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锦鲤疱疹病毒CJ株ORF27基因克隆及生物信息学分析
被引量:
2
1
作者
王友超
周井祥
+1 位作者
王好
邢程
《水产学杂志》
CAS
2014年第2期20-24,共5页
为了解锦鲤疱疹病毒中国吉林株(KHV-CJ)ORF27基因编码蛋白的结构特征和进化关系,采用镜鲤尾鳍原代细胞增殖KHV-CJ,提取其DNA,经PCR扩增,获得ORF27基因,将其克隆在pMD18-T载体中,构建重组质粒。应用生物信息学方法初步分析KHV-CJORF27基...
为了解锦鲤疱疹病毒中国吉林株(KHV-CJ)ORF27基因编码蛋白的结构特征和进化关系,采用镜鲤尾鳍原代细胞增殖KHV-CJ,提取其DNA,经PCR扩增,获得ORF27基因,将其克隆在pMD18-T载体中,构建重组质粒。应用生物信息学方法初步分析KHV-CJORF27基因的结构和功能,并与GenBank上公布的三株KHV构建系统进化树。结果显示:获得207bp的ORF27基因,编码69个氨基酸;预测ORF27编码蛋白的理论分子质量为7366.62Da,等电点为4.487;抗原表位预测显示抗原性良好;编码蛋白存在1个N-糖基化位点、4个O糖基化位点和5个磷酸化位点;系统进化树分析表明与锦鲤疱疹病毒美国株(KHV-U)属同一分支。
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关键词
锦鲤疱疹病毒
orf27
基因
生物信息学分析
下载PDF
职称材料
题名
锦鲤疱疹病毒CJ株ORF27基因克隆及生物信息学分析
被引量:
2
1
作者
王友超
周井祥
王好
邢程
机构
吉林农业大学动物科学技术学院动物生产及产品质量安全教育部重点实验室
出处
《水产学杂志》
CAS
2014年第2期20-24,共5页
文摘
为了解锦鲤疱疹病毒中国吉林株(KHV-CJ)ORF27基因编码蛋白的结构特征和进化关系,采用镜鲤尾鳍原代细胞增殖KHV-CJ,提取其DNA,经PCR扩增,获得ORF27基因,将其克隆在pMD18-T载体中,构建重组质粒。应用生物信息学方法初步分析KHV-CJORF27基因的结构和功能,并与GenBank上公布的三株KHV构建系统进化树。结果显示:获得207bp的ORF27基因,编码69个氨基酸;预测ORF27编码蛋白的理论分子质量为7366.62Da,等电点为4.487;抗原表位预测显示抗原性良好;编码蛋白存在1个N-糖基化位点、4个O糖基化位点和5个磷酸化位点;系统进化树分析表明与锦鲤疱疹病毒美国株(KHV-U)属同一分支。
关键词
锦鲤疱疹病毒
orf27
基因
生物信息学分析
Keywords
koi herpesvirus
orf27 gene
bioinformatics analysis
分类号
S941.41 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
锦鲤疱疹病毒CJ株ORF27基因克隆及生物信息学分析
王友超
周井祥
王好
邢程
《水产学杂志》
CAS
2014
2
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职称材料
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