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Gene cloning and prokaryotic expression of recombinant outer membrane protein from Vibrio parahaemolyticus
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作者 袁野 王秀利 +1 位作者 郭设平 仇雪梅 《Chinese Journal of Oceanology and Limnology》 SCIE CAS CSCD 2011年第5期952-957,共6页
Gram-negative Vibrio parahaemolyticus is a common pathogen in humans and marine animals, The outer membrane protein of bacteria plays an important role in the infection and pathogenicity to the host. Thus, the outer m... Gram-negative Vibrio parahaemolyticus is a common pathogen in humans and marine animals, The outer membrane protein of bacteria plays an important role in the infection and pathogenicity to the host. Thus, the outer membrane proteins are an ideal target for vaccines. We amplified a complete outer membrane protein gene (ompW) from E parahaemolyticus ATCC 17802. We then cloned and expressed the gene into Escherichia coli BL21 (DE3) cells. The gene coded for a protein that was 42.78 kDa. We purified the protein using Ni-NTA affinity chromatography and Anti-His antibody Western blotting, respectively. Our results provide a basis for future application of the OmpW protein as a vaccine candidate against infection by E parahaemolyticus. In addition, the purified OmpW protein can be used for further functional and structural studies. 展开更多
关键词 vibrio parahaemolyticus outer membrane protein (ompw CLONING prokaryotic expression protein characterization recombinant proteins
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Genotypic Analysis, Construction of the Expression System and Immunological Identification of the Recombinant Proteins of the LipL32 Gene in the Dominant Serogroups of Leptospira interrogans in China
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作者 范兴丽 严杰 +2 位作者 毛亚飞 李立伟 李淑萍 《Journal of Microbiology and Immunology》 2004年第1期17-23,共7页
To investigate the existence of the major outer membrane protein (MOMP) gene LipL32 in 15 dominant Chinese strains of 15 serogroups of Leptospira interrogans and 2 international strains of 2 serogroups of Leptospira b... To investigate the existence of the major outer membrane protein (MOMP) gene LipL32 in 15 dominant Chinese strains of 15 serogroups of Leptospira interrogans and 2 international strains of 2 serogroups of Leptospira biflexa, and to clone and construct the expression system as well as to identify the recombinant proteins, genomic DNAs from strains of leptospira were prepared by routine phenol-chloroform method, and the fragments of the LipL32 gene with the whole length from the strains were amplified with high fidelity PCR. The target amplification products were sequenced after T-A cloning, and the expression system for the genes were thereby constructed. Expression of the recombinant proteins was identified by using SDS-PAGE after induction with IPTG at different dosages. Western blot assays with rabbit antiserum against the whole cell of TR/PatocⅠ of Leptospira and immunized serum with rMOMPs were used to determine the immunoreactivity and immunogenicity of the recombinant proteins. Microscopic agglutination test was used to determine the cross- agglutination titres in rabbit sera immunized with rMOMPs, and the cell adherence model of Leptospira was used to examine the blocking effects of rabbit antisera against these rMOMPs. It was found that the LipL32 gene could be found in all the 17 strains of Leptospira mentioned above with two different genotypes, i.e. LipL32/1 and LipL32/2. Amounts of expressions of rMOMP1 and rMOMP2 after IPTG accounted for 40% and 10% of the total bacterial proteins respectively. Both rMOMP1 and rMOMP2 could combine with the rabbit antiserum against leptospiral TR/PatocⅠ, and could induce the production of agglutination antibodies to these 17 strains of Leptospira with 1∶2 to 1∶64 MAT titres. The rabbit anti-rMOMP1 and anti-MOMP2 antibodies at 1∶2 to 1∶16 dilutions could efficiently block adherence of Leptospira. It concludes that all the Leptospira tested in the present study possess LipL32/1 or LipL32/2 genes, and the constructed expression system can express the rMOMP1 and rMOMP2. These recombinant proteins are showed to have good immunogenicity and satisfactory immunoreactivity. 展开更多
关键词 LEPTOSPIRA LipL32 gene Major outer membrane protein Genus-specific protein antigens Cloning/expressionImmunity/identification MAT
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哈维氏弧菌外膜蛋白OmpW基因克隆、表达及DNA疫苗的免疫效果 被引量:8
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作者 黄浦江 黄郁葱 +3 位作者 简纪常 吴灶和 鲁义善 张雪利 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第12期1839-1847,共9页
参照GenBank上登录的哈维氏弧菌外膜蛋白OmpW基因序列,设计引物扩增OmpW的开放阅读框,序列分析结果显示该基因全长645bp。将其定向克隆到原核表达载体pET-32a(+),在大肠杆菌BL21中成功表达出带His-tag的融合蛋白,融合蛋白分子量... 参照GenBank上登录的哈维氏弧菌外膜蛋白OmpW基因序列,设计引物扩增OmpW的开放阅读框,序列分析结果显示该基因全长645bp。将其定向克隆到原核表达载体pET-32a(+),在大肠杆菌BL21中成功表达出带His-tag的融合蛋白,融合蛋白分子量约为43.8ku,且主要以包涵体形式存在。优化的表达条件为37oC,IPTG浓度0.1mmol/L,诱导时间5h。将纯化的融合蛋白免疫SPF昆明小鼠制备多克隆抗体,ELISA方法检测抗体效价达1:30000,Western.Blot结果表明鼠抗OmpW血清能与诱导后的重组蛋白发生特异反应,提示OmpW可能是哈维氏弧菌的一种重要保护性抗原。为进一步研究哈维氏弧菌外膜蛋白OmpW基因DNA疫苗对红笛鲷的免疫保护效果,构建了真核表达重组质粒pcDNA-OmpW,然后将真核质粒免疫接种红笛鲷。PCR结果显示,免疫接种后第7—28天,在红笛鲷的肌肉、头肾、肝脏和脾脏组织中均存在质粒分布;RT.PCR结果显示,免疫接种后第7~28天,红笛鲷上述组织均有目的基因的表达。ELISA结果表明,红笛鲷体内血清产生了抗OmpW蛋白的高效价抗体。Western.Blot分析表明,DNA疫苗免疫后红笛鲷体内表达了相应的目的蛋白,并诱导产生了相应抗体。攻毒实验结果表明,免疫保护率高达60%,可见pcDNA-OmpW可作为红笛鲷预防哈维氏弧菌感染的有效候选疫苗之一。 展开更多
关键词 哈维氏弧菌 外膜蛋白 ompw 免疫原性 DNA疫苗
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外膜蛋白(ompw)引物扩增技术在非01群霍乱检测中的应用 被引量:4
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作者 丁健清 田永琴 +1 位作者 王书梅 王丽华 《中国卫生检验杂志》 CAS 2001年第4期396-397,共2页
〔目的〕采用霍乱弧菌外膜蛋白合成一对引物 ,建立一种灵敏、特异的PCR方法检测非 0 1群霍乱弧菌。〔方法〕在实验室对 42株来自外环境和病人中分离出的非 0 1群霍乱弧菌采用PCR技术作了效果观察 ,并以大肠、痢疾、沙门菌等作为阴性对... 〔目的〕采用霍乱弧菌外膜蛋白合成一对引物 ,建立一种灵敏、特异的PCR方法检测非 0 1群霍乱弧菌。〔方法〕在实验室对 42株来自外环境和病人中分离出的非 0 1群霍乱弧菌采用PCR技术作了效果观察 ,并以大肠、痢疾、沙门菌等作为阴性对照其敏感性和特异性进行了验证。〔结果〕42株非 0 1群霍乱弧菌采用外膜蛋白引物行PCR扩增 ,阳性率为 10 0 %,扩增片段为 5 88bp ,阴性对照扩增均为阴性。〔结论〕霍乱弧菌外膜蛋白引物快速检测非 0 展开更多
关键词 非01群霍乱 外膜蛋白引物 基因扩增 检测
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基于分子对接的副溶血弧菌外膜蛋白OmpW天然抑制剂的筛选 被引量:1
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作者 刘雪飞 吴晓芳 +5 位作者 祁悦 张德福 谢晶 牟伟丽 李学鹏 励建荣 《中国食品学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第3期22-30,共9页
为了筛选更加高效、无毒、绿色的副溶血弧菌抑制剂,以副溶血弧菌外膜蛋白OmpW作为受体,利用分子对接方法筛选具有潜在抑菌作用的天然小分子,选用对接结果较理想的柠檬酸和咖啡酸进行试验验证。在测定最小抑菌浓度的基础上,研究去外膜和... 为了筛选更加高效、无毒、绿色的副溶血弧菌抑制剂,以副溶血弧菌外膜蛋白OmpW作为受体,利用分子对接方法筛选具有潜在抑菌作用的天然小分子,选用对接结果较理想的柠檬酸和咖啡酸进行试验验证。在测定最小抑菌浓度的基础上,研究去外膜和去壁的副溶血弧菌对小分子敏感性及杀菌曲线的变化,分析外膜蛋白OmpW是否为柠檬酸和咖啡酸的作用位点,验证基于分子对接筛选细菌抑制剂方法的正确性。研究结果显示,柠檬酸与咖啡酸对副溶血弧菌ATCC17802的最小抑制浓度均为2 mg/mL。去外膜和去壁的菌体与对照相比,最小抑制浓度减小16~64倍,这表明柠檬酸和咖啡酸很有可能作用于副溶血弧菌的外膜蛋白OmpW,分子对接结果也显示二者通过非共价结合发挥抑制作用。验证性试验表明:这两种小分子对于副溶血弧菌其它菌株类型也有同样的抑制效果。结论:柠檬酸和咖啡酸是有效的副溶血弧菌抑制剂(最小抑制浓度<5 mg/mL),其作用位点很可能是外膜蛋白OmpW。利用分子对接方法寻找高效、绿色的细菌抑制剂具有广阔的发展前景。 展开更多
关键词 副溶血弧菌 外膜蛋白ompw 分子对接 抑菌剂
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Helicobacter pylori virulence genes 被引量:29
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作者 Anja Sterbenc Erika Jarc +1 位作者 Mario Poljak Matjaz Homan 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2019年第33期4870-4884,共15页
Helicobacter pylori(H.pylori)is one of the most important human pathogens,infecting approximately half of the global population.Despite its high prevalence,only a subset of H.pylori infected individuals develop seriou... Helicobacter pylori(H.pylori)is one of the most important human pathogens,infecting approximately half of the global population.Despite its high prevalence,only a subset of H.pylori infected individuals develop serious gastroduodenal pathology.The pathogenesis of H.pylori infection and disease outcome is thus thought to be mediated by an intricate interplay between host,environmental and bacterial virulence factors.H.pylori has adapted to the harsh milieu of the human stomach through possession of various virulence genes that enable survival of the bacteria in the acidic environment,movement towards the gastric epithelium,and attachment to gastric epithelial cells.These virulence factors enable successful colonization of the gastric mucosa and sustain persistent H.pylori infection,causing chronic inflammation and tissue damage,which may eventually lead to the development of peptic ulcers and gastric cancer.Numerous studies have focused on the prevalence and role of putative H.pylori virulence genes in disease pathogenesis.While several virulence factors with various functions have been identified,disease associations appear to be less evident,especially among different study populations.This review presents key findings on the most important H.pylori virulence genes,including several bacterial adhesins and toxins,in children and adults,and focuses on their prevalence,clinical significance and potential relationships. 展开更多
关键词 Helicobacter pylori Virulence genes Disease association CHILDREN ADULTS outer membrane proteins Bacterial toxins
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Cloning of Omp1 Gene from Chlamydia trachomatis F Genotype
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作者 齐蔓莉 刘全中 +2 位作者 缴稳苓 田敬群 陈锦英 《Chinese Journal of Sexually Transmitted Infections》 2002年第2期25-28,共4页
Objective: To directionally clone the ompl gene fromChlamydia trachomatis (Ct) F genotype onto a plasmid vectorfor constructing a rudimentary DNA vaccine. Methods: The complete ompl gene from genomic DNA of CtF genoty... Objective: To directionally clone the ompl gene fromChlamydia trachomatis (Ct) F genotype onto a plasmid vectorfor constructing a rudimentary DNA vaccine. Methods: The complete ompl gene from genomic DNA of CtF genotype wild species was amplified with primers designedby computer. The recombinant gene was obtained byrestriction enzyme cutting, linking the gene with the plasmidvector in vitro, transforming the recombinant gene intobacteria, and extracting the DNA from the bacteria. Results: DNA extracted from the bacteria was composed ofthe ompl gene and plasmid, which is identified by threemethods of singular restrictive enzyme cutting, doublerestrictive enzyme cutting and PCR. Conclusion: Cloning of the ompl gene from the Ct Fgenotype means that a rudimentary DNA vaccine wassuccessfully constructed. 展开更多
关键词 Chlamydia trachomatis F genotype main outer membrane protein omp1 gene CLONE DNA vaccine
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幽门螺杆菌东亚型菌株GZ7/cagA^(+)和GZ7/ΔcagA源外膜囊泡的蛋白组学比较
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作者 彭国玲 周佳 +3 位作者 廖永慧 谢渊 周建奖 赵艳 《贵州医科大学学报》 CAS 2024年第5期636-644,共9页
目的通过分离、鉴定和比较细胞毒素相关基因A蛋白(cagA)、阳性幽门螺杆菌(H.pylori)、东亚型菌株GZ7/cagA^(+)及其cagA敲除菌株GZ7/ΔcagA来源的外膜囊泡(OMVs)中的差异表达蛋白(DEPs),分析cagA基因对OMVs中蛋白表达的影响。方法采用超... 目的通过分离、鉴定和比较细胞毒素相关基因A蛋白(cagA)、阳性幽门螺杆菌(H.pylori)、东亚型菌株GZ7/cagA^(+)及其cagA敲除菌株GZ7/ΔcagA来源的外膜囊泡(OMVs)中的差异表达蛋白(DEPs),分析cagA基因对OMVs中蛋白表达的影响。方法采用超速离心法分别提取GZ7/ΔcagA和GZ7/cagA^(+)的OMVs,通过透射电镜和纳米颗粒追踪技术鉴定其形态和粒径,使用Western blot技术验证两组OMVs中cagA蛋白的表达,分析OMVs的蛋白质组学;对蛋白组学数据进行质控分析和主成分分析鉴定后,以上调蛋白倍数变化(FC)>2.0、下调蛋白FC<0.5,FDR≤0.05为筛选条件筛选DEPs,利用OmicsBean在线工具、Gene Ontology和KOBAS对DEPs进行生物信息学分析;采用免疫荧光鉴定OMVs细胞在细胞中的定位,实时无标记细胞分析仪检测细胞活性。结果通过电镜和粒径证实成功分离纯化了OMVs;蛋白质组分析发现,GZ7/cagA^(+)-OMVs组与GZ7/ΔcagA-OMVs组比较有79个DEPs,其中38个蛋白下调、41个蛋白上调;生物信息学分析显示,DEPs主要与丙酮酸代谢、丙酸代谢、糖酵解/糖异生及柠檬酸循环等代谢途径有关;免疫荧光和实时无标记细胞分析证实H.pylori来源的OMVs能进入细胞并定位在线粒体并抑制细胞增殖。结论cagA能影响H.pylori分泌的OMVs中蛋白质的成分,DEPs可能促进cagA^(+)H.pylori在胃黏膜上的定植及致病性。 展开更多
关键词 幽门螺杆菌 细胞毒素相关基因A蛋白 胃癌 蛋白组 差异表达蛋白 线粒体
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外膜蛋白OmpA在蛙源米尔伊丽莎白菌致病性中的功能
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作者 刘芳园 胡瑞雪 +3 位作者 余芳 侯家昊 于子润 顾泽茂 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期203-209,共7页
为探究外膜蛋白A(outer membrane protein A,OmpA)对米尔伊丽莎白菌致病作用的影响,以蛙源米尔伊丽莎白菌FL160902为研究对象,通过同源重组法构建OmpA缺失株△ompA,比较缺失株和野生株的生长特性、生物膜形成能力、抗血清杀伤能力、对... 为探究外膜蛋白A(outer membrane protein A,OmpA)对米尔伊丽莎白菌致病作用的影响,以蛙源米尔伊丽莎白菌FL160902为研究对象,通过同源重组法构建OmpA缺失株△ompA,比较缺失株和野生株的生长特性、生物膜形成能力、抗血清杀伤能力、对细胞的黏附能力以及对蛙的致病性差异。结果显示:△ompA的生长能力和抗血清杀伤能力与野生株无显著差异;但与野生株相比,△ompA的生物膜形成能力增加了66%,△ompA对bEnd.3细胞的黏附能力降低了61%;黑斑蛙感染试验显示,△ompA在黑斑蛙血液、脾和脑组织中的载菌量分别为(3.15×10^(8)±0.09×10^(8))、(2.11×10^(8)±0.07×10^(8))和(6.61×10^(8)±0.16×10^(8))copies/g,均显著低于野生株,且△ompA对黑斑蛙的致死率为37%,显著低于野生株的致死率(75%)。上述结果表明,ompA基因缺失不改变米尔伊丽莎白菌的抗血清杀伤能力,但增加了菌株的生物膜形成能力,减弱了菌株的黏附能力,从而降低了该菌对蛙的致病性。 展开更多
关键词 米尔伊丽莎白菌 基因缺失 外膜蛋白A 致病性
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嗜水气单胞菌外膜蛋白基因ompTS的克隆与序列分析 被引量:19
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作者 黄晓 叶巧真 +2 位作者 何建国 谢俊峰 王顺强 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第6期552-558,共7页
根据已发表的外膜蛋白基因ompII的核苷酸序列设计引物 ,从分离自患红底板病的中华鳖的嗜水气单胞菌中扩增得到了ompTS基因。对ompTS基因进行序列分析 ,发现其与ompII基因的核苷酸序列有 83.5 %的同源性。ompTS基因最长的开放阅读框 (ORF... 根据已发表的外膜蛋白基因ompII的核苷酸序列设计引物 ,从分离自患红底板病的中华鳖的嗜水气单胞菌中扩增得到了ompTS基因。对ompTS基因进行序列分析 ,发现其与ompII基因的核苷酸序列有 83.5 %的同源性。ompTS基因最长的开放阅读框 (ORF)为 10 6 8nt,编码由 35 5个氨基酸组成 ,分子量为 38.9kDa的蛋白质OmpTS ,其氨基酸序列的前 2 0个氨基酸残基可能组成信号肽。由ompTS基因推导的编码氨基酸序列与其它细菌外膜蛋白的氨基酸序列的比较结果 ,进一步证实细菌外膜蛋白氨基酸序列的N端存在高度保守区。根据序列分析结果推测 ,ompTS基因很可能是一个新的基因 ,编码 38.9kDa的嗜水气单胞菌外膜蛋白OmpTS ,该蛋白质在膜中极有可能形成孔道 。 展开更多
关键词 嗜水气单胞菌 外膜蛋白 ompTS基因 克隆 水产动物病害
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柑橘黄龙病LAMP快速检测方法的建立及应用 被引量:31
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作者 黄丽 苏华楠 +3 位作者 唐科志 黄爱军 周常勇 李中安 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期1121-1126,I0003,共7页
【目的】为了建立柑橘黄龙病菌亚洲种LAMP快速检测方法。【方法】根据黄龙病菌亚洲种外膜蛋白基因,在种属特异保守区域的6个位点设计2对特异性引物,对反应条件和体系进行优化,并通过产物沉淀观察和SYBRGreen I荧光染料显色的方法来快速... 【目的】为了建立柑橘黄龙病菌亚洲种LAMP快速检测方法。【方法】根据黄龙病菌亚洲种外膜蛋白基因,在种属特异保守区域的6个位点设计2对特异性引物,对反应条件和体系进行优化,并通过产物沉淀观察和SYBRGreen I荧光染料显色的方法来快速判读检测结果。同时对田间样品进行了特异性和灵敏度分析试验。【结果】该方法仅需63℃反应70 min即可得到结果,特异性强,灵敏度高。对柑橘常见病害样品进行LAMP扩增,仅HLB阳性样品扩增产物电泳呈特征性梯状条带。检测灵敏度比常规PCR高100倍,与实时定量PCR相当。在对105份黄龙病田间疑似样品检测中,LAMP阳性检出率为52.4%,常规PCR为37.1%,2种检测方法符合率为84.7%。【结论】建立的黄龙病菌亚洲种LAMP检测方法,快速简便、特异性强、灵敏度高,为快速检测柑橘黄龙病提供了新方法和新思路。 展开更多
关键词 柑橘黄龙病菌亚洲种 外膜蛋白基因 环介导等温扩增技术
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嗜水气单胞菌外膜蛋白基因ompTS的高效表达及其免疫原性 被引量:12
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作者 谢俊锋 叶巧真 +4 位作者 何建国 戴伟君 黄晓 何鸣筱 陈诚 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期300-303,共4页
根据嗜水气单胞菌外膜蛋白基因ompTS的核苷酸序列设计引物 ,运用聚合酶链式反应 (PCR)扩增出与预期大小相符的基因片段。将此基因片段克隆至质粒pRSETA的BamHI和EcoRI位点 ,构建重组质粒 ,转化大肠杆菌BL2 1(DE3) ,经IPTG诱导获得高效表... 根据嗜水气单胞菌外膜蛋白基因ompTS的核苷酸序列设计引物 ,运用聚合酶链式反应 (PCR)扩增出与预期大小相符的基因片段。将此基因片段克隆至质粒pRSETA的BamHI和EcoRI位点 ,构建重组质粒 ,转化大肠杆菌BL2 1(DE3) ,经IPTG诱导获得高效表达 ,SDS PAGE蛋白电泳表明在 39 9kD处出现超强特异带 ,占总蛋白的5 1%。以Ni NTA Conjugate抗体进行Westernblot分析证明该 39 9kD的蛋白为所表达的融合蛋白。纯化融合蛋白注射雄性新西兰大白兔可诱导产生特异抗体。ELISA和Westernblot检测结果显示 ,该抗体与表达的融合蛋白和从嗜水气单胞菌中提取的 36 9kD外膜蛋白均呈阳性反应 ,表明所表达的融合蛋白仍保持原有外膜蛋白的免疫原性 。 展开更多
关键词 嗜水气单胞菌 外膜蛋白OmpTS ompTS基因 基因表达 免疫原性 水产动物 疫苗
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多重耐药鲍曼不动杆菌β-内酰胺酶、膜孔蛋白及β-内酰胺类靶位编码基因研究 被引量:17
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作者 许亚丰 耿先龙 +4 位作者 王春新 陈国千 赵琪 周丽珍 糜祖煌 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期58-64,共7页
目的研究一株多重耐药鲍曼不动杆菌(Multi-drug-resistant Acinetobacter baumannii,MDR-ABA)J65可能存在的β-内酰胺类药物耐药机制。方法 MDR-ABA J65株分离自2011年12月某三甲医院住院患者痰标本,用gyrA和parC基因PCR扩增、测序和BLA... 目的研究一株多重耐药鲍曼不动杆菌(Multi-drug-resistant Acinetobacter baumannii,MDR-ABA)J65可能存在的β-内酰胺类药物耐药机制。方法 MDR-ABA J65株分离自2011年12月某三甲医院住院患者痰标本,用gyrA和parC基因PCR扩增、测序和BLASTn比对确认菌种。用PCR法分析该菌株的PBP1a、PBP2、CarO和33种A^D类β-内酰胺酶编码基因,并对检出的β-内酰胺酶编码基因作了插入序列与β-内酰胺酶编码基因连锁检测。结果 MDR-ABA J65检出β-内酰胺酶编码基因bla TEM-1、bla ADC-62、bla OXA-23、bla OXA-66,插入序列与β-内酰胺酶编码基因连锁检测显示ISaba1-ADC-62和ISaba1-OXA-23为阳性。PBP1a、PBP2和CarO编码基因序列与鲍曼不动杆菌敏感株(SDF)相比均存在有义突变,且三维结构同源建模显示,与SDF株PBP1a、PBP2和CarO蛋白分子立体结构有明显差别。结论 MDR-ABA J65对β-内酰胺类耐药机制为PBPs和孔蛋白CarO变异及可移动遗传元件介异的β-内酰胺酶编码基因。 展开更多
关键词 鲍曼不动杆菌 Β-内酰胺酶基因 膜孔蛋白 外排泵蛋白 青霉素结合蛋白 多重耐药
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布鲁菌病多重PCR快速检测方法的建立及应用 被引量:11
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作者 王晶钰 张三东 +4 位作者 刘红彦 李河林 程媛媛 李宇立 战美娜 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2010年第S1期5-9,共5页
根据GenBank中登录的布鲁菌(Brucella)omp31、bp26、omp10外膜蛋白基因序列,针对同一种病原,各设计合成了一对特异性引物,通过优化引物浓度组合,建立了检测布鲁菌472 bp、290 bp、162 bp片段的多重PCR快速检测方法。通过对该方法的特异... 根据GenBank中登录的布鲁菌(Brucella)omp31、bp26、omp10外膜蛋白基因序列,针对同一种病原,各设计合成了一对特异性引物,通过优化引物浓度组合,建立了检测布鲁菌472 bp、290 bp、162 bp片段的多重PCR快速检测方法。通过对该方法的特异性、敏感性和重复性试验,结果显示,该方法从布鲁菌标准菌株中扩增出了特异性的目的片段,而对大肠埃希菌等细菌的扩增结果均为阴性。经过对10倍倍比稀释的模板进行检测,多重PCR的敏感度为最低可检出1.1×10-3ng的DNA,在感染布鲁菌病奶牛乳汁模拟标本中最低可检出细菌数为80 cfu/mL。不同人员用该方法重复检测,结果均一致,表明重复性好。应用该方法对88份临床疑似布鲁菌感染的奶牛乳样进行了检测,结果检出17份阳性,阳性检出率约为19.3%。检测结果表明,该方法具有特异、敏感、重复性好等优点,可用于奶牛布鲁菌病的临床检测及流行病学监测等。 展开更多
关键词 布鲁菌 外膜蛋白基因 多重PCR 检测
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幽门螺杆菌27 kDa外膜蛋白的基因克隆和特性鉴定 被引量:15
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作者 庞智 朱红音 +1 位作者 徐蔚文 萧树东 《胃肠病学》 2002年第5期265-269,共5页
背景:幽门螺杆菌(H.Pylori)是全球人群中感染范围最广的致病菌,现己被公认为慢性胃炎和消化性溃疡的重要致病因子,并与胃腺癌和胃淋巴瘤的形成密切相关。而H.Pylori疫苗可能成为控制这一全球范围感染的有效措施,其研制和开发已成为目... 背景:幽门螺杆菌(H.Pylori)是全球人群中感染范围最广的致病菌,现己被公认为慢性胃炎和消化性溃疡的重要致病因子,并与胃腺癌和胃淋巴瘤的形成密切相关。而H.Pylori疫苗可能成为控制这一全球范围感染的有效措施,其研制和开发已成为目前研究的热点。目的:探索研制H.Pylori疫苗的新途径,对H.Pylori27kDa外膜蛋白(OMP27)进行基因克隆和特性鉴定。方法:培养和收集H.Pylori菌株NCTC11637,采用酚:氯仿抽提和纯化基因组DNA。分别设计引物P1和P2,并以该基因组DNA为模板,以聚合酶链反应(PCR)方法扩增OMP27基因片段。构建pQE30-OMP27重组表达载体时,pQE30质粒载体和纯化的PCR产物均用限制性内切酶Kpnl和HindⅢ双酶切,再用T4 DNA连接酶将双酶切后的目的基因片段OMP27重组于pQE30的相应酶切位点之间,连接产物转化大肠杆菌XL1-Blue。挑选转化克隆、提取质粒,并进行Kpnl和HindⅢ双酶切和PCR方法鉴定,1%琼脂糖凝胶电泳观察酶切和PCR扩增结果,经测序分析确认后,筛选出插入目的基因的阳性克隆,命名为pQE30-OMP27。挑取单个含重组质粒PQE30-OMP27的工程菌(XL1-Blue)阳性克隆,进行培养和IPTG诱导表达后,经SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)和Western blot进行蛋白表达和抗原性鉴定。 展开更多
关键词 PCR 基因表达 幽门螺杆菌27kDa 外膜蛋白 基因克隆 特性鉴定
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多重耐药鲍曼不动杆菌β-内酰胺酶基因和膜孔蛋白基因研究 被引量:11
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作者 傅爱玲 于翠香 +6 位作者 李希华 王英田 王均玲 周玲 孙丽丽 陈方方 王西艳 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期549-552,共4页
目的检测分析鲍曼不动杆菌的耐药性、全面了解多重耐药鲍曼不动杆菌β-内酰胺类耐药机制;方法药敏试验为Kirby-Bauer法、基因检测采用PCR对20株多药耐药鲍曼不动杆菌进行了22种β-内酰胺酶基因和膜孔蛋白carO基因检测;结果20株鲍曼不动... 目的检测分析鲍曼不动杆菌的耐药性、全面了解多重耐药鲍曼不动杆菌β-内酰胺类耐药机制;方法药敏试验为Kirby-Bauer法、基因检测采用PCR对20株多药耐药鲍曼不动杆菌进行了22种β-内酰胺酶基因和膜孔蛋白carO基因检测;结果20株鲍曼不动杆菌耐药率除亚胺培南外,其余药物耐药率均在95%以上、共有TEM、PER、ADC等3种β-内酰胺酶基因呈阳性,阳性率分别为95.0.0%(19/20)、25.0%(5/20)、100.0%(20/20)。膜孔蛋白carO基因突变率达100.0%;结论本组MDR-ABA菌多种β-内酰胺类药物耐药与产TEM、PER、ADC等3种β-内酰胺酶相关外,还与膜孔蛋白编码基因carO突变有关。 展开更多
关键词 鲍曼不动杆菌 Β-内酰胺酶 膜孔蛋白 耐药基因
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变性高效液相色谱检测霍乱弧菌 被引量:8
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作者 曹际娟 闫平平 +5 位作者 于珂 于兵 麻丽丹 高世光 黄晓蓉 谢明杰 《辽宁师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2008年第3期347-352,共6页
变性高效液相色谱(DHPLC)是近几年刚发展起来的一种快速检测PCR扩增产物的新技术.应用该技术快速检测O1、O139、非O1、非O139群霍乱弧菌的外膜蛋白基因(ompW).根据霍乱弧菌外膜蛋白基因的特异性引物,PCR扩增的产物经DHPLC进行快速检测.... 变性高效液相色谱(DHPLC)是近几年刚发展起来的一种快速检测PCR扩增产物的新技术.应用该技术快速检测O1、O139、非O1、非O139群霍乱弧菌的外膜蛋白基因(ompW).根据霍乱弧菌外膜蛋白基因的特异性引物,PCR扩增的产物经DHPLC进行快速检测.以54株参考菌株做特异性检测.在丹东口岸国境外环境水体采集水样310份,以PCR-DHPLC和常规分离培养进行了比较,对丹东口岸国境外环境水体霍乱弧菌感染状况进行了检测,并对分离株进行了ompW基因测序.试验结果表明该方法有很好的特异性,310份水样中经PCR-DHPLC检测出58株霍乱弧菌的分菌株,阳性率为19%,与常规分离培养比较,符合率为100%.分离株的ompW序列与Genbank中的存在1%~3%的差异.这种检验方法特异性强,简便快捷,为霍乱防治提供了一种有效的检测新手段. 展开更多
关键词 DHPLC 霍乱弧菌O1群 霍乱弧菌O139群 霍乱弧菌非O1非O139群 外膜蛋白基因 (ompw) 丹东口岸国境外环境水体
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鳗源嗜水气单胞菌主要外膜蛋白基因克隆及其表达 被引量:7
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作者 欧阳岁东 林天龙 +4 位作者 陈孝煊 俞伏松 龚晖 陈红燕 方勤美 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期566-570,共5页
A pair of primers were designed according to the published nucleotide sequence of a putative outer membrane protein gene(omp) of Aeromonas hydrophila.With the specific primers,a target fragment about 1.1 kb was amplif... A pair of primers were designed according to the published nucleotide sequence of a putative outer membrane protein gene(omp) of Aeromonas hydrophila.With the specific primers,a target fragment about 1.1 kb was amplified from Aeromonas hydrophila ML316 via PCR.The target fragment was inserted into the linearized pGEM-T easy vector.After enzyme restriction and sequencing analysis,the nucleotide data had been further analyzed by DNAman and ClutalW software.The analysis results showed that the cloned DNA fragment had a longest open reading frame(ORF) of 1035 nt,it predicted to be encoded a 344-aa protein with the molecular weight of 36 kD.Hydrophobicity analysis suggested that the protein was highly hydrophilic,especialy at the first 24 amino-acid,this region could function as signal peptide.The homologious comparison proved the cloned gene had 96% homology to the sequence of the omp gene,and the alignment of the amino acid sequence was 98%.The recombinant plasmid was constructed with the target gene and the expressing vector pGEX-4T-1 and then was transformed into E.coli BL21(DE3)by BamH and Sal I.The fusion protein was expressed under the IPTG inducing condition,and exhibited about 62 kD in size,very close to the predicted molecular weight of GST-MOMP,furthermore,the fusion protein was specifically recognized by anti-serum which raised against the major outer membrane protein of AHML316.Considering all these together,it proved that the cloned gene represented the major outer membrane protein gene of AHML316,and the expressed gene products shared identical antigenicity with the natural main outer membrane protein,and also provided technical support for developing an advanced gene engineering vaccine against Aeromonas hydrophila. 展开更多
关键词 嗜水气单胞菌 欧鳗 主要外膜蛋白基因 克隆 表达
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多重PCR特异检测布鲁氏菌方法的建立 被引量:16
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作者 杜昕颖 陈泽良 +4 位作者 王玉飞 乔凤 赵瑾 苑锡铜 黄留玉 《解放军预防医学杂志》 CAS 北大核心 2008年第5期341-343,共3页
目的建立一种快速检测布鲁氏菌的多重PCR方法,为临床快速检测、准确诊断布鲁氏菌提供依据。方法针对布鲁氏菌外膜蛋白31 kD、22 kD和2a基因,各设计一对引物,扩增片断大小分别为427 bp3、17 bp和830 bp。利用纯培养物和模拟标本,分析这3... 目的建立一种快速检测布鲁氏菌的多重PCR方法,为临床快速检测、准确诊断布鲁氏菌提供依据。方法针对布鲁氏菌外膜蛋白31 kD、22 kD和2a基因,各设计一对引物,扩增片断大小分别为427 bp3、17 bp和830 bp。利用纯培养物和模拟标本,分析这3对引物的特异性和敏感性。结果3对引物均能特异扩增布鲁氏菌的DNA,31 kD、22 kD和2a,扩增纯培养物的敏感性分别为2.8×103、4.6×103和2.1×104cfu,将3对引物组合在一起建立了多重PCR方法,能从模拟的细胞和血液标本中扩增出特异的产物,对模拟的细胞感染标本的敏感性为1×105cfu,对模拟的血标本的敏感性为1.2×106cfu。结论针对外膜蛋白基因,建立了能特异地检测标本中布鲁氏菌的多重PCR检测方法。 展开更多
关键词 多重PCR 布鲁氏茵 外膜蛋白
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幽门螺杆菌Mr26000外膜蛋白编码基因的克隆及表达 被引量:10
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作者 姜政 黄爱龙 +2 位作者 陶小红 王丕龙 蒲丹 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期376-379,共4页
目的 构建含幽门螺杆菌 (Hp)Mr 2 6 0 0 0外膜蛋白编码基因的重组载体 ,并在E .coliBL2 1中表达。方法 用PCR从Hp染色体中 ,扩增Mr 2 6 0 0 0外膜蛋白编码基因片段。将目的基因与pET32a(+)同时经BamHI、HindⅢ双酶切、纯化、连接后 ,... 目的 构建含幽门螺杆菌 (Hp)Mr 2 6 0 0 0外膜蛋白编码基因的重组载体 ,并在E .coliBL2 1中表达。方法 用PCR从Hp染色体中 ,扩增Mr 2 6 0 0 0外膜蛋白编码基因片段。将目的基因与pET32a(+)同时经BamHI、HindⅢ双酶切、纯化、连接后 ,构建含有目的基因的重组载体。以含目的基因片段的重组载体转化大肠杆菌BL2 1(DE30 )并表达。表达产物经纯化后 ,用ELISA法检测其抗原性。结果 经酶切、测序分析表明 ,插入的基因片段为HpMr 2 6 0 0 0的外膜蛋白编码基因 ,与Tomb等的报道相比较 ,有 1.1%的bp发生变异 ,1.5 1%的氨基酸残基改变。经SDS PAGE分析发现 ,融合基因表达的蛋白Mr为 4 6× 10 3 ,可溶性表达产物占细菌总蛋白的 38.96 %。重组蛋白经Ni NTA琼脂糖树脂纯化后 ,其纯度达 95 %以上。ELISA法检测显示 ,该重组蛋白可被Hp阳性患者的血清所识别 ,具有良好的抗原性。结论成功地克隆并表达Mr为 2 6 0 0 0的Hp外膜蛋白编码基因 。 展开更多
关键词 幽门螺杆菌 外膜蛋白基因 原核表达
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