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短花药野生稻(Oryza brachyantha)AQP家族的全基因组序列鉴定及其特征分析
被引量:
1
1
作者
刘思成
张作林
+2 位作者
赵如飞
熊栋梁
黄见良
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第14期4515-4522,共8页
水通道蛋白(aquaporin, AQP)介导植物各组织间水分转运,参与植物体内物质跨膜转运,在植物各种生理过程中发挥着重要作用。短花药野生稻作为一种具有优良性状的野生稻,其AQP基因家族成员的特征还尚未了解透彻。为此,本研究鉴定了39个短...
水通道蛋白(aquaporin, AQP)介导植物各组织间水分转运,参与植物体内物质跨膜转运,在植物各种生理过程中发挥着重要作用。短花药野生稻作为一种具有优良性状的野生稻,其AQP基因家族成员的特征还尚未了解透彻。为此,本研究鉴定了39个短花药野生稻的水通道蛋白基因(ObAQP),根据进化树将其分类,并进行基因结构分析、蛋白质保守基序分析、基因启动子预测和染色体定位分析。结果表明:短花药野生稻中的AQP可以分为PIPs、NIPs、TIPs和SIPs四个亚族;ObAQP蛋白质保守基序大多数都可能参与跨膜转运、通道活动以及膜相关功能;启动子分析表明ObAQP基因至少含有一个应激反应性顺式元件;ObAQP基因在染色体上分布并不均匀。以上分析结果简要归纳了短花药野生稻AQP基因家族的特征,为以后深入研究ObAQP基因功能未来栽培稻性状改良提供了理论依据。
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关键词
短花药野生稻
AQP
基因家族
生物信息学
原文传递
稻属谷氨酰胺合成酶家族的系统分析
被引量:
1
2
作者
王江
张景六
《植物生理学通讯》
CSCD
北大核心
2007年第2期277-282,共6页
比较籼粳栽培稻和野生稻中谷氨酰胺合成酶(GS)基因和蛋白质的结果表明,水稻GS蛋白编码区序列高度保守,而非编码序列变异较大。GS2基因的进化比GS1基因保守。短药野生稻中GS基因进化主要是内含子的变异,但此种内含子的变异在籼粳栽培稻...
比较籼粳栽培稻和野生稻中谷氨酰胺合成酶(GS)基因和蛋白质的结果表明,水稻GS蛋白编码区序列高度保守,而非编码序列变异较大。GS2基因的进化比GS1基因保守。短药野生稻中GS基因进化主要是内含子的变异,但此种内含子的变异在籼粳栽培稻中幅度要小得多。
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关键词
谷氨酰胺合成酶
短药野生稻
栽培稻
序列比对
分子进化树
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职称材料
题名
短花药野生稻(Oryza brachyantha)AQP家族的全基因组序列鉴定及其特征分析
被引量:
1
1
作者
刘思成
张作林
赵如飞
熊栋梁
黄见良
机构
华中农业大学植物科学技术学院
长江大学农学院
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第14期4515-4522,共8页
基金
国家自然科学基金(31671620)资助。
文摘
水通道蛋白(aquaporin, AQP)介导植物各组织间水分转运,参与植物体内物质跨膜转运,在植物各种生理过程中发挥着重要作用。短花药野生稻作为一种具有优良性状的野生稻,其AQP基因家族成员的特征还尚未了解透彻。为此,本研究鉴定了39个短花药野生稻的水通道蛋白基因(ObAQP),根据进化树将其分类,并进行基因结构分析、蛋白质保守基序分析、基因启动子预测和染色体定位分析。结果表明:短花药野生稻中的AQP可以分为PIPs、NIPs、TIPs和SIPs四个亚族;ObAQP蛋白质保守基序大多数都可能参与跨膜转运、通道活动以及膜相关功能;启动子分析表明ObAQP基因至少含有一个应激反应性顺式元件;ObAQP基因在染色体上分布并不均匀。以上分析结果简要归纳了短花药野生稻AQP基因家族的特征,为以后深入研究ObAQP基因功能未来栽培稻性状改良提供了理论依据。
关键词
短花药野生稻
AQP
基因家族
生物信息学
Keywords
oryza brachyantha
AQP
Gene family
Bioinformatics
分类号
S511 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
稻属谷氨酰胺合成酶家族的系统分析
被引量:
1
2
作者
王江
张景六
机构
中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所
出处
《植物生理学通讯》
CSCD
北大核心
2007年第2期277-282,共6页
基金
国家高技术研究发展计划"(863"计划
2006AA10A102)。
文摘
比较籼粳栽培稻和野生稻中谷氨酰胺合成酶(GS)基因和蛋白质的结果表明,水稻GS蛋白编码区序列高度保守,而非编码序列变异较大。GS2基因的进化比GS1基因保守。短药野生稻中GS基因进化主要是内含子的变异,但此种内含子的变异在籼粳栽培稻中幅度要小得多。
关键词
谷氨酰胺合成酶
短药野生稻
栽培稻
序列比对
分子进化树
Keywords
glutamine synthetase
oryza brachyantha
oryza
sativa
alignment
phylogenetic tree
分类号
S511 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
短花药野生稻(Oryza brachyantha)AQP家族的全基因组序列鉴定及其特征分析
刘思成
张作林
赵如飞
熊栋梁
黄见良
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020
1
原文传递
2
稻属谷氨酰胺合成酶家族的系统分析
王江
张景六
《植物生理学通讯》
CSCD
北大核心
2007
1
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