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Screening of genes of proteins interacting with p7 protein of hepatitis C virus from human liver cDNA library by yeast two-hybrid system 被引量:2
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作者 Yan-Ping Huang Shu-Lin Zhang +11 位作者 Jun Cheng Lin Wang Jiang Guo Yan Liu Yuan Yang Li-Ying Zhang Gui-Qin Bai Xue Song Gao Dong Ji Shu-Mei Lin Yan-Wei Zhong Qing Shao 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2005年第30期4709-4714,共6页
AIM: To investigate the biological function of p7 protein and to look for proteins interacting with p7 protein in hepatocytes. METHODS: We constructed p7 protein bait plasmid by cloning the gene of p7 protein into p... AIM: To investigate the biological function of p7 protein and to look for proteins interacting with p7 protein in hepatocytes. METHODS: We constructed p7 protein bait plasmid by cloning the gene of p7 protein into pGBKTT, then transformed it into yeast AH109 (a type). The transformed yeast was mated with yeast Y187 (α type) containing liver cDNA library plasmid, pACT2 in 2×YPDA medium. Diploid yeast was plated on synthetic dropout nutrient medium (SD/- Trp-Leu-His-Ade) containing x-α-gal for selection and screening. After extracting and sequencing of plasmids from blue colonies, we performed sequence analysis by bioinformatics. RESULTS: Fifty colonies were selected and sequenced. Among them, one colony was Homo sapiens signal sequence receptor, seven colonies were Homo sapiens H19, seven colonies were immunoglobulin superfamily containing leucine-rich repeat, three colonies were spermatid peri-nuclear RNA binding proteins, two colonies were membrane-spanning 4-domains, 24 colonies were cancer-associated antigens, four colonies were nudeoporin 214 ku and two colonies were CLL-associated antigens. CONCLUSION: The successful cloning of gene of protein interacting with p7 protein paves a way for the study of the physiological function of p7 protein and its assodated protein. 展开更多
关键词 Hepatitis C virus p7 protein Interacting proteins Yeast two-hybrid system
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HCV p7蛋白反式调节基因p7TP2的克隆化及生物信息学分析 被引量:6
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作者 袁菊 郭江 +5 位作者 成军 陶明亮 蓝贤勇 洪源 靳亚平 毛羽 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2006年第6期581-587,共7页
目的:克隆HCV p7蛋白反式调节未知功能新基因p7TP2,构建其真核表达载体,并应用生物信息学初步探讨其结构及功能.方法:应用PCR技术从HepG2细胞提取的 cDNA扩增p7TP2基因,选用pGEM-T载体进行TA克隆,通过PCR,限制性酶切分析及测序进行鉴定... 目的:克隆HCV p7蛋白反式调节未知功能新基因p7TP2,构建其真核表达载体,并应用生物信息学初步探讨其结构及功能.方法:应用PCR技术从HepG2细胞提取的 cDNA扩增p7TP2基因,选用pGEM-T载体进行TA克隆,通过PCR,限制性酶切分析及测序进行鉴定,再将其亚克隆到真核表达载体 pcDNATM3.1/myc-His A,通过PCR,限制酶切分析进行鉴定,并应用生物信息学初步分析其物理化学性质、蛋白质结构域、功能及染色体定位.结果:成功从HepG2细胞提取的cDNA中扩增出p7TP2基因,编码区为495核苷酸(nt),编码产物为164氨基酸残基(aa),经核苷酸序列数据库(GenBank)同源序列的搜寻,与已知基因序列和蛋白序列之间没有显著同源性,属于未知功能新基因,并成功进行TA克隆,酶切、测序均正确,并进一步亚克隆至pcDNATM3.1/ myc-His A真核表达载体,生物信息学分析此基因位于8q24.3,Mr17 146.5,理论pI:9.26,半衰期为30 h(体外哺乳类网状细胞),属于不稳定蛋白,疏水指数较高,含有潜在的三个螺旋区域,四个β折叠,四个蛋白激酶C磷酸化位点, 一个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,5个N-肉豆蔻酰位点,预测可能为具有不紧密的球蛋白结构,具有信号肽及两个跨膜结构域.结论:发现了HCV p7反式调节新的靶基因, 构建了pcDNATM3.1/myc-HisA真核表达载体. 展开更多
关键词 HCV p7蛋白 反式调节基因 克隆化 生物 信息学分析
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牛病毒性腹泻病毒离子孔道蛋白p7多肽多克隆抗体的制备和鉴定 被引量:2
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作者 付强 郭妍婷 +2 位作者 陈俊贞 王金泉 史慧君 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期137-142,共6页
牛病毒性腹泻病毒(Bovine viral diarrhea virus,BVDV)非结构蛋白p7因其离子通道活性被称为病毒孔蛋白,参与病毒进入、释放和复制的过程。为了深入研究p7蛋白形成离子通道的机理,使用人工合成的多肽制备p7特异性多克隆抗体。根据GenBank... 牛病毒性腹泻病毒(Bovine viral diarrhea virus,BVDV)非结构蛋白p7因其离子通道活性被称为病毒孔蛋白,参与病毒进入、释放和复制的过程。为了深入研究p7蛋白形成离子通道的机理,使用人工合成的多肽制备p7特异性多克隆抗体。根据GenBank中BVDV毒株NADL p7氨基酸序列信息,进行生物信息学分析,合成表面抗原多肽并偶联血蓝蛋白(keyhole limpet hemocyanin,KLH)作为载体蛋白,经反相高效液相色谱(reversed-phase-high performance liquid chromatography,RP-HPLC)纯化、纯度分析,用质谱进行定性鉴定;使用弗氏佐剂进行乳化后,对新西兰大白兔进行皮下多点注射免疫,免疫剂量为400μg/只,连续5次免疫,免疫后10 d时采用多肽亲和柱纯化血清,获得多肽多克隆抗体,使用间接ELISA和SDS-PAGE进行抗体效价和纯度检测;BVDV NADL感染牛肾细胞MDBK后使用免疫荧光染色检测多肽多克隆抗体的反应性和特异性。生物信息学分析p7蛋白的主要抗原表位分布在氨基端,偶联KLH后合成多肽MSQYGAGEIVM MGN-Cys-KLH,经RP-HPLC纯化后多肽纯度可达80.19%,分子量为794.2 Da;经过5次免疫并使用多肽亲和柱纯化血清后,间接ELISA检测多肽多克隆抗体效价为1:100000,Western blot检测抗体的纯度为90.2%;使用免疫荧光染色检测发现该抗体在BVDV NADL感染的MDBK细胞的细胞膜上呈现阳性染色,与p7离子孔道定位相符。成功制备兔抗BVDV p7多肽多克隆抗体,具有较好的反应性和特异性,为进一步研究p7形成离子孔道的机理提供了有利工具。 展开更多
关键词 牛病毒性腹泻病毒 p7蛋白 离子孔道蛋白 多肽 多克隆抗体
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丙型肝炎病毒P7蛋白体外原核表达状况的研究 被引量:1
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作者 陈可 胡接力 +5 位作者 胡源 张文露 王增产 汤华 黄爱龙 蔡雪飞 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期262-265,共4页
目的:扩增丙型肝炎病毒(Hepatitis Cvirus,HCV)P7蛋白基因,克隆到多个原核表达系统,观察P7蛋白在体外表达的情况,获取具有生物学活性的HCVP7重组蛋白。方法:设计扩增全长HCVP7基因片段的特异引物,以H/FL质粒DNA(含HCV1acDNA全长序列)为... 目的:扩增丙型肝炎病毒(Hepatitis Cvirus,HCV)P7蛋白基因,克隆到多个原核表达系统,观察P7蛋白在体外表达的情况,获取具有生物学活性的HCVP7重组蛋白。方法:设计扩增全长HCVP7基因片段的特异引物,以H/FL质粒DNA(含HCV1acDNA全长序列)为模板,通过PCR扩增全长HCV P7基因,定向克隆到pQE30、pGEX 4T-2、pET32a(+)3种不同类型的原核表达载体中。将重组后包含HCVP7基因的原核表达载体转化表达型大肠杆菌BL21(DE3)pLysS或SG13009(PREP4),并做异丙基硫化-β-D-半乳糖苷(Isopropyl-beta-D-thiogalactoside,IPTG)诱导表达,通过SDS-PAGE和Western blot鉴定HCV P7蛋白原核表达的情况。结论:获得可溶性的重组蛋白GST-HCVP7和Trx-HCVP7,为进一步研究P7蛋白的生物学功能奠定基础。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 p7蛋白 原核表达
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日本血吸虫P7蛋白基因的克隆及序列分析 被引量:1
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作者 刘晓静 余宏 +2 位作者 姚涌 张婧 汪学龙 《热带病与寄生虫学》 2012年第4期190-192,共3页
目的克隆、分析日本血吸虫p7蛋白(Sj P7)基因,为研究该基因编码蛋白在日本血吸虫病免疫诊断及预防中的作用奠定基础。方法从日本血吸虫cDNA文库中用PCR法体外扩增出Sj P7蛋白基因,通过与线性克降载体pGEM-T连接,经进行酶切和PCR鉴定及DN... 目的克隆、分析日本血吸虫p7蛋白(Sj P7)基因,为研究该基因编码蛋白在日本血吸虫病免疫诊断及预防中的作用奠定基础。方法从日本血吸虫cDNA文库中用PCR法体外扩增出Sj P7蛋白基因,通过与线性克降载体pGEM-T连接,经进行酶切和PCR鉴定及DNA测序证实和分析。结果 PCR法扩增出了一个大小约423bp左右的DNA片断,将重组质粒pGEM-T-Sj P7作BamHⅠ和XhoⅠ双酶切,均能得到一个大小与PCR扩增产物一致的插入片断,对插入片断的测序结果表明,Si P7具有一个长度为423bp的完整开放阅读框(ORF),编码140个氨基酸,理论分子量为20 kDa,与GenBank收录(编号为EU121231)的Sj P7基因具有高度的同源性(100%)。结论本文验成功地克隆了Si p7编码基因。为进一步研究提供了条件。 展开更多
关键词 日本血吸虫 p7蛋白 基因克隆 序列分析
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应用基因表达谱芯片技术筛选HCV p7蛋白反式调节基因
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作者 郭江 成军 +3 位作者 洪源 王琦 邢卉春 毛羽 《中国肝脏病杂志(电子版)》 CAS 2010年第1期5-9,共5页
目的应用基因芯片技术对pcDNA3.1(-)和pcDNA3.1(-)-p7分别转染的HepG2细胞的基因表达谱进行分析,筛选能被HCV p7蛋白反式调节的靶基因,研究p7蛋白的生物学功能。方法以含有HCV全基因组的pBRTM质粒作为模板,应用聚合酶链反应(PCR)扩增p7... 目的应用基因芯片技术对pcDNA3.1(-)和pcDNA3.1(-)-p7分别转染的HepG2细胞的基因表达谱进行分析,筛选能被HCV p7蛋白反式调节的靶基因,研究p7蛋白的生物学功能。方法以含有HCV全基因组的pBRTM质粒作为模板,应用聚合酶链反应(PCR)扩增p7蛋白编码基因片段,以常规的分子生物学技术构建表达载体pcDNA3.1(-)-p7。以脂质体技术转染肝母细胞瘤细胞系HepG2,提取总mRNA,逆转录为cDNA,与转染空白表达载体pcDNA3.1(-)的HepG2细胞进行DNA芯片分析并比较。结果构建的表达载体经过限制性内切酶分析和DNA序列测定,证实准确无误,提取高质量的总mRNA并逆转录成cDNA,进行DNA芯片技术分析。在1152个基因表达谱的筛选中,有1个基因表达水平显著上调,22个基因表达水平显著下调。结论 HCV p7蛋白是一种反式调节因子,p7基因的表达对于肝细胞基因表达谱有显著影响。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 p7蛋白 反式调节
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四种水稻蛋白与水稻黑条矮缩病毒编码非结构蛋白P7-2的互作分析 被引量:1
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作者 张上林 孙丽英 陈剑平 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2013年第6期1298-1303,共6页
水稻黑条矮缩病毒(RBSDV)是斐济病毒属的成员之一,可侵染玉米和水稻等作物,给亚洲地区的田间生产带来严重的损失。RBSDV有10条双链RNA(double strand RNA,dsRNA)基因组,编码12个蛋白。其中6个蛋白是病毒粒子的结构成分(P1,P2,P3,P4,P8,P... 水稻黑条矮缩病毒(RBSDV)是斐济病毒属的成员之一,可侵染玉米和水稻等作物,给亚洲地区的田间生产带来严重的损失。RBSDV有10条双链RNA(double strand RNA,dsRNA)基因组,编码12个蛋白。其中6个蛋白是病毒粒子的结构成分(P1,P2,P3,P4,P8,P10),6个非结构蛋白分别为P5,P6,P7-1,P7-2,P9-1,P9-2。在非结构蛋白中,P5,P6和P9-1已被证实参与形成毒质结构,P7-1被认为可在细胞质中形成类似管状的结构作为病毒胞间扩散的通道,P7-2和P9-2的功能目前尚不明确。文章采用Pull-Down和液相色谱—质谱联用(LC-MS/MS)等技术来鉴定水稻蛋白(日本晴)与P7-2蛋白间可能存在的互作关系。通过Pull-Down实验分析,发现有4种水稻蛋白可与P7-2相结合,其中2个蛋白为转录相关蛋白,1个为氨基转移酶,还有1个为假定的分子伴侣60前体。实时荧光定量PCR分析显示,感病寄主中的转录相关蛋白和假定的分子伴侣60前体的表达量上调,而氨基转移酶的表达量降低。 展开更多
关键词 水稻黑条矮缩病毒 p7-2基因 原核表达 蛋白质互作 实时荧光定量PCR
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热休克蛋白90靶向抑制剂多肽P7联合替莫唑胺协同抗胶质母细胞瘤的作用 被引量:2
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作者 薛瞳瞳 黄薇 +1 位作者 杨楠 刘雁勇 《中国药业》 CAS 2021年第12期30-33,共4页
目的探讨双功能小分子多肽P7(序列LPLTPLP)联合替莫唑胺(TMZ)对人胶质母细胞瘤细胞系U87MG的影响。方法以TMZ与P7单用或联用处理U87MG细胞,采用CCK-8法检测细胞活性,流式细胞术检测U87MG细胞凋亡水平,蛋白质免疫印迹法检测U87MG细胞凋... 目的探讨双功能小分子多肽P7(序列LPLTPLP)联合替莫唑胺(TMZ)对人胶质母细胞瘤细胞系U87MG的影响。方法以TMZ与P7单用或联用处理U87MG细胞,采用CCK-8法检测细胞活性,流式细胞术检测U87MG细胞凋亡水平,蛋白质免疫印迹法检测U87MG细胞凋亡相关蛋白水平。以溶剂作对照。结果TMZ和P7均能抑制U87MG细胞的生长,当P7与TMZ浓度比为1∶1时,协同作用最明显;与对照组比较,联合给药组的U87MG细胞凋亡率显著升高(P<0.01),cleaved caspase-9和cleaved caspase-3表达水平显著升高(P<0.05)。结论P7联合TMZ能协同抑制U87MG细胞活力,并促进其凋亡,其机制可能与显著上调促凋亡蛋白cleaved caspase-9和cleaved caspase-3水平有关。 展开更多
关键词 胶质母细胞瘤 U87MG细胞 热休克蛋白90 靶向抑制剂 多肽p7 细胞凋亡 协同作用 机制
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HCV跨膜蛋白(P7)重组表达及化学发光法检测HCV感染者血清中抗P7抗体的建立与评价 被引量:1
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作者 吴婕 戴玉柱 +1 位作者 张英杰(指导) 成军(指导) 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第13期1614-1620,共7页
目的:建立化学发光法检测丙型肝炎病毒(HCV)感染者血清抗跨膜蛋白P7(anti-P7)抗体的方法,并进行应用评价。方法:以含有HCV 1b基因型P7核酸序列(Accession No:AJ238800)的质粒PUC-P7为模板,PCR扩增P7基因,构建重组质粒pGEX-KG-P7,P7融合... 目的:建立化学发光法检测丙型肝炎病毒(HCV)感染者血清抗跨膜蛋白P7(anti-P7)抗体的方法,并进行应用评价。方法:以含有HCV 1b基因型P7核酸序列(Accession No:AJ238800)的质粒PUC-P7为模板,PCR扩增P7基因,构建重组质粒pGEX-KG-P7,P7融合蛋白经原核诱导表达、提取纯化后,间接法包被微孔板、制备化学发光法检测抗P7抗体试剂盒,并对其方法学指标进行评价。结果:质粒pGEX-KG-P7构建正确,经原核诱导表达获得相对分子质量约34 kD的P7融合蛋白,制备的化学发光法检测抗P7抗体试剂盒方法学指标为:精密度试验(批内变异系数2.97%~4.09%,批间变异系数3.75%~5.52%),空白限和检出限分别为1.56、5.99 RLIR,相关系数r=0.9989,分析测量范围(AMR)为1.252~18.774 RLIR,平均回收率为97.8%,类风湿因子等阳性血清标本对本试验无交叉反应,试剂盒15个月内稳定,45例HCV感染者血清抗P7抗体阳性率为20%(9/45)。结论:化学发光法检测HCV感染者血清中抗P7抗体试剂盒符合方法学要求,可用于HCV感染者筛查诊断、病情监测、预后评估、疾病机制和流行病学研究,P7蛋白在HCV感染者体内存在免疫应答现象。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 跨膜蛋白p7 抗体 检测 评价
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猪瘟病毒P7基因的原核表达及表达产物的寡聚化研究
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作者 孙德惠 闫丹 +4 位作者 董虎 魏衍全 敖大 王海明 孙世琪 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期235-239,共5页
采用RT-PCR方法从接种了猪瘟疫苗的家兔脾组织中扩增出了P7基因,将其克隆到表达载体pSMK中,测序验证后转化入表达菌BL21中进行诱导表达。结果显示,重组菌可以表达出分子质量约为19ku的重组融合蛋白,经终浓度为1mmol/L的IPTG诱导2h的表... 采用RT-PCR方法从接种了猪瘟疫苗的家兔脾组织中扩增出了P7基因,将其克隆到表达载体pSMK中,测序验证后转化入表达菌BL21中进行诱导表达。结果显示,重组菌可以表达出分子质量约为19ku的重组融合蛋白,经终浓度为1mmol/L的IPTG诱导2h的表达效果较好。表达产物经Ni柱纯化,可得到纯度较好的目的蛋白。纯化的蛋白置于4℃2d后进行Western-blot检测,发现有多聚体形成;戊二醛交联结果表明,P7蛋白可形成同源寡聚体。此研究结果为进一步研究猪瘟病毒P7基因表达蛋白的性质和功能奠定了基础。 展开更多
关键词 猪瘟病毒 p7蛋白 原核表达 同源寡聚
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Effects of moxibustion on the P2X7R/STAT3/VEGF pathway in rats with colitis-associated colon cancer 被引量:1
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作者 Lin Ya-ying Wang Di +7 位作者 Wu Huan-gan Gu Mu-en Li Qi Ma Zhe Huang Yan Lu Yuan Li Kun-shan Wu Lu-yi 《Journal of Acupuncture and Tuina Science》 CSCD 2021年第2期83-94,共12页
Objective:To observe the effects of herb-partitioned moxibustion and ginger-partitioned moxibustion on the growth of colon tumors in rats with colitis-associated colon cancer(CACC),and explore the mechanism of moxibus... Objective:To observe the effects of herb-partitioned moxibustion and ginger-partitioned moxibustion on the growth of colon tumors in rats with colitis-associated colon cancer(CACC),and explore the mechanism of moxibustion intervening CACC through the purinergic receptor P2X ligand-gated ion channel 7(P2X7R)/signal transducer and activator of transcription 3(STAT3)/vascular endothelial growth factor(VEGF)pathway.Methods:A total of 26 male Sprague-Dawley rats were selected.According to the random number table method,6 rats were selected as the normal group.The remaining 20 rats were injected intraperitoneally with azoxymethane(AOM)combined with oral dextran sodium sulfate(DSS)to prepare the CACC model.After the model was successfully established,2 rats were randomly selected for model identification.The remaining 18 rats which were successfully modeled were randomly divided into a model group,a herb-partitioned moxibustion group and a ginger-partitioned moxibustion group,with 6 rats in each group.Moxibustion intervention was performed in the herb-partitioned moxibustion group and the ginger-partitioned moxibustion group at Qihai(CV 6)and bilateral Tianshu(ST 25).Moxibustion was performed twice at each point each time,once a day,at a 1-day interval after 6 consecutive interventions,for a total of 30 interventions.After intervention,the colon tumor load,pathological change and histopathological score were observed.Immunohistochemistry was used to detect the expressions of VEGF,P2X7R,phospho-STAT3(p-STAT3),and nuclear factor-kappa B p65(NF-κB p65)proteins in rat colon tissue.Western blot was used to detect the levels of p-STAT3 and NF-κB p65 proteins in rat colon tissue.Results:Compared with the normal group,the colon tumor load and histopathological score in the model group were significantly increased(both P<0.001),and different grades of dysplasia were observed in colon tissue from the model group,reaching the degree of adenocarcinoma;the expression level of P2X7R protein in colon tissue was significantly decreased(P<0.001),and the expression levels of p-STAT3,NF-κB p65 and VEGF proteins were significantly increased(all P<0.001)in the model group.Compared with the model group,the colon tumor load,colon histopathological score and the levels of p-STAT3,NF-κB p65 and VEGF proteins in colon tissue were significantly decreased(all P<0.05)in the herb-partitioned moxibustion group and the ginger-partitioned moxibustion group while the expression levels of P2X7R protein in colon tissue were significantly increased(both P<0.05).Conclusion:Both herb-partitioned moxibustion and ginger-partitioned moxibustion can reduce the colon tumor load in CACC rats and delay the progression of colon adenomas.The mechanism may be mediated by the P2X7R/STAT3 pathway to inhibit STAT3 phosphorylation,thereby reducing VEGF protein expression. 展开更多
关键词 Moxibustion Therapy Medicinal Cake-partitioned Moxibustion Ginger-partitioned Moxibustion Colitis-associated Neoplasms Vascular Endothelial Growth Factor Receptors Purinergic P2X7STAT3 protein NF-kappa B
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