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一株基因Ⅲ型禽呼肠孤病毒变异株的分离及其灭活疫苗免疫原性初步评价
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作者 刘芮 李晓涵 +8 位作者 高金慧 刘长军 祁小乐 李凯 张艳萍 崔红玉 王素艳 高玉龙 高立 《中国家禽》 北大核心 2024年第8期69-75,共7页
为了解禽呼肠孤病毒(Avian reovirus,ARV)变异株在我国的流行情况及其生物学特性和致病特点,试验采集黑龙江省某企业送检的病鸡关节组织进行病毒分离,通过RT-PCR、序列分析及常见禽类外源病毒检测鉴定,进一步通过对体外复制能力、致病... 为了解禽呼肠孤病毒(Avian reovirus,ARV)变异株在我国的流行情况及其生物学特性和致病特点,试验采集黑龙江省某企业送检的病鸡关节组织进行病毒分离,通过RT-PCR、序列分析及常见禽类外源病毒检测鉴定,进一步通过对体外复制能力、致病性、血清交叉中和能力及灭活疫苗免疫抗体水平检测,分析其致病性、抗原性和免疫原性。结果显示:成功从病鸡关节组织中分离到1株ARV,命名为ARV-HLJ21-1690401,该分离株位于基因Ⅲ型分支,与基因Ⅲ型参考株ISR5233和42563-4-2005遗传距离较近,氨基酸序列相似性为83.4%和81.7%,而与其他基因型分离株遗传距离较远;该分离株在LMH细胞上增殖良好,对鸡胚和SPF鸡均具有明显的致病性,可引起接种鸡胚90%死亡,接种6周龄SPF鸡可引起100%发病;该分离株具有良好的免疫原性,其制备的灭活疫苗免疫SPF鸡可诱导产生较好的抗体水平。综上所述,研究成功分离到一株具有致病性和良好免疫原性的基因Ⅲ型ARV变异株,为了解我国ARV变异株的流行及遗传进化特征提供了重要理论依据。 展开更多
关键词 禽呼肠孤病毒 基因Ⅲ型 变异株 致病性 灭活疫苗
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我国部分省份牛冠状病毒HE基因遗传变异分析
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作者 罗健丹 张欣怡 +5 位作者 房琳琳 刘爽 郑辉 魏荣 董雅琴 肖啸 《动物医学进展》 北大核心 2024年第9期81-87,共7页
2020-2023年收集我国14个省份78个临床发病牛群的肛拭子、粪便、组织等样品1819份,用实时荧光RT-PCR方法进行牛冠状病毒(BCoV)检测,并选取部分核酸阳性样品进行HE基因全长的扩增、测序与遗传变异分析。78个发病牛群中,BCoV阳性场占56.4... 2020-2023年收集我国14个省份78个临床发病牛群的肛拭子、粪便、组织等样品1819份,用实时荧光RT-PCR方法进行牛冠状病毒(BCoV)检测,并选取部分核酸阳性样品进行HE基因全长的扩增、测序与遗传变异分析。78个发病牛群中,BCoV阳性场占56.41%,共获得35条HE基因全长序列,与参考序列相比,核苷酸同源性为97.0%~100.0%,氨基酸同源性为97.0%~99.8%。系统进化分析表明,BCoV毒株HE基因在进化上呈现典型的地域性特点,亚洲毒株和美国毒株进化上较为接近,而欧洲毒株位于另一个分支,所测毒株与中国参考毒株处于亚-美型毒株分支中,位置相对较为集中。所测35个HE序列中,有34个没有发生插入或缺失突变,来自宁夏的BCoV/NX13/CHN/2023毒株其HE基因存在12个核苷酸的插入突变,证实了BCoV HE基因插入变异株在我国的存在。基因重组分析显示,该毒株与BCoV/HeB120/CHN/2021的HE基因可能发生了重组,预测重组值分别为0.797和0.759。说明了我国部分省份临床发病牛群BCoV感染及BCoV HE基因的遗传变异,为明晰我国BCoV流行毒株分子特征提供参考。 展开更多
关键词 牛冠状病毒 HE基因 系统进化分析 变异株 基因重组
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一株猪流行性腹泻病毒变异株的分离、鉴定与全基因组序列分析
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作者 刘曦 贾相超 +1 位作者 李晨曦 李自力 《湖北农业科学》 2024年第7期134-140,共7页
江苏省某猪场疑似发生猪流行性腹泻(Porcine epidemic diarrhea,PED),采集病料后,经RT-PCR检测PEDV呈阳性。病毒感染Vero细胞能够引起明显的细胞病变,间接免疫荧光鉴定结果显示病毒感染细胞后能被抗PEDV N蛋白的特异性单克隆抗体识别。... 江苏省某猪场疑似发生猪流行性腹泻(Porcine epidemic diarrhea,PED),采集病料后,经RT-PCR检测PEDV呈阳性。病毒感染Vero细胞能够引起明显的细胞病变,间接免疫荧光鉴定结果显示病毒感染细胞后能被抗PEDV N蛋白的特异性单克隆抗体识别。通过全基因组序列分析,鉴定该毒株为PEDV G2b亚型变异株,并将其命名为PEDV JS-B株。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 分离鉴定 变异毒株 分段测序 序列分析
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Phase field modeling of ferroelastic variant switching in yttria-stabilized t'zirconia with strain gradient elasticity and interface tension
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作者 ZHOU QianQian WEI YueGuang +1 位作者 ZHOU YiChun YANG Li 《Science China(Technological Sciences)》 SCIE EI CAS CSCD 2024年第5期1443-1457,共15页
The 6–8 wt%yttria-stabilized zirconia with a tetragonal structure(t’-YSZ)is extensively employed in thermal barrier coatings.The exceptional fracture toughness of t’-YSZ can be attributed to its distinctive ferroel... The 6–8 wt%yttria-stabilized zirconia with a tetragonal structure(t’-YSZ)is extensively employed in thermal barrier coatings.The exceptional fracture toughness of t’-YSZ can be attributed to its distinctive ferroelastic toughening mechanism.Microstructure and interface tension play a critical role in ferroelastic variant switching at the micro-and nano-scale.This paper presents an original thermodynamically consistent phase field(PF)theory for analyzing ferroelastic variant switching at the micro-and nano-scale of t’-YSZ.The theory incorporates strain gradient elasticity using higher-order elastic energy and interface tension tensor via geometric nonlinearity to represent biaxial tension resulting from interface energy.Subsequently,a mixed-type formulation is employed to implement the higher-order theory through the finite element method.For an interface in equilibrium,the effects of strain gradient elasticity result in a more uniform distribution of stresses,whereas the presence of interface tension tensor significantly amplifies the stress magnitude at the interface.The introduction of an interface tension tensor increases the maximum value of stress at the interface by a factor of 4 to 10.The nucleation and evolution of variants at a pre-existing crack tip in a mono-phase t’-YSZ have also been studied.The strain gradient elasticity is capable of capturing the size effect of ferroelastic variant switching associated with microstructures in experiments.Specifically,when the grain size approaches that of the specimen,the critical load required for variant switching at the crack tip increases,resulting in greater dissipation of elastic energy during ferroelastic variant switching.Moreover,the interface tension accelerates the evolution of variants.The presented framework exhibits significant potential in modeling ferroelastic variant switching at the micro-and nano-scale. 展开更多
关键词 THERMODYNAMICS strain gradient elasticity interface tension phase field method ferroelastic variant switching
原文传递
一株麻鸡传染性法氏囊病毒新型变异株的分离鉴定
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作者 王艳 孙文渊 +2 位作者 朱维 王峰升 孟德坤 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2024年第2期83-88,共6页
近几年,鸡传染性法氏囊病毒新型变异株在我国广泛流行,主要发生于肉鸡,其致病力弱、隐蔽性强但能造成法氏囊严重萎缩。本研究从山东济宁地区临床出现法氏囊萎缩的发病麻鸡中采集法氏囊病料,接种SPF鸡胚进行病毒分离,通过RT-PCR方法进行... 近几年,鸡传染性法氏囊病毒新型变异株在我国广泛流行,主要发生于肉鸡,其致病力弱、隐蔽性强但能造成法氏囊严重萎缩。本研究从山东济宁地区临床出现法氏囊萎缩的发病麻鸡中采集法氏囊病料,接种SPF鸡胚进行病毒分离,通过RT-PCR方法进行病毒鉴定,将分离毒株回归SPF鸡进行致病性试验,同时对其主要抗原基因VP2进行进化分析。结果发现,该毒株能致死鸡胚;对其VP2基因进行测序比对和进化树分析发现,其与近几年的新型变异株基因序列的进化关系较近,同源性为96.1%~99.2%;人工感染SPF鸡第7 d法氏囊即出现较为明显的萎缩,第14 d萎缩更为明显,囊体比显著小于对照组(P<0.01)。本研究分离到的麻鸡源传染性法氏囊病毒JN22株属于新型变异株,能导致SPF鸡法氏囊显著萎缩。 展开更多
关键词 鸡传染性法氏囊病毒 新型变异株 麻鸡 法氏囊萎缩
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肉鸡源传染性法氏囊病新型重排毒株的分离鉴定及遗传进化分析
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作者 左文博 蒲德粉 +3 位作者 王威威 王林果 韦平 何秀苗 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第4期890-896,共7页
[目的]明确云南某肉鸡场疑似传染性法氏囊病病毒(IBDV)感染病例的病原类型及分子特征,以了解IBDV新型重排毒株在肉鸡中的流行情况、分子进化趋势,为制定有效的传染性法氏囊病(IBD)防控和疫苗选用策略提供参考依据。[方法]对疑似IBDV感... [目的]明确云南某肉鸡场疑似传染性法氏囊病病毒(IBDV)感染病例的病原类型及分子特征,以了解IBDV新型重排毒株在肉鸡中的流行情况、分子进化趋势,为制定有效的传染性法氏囊病(IBD)防控和疫苗选用策略提供参考依据。[方法]对疑似IBDV感染的病鸡法氏囊进行研磨处理后,采用巢式RT-PCR进行检测,后将IBDV阳性的法氏囊组织悬液接种于9日龄SPF鸡胚并进行病毒分离,对病毒的vVP2和VP1-b基因扩增并进行遗传变异分析。[结果]成功分离出一株新型IBDV重排毒株(命名为YN-YX221110),接种9日龄SPF鸡胚后,胚体整体呈现弥漫性出血,头、颈以及背部皮肤有出血点。基于vVP2基因序列,分离株YN-YX221110与新型变异株(nvIBDV)参考株的核苷酸相似性最高,为93.2%~97.9%,分离株YN-YX221110的vVP2基因222A特征性氨基酸位点与UK661、HK46等超强毒株(vvIBDV)参考株相同,249K、256V、279N、284A、294L、299S等位点与新型变异株(nvIBDV)参考株中的SHG19相同;在基于vVP2基因的遗传进化树中,分离株YN-YX221110与GX-QZ191002、SHG19等nvIBDV参考株聚为一支,属于A2d分支。基于VP1-b基因序列,分离株YN-YX221110与参考株中的经典毒株(cIBDV)类似株核苷酸相似性最高,为97.8%~98.4%,分离株YN-YX221110的vVP2基因特征性氨基酸位点240D、242D、287T、390L和393E与致弱毒株(attIBDV)参考株中的B87、Gt相同;在基于VP1-b基因序列的系统发育进化树中,分离株YN-YX221110与参考株Gt、B87和CEF94等cIBDV类似株中的attIBDV聚为一支,属于B1a分支。分离株YN-YX221110基因型为A2dB1a。[结论]成功分离得到肉鸡源IBDV分离株YN-YX221110,其A片段来源于nvIBDV,B片段来源于cIBDV类似株中的attIBDV,为新型IBDV重排毒株。 展开更多
关键词 传染性法氏囊病病毒(IBDV) 新型变异株 分离鉴定 基因重排 分子遗传进化
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经长春海关关区输入的境外新型冠状病毒基因组特征分析
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作者 丁旭 张井巍 +5 位作者 王玮琳 马文晨 刘韬 石洋 孙丽华 张婷 《现代科学仪器》 2024年第5期51-54,共4页
为了解经长春海关关区输入的新型冠状病毒肺炎(Coronavirus Disease 2019,COVID-19)感染者人口学特征和新型冠状病毒(SARS-CoV-2)全基因组变异情况。收集2023年4月至12月经长春海关关区输入的27例新型冠状肺炎感染者个案信息。采用RT-PC... 为了解经长春海关关区输入的新型冠状病毒肺炎(Coronavirus Disease 2019,COVID-19)感染者人口学特征和新型冠状病毒(SARS-CoV-2)全基因组变异情况。收集2023年4月至12月经长春海关关区输入的27例新型冠状肺炎感染者个案信息。采用RT-PCR方法对咽拭子样本进行核酸检测,CT值中ORF1ab基因和N基因Ct值均在25至30之间,占55.56%。应用第三代纳米孔基因测序仪测序及新型冠状病毒全基因组分析软件V1.0分析,测序覆盖度为98.02%~99.59%。与武汉参考株(NC_045512.2)相比SARS-CoV-2基因组序列核苷酸突变位点数在62~132个之间。Pangolin分型显示均为Omicron变异株,EG.5.1及其亚分支占比最多,占25.93%。通过分析经长春海关关区入境的人员新冠病毒核酸及基因序列,监测境外SARS-CoV-2输入情况,可实时掌握病毒株变异趋势。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 Omicron变异株 境外输入 全基因组三代测序
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伪狂犬病病毒贵州分离株与疫苗株遗传进化和抗原表位分析 被引量:1
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作者 张婧旭 徐玉 +6 位作者 梁海英 曾智勇 汤德元 王彬 徐松平 万娟 祝羊 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期1093-1106,共14页
【目的】了解贵州省猪群伪狂犬病病毒(Pseudorabies virus,PRV)毒株与疫苗株的分子特征,探究贵州省PRV变异株的遗传演化情况并对比其与疫苗株抗原差异性。【方法】通过分子克隆和生物信息学技术对本实验室在2015-2021年间贵州省分离到的... 【目的】了解贵州省猪群伪狂犬病病毒(Pseudorabies virus,PRV)毒株与疫苗株的分子特征,探究贵州省PRV变异株的遗传演化情况并对比其与疫苗株抗原差异性。【方法】通过分子克隆和生物信息学技术对本实验室在2015-2021年间贵州省分离到的5株PRV毒株的gB、gC、gD基因和商品化疫苗株(C株和HB2000株)进行克隆测序,利用本实验室序列库中的2株PRV贵州株及GenBank上登录的疫苗毒株序列,进行系统遗传进化和B细胞线性抗原表位差异性分析。【结果】结果显示,7株贵州株与疫苗株gB、gC、gD全基因组的核苷酸序列相似性分别为98.1%~100%、94.7%~100%和98.8%~100%,7株贵州株与疫苗株gB、gC、gD全基因组的氨基酸序列相似性分别为96.4%~100%、90.9%~100%和97.0%~100%;氨基酸替换分析结果显示,7株PRV贵州株和疫苗毒株间gB、gC、gD基因存在56、68和23处氨基酸位点差异,其中gC基因氨基酸位点差异最大;GZQX2017株缺失gE基因,在遗传进化树中GZQX2017株与Bartha-K61、Becker和NIA3等国外株位于同一大进化分支,属于PRVⅠ型;其余6株贵州株gE基因在第48和496位各插入1个天冬氨酸(D),符合流行变异株的基因特征,与国内流行PRV变异株位于另一大进化分支,属于PRVⅡ型;以GZQX2017株gB、gC、gD全基因作为目标基因,以Bartha-K61株作为主要亲本、Fa株作为次要亲本,gB、gC全基因均能检测到重组信号,gD全基因重组信号不明显;相比Bartha-K61株,gB、gC、gD蛋白抗原表位数量和位点存在差异。【结论】7株PRV贵州株中,GZQX2017株与疫苗Bartha-K61株、C株属于PRVⅠ型,GZQX2017株可能是由Bartha-K61株为主要亲本进行重组产生的gE基因自然缺失株,后续有望将其作为候选疫苗株进行进一步研究;其余6株贵州株与Fa株、HB2000株等属于PRVⅡ型,具有流行变异毒株的流行特征。本研究结果对了解中国贵州省流行PRV毒株分子特征具有十分重要的意义。 展开更多
关键词 猪伪狂犬病病毒(PRV) 变异株 遗传进化 抗原表位 重组信号
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传染性法氏囊病病毒新型变异株VP2蛋白原核表达及免疫效果评价 被引量:4
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作者 马景霞 王常伟 +4 位作者 吴洪才 何吉鑫 牛晓赛 段志强 朱杰 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期1876-1883,共8页
【目的】构建传染性法氏囊病病毒新型变异株(vaIBDV)VP2蛋白原核表达质粒,并明确VP2蛋白的免疫原性,为vaIBDV亚单位疫苗的开发提供技术支持。【方法】从IBDV新型变异株(BZ)中扩增VP2基因片段,亚克隆至pET-28a(+)载体上构建重组原核表达... 【目的】构建传染性法氏囊病病毒新型变异株(vaIBDV)VP2蛋白原核表达质粒,并明确VP2蛋白的免疫原性,为vaIBDV亚单位疫苗的开发提供技术支持。【方法】从IBDV新型变异株(BZ)中扩增VP2基因片段,亚克隆至pET-28a(+)载体上构建重组原核表达质粒,并转化大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞,以IPTG诱导表达后通过SDS-PAGE和Western blotting进行鉴定,并以vaIBDV阳性血清进行琼扩效价测定;经Ni-NTA亲和层析纯化及适当浓缩后,制备乳化疫苗并免疫21日龄SPF鸡,通过安全性检验、抗体效价测定及攻毒保护评价进一步验证融合蛋白VP2的免疫原性。【结果】在25℃下以IPTG进行诱导表达,获得的融合蛋白VP2主要呈可溶性表达,大小约40 kD,且表达上清液中的融合蛋白VP2能与vaIBDV阳性血清发生特异性反应,其琼扩效价可达1∶32;经Ni-NTA亲和层析纯化及适当浓缩后,融合蛋白VP2的琼扩效价高达1∶256。以融合蛋白VP2为抗原制备的亚单位疫苗稳定性好,安全性高,无免疫引起的不良反应,剖检也未发现接种部位有明显损伤、局部炎症或疫苗吸收不良等现象。免疫21 d后鸡血清琼扩效价平均值达1∶76.8,而血清抗体效价均在1∶20000以上,表明以融合蛋白VP2制备的疫苗可刺激机体产生强烈的体液免疫反应,抗体阳性率达100%;使用IBDV BZ株攻毒后7 d剖检观察鸡法氏囊病变情况,结果显示免疫组鸡只均未发病,其法氏囊也无明显萎缩现象,即免疫保护率达100%。【结论】通过原核表达系统能成功实现vaIBDV VP2蛋白的可溶性表达,且获得的融合蛋白VP2免疫原性良好,能对vaIBDV提供100%的免疫保护效果,为开发vaIBDV亚单位疫苗提供了技术支持。 展开更多
关键词 传染性法氏囊病病毒(IBDV) 新型变异株 VP2蛋白 亚单位疫苗 免疫效果
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一株鸡传染性法氏囊病毒变异株的鉴定与致病性 被引量:1
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作者 李娜 陈淑莲 +2 位作者 罗忠宝 黄宝钦 吴异健 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2023年第2期222-231,共10页
近日,在福建省南平市某鸡场发现一株新的鸡传染性法氏囊病毒(IBDV)流行株,并将其命名为IBDV-FJ02.为了明晰IBDV-FJ02株遗传变异情况和临床致病特征,进行了A节段基因组序列和特征性氨基酸位点的分析、基于A节段和B节段的新型基因型分类... 近日,在福建省南平市某鸡场发现一株新的鸡传染性法氏囊病毒(IBDV)流行株,并将其命名为IBDV-FJ02.为了明晰IBDV-FJ02株遗传变异情况和临床致病特征,进行了A节段基因组序列和特征性氨基酸位点的分析、基于A节段和B节段的新型基因型分类以及对无特定病原体(SPF)鸡致病性的研究,旨在为鸡传染性法氏囊病的防治提供依据.结果显示:IBDV-FJ02株A节段核苷酸序列与早期变异株E的同源性最高,达95.6%,与中国变异株SHG558在同一分支上;IBDV-FJ02株VP2-4-3蛋白氨基酸序列第222位氨基酸为T,第249位为K,第318位为D,参考变异株中仅GLS、E与其一致,位点N^(213)、T^(222)、K^(249)、 D^(318)、E^(323)均符合变异株的特征.根据新型基因型分类方案,显示IBDV-FJ02株属于A2dB1基因型,即IBDV新型变异株类群.致病性测定结果显示:IBDV-FJ02株感染3周龄SPF鸡并不会导致感染鸡只死亡,在感染后21 d内,主要引起鸡只法氏囊的严重萎缩和脾脏的轻微肿大.上述结果表明,IBDV-FJ02株是一种IBDV新型变异株,具有明显的IBDV变异株致病特点. 展开更多
关键词 鸡传染性法氏囊病病毒 序列比对 新型基因型分类 致病性 新型变异株
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传染性法氏囊病病毒新型重排毒株GX-NN200111的分离鉴定及遗传进化分析 被引量:4
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作者 乔远征 王威威 +6 位作者 施俊 张燕 陈金南 项燕华 王致远 何秀苗 韦平 《中国家禽》 北大核心 2023年第5期39-47,共9页
为明确广西某养殖场疑似传染性法氏囊病病毒(IBDV)感染鸡的病原类型及分子特征,试验通过病毒分离、基因扩增、序列测定、核苷酸同源性分析、系统进化树构建、氨基酸位点变异分析、重组及选择压力分析等方法进行病原研究。结果显示:成功... 为明确广西某养殖场疑似传染性法氏囊病病毒(IBDV)感染鸡的病原类型及分子特征,试验通过病毒分离、基因扩增、序列测定、核苷酸同源性分析、系统进化树构建、氨基酸位点变异分析、重组及选择压力分析等方法进行病原研究。结果显示:成功分离一株IBDV新型重排毒株(命名为GX-NN200111),该毒株属最新发现A3B1b基因型;分离株GX-NN200111能够在鸡胚中很好地增殖,表现为鸡胚头、颈、背部皮肤出血;序列分析显示,分离株GX-NN200111 vVP2属于超强毒株分支A3,核苷酸相似性为93.7%~97.9%,具有超强毒株特征性氨基酸位点212N、222A、256I和294I;VP1-b属于中国新型变异株分支B1b,核苷酸相似性为95.8%~99.7%,具有中国新型变异株的特征性氨基酸位点240E;重组分析未见有证据证实分离株GX-NN200111存在明显的重组事件,选择压力分析发现分离株GX-NN200111在vVP2和VP1-b中分别存在3个(第205、222、249位)和2个(第331、426位)正选择位点;氨基酸置换熵值分析发现分离株GX-NN200111在vVP2和VP1-b中分别存在10个(第213、222、242、249、253、254、256、279、294、299位)和4个(第242、287、390、393位)易突变位点。研究证实,分离株GX-NN200111是首次发现的一种新的重排毒株(A3B1b),其A节段来源于超强毒株、B节段来源于中国新型变异株。 展开更多
关键词 IBDV 新型变异株 自然重排 遗传进化 重组 选择压力
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传染性法氏囊病病毒新型变异株的分离和鉴定 被引量:3
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作者 姜婷婷 焦晓丽 +7 位作者 吴村 刘东海 马坤 蔡梦雷 娄路平 李夫宏 刘彦威 崔国林 《动物医学进展》 北大核心 2023年第5期44-49,共6页
为调查我国部分地区规模化养鸡场传染性法氏囊病病毒(IBDV)新型变异株流行现状,参考IBDV VP2蛋白高变区序列设计Taqman-MGB探针和引物,建立IBDV快速检测方法,利用其检测来自河北邯郸、江西宜春、重庆7家大型育雏场送检法氏囊病料,并对... 为调查我国部分地区规模化养鸡场传染性法氏囊病病毒(IBDV)新型变异株流行现状,参考IBDV VP2蛋白高变区序列设计Taqman-MGB探针和引物,建立IBDV快速检测方法,利用其检测来自河北邯郸、江西宜春、重庆7家大型育雏场送检法氏囊病料,并对阳性病料进行病毒分离、测序和进化分析。成功建立了一种兼顾IBDV鉴定和测序分型的荧光定量PCR方法,该方法在10^(1)~10^(8)拷贝/μL范围内具有良好线性关系(相关系数为0.9963),扩增效率良好(扩增效率为109%),对其他常见病毒无扩增,最低检测限为1.25×10^(1)拷贝/μL;利用该方法检测邯郸地区4家育雏场送检样品均为阳性,测序均为IBDV新型变异株,采用鸡胚自阳性样品中分离到3株IBDV(T2021与T2022、J2021);对分离株A节段测序发现,3株IBDV分离株均属国内新型变异株,与国内新型变异株SHG19氨基酸同源性为100%,核苷酸同源性为98.0%~98.6%,T2021与T2022、J2021分属两个进化分支。建立了一种IBDV快速检测方法,发现IBDV国内新型变异株在我国部分地区仍存在。 展开更多
关键词 传染性法氏囊病病毒 荧光定量PCR 鉴定 新型变异株
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新冠感染者康复期血浆中高效价新冠病毒IgG抗体检测的ELISA试剂盒筛选 被引量:2
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作者 周志军 冯璐 +9 位作者 岳胜兰 彭焱 高斌 纪德铭 李娟 陈克金 林连珍 李策生 胡勇 李陶敬 《中国输血杂志》 CAS 2023年第3期199-203,共5页
目的通过对ELISA-IgG试剂盒检测不同时期采集的单份康复期血浆及病毒中和实验检测不同效价的混合血浆的结果进行比较与分析,确定能用于高效价新冠病毒IgG抗体筛查的试剂盒。方法用A、B两种不同厂家ELISA-IgG试剂盒同时检测2020年2月~202... 目的通过对ELISA-IgG试剂盒检测不同时期采集的单份康复期血浆及病毒中和实验检测不同效价的混合血浆的结果进行比较与分析,确定能用于高效价新冠病毒IgG抗体筛查的试剂盒。方法用A、B两种不同厂家ELISA-IgG试剂盒同时检测2020年2月~2022年1月采集的269份康复期血浆,分析两者结果的相关性及符合率,初步确定试剂盒;按照初步选定的试剂盒的系列稀释标准品效价,分档位制备5档混合血浆小样G4~G128,同时用厂家A和厂家B的ELISA试剂盒以及原始株、Omicron变异株BA.1和BA.2株的假病毒中和实验检测,分析结果的相关性,结合强阳性样品的孔外稀释倍数,确定可用于筛选高效价新冠病毒IgG抗体的试剂盒。结果以内控参考品B2为标准品,厂家A检测敏感度为1∶32,厂家B检测敏感度为1∶8,厂家A的检测敏感度是厂家B的4倍;两个试剂盒检测269份血浆结果的相关性Pearson r为0.9441,P<0.0001;初步选定敏感度较低的厂家B为备选试剂盒。混浆小样结果分析显示,厂家A结果与厂家B结果的相关性Pearson r为0.988,厂家A的ELISA-IgG结果与3株病毒中和抗体效价相关性r排序分别为原始株(0.978)>BA.2株(0.970)>BA.1株(0.799),厂家B的ELISA-IgG结果与3株病毒中和抗体效价相关性r排序分别为原始株(0.994)>BA.2株(0.968)>BA.1株(0.804);若以B2稀释2倍的样品为收浆标准,厂家B试剂盒的收浆合格率为55.4%(149/269),高于现用的厂家A试剂盒的收浆合格率47.2%(127/269),对于强阳性血浆,厂家B试剂盒对于样品的稀释倍数更低,更方便操作。结论厂家A和厂家B的ELISA-IgG试剂盒均符合新冠病毒株IgG抗体检测要求,其中厂家B的试剂盒更适用于高效价IgG抗体的筛选。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 原始株和变异株 ELISA-IgG效价 康复期血浆 中和抗体效价 收浆合格率
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猪伪狂犬病病毒经典毒株与变异毒株双重实时荧光定量PCR方法的建立及应用 被引量:1
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作者 苏金辉 邓云贵 夏冰 《黑龙江畜牧兽医》 北大核心 2023年第21期84-89,共6页
为了建立一种快速检测猪伪狂犬病病毒(PRV)经典毒株和变异毒株的双重实时荧光定量PCR方法,试验根据GenBank上收录的30株PRV设计gE基因和gC基因的特异性引物和探针,构建含有gE基因和gC基因的标准质粒,优化扩增体系建立双重实时荧光定量PC... 为了建立一种快速检测猪伪狂犬病病毒(PRV)经典毒株和变异毒株的双重实时荧光定量PCR方法,试验根据GenBank上收录的30株PRV设计gE基因和gC基因的特异性引物和探针,构建含有gE基因和gC基因的标准质粒,优化扩增体系建立双重实时荧光定量PCR方法,并检验该方法的特异性、敏感性和重复性,同时绘制标准曲线,最后采用该方法对临床样品进行检测。结果表明:试验建立的双重实时荧光定量PCR方法的最佳退火温度是60℃,最佳引物体积为0.8μL,最佳探针体积为0.4μL。该方法对猪场常见疫病病原猪蓝耳病病毒(PRRSV)、猪瘟病毒(CSFV)、猪圆环病毒2型(PCV-2)、猪圆环病毒3型(PCV-3)、猪细小病毒(PPV)、猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)均无交叉反应,特异性强;对两种标准质粒pUC57-gE和pUC57-gC的最低检测限均为1×10^(1)copies/μL,gE基因和gC基因对应的标准曲线分别为y=-3.446x+41.920(R^(2)=0.998)和y=-3.255x+39.185(R^(2)=0.998);组内和组间变异系数均小于2%。临床样品检测结果的阳性率为10.53%,与《伪狂犬病诊断方法》(GB/T 18641—2018)的检测结果相同;变异毒株的阳性率为100%,扩增gC基因后的测序结果与GenBank中收录的PRV变异毒株一致。说明试验成功建立了可同时快速、准确鉴定PRV经典毒株和变异毒株的双重实时荧光定量PCR方法。 展开更多
关键词 伪狂犬病病毒 变异毒株 鉴别诊断 特异性 敏感性
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猪伪狂犬病病毒新流行变异毒株的研究进展 被引量:42
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作者 华利忠 刘剑锋 +2 位作者 冯志新 杨若松 邵国青 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第2期-,共5页
近30年内,猪伪狂犬活疫苗的应用对中国猪伪狂犬病的防控贡献巨大。2011年以来,中国许多免疫猪场相继暴发猪伪狂犬疫情,给养猪业造成了巨大的损失。研究显示最新流行的PRV毒株为变异株,部分商品化活疫苗不能对其提供完全的保护。本文详... 近30年内,猪伪狂犬活疫苗的应用对中国猪伪狂犬病的防控贡献巨大。2011年以来,中国许多免疫猪场相继暴发猪伪狂犬疫情,给养猪业造成了巨大的损失。研究显示最新流行的PRV毒株为变异株,部分商品化活疫苗不能对其提供完全的保护。本文详细介绍了2011年以来中国猪伪狂犬病的发病情况及其分子流行病学调查结果,分析了猪伪狂犬新变异株的分子生物学特性及其变异株来源,同时论述了针对PRV突变株新型疫苗的研究进展,最后对深入开展中国猪伪狂犬病控制与净化研究进行了展望。 展开更多
关键词 猪伪狂犬病毒 变异株 分子生物学 疫苗
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猪流行性腹泻病毒变异毒株、经典毒株及弱毒疫苗株多重RT-PCR鉴别检测方法的建立及应用 被引量:5
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作者 秦毅斌 卢冰霞 +8 位作者 段群棚 何颖 李斌 梁家幸 苏乾莲 周英宁 蒋冬福 卢敬专 赵武 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2016年第11期2746-2751,共6页
为建立猪流行性腹泻病毒(PEDV)变异毒株、经典毒株及弱毒疫苗株快速鉴别检测方法,根据Gen Bank中公布的PEDV变异毒株、经典毒株及弱毒疫苗株的S基因和ORF3基因,设计合成2对特异性扩增引物,用以扩增PEDV S基因和ORF3基因,通过目的片段的... 为建立猪流行性腹泻病毒(PEDV)变异毒株、经典毒株及弱毒疫苗株快速鉴别检测方法,根据Gen Bank中公布的PEDV变异毒株、经典毒株及弱毒疫苗株的S基因和ORF3基因,设计合成2对特异性扩增引物,用以扩增PEDV S基因和ORF3基因,通过目的片段的数量和片段大小来判断PEDV的毒株类型;通过对退火温度等反应条件的优化,建立了检测不同PEDV毒株类型的多重RT-PCR鉴别检测方法。结果显示,所建立的多重RT-PCR鉴别检测方法能特异性区分PEDV变异毒株、经典毒株和弱毒疫苗株;PEDV变异毒株扩增出2条目的条带,分别为234 bp的ORF3基因片段和826 bp的S基因片段;PEDV经典毒株扩增出1条目的条带,片段大小为234 bp的ORF3基因片段;而弱毒疫苗株扩增出1条目的条带,片段大小为185 bp的ORF3基因片段;与猪传染性胃肠炎病毒、A群猪轮状病毒、猪嵴病毒、猪繁殖与呼吸综合症病毒、猪伪狂犬病毒、猪瘟病毒、猪圆环病毒2型、猪乙型脑炎病毒、猪细环病毒及猪细小病毒均无交叉反应;敏感性试验显示,该方法能检测到的最低核酸浓度为2.3×10-4ng/μl;且该方法具有良好的重复性。利用该方法对采集自广西部分地区的91份临床腹泻样品进行检测,样品中PEDV阳性样品有64份,其中变异毒株占89.06%(57/64),经典毒株占4.69%(3/64),弱毒疫苗株占6.25%(4/64)。结果表明,该多重RT-PCR鉴别检测方法特异性强、灵敏度高、操作简单,为猪流行性腹泻的流行病学及病原的鉴别诊断研究提供了可供借鉴的技术手段。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 变异毒株 经典毒株 弱毒疫苗株 RT-PCR 鉴别诊断
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我国猪流行性腹泻病毒流行现状及分子遗传演化特征 被引量:20
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作者 左媛媛 徐天刚 +2 位作者 戈胜强 路皓东 吴晓东 《中国动物检疫》 CAS 2022年第9期9-17,共9页
猪流行性腹泻(PED)是由猪流行性腹泻病毒(PEDV)引起的,以腹泻为主要症状的急性肠道传染病,是长期以来危害我国养猪业健康发展的常见疾病之一。PEDV通过基因插入、缺失和重组等方式不断发生演化和变异,高致病力毒株、变异毒株不断出现,... 猪流行性腹泻(PED)是由猪流行性腹泻病毒(PEDV)引起的,以腹泻为主要症状的急性肠道传染病,是长期以来危害我国养猪业健康发展的常见疾病之一。PEDV通过基因插入、缺失和重组等方式不断发生演化和变异,高致病力毒株、变异毒株不断出现,各类毒株之间的抗原性存在明显差异,导致临床上猪腹泻情况更加复杂。自2010年10月以来,由PEDV变异株引起的PED在我国大规模暴发流行,用经典毒株制备疫苗的免疫效果并不理想,因而造成重大经济损失。本文综述了PEDV在我国的流行现状及分子遗传演化特征,旨在为PED疫苗和诊断试剂研发提供参考。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 遗传演化 流行 基因分型 变异毒株
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猪繁殖与呼吸综合征病毒变异株与猪瘟病毒等混合感染的调查与分析 被引量:14
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作者 王连想 马静云 +5 位作者 谢青梅 陈峰 薛春宜 曹永长 毕英佐 于康震 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2009年第10期3-5,共3页
从华南地区PRRSV变异株(NSP2 1 594-1 680 bp缺失)核酸阳性的23个规模场、42个个体养殖场和15个散养户,随机采集发病、同群猪血清197份、组织样品115份,调查猪群个体感染PRRSV变异株情况,并对PRRSV变异株核酸阳性样品进行CSFV、PRV、PCV... 从华南地区PRRSV变异株(NSP2 1 594-1 680 bp缺失)核酸阳性的23个规模场、42个个体养殖场和15个散养户,随机采集发病、同群猪血清197份、组织样品115份,调查猪群个体感染PRRSV变异株情况,并对PRRSV变异株核酸阳性样品进行CSFV、PRV、PCV2、SIV检测,调查PRRSV变异株混合感染情况。结果表明:312份样品中224份PRRSV变异株核酸阳性,阳性率71.79%;PRRSV变异株核酸阳性样品中CSFV、PRV、PCV2核酸阳性样品分别为12份、2份、35份,阳性率分别为5.35%、0.89%、15.6%;80个场(群)均未检测到SIV核酸的存在。25个场(群)存在病毒混合感染,其中PRRSV变异株/CSFV、PRRSV变异株/PRV、PRRSV变异株/PCV2二重感染和PRRSV变异株/CSFV/PCV2、PRRSV变异株/PRV/PCV2三重感染猪场(群)百分率分别为5%、1.25%、21.25%和2.5%、1.25%。PRRSV变异株(NSP2 1 594-1 680变异)是造成猪场(群)重大损失的直接原因,并可与CSFV、PRV、PCV2等病毒出现混合感染,与PCV2混合感染比率较高。 展开更多
关键词 PRRSV CSFV PCV2 PRV SIV 混合感染
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猪繁殖与呼吸综合征病毒美洲株与NSP2变异株二重PCR诊断方法的建立及应用 被引量:5
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作者 何丹 龙剑明 +4 位作者 傅薇 冯淑萍 胡晓静 付建 刘棋 《广西农业科学》 CAS CSCD 2009年第1期84-87,共4页
根据猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)美洲型标准株VR2332保守序列与近年PRRSV自然变异株序列分析研究,设计合成了2对特异引物,分别扩增出225、427bp两条特异型基因片段,通过优化RT-PCR条件,建立了可同时检测PRRSV标准株和NSP2变异株的二... 根据猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)美洲型标准株VR2332保守序列与近年PRRSV自然变异株序列分析研究,设计合成了2对特异引物,分别扩增出225、427bp两条特异型基因片段,通过优化RT-PCR条件,建立了可同时检测PRRSV标准株和NSP2变异株的二重PCR诊断方法。应用该方法分别对广西不同地区的16份病、死猪的血液、肺等组织进行检测,结果15份PRRSV阳性,其中1份为标准株,14份为变异株。试验结果表明,PRRSV标准株与变异株二重PCR诊断方法具有高度特异性、敏感性和实用性,可用于临床诊断,为目前流行的猪高热病病原研究及广西PRRS的防制提供了一定科学依据。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 变异株 二重PCR
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2008年江苏地区基因Ⅶd亚型新城疫病毒遗传变异分析 被引量:5
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作者 吴双 黄伟平 +3 位作者 王伟伟 胡顺林 王晓泉 刘秀梵 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第12期1782-1787,共6页
为了研究基因Ⅶd亚型新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)的分子流行病学及遗传变异规律,作者对2008年分离自江苏地区16株具有一定代表性NDV分离株的F和HN基因片段进行了扩增。根据F基因和HN基因序列绘制的2个遗传进化树基本一致,... 为了研究基因Ⅶd亚型新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)的分子流行病学及遗传变异规律,作者对2008年分离自江苏地区16株具有一定代表性NDV分离株的F和HN基因片段进行了扩增。根据F基因和HN基因序列绘制的2个遗传进化树基本一致,表明分离株中不存在囊膜糖蛋白基因发生重组的NDV;同时,HN蛋白线性表位发生E347K突变的变异株的分离率在我国呈上升趋势。基因Ⅶd亚型变异株的出现应引起相关领域从业者们的高度重视。 展开更多
关键词 新城疫病毒 基因Ⅶd亚型 变异株
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