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猕猴桃OSCA基因家族鉴定及其在非生物胁迫下的表达分析
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作者 徐子怡 罗晨宇 +4 位作者 占坤 邱荣辉 黄春辉 徐小彪 贾东峰 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期436-447,共12页
【目的】揭示OSCA家族基因在猕猴桃响应非生物胁迫中的表达特征,为猕猴桃OSCA基因功能分析与猕猴桃抗逆性遗传改良提供参考。【方法】利用生物信息学方法对全基因组范围内猕猴桃OSCA基因家族成员进行鉴定和综合分析,通过qRT-PCR法分析... 【目的】揭示OSCA家族基因在猕猴桃响应非生物胁迫中的表达特征,为猕猴桃OSCA基因功能分析与猕猴桃抗逆性遗传改良提供参考。【方法】利用生物信息学方法对全基因组范围内猕猴桃OSCA基因家族成员进行鉴定和综合分析,通过qRT-PCR法分析它们在不同非生物胁迫下的表达特征。【结果】在中华猕猴桃基因组中共鉴定出16个OSCA基因,它们不均等地分布于13条染色体上,其启动子区域存在大量响应逆境胁迫的顺式作用元件。OSCA3在干旱、盐、高温和低温胁迫下表达量均较显著上调,OSCA8在干旱、盐和低温胁迫下表达量显著上调,OSCA1和OSCA14在低温胁迫处理下表达量显著上调,OSCA7和OSCA15均显著响应干旱胁迫。【结论】鉴定出6个受非生物胁迫显著诱导表达的猕猴桃OSCA基因,为进一步研究OSCA基因在响应猕猴桃非生物胁迫中的分子功能提供了重要依据。 展开更多
关键词 猕猴桃 osca基因家族 非生物胁迫 基因表达
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茶树OSCA基因家族的鉴定及表达分析
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作者 刘丹丹 吴琼 +2 位作者 焦小雨 孙明慧 王文杰 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期10-22,共13页
钙通透性阳离子通道蛋白(OSCA)在植物调节高渗胁迫中发挥着重要作用。为了解OSCA基因家族在茶树响应干旱胁迫中的作用,本研究基于茶树全基因组数据对OSCA基因家族进行鉴定,分析CsOSCAs基因和蛋白结构以及启动子顺式作用元件,并对CsOSCA... 钙通透性阳离子通道蛋白(OSCA)在植物调节高渗胁迫中发挥着重要作用。为了解OSCA基因家族在茶树响应干旱胁迫中的作用,本研究基于茶树全基因组数据对OSCA基因家族进行鉴定,分析CsOSCAs基因和蛋白结构以及启动子顺式作用元件,并对CsOSCAs在茶树不同组织、不同抗旱性品种间和干旱胁迫下的表达模式进行分析。结果表明:茶树基因组包含12个OSCA基因家族成员,分别命名为CsOSCA1~CsOSCA12;CsOSCAs基因编码的氨基酸序列长度为667~831 bp,蛋白分子量在76630.55~93563.99 kDa之间,等电点在6.15~9.33之间,含有9~12个跨膜结构域,均含有特征保守结构域DUF221,根据系统进化关系可以分为4个亚族;10个CsOSCAs基因定位于茶树7条染色体上,2个CsOSCAs基因定位于未锚定染色体的contig上;CsOSCAs基因编码的蛋白二级结构含有32%~38%的跨膜结构和60%~68%的α-螺旋;CsOSCAs基因具有组织表达特异性,CsOSCA2、CsOSCA3、CsOSCA11、CsOSCA12基因在干旱敏感的品种CN98中的表达量显著高于其他2个耐旱品种,9个基因响应PEG胁迫,其中CsOSCA2、CsOSCA3、CSOSCA5、CsOSCA8、CsOSCA10和CsOSCA12受干旱胁迫强烈诱导;进一步分析启动子顺式作用元件显示,6个基因含有干旱诱导响应元件,11个基因含有脱落酸响应元件。由此推测茶树OSCA基因家族在茶树响应干旱胁迫中发挥着重要的作用,此研究为茶树OSCA基因功能分析与茶树抗逆性研究提供参考。 展开更多
关键词 茶树 osca基因家族 Ca^(2+)通道 全基因组表达分析
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藜麦OSCA基因家族的鉴定及进化分析
3
作者 李凤 曹慧芬 +3 位作者 刘丽珍 董文姝 黄子娟 唐纪文 《山西大同大学学报(自然科学版)》 2023年第3期76-81,共6页
目的 对藜麦高渗门控钙渗透通道(OSCA)基因家族进行全基因水平上的鉴定,以挖掘藜麦Ca2+非选择性阳离子通道OSCA家族成员。方法 利用BLASTP、MEGA7、GSDS、KaKs_Calculator等生物信息学手段对藜麦OSCA家族进行鉴定、进化分析、基因结构... 目的 对藜麦高渗门控钙渗透通道(OSCA)基因家族进行全基因水平上的鉴定,以挖掘藜麦Ca2+非选择性阳离子通道OSCA家族成员。方法 利用BLASTP、MEGA7、GSDS、KaKs_Calculator等生物信息学手段对藜麦OSCA家族进行鉴定、进化分析、基因结构及基因复制分析。结果 藜麦基因组中含有21个OSCA成员,进化分类划分成4个亚家族(I、II、III和IV),分别含有6、8、5和2个OSCA,且各个亚家族基因结构呈现保守性。此外,在藜麦中共鉴定出5对OSCA复制基因,且在基因复制发生之后,有80%的OSCA复制基因经历了强烈的纯化选择。结论 藜麦OSCA复制基因的功能可能没有发生明显的分化。 展开更多
关键词 藜麦 osca基因家族 鉴定 进化分析
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水稻β-石竹烯合成酶基因OsCAS的克隆鉴定、原核表达及其遗传转化 被引量:6
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作者 戈林泉 周国鑫 +2 位作者 王祺 祝树德 娄永根 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期365-371,共7页
为阐明水稻β-石竹烯在调节水稻、害虫及其天敌相互关系中的作用,克隆鉴定了一个水稻β-石竹烯合成酶基因OsCAS,并对其原核表达与遗传转化进行研究.该基因的cDNA全长1731 bp,包含一个1728 bp的开放阅读框,编码一个由576个氨基酸组成的蛋... 为阐明水稻β-石竹烯在调节水稻、害虫及其天敌相互关系中的作用,克隆鉴定了一个水稻β-石竹烯合成酶基因OsCAS,并对其原核表达与遗传转化进行研究.该基因的cDNA全长1731 bp,包含一个1728 bp的开放阅读框,编码一个由576个氨基酸组成的蛋白,预测分子量66.5 kDa.系统进化树分析表明,水稻OsCAS基因编码蛋白的氨基酸序列与同为单子叶植物玉米的β-石竹烯合成酶氨基酸序列同源性达99%,而与其他植物(拟南芥、青篙、黄瓜)的同源性仅51%.褐飞虱为害和茉莉酸处理能明显上调OsCAS基因的表达水平.同时原核表达了OsCAS基因,并利用农杆菌转化系统获得OsCAS基因过量表达和RNAi的水稻品系,为分析OsCAS基因的生化与生物学功能奠定了基础. 展开更多
关键词 水稻 β-石竹烯合成酶 褐飞虱 oscaS 原核表达 遗传转化
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番茄OSCA基因家族鉴定及不同胁迫条件下表达分析 被引量:8
5
作者 王傲雪 张可为 +2 位作者 张瑶 陈秀玲 刘佳音 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期19-28,共10页
为阐明高渗性钙离子通道OSCA基因在不同胁迫条件下作用,基于番茄全基因组信息,从栽培番茄中鉴定出12个SlOSCA基因,均含DUF221结构域,分别位于1、2、4、6、7、8、9、12号染色体上,亚细胞定位分析表明均位于质膜和高尔基体上。系统进化分... 为阐明高渗性钙离子通道OSCA基因在不同胁迫条件下作用,基于番茄全基因组信息,从栽培番茄中鉴定出12个SlOSCA基因,均含DUF221结构域,分别位于1、2、4、6、7、8、9、12号染色体上,亚细胞定位分析表明均位于质膜和高尔基体上。系统进化分析显示SlOSCA基因家族可分为5个进化群。根据番茄表达量数据库组织特异性分析发现,SlOSCA基因家族在不同组织部位表达量不同,其中根部和叶片表达量相对较高。Real-time PCR结果表明,多数SlOSCA基因响应干旱、盐、低温、ABA和灰霉病胁迫。SlOSCA基因响应ABA胁迫普遍强烈,受低温胁迫影响较小。其中SlOSCA9受干旱、盐和ABA胁迫强烈诱导,SlOSCA10受灰霉病胁迫强烈诱导。 展开更多
关键词 番茄 osca 家族分析 表达分析 生物胁迫 非生物胁迫
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辣椒OSCA基因家族的全基因组鉴定及不同胁迫条件下表达分析 被引量:3
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作者 李嘉琪 罗石磊 +2 位作者 张帅磊 张文渊 张国斌 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期187-196,共10页
钙通透性阳离子通道蛋白(OSCA)在渗透胁迫感应中发挥重要的作用。本研究利用辣椒(Capsicum annuum L.)全基因组信息,鉴定出14个OSCA基因(CaOSCA),染色体定位及同源性分析表明,它们分别位于1、2、4、6、7、8、9、12号染色体上,亚细胞定... 钙通透性阳离子通道蛋白(OSCA)在渗透胁迫感应中发挥重要的作用。本研究利用辣椒(Capsicum annuum L.)全基因组信息,鉴定出14个OSCA基因(CaOSCA),染色体定位及同源性分析表明,它们分别位于1、2、4、6、7、8、9、12号染色体上,亚细胞定位预测表明其编码产物均位于质膜上。系统进化树分析这些基因可分为4个组,分别命名为Ⅰ~Ⅳ,与拟南芥存在11对共线性基因。顺式作用元件预测显示CaOSCA基因能响应激素和非生物胁迫,表达分析显示多数CaOSCA基因能响应干旱、盐和低温胁迫。干旱胁迫24 h时,CaOSCA8和CaOSCA11相对表达量显著高于对照,分别上升14和13倍。 展开更多
关键词 辣椒 osca 家族分析 非生物胁迫
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烟草OSCA基因家族鉴定及非生物胁迫诱导表达模式分析 被引量:3
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作者 邓智超 田冬冬 +6 位作者 宋青松 郭存 文利超 王奇 初雨蒙 刘涛 郭永峰 《中国烟草科学》 CSCD 北大核心 2022年第1期14-21,共8页
高渗门控钙渗透通道(OSCA,hyperosmolal-gatedcalcium-permeable channel)是一种Ca2+非选择性阳离子通道,OSCA家族含有钙依赖性通道DUF221结构域。为了进一步了解烟草OSCA基因家族特征和功能,本研究从栽培烟草K326基因组中鉴定到23个OSC... 高渗门控钙渗透通道(OSCA,hyperosmolal-gatedcalcium-permeable channel)是一种Ca2+非选择性阳离子通道,OSCA家族含有钙依赖性通道DUF221结构域。为了进一步了解烟草OSCA基因家族特征和功能,本研究从栽培烟草K326基因组中鉴定到23个OSCA家族基因,并对Nt OSCA家族系统进化关系、基因结构与蛋白结构域、启动子、不同组织器官及干旱和盐胁迫下表达模式进行分析。根据进化关系,Nt OSCA基因家族被分为4个亚家族,并且同一亚家族成员间蛋白及基因结构相似。启动子分析结果表明,Nt OSCA家族基因启动子中存在着多种不同的胁迫响应元件,其中干旱响应元件和脱落酸响应元件较多。进一步组织表达分析结果表明,Nt OSCA基因家族成员在不同组织的表达量不同。干旱和盐胁迫表达模式分析表明,20个Nt OSCA基因在干旱胁迫下表达量上调,15个Nt OSCA基因在盐胁迫下表达量上调。这说明OSCA基因家族在烟草抗旱和抗盐胁迫中具有重要作用。 展开更多
关键词 烟草 osca 家族分析 表达分析 干旱胁迫 盐胁迫
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大豆基因组中OSCA基因家族的进化和表达分析 被引量:11
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作者 李建伟 杨珺凯 +4 位作者 贾博为 孙明哲 刘瑀 殷奎德 孙晓丽 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期589-599,共11页
OSCA是钙通透性阳离子通道蛋白,在高渗胁迫感应中发挥重要的作用。本研究利用生物信息,筛选并鉴定出21个大豆OSCA家族成员。通过染色体定位及同源性分析表明,OSCA家族成员分布在15条染色体上,且存在大量的复制现象;通过Ka/Ks分析表明大... OSCA是钙通透性阳离子通道蛋白,在高渗胁迫感应中发挥重要的作用。本研究利用生物信息,筛选并鉴定出21个大豆OSCA家族成员。通过染色体定位及同源性分析表明,OSCA家族成员分布在15条染色体上,且存在大量的复制现象;通过Ka/Ks分析表明大豆OSCA家族基因的进化经受纯化选择压力。通过构建系统进化树,将大豆OSCA家族分为2个亚家族,第一亚家族又分为三组(GroupⅠ~Ⅲ),且各组内成员具有相似的内含子-外显子组成模式。保守性分析结果表明,大豆OSCA基因家族很保守,都包含3个功能结构域(即Late exocytosis,Cytosolic domain of 10TM putative phosphate transporter和Calcium-dependent channel);进一步组织表达分析结果表明,OSCA基因家族在不同组织的表达量不同。盐碱胁迫表达模式分析表明,OSCA3.1上调表达变化倍数最大。进一步的启动子分析结果表明,这些盐碱胁迫应答的基因启动子中存在着多种不同的胁迫响应元件,其中干旱和ABA应答相关的元件较多。以上结果为OSCA基因家族提供了新的有价值的信息,并为后续研究提供了重要参考。 展开更多
关键词 大豆 osca 家族分析 表达分析
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OSCA-CFAR在K分布杂波边缘中的性能分析 被引量:2
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作者 郝程鹏 原建平 +1 位作者 刘斌 侯朝焕 《弹箭与制导学报》 CSCD 北大核心 2008年第4期203-205,208,共4页
文中研究有序统计平均(OSCA)恒虚警检测器在K分布杂波边缘中的性能。推导出该检测器在K分布杂波边缘中虚警概率的解析表达式,分析了它抗干扰边缘的性能,并与OS,OSGO等检测器进行了比较,结果表明OSCA的抗K分布边缘干扰的性能优于OS,稍逊... 文中研究有序统计平均(OSCA)恒虚警检测器在K分布杂波边缘中的性能。推导出该检测器在K分布杂波边缘中虚警概率的解析表达式,分析了它抗干扰边缘的性能,并与OS,OSGO等检测器进行了比较,结果表明OSCA的抗K分布边缘干扰的性能优于OS,稍逊于OSGO。 展开更多
关键词 K分布杂波边缘 恒虚警 有序统计平均
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Genome-wide identification of OSCA gene family and their potential function in the regulation of dehydration and salt stress in Gossypium hirsutum 被引量:8
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作者 YANG Xiu XU Yanchao +8 位作者 YANG Fangfang MAGWANGA Richard Odongo CAI Xiaoyan WANG Xingxing WANG Yuhong HOU Yuqing WANG Kunbo LIU Fang ZHOU Zhongli 《Journal of Cotton Research》 2019年第2期87-104,共18页
Background:Cotton(Gossypium hirsutum) provides the largest natural fiber for the textile manufacturing industries,but its production is on the decline due to the effects of salinity.Soil salt-alkalization leads to dam... Background:Cotton(Gossypium hirsutum) provides the largest natural fiber for the textile manufacturing industries,but its production is on the decline due to the effects of salinity.Soil salt-alkalization leads to damage in cotton growth and a decrease in yields.Hyperosmolality-gated calcium-permeable channels(OSCA) have been found to be involved in the detection of extracellular changes which trigger an increase in cytosolic free calcium concentration.Hyperosmolality-induced calcium ion increases have been widely speculated to be playing a role in osmosensing in plants.However,the molecular nature of the corresponding calcium ion channels remains unclearly.In this research work,we describe the OSCA genes and their putative function in osmosensing in plants by carrying out genomewide identification,characterization and functional analysis of the significantly up-regulated OSCA gene,GhOSCA1.1 through reverse genetics.Result:A total of 35,21 and 22 OSCA genes were identified in G.hirsutum,G.arboreum,and G.raimondii genomes,respectively,and were classified into four different clades according to their gene structure and phylogenetic relationship.Gene and protein structure analysis indicated that 35 GhOSCA genes contained a conserved RSN17 TM(PF02714) domain.Moreover,the cis-regulatory element analysis indicated that the OSCA genes were involved in response to abiotic stress.Furthermore,the knockdown of one of the highly up-regulated genes,GhOSCA1.1 showed that the virus-induced gene silenced(VIGS) plants were highly sensitive to dehydration and salinity stresses compared with the none VIGS plants as evident with higher concentration levels of oxidant enzymes compared with the antioxidant enzymes on the leaves of the stressed plants.Conclusion:This study provides the first systematic analysis of the OSCA gene family and will be important for understanding the putative functions of the proteins encoded by the OSCA genes in cotton.These results provide a new insight of defense responses in general and lay the foundation for further investigation of the molecular role played by the OSCA genes,thereby providing suitable approaches to improve crop performance under salinity and drought stress conditions. 展开更多
关键词 osca gene family GOSSYPIUM hirsutum VIGS Salt and DEHYDRATION stress
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西瓜OSCA基因家族全基因组鉴定及胁迫响应分析
11
作者 张瑜 吴才君 +4 位作者 苏文桢 周聪 滕丽姚 涂志伟 朱强龙 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期3330-3339,共10页
【目的】对西瓜OSCA基因家族进行成员鉴定、系统发育分析以及胁迫响应分析,为揭示西瓜OSCA基因生物学功能和抗逆分子机制提供参考依据。【方法】运用生物信息学的方法从西瓜全基因组数据库中鉴定出西瓜OSCA基因家族成员,根据染色体定位... 【目的】对西瓜OSCA基因家族进行成员鉴定、系统发育分析以及胁迫响应分析,为揭示西瓜OSCA基因生物学功能和抗逆分子机制提供参考依据。【方法】运用生物信息学的方法从西瓜全基因组数据库中鉴定出西瓜OSCA基因家族成员,根据染色体定位信息进行命名。对基因家族成员染色体位置、基因结构、共线性、启动子、蛋白结构和系统发育等进行全面分析。利用转录组数据和qRT-PCR分析西瓜OSCA基因在胁迫条件下的表达情况。【结果】西瓜OSCA基因家族有10个成员,不均等地分布在6条染色体上。西瓜OSCA蛋白分子量变化范围为24.59~91.97 kD,氨基酸数量为214~809 aa,多数定位于质膜上。共线性分析结果表明,西瓜OSCA基因在进化过程中发生了片段复制事件。西瓜OSCA基因家族分为三大类群,同一类群成员的外显子一内含子的组成模式、蛋白保守基序排列、蛋白二级结构数量比例和蛋白三级结构模型均相似。西瓜、水稻、番茄和拟南芥的OSCA基因被分为6个亚族,每个亚族均有西瓜OSCA基因分布。西瓜OSCA基因启动子区域含有厌氧诱导、冷胁迫应答、光反应和干旱胁迫应答等多种非生物胁迫响应元件。在干旱、低温和盐胁迫下,西瓜OSCA基因家族各成员表达量均有不同程度变化,其中ClaOSCA3和ClaOSCA5在3种不同胁迫条件下表达量均有显著差异(P<0.05)。【结论】西瓜OSCA基因在进化过程中具有一定保守性,与拟南芥、水稻和番茄OSCA基因存在较近亲缘关系。西瓜OSCA基因家族内部存在功能分化,ClaOSCA3和ClaOSCA5可能是胁迫响应机制中的重要抗逆基因。 展开更多
关键词 西瓜 osca基因 胁迫响应 生物信息学
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分布式OSCA-CFAR检测系统的检测性能
12
作者 宋玉珍 刘炼 曲付勇 《现代电子技术》 2010年第14期131-133,共3页
分布式检测系统可以提供更高的信噪比,提高系统在复杂电磁环境下的生存能力,抗干扰能力。由于OSCA-CFAR检测器具有较好的抗干扰性能,因此,在此研究了分布式OSCA-CFAR检测系统采用"AND","OR"融合准则时在非均匀背景... 分布式检测系统可以提供更高的信噪比,提高系统在复杂电磁环境下的生存能力,抗干扰能力。由于OSCA-CFAR检测器具有较好的抗干扰性能,因此,在此研究了分布式OSCA-CFAR检测系统采用"AND","OR"融合准则时在非均匀背景下的检测性能。分析表明,分布式OSCA-CFAR检测系统采用"OR"融合准则时在非均匀背景下具有更好的抗干扰性能。 展开更多
关键词 分布式检测 恒虚警 有序统计平均 融合准则
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植物OSCA1家族的起源与进化
13
作者 柴利芳 《安徽农业科学》 CAS 2019年第20期1-6,17,共7页
OSCA(reduced hyperosmolality-induced[Ca2+]iincreasechannel)是高渗性门控非选择性的钙渗透阳离子通道,它在感受外源和内源的渗透变化以及调节植物生长发育中起着关键作用。目前关于OSCA1家族的研究大多集中在功能方面,而关于系统发... OSCA(reduced hyperosmolality-induced[Ca2+]iincreasechannel)是高渗性门控非选择性的钙渗透阳离子通道,它在感受外源和内源的渗透变化以及调节植物生长发育中起着关键作用。目前关于OSCA1家族的研究大多集中在功能方面,而关于系统发育分析的研究较少,尤其是在植物界没有采集大量的样本并进行深入研究。通过对植物界目前已完成全基因组测序的82个物种OSCA1家族的系统发育分析来探究该家族的起源与进化。研究表明,OSCA1在被子植物中可以分为四大分支(OSCA1.2、OSCA1.5、OSCA1.7和OSCA1.8),且该家族在整个高等植物中为一个单系;在OSCA1家族的8个成员中均发生了基因重复事件;OSCA1家族在低等到高等植物中的数量分布大致呈现递增趋势。以上结果不仅可以完善植物界中OSCA1家族的进化历史,而且能够为进一步研究其功能提供充足的理论依据。 展开更多
关键词 osca 通道蛋白 基因重复 系统发育
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正宗玛莎拉蒂死灰复燃OSCA2500GT
14
作者 顾矾 《交通世界》 2000年第4期16-17,共2页
提起OSCA,10个人当中可能有10个人没听说过这个名字,更不用说它和玛莎拉蒂的关系了。OSCA是一家意大利汽车制造公司的名称缩写,然而就是在意大利,知道它的人也不多,因为这家公司在34年前就已经死掉了。
关键词 轿车 玛莎拉蒂 osca2500TG 技术参数
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缫丝花OSCA基因家族的鉴定与表达分析 被引量:3
15
作者 王照 鲁敏 +1 位作者 南红 安华明 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期350-362,共13页
OSCA是一类感受外界高渗胁迫的钙离子通道,在植物的胁迫应答中发挥重要作用。为了了解缫丝花(俗名"刺梨",Rosa roxburghii)OSCA(RrOSCA)的结构特征和表达特点,本研究从缫丝花基因组中鉴定出了19个RrOSCA基因家族成员,定位在6... OSCA是一类感受外界高渗胁迫的钙离子通道,在植物的胁迫应答中发挥重要作用。为了了解缫丝花(俗名"刺梨",Rosa roxburghii)OSCA(RrOSCA)的结构特征和表达特点,本研究从缫丝花基因组中鉴定出了19个RrOSCA基因家族成员,定位在6条染色体上。通过生物信息学分析发现80%的基因家族成员内含子数量为7~10个,而编码氨基酸在158~1256 aa之间,差别较大;亚细胞定位预测结果显示其主要定位在细胞膜上,与其功能一致。通过基因系统进化分析可将拟南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa)、苹果(Malus pumila)、草莓(Fragaria×ananassa)、缫丝花的OSCA家族成员可归入4个亚家族,其中RrOSCA家族与草莓OSCA家族的亲缘关系最近。果实发育过程中的转录组测序结果表明,除RrOSCA4外,其余成员的表达均呈现出明显的时间特异性。对其中6个成员进行实时荧光定量PCR分析,发现其均表现出组织特异性,且在花瓣中大量表达;并且这些成员的转录或被外源钙诱导,或被螯合剂乙二醇四乙酸(EGTA)和钙通道抑制剂维拉帕米(verapamil)阻遏,并表现出不同的钙响应敏感性。分析各基因家族成员的启动子序列,发现多种胁迫和激素类响应元件;外源植物生长调节剂处理结果证实除RrOSCA2外,其余被检测成员均受生长素类或水杨酸(SA)诱导。以上结果可为深入揭示缫丝花OSCA基因家族功能及其对激素、Ca^(2+)等因素的响应机制提供参考信息。 展开更多
关键词 缫丝花 osca基因家族 表达模式 激素
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毛果杨OSCA基因家族的鉴定及其在盐胁迫下的表达分析 被引量:1
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作者 张杰 陈兴浩 +4 位作者 庞丁玮 段安安 李昕蔓 孙宇涵 杨敏生 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2022年第13期4323-4330,共8页
OSCA(Hyperosmdality-gate calcium-permeable channels)是钙通透性阳离子通道蛋白,通过参与感知细胞外渗透势的变化,诱导Ca^(2+)浓度增加,调节渗透势,在高渗胁迫感应中发挥重要的作用。本研究从毛果杨基因组中鉴定得到16条OSCA基因序... OSCA(Hyperosmdality-gate calcium-permeable channels)是钙通透性阳离子通道蛋白,通过参与感知细胞外渗透势的变化,诱导Ca^(2+)浓度增加,调节渗透势,在高渗胁迫感应中发挥重要的作用。本研究从毛果杨基因组中鉴定得到16条OSCA基因序列并根据其在染色体上的分布将它们重新命名。基于系统发育树分析,将PtOSCAs基因分为4组,每一组中的OSCA基因都具有相似的基因结构。从杨树OSCA家族基因间鉴定到2个重复事件,分别为涉及3个基因的一个串联重复事件和涉及2个基因的一个片段重复事件,并且每一对基因的Ka/Ks值均在1以下,由此可见,进化中杨树OSCA家族基因存在纯化作用。通过分析PtOSCAs基因在低浓度以及高浓度盐胁迫下的表达情况,发现存在以下三类:第Ⅰ类,在低浓度及高浓度盐胁迫下表达量均出现上升;第Ⅱ类,在低浓度和高浓度盐胁迫下表达量均下降;第Ⅲ,在低浓度盐胁迫下表达量呈上升趋势,但是在高浓度盐胁迫下表达量呈下降趋势。此研究为PtOSCAs基因的功能分析和杨树的遗传改良提供了参考。 展开更多
关键词 杨树 osca 盐胁迫 表达分析
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拟南芥高渗诱导Ca2^+通道蛋白OSCA1的表达、结晶及晶体初步分析 被引量:1
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作者 闫芹芹 《南开大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期101-106,共6页
高渗透胁引发植物细胞内发生复杂的生理反应,钙离子信号作为信号级联反应的第二信使,在胞质内的浓度变化对细胞行使正常生理功能十分关键.OSCA1是定位于细胞质膜.上的高渗透压诱导离子通道,具有Ca^2+通透性.利用pEG BacMam高水平表达系... 高渗透胁引发植物细胞内发生复杂的生理反应,钙离子信号作为信号级联反应的第二信使,在胞质内的浓度变化对细胞行使正常生理功能十分关键.OSCA1是定位于细胞质膜.上的高渗透压诱导离子通道,具有Ca^2+通透性.利用pEG BacMam高水平表达系统在哺乳动物细胞HEK293S GnTI-中过表达质膜蛋白AtOS-CA1,通过去污剂DDM(n-Dodecyl-β-D-Maltopyranoside)纯化OSCA1样品,并在去污剂GDN(glyco-diosgenin)条件下结晶.采用正交梯度优化,添加剂筛选和去污剂筛选来获得更好的晶体衍射,对渗透胁迫离子通道的结构和功能分析研究具有重要意义. 展开更多
关键词 osca1 渗透胁迫 离子通道 膜蛋白晶体
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两种基于MIMO雷达体制的鲁棒CFAR检测器 被引量:3
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作者 王敦勇 马晓岩 +1 位作者 袁俊泉 王党卫 《电子与信息学报》 EI CSCD 北大核心 2009年第3期596-600,共5页
针对MIMO雷达的体制特点,该文提出了两种有序统计与均值相给合的MIMO雷达CFAR检测器(OSCA-CFAR和LCIOSCA-CFAR),给出了虚警概率与检测概率的表达式,然后在各种杂波背景下对检测器性能进行了仿真分析,并与经典的CA-CFAR检测器进行比较,... 针对MIMO雷达的体制特点,该文提出了两种有序统计与均值相给合的MIMO雷达CFAR检测器(OSCA-CFAR和LCIOSCA-CFAR),给出了虚警概率与检测概率的表达式,然后在各种杂波背景下对检测器性能进行了仿真分析,并与经典的CA-CFAR检测器进行比较,仿真结果表明,OSCA-CFAR和LCIOSCA-CFAR检测器在均匀背景下较CA-CFAR有较小损失,在多目标干扰环境较CA-CFAR性能改善明显,在实际背景中具有更强的鲁棒性。最后比较了OSCA-CFAR和LCIOSCA-CFAR检测器的优缺点。 展开更多
关键词 MIMO雷达 osca-CFAR LCIosca-CFAR 检测性能
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水稻507ys黄绿叶突变体的遗传鉴定与候选基因分析 被引量:11
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作者 李燕群 蒲翔 +5 位作者 李春梅 钟萍 孙昌辉 李秀兰 邓晓建 王平荣 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期221-229,共9页
【目的】对水稻507ys黄绿叶突变体进行遗传鉴定与候选基因分析。【方法】用化学诱变剂甲基磺酸乙酯(EMS)处理粳稻品种日本晴(Nipponbare),从突变体库中获得一份黄绿叶突变体507ys。对该突变体进行表型观察以及主要农艺性状调查分析。将5... 【目的】对水稻507ys黄绿叶突变体进行遗传鉴定与候选基因分析。【方法】用化学诱变剂甲基磺酸乙酯(EMS)处理粳稻品种日本晴(Nipponbare),从突变体库中获得一份黄绿叶突变体507ys。对该突变体进行表型观察以及主要农艺性状调查分析。将507ys与正常绿色品种进行杂交,调查F1代的叶色表型和F2群体的叶色分离情况,分析该突变表型的遗传行为。利用(507ys/明恢63)的F2作为定位群体,对507ys突变基因进行精细定位且遴选候选基因,对候选基因进行DNA测序验证及编码蛋白序列同源性分析。同时,测定507ys突变体和野生型亲本的光合色素含量,并利用高效液相色谱(HPLC)精确分析它们的叶绿素组成成分,以进一步揭示507ys黄绿叶突变基因的候选基因。【结果】507ys黄绿叶突变体整个生育期呈黄绿色。与野生型亲本日本晴相比,507ys突变体在分蘖期叶片的叶绿素和类胡萝卜素含量分别下降52.1%和58.1%,成熟期株高、每株有效穗数、每穗着粒数和结实率分别减少8.3%、51.0%、7.4%和11.6%。507ys与正常绿色品种日本晴和明恢63杂交的F1表现正常的绿色,F2群体绿色正常植株与黄绿叶突变植株分离比符合3﹕1,表明507ys的黄绿叶突变性状由1对隐性核基因控制。该突变基因定位在第10染色体长臂近端部SSR标记RM333和InDel标记L3之间,遗传距离分别为0.56 cM和0.14 cM,两标记之间的物理距离约为60.2 kb,此区间内包含13个有注释的预测基因。基因组序列分析发现,507ys突变体中编码叶绿素酸酯a加氧酶的OsCAO1(LOC_Os10g41780)在编码区第2 198位碱基(CDS第1 057位碱基)处,碱基G突变为碱基A,造成编码蛋白的氨基酸序列第353位的谷氨酸(E)突变成赖氨酸(K)。对叶绿素组成成分分析表明,507ys突变体叶片中只有叶绿素a,没有叶绿素b。【结论】507ys突变体基因是已报道的叶绿素酸酯a加氧酶基因OsCAO1的等位基因。507ys突变体在OsCAO1外显子上发生的一个点突变使得其体内叶绿素酸酯a加氧酶失活,造成叶绿素b合成受阻。 展开更多
关键词 水稻 黄绿叶突变体 osca01 遗传分析 候选基因分析
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基于Shi-Tomasi算法的探地雷达管线目标检测 被引量:2
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作者 赵杰 柯海南 林凯强 《信息通信》 2019年第1期10-12,共3页
探地雷达图像中的双曲线特征是用于识别管线位置的重要信息,然而在实际应用中,由于环境和设备因素的影响,双曲线特征往往发生扭曲与变形,不利于分析判读。对此提出了一种基于Shi-Tomasi算法的自动化双曲线特征的识别方法,在预处理阶段... 探地雷达图像中的双曲线特征是用于识别管线位置的重要信息,然而在实际应用中,由于环境和设备因素的影响,双曲线特征往往发生扭曲与变形,不利于分析判读。对此提出了一种基于Shi-Tomasi算法的自动化双曲线特征的识别方法,在预处理阶段通过小波软阈值去噪与频率波数域滤波的方法去除干扰,然后采用基于Shi-Tomasi算法的图像自适应分割,最后利用OSCA(Open Scan Clustering Algorithm)算法对分割结果中的双曲线特征进行筛选,得到的双曲线特征经过拟合分析后,可用于探地雷达管线检测定位。 展开更多
关键词 探地雷达 小波去噪 频率波数滤波 Shi-Tomasi算法 osca算法
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