amplification Loop-mediated isothermal amplification Helicase-dependent amplification Recombinase polymerase amplification Cross-primer amplification
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NASBA快速检测禽流感H5亚型病毒 被引量:18
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作者 单松华 刘乐庭 +1 位作者 陈家华 吴仲梁 《中国病毒学》 CSCD 2005年第3期288-292,共5页
采用建立的依赖核酸序列的扩增(Nucleicacidsequencebasedamplification,NASBA)对禽流感病毒3株H5亚型、1株H1、H3、H6亚型、3株禽流感H9亚型、5株不同宿主来源的新城疫病毒、鸭肝炎病毒、鸭瘟病毒、SPF鸡胚尿囊液及禽流感(H9)疫苗、新... 采用建立的依赖核酸序列的扩增(Nucleicacidsequencebasedamplification,NASBA)对禽流感病毒3株H5亚型、1株H1、H3、H6亚型、3株禽流感H9亚型、5株不同宿主来源的新城疫病毒、鸭肝炎病毒、鸭瘟病毒、SPF鸡胚尿囊液及禽流感(H9)疫苗、新城疫疫苗、传染性法氏囊病疫苗、传染性支气管炎疫苗进行检测,结果NASBA(H5试剂)仅检测到禽流感病毒H5亚型,表明方法的特异性强。采用已知禽流感病毒A/Chicken/HK/1000/97(H5N1)的鸡胚尿囊液(ELD5010-7.5/mL),经10倍连续稀释,将经典的鸡胚病原分离法和NASBA进行比较,二种方法的灵敏度相当。用A/Chicken/HK/1000/97(H5N1)病毒人工感染SPF鸡、商品鸡,采用NASBA和病原分离法同时对人工感染鸡的粪拭子、血液进行了动态检测;采集感染死亡鸡的组织脏器,共检测了101个组织脏器,两种方法的符合率为90%(87/97)。 展开更多
关键词 禽流感H5亚型病毒 nasba 鸡胚病毒分离法 快速检测
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等温条件下序列特异性核酸扩增技术:NASBA 被引量:1
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作者 刘敬忠 于力 孙燕 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 1994年第2期27-29,共3页
介绍了一种能在等温条件下进行序列特异性核酸体外扩增的技术──NASBA(NucleicAcidSpecific-BasedAmplification)。该技术同时使用AMV反转录酶、T7RNA聚合酶及RNaseH,在... 介绍了一种能在等温条件下进行序列特异性核酸体外扩增的技术──NASBA(NucleicAcidSpecific-BasedAmplification)。该技术同时使用AMV反转录酶、T7RNA聚合酶及RNaseH,在同一个恒定温度下协同作用,使特异的核酸序列得以扩增至106~108倍。起始的模板可以是RNA,也可以是DNA,尤其适用于微量mRNA的特异性扩增。本文研究了各种因素对NASBA扩增效率的影响,找到了最适反应条件。并成功地从人脐带血总RNA中扩增了人T细胞受体γ链mRNA。 展开更多
关键词 核酸体外扩增 序列 等温条件
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高致病性猪生殖与呼吸综合征病毒NASBA-ELISA检测方法的建立 被引量:11
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作者 梁海霞 薛青红 +4 位作者 高金源 邓永 陈晓春 吴华伟 郎洪武 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期401-404,共4页
针对猪生殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)ORF1中编码Nsp2的基因序列设计引物,建立了核酸序列依赖性扩增(NASBA)方法,并结合微孔板中液相杂交和酶标显色反应检测NASBA扩增产物,建立了检测高致病性PRRSV的NASBA-ELISA。琼脂糖凝胶电泳显示,NASB... 针对猪生殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)ORF1中编码Nsp2的基因序列设计引物,建立了核酸序列依赖性扩增(NASBA)方法,并结合微孔板中液相杂交和酶标显色反应检测NASBA扩增产物,建立了检测高致病性PRRSV的NASBA-ELISA。琼脂糖凝胶电泳显示,NASBA方法扩增出了特异性的目的条带。将NASBA产物RNA系列稀释后同时进行了ELISA和Northern杂交。结果显示,ELISA和Nor-thern杂交最高可分别检测到1∶50和1∶30稀释的产物RNA。采用建立的NASBA-ELISA可检测到101.83TCID50/mL的HuN4株PRRSV。该方法只对3株高致病性PRRSV的检测结果为阳性,对经典株PRRSV和其他猪源病毒的检测结果均为阴性。结果表明,NASBA-ELISA能够敏感并特异地检测高致病性PRRSV。 展开更多
关键词 高致病性猪生殖与呼吸综合征病毒 核酸序列依赖性扩增 酶联免疫吸附试验
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bDNA和NASBA法定量检测HIV-1病毒载量的比较研究 被引量:8
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作者 郭秋艳 黄晓婕 +10 位作者 代丽丽 汪习成 魏飞力 计云霞 石英 夏伟 郭彩萍 吴亚松 张彤 陈德喜 吴昊 《中国病原生物学杂志》 CSCD 2007年第5期326-328,共3页
目的比较分支DNA杂交实验(branched DNA,bDNA)和核酸序列扩增实验(Nucleic acid sequence-based am-plification,NASBA)两种方法检测人类免疫缺陷病毒1型病毒(HIV-1)病毒载量间的一致性。方法对25例HIV感染者/艾滋病(Acquired immune de... 目的比较分支DNA杂交实验(branched DNA,bDNA)和核酸序列扩增实验(Nucleic acid sequence-based am-plification,NASBA)两种方法检测人类免疫缺陷病毒1型病毒(HIV-1)病毒载量间的一致性。方法对25例HIV感染者/艾滋病(Acquired immune deficiency syndrome,AIDS)患者血浆标本同时用bDNA法和NASBA法检测HIV-1病毒载量,并用流式细胞术检测患者外周血CD4+、CD8+T淋巴细胞。结果bDNA法及NASBA法测得HIV-1病毒载量平均值分别为(4.398±0.580)log拷贝数/ml和(4.488±0.602)log拷贝数/ml,差异无统计学意义(t=1.210,P>0.05);两种方法检测出的病毒载量呈显著直线相关(r=0.8004,P<0.001),且与患者的CD4+T细胞数及CD4+/CD8+比值均呈显著直线负相关。结论bDNA法和NASBA法检测HIV-1病毒载量具有高度一致性,在实际工作中均可选用。 展开更多
关键词 HIV病毒载量 nasba bDNA法
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等温核酸扩增技术进展 被引量:11
7
作者 梁海燕 刘文鑫 杨志刚 《中国医学创新》 CAS 2017年第16期145-148,共4页
等温核酸扩增技术已广泛应用于生物分析的体外核酸扩增,本文综合国内外报道,对等温核酸扩增技术的进展进行简要综述,包括依赖核酸序列型扩增(NASBA)、链置换扩增(SDA)、滚环扩增(RCA)、环介导等温扩增(LAMP)、单引物等温扩增(SPIA)、交... 等温核酸扩增技术已广泛应用于生物分析的体外核酸扩增,本文综合国内外报道,对等温核酸扩增技术的进展进行简要综述,包括依赖核酸序列型扩增(NASBA)、链置换扩增(SDA)、滚环扩增(RCA)、环介导等温扩增(LAMP)、单引物等温扩增(SPIA)、交叉引物等温扩增(CPA)、新型等温多自配引发扩增(IMSA)的原理、重要特性、应用及未来的展望。 展开更多
关键词 等温核酸扩增 依赖核酸序列型扩增 链置换扩增 环介导等温扩增 新型等温多自配引发扩增
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NASBA(依赖核酸序列的扩增)技术及其在病毒检测中的应用 被引量:23
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作者 高闪电 常惠芸 +3 位作者 丛国正 独军政 邵军军 林彤 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期80-85,共6页
NASBA(nucleic acid sequence—based amplification)即依赖核酸序列的扩增技术,是一种扩增RNA的新技术,是由一对引物介导的、连续均一的、体外特异核苷酸序列等温扩增的酶促反应过程。反应在42%进行,可以在2h左右将模板RNA扩增... NASBA(nucleic acid sequence—based amplification)即依赖核酸序列的扩增技术,是一种扩增RNA的新技术,是由一对引物介导的、连续均一的、体外特异核苷酸序列等温扩增的酶促反应过程。反应在42%进行,可以在2h左右将模板RNA扩增约10卧佗倍,不需特殊的仪器。NASBA已经广泛应用于细菌、病毒等多种病原微生物的检测,就NASBA的技术原理及其在病毒检测中的应用作一综述。 展开更多
关键词 依赖核酸序列的扩增(nasba) 恒温扩增 病毒检测
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番茄斑萎病毒NASBA检测方法的建立 被引量:8
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作者 吴兴海 陈长法 +1 位作者 封立平 邵秀玲 《植物保护学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期900-906,共7页
为建立一种快速检测番茄斑萎病毒(Tomato spotted wilt virus,TSWV)的方法,以TSWV-CP1/TSWV-CP2为引物对TSWV的N基因进行PCR扩增及序列测定,在TSWV N基因的高度保守区设计特异性扩增引物NA-P1/NA-P2进行核酸序列依赖性扩增(NASBA)反应,... 为建立一种快速检测番茄斑萎病毒(Tomato spotted wilt virus,TSWV)的方法,以TSWV-CP1/TSWV-CP2为引物对TSWV的N基因进行PCR扩增及序列测定,在TSWV N基因的高度保守区设计特异性扩增引物NA-P1/NA-P2进行核酸序列依赖性扩增(NASBA)反应,并对NASBA方法的特异性和灵敏度进行验证。结果表明,建立的NASBA方法最佳反应时间为1.5 h。该方法特异性较好,只有TSWV阳性样品中出现了预期大小为235 bp的扩增产物,与烟草环斑病毒(Tobacco ring spot virus,TRSV)、番茄黑环病毒(Tomato black ring virus,TBRV)、黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)、番茄花叶病毒(Tomato mosaic virus,ToMV)、番茄黄化曲叶病毒(Tomato yellow curl virus,ToYCLV)无交叉反应。灵敏度验证中,实时荧光RT-PCR的灵敏度最高,为1.56×10^(-5)ng/μL感病植物RNA模板,NASBA次之,为1.56×10^(-4)ng/μL,普通RT-PCR最低,为1.56×10^(-3)ng/μL。在对9份实际样品检测中,NASBA的阳性检出率与实时荧光RT-PCR、普通RT-PCR相同,均为33%,高于ELISA检测的22%。表明NASBA方法适用于实际样品检测,可对TSWV进行快速检测。 展开更多
关键词 番茄斑萎病毒 核酸序列依赖性扩增 检测
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不同方法定量检测HIV/AIDS病例病毒载量分析 被引量:2
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作者 边仕超 袁珣 +3 位作者 肖林 陈世国 潘露 邓勇 《预防医学情报杂志》 CAS 2013年第11期981-984,共4页
目的比较2种方法检测人类免疫缺陷病毒(HIV)1型病毒载量的相关性及一致性,为合理评价HIV/AIDS病程进展及抗HIV药物疗效提供参考。方法对四川省凉山州95例在治HIV/AIDS的血浆样本同时用分支DNA杂交实验(bDNA)法和核酸序列扩增实验(NASBA... 目的比较2种方法检测人类免疫缺陷病毒(HIV)1型病毒载量的相关性及一致性,为合理评价HIV/AIDS病程进展及抗HIV药物疗效提供参考。方法对四川省凉山州95例在治HIV/AIDS的血浆样本同时用分支DNA杂交实验(bDNA)法和核酸序列扩增实验(NASBA)法检测HIV-1病毒载量,结果进行比较分析。结果该2种方法测得阳性样本均值bDNA法为3.75±1.05 log copies/mL,NASBA法为4.22±1.23 log copies/mL,差异有统计学意义(t=6.09,P<0.05);2种方法测出的病毒载量呈显著直线相关(r=0.852,P<0.01);2种方法测出的病毒载量阳性率差异无统计学意义(χ2=0.836,P>0.05)。结论 bDNA法和NASBA法检测HIV-1病毒载量具有高度的一致性,在实际工作中均可选用,但是两者检测结果的数值不能完全等同。建议抗HIV药物疗效评价最好应用同一种方法的检测结果,使其治疗前后的结果具有可比性和一致性。 展开更多
关键词 HIV病毒载量 nasba bDNA法
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