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Mutations in pre-core and basic core promoter regions of hepatitis B virus in chronic hepatitis B patients 被引量:12
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作者 Xiao-Ling Wang Jian-Ping Ren +3 位作者 Xue-Qing Wang Xiao-Hong Wang Shao-Fang Yang Yi Xiong 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2016年第11期3268-3274,共7页
AIM: To investigate the frequency of mutations in pre-core (pre-C) and basic core promoter (BCP) regions of hepatitis B virus (HBV) from Shanxi Province, and the association between mutations and disease related index... AIM: To investigate the frequency of mutations in pre-core (pre-C) and basic core promoter (BCP) regions of hepatitis B virus (HBV) from Shanxi Province, and the association between mutations and disease related indexes.METHODS: One hundred chronic hepatitis B patients treated at Shanxi Province Hospital of Traditional Chinese Medicine were included in this study. PCR-reverse dot blot hybridization and mismatch amplification mutation assay (MAMA)-PCR were used to detect the mutations in the HBV pre-C and BCP regions. HBV DNA content and liver function were compared between patients with mutant HBV pre-C and BCP loci and those with wild-type loci. The consistency between PCR-reverse dot blot hybridization and MAMA-PCR for detecting mutations in the HBV pre-C and BCP regions was assessed.RESULTS: Of the 100 serum samples detected, 9.38% had single mutations in the pre-C region, 29.17% had single mutations in the BCP region, 41.67% had mutations in both BCP and pre-C regions, and 19.79% had wild-type loci. The rates of BCP and pre-C mutations were 65.7% and 34.3%, respectively, in hepatitis B e antigen (HBeAg) positive patients, and 84.6% and 96.2%, respectively, in HBeAg negative patients. The rate of pre-C mutations was significantly higher in HBeAg negative patients than in HBeAg positive patients (&#x003c7;<sup>2</sup> = 26.62, P = 0.00), but there was no significant difference in the distribution of mutations in the BCP region between HBeAg positive and negative patients (&#x003c7;<sup>2</sup> = 2.43, P = 0.12). The presence of mutations in the pre-C (Wilcoxon W = 1802.5, P = 0.00) and BCP regions (Wilcoxon W = 2906.5, P = 0.00) was more common in patients with low HBV DNA content. Both AST and GGT were significantly higher in patients with mutant pre-C and BCP loci than in those with wild-type loci (P &#x0003c; 0.05). PCR-reverse dot blot hybridization and MAMA-PCR for detection of mutations in the BCP and pre-C regions had good consistency, and the Kappa values obtained were 0.91 and 0.58, respectively.CONCLUSION: HBeAg negative patients tend to have HBV pre-C mutations. However, these mutations do not cause increased DNA copies, but associate with damage of liver function. 展开更多
关键词 Basic core promoter region Pre-core region Liver injury Reverse dot blot hybridization Mismatch amplification mutation assay
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Review on hepatitis B virus precore/core promoter mutations and their correlation with genotypes and liver disease severity 被引量:5
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作者 Rajesh Kumar 《World Journal of Hepatology》 2022年第4期708-718,共11页
Of 350 million people worldwide are chronically infected with hepatitis B virus(HBV)and are at risk of developing cirrhosis and hepatocellular carcinoma(HCC)later in life.HBV is the most diverse DNA virus,and its geno... Of 350 million people worldwide are chronically infected with hepatitis B virus(HBV)and are at risk of developing cirrhosis and hepatocellular carcinoma(HCC)later in life.HBV is the most diverse DNA virus,and its genome is composed of four open reading frames:Presurface antigen/surface antigen gene(preS/S),precore/core gene(preC/C),polymerase gene(P),and theχgene(χ).HBV produces quasispecies naturally or in response to antiviral agents because of the absence of proofreading activity amid reverse transcription and a high replication rate.The virus has 10 genotypes(A to J)with different geographical distributions.There are various HBV mutations in the HBV genome,including preC/C mutations,preS/S mutations,P gene mutations,andχgene mutations.The core promoter region plays a vital part in the replication,morphogenesis and pathogenesis of the virus.The precore region also plays a crucial role in viral replication.Both core promoter and precore mutations rescue the virus from host immune surveillance and result in the formation of mutated strains that may have altered pathogenicity.preC/C mutations are associated with liver disease progression.Precore mutations stop hepatitis B e antigen(HBeAg)production and basal core promoter mutations downregulate HBeAg production.Mutations in the basal core promoter are also associated with increased HBV replication and an increased incidence of advanced liver diseases such as cirrhosis and HCC.The emergence of antiviral-resistant mutations is the main reason for treatment failure.This review focuses mainly on preC/C promoter mutations and their correlation with genotypes and liver disease severity.Thorough perception and knowledge of HBV genetic variety and mutants could be vital to discover techniques for the prognosis and control of HBV infection. 展开更多
关键词 Hepatitis B virus Hepatitis B virus e antigen Hepatocellular carcinoma Basal core promoter core promoter region Precore region Fulminant hepatitis Acute hepatitis
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HBV PC区和BCP区变异与Peg-IFNα-2b疗效的关系及治疗前后的变化 被引量:1
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作者 汪波 刘艳艳 李家斌 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第9期1684-1689,1695,共7页
目的:探讨乙型肝炎病毒(HBV)前核心区(PC区)G1896A和基本核心启动子区(BCP区)A1762T/G1764A突变与聚乙二醇化干扰素α-2b(Peg-IFNα-2b)治疗应答的关系及相关变异在治疗前后的变化。方法:69例HBeAg阳性慢性乙型肝炎(CHB)患者,接受48周Pe... 目的:探讨乙型肝炎病毒(HBV)前核心区(PC区)G1896A和基本核心启动子区(BCP区)A1762T/G1764A突变与聚乙二醇化干扰素α-2b(Peg-IFNα-2b)治疗应答的关系及相关变异在治疗前后的变化。方法:69例HBeAg阳性慢性乙型肝炎(CHB)患者,接受48周Peg-IFNα-2b治疗并随访24周。PCR扩增每位患者第0周和第72周HBV PC和BCP区并测序分析突变情况,同时监测患者第0、4、8、12、24、36、48、60和72周HBsAg、HBeAg、丙氨酸转氨酶(ALT)和HBV的DNA水平。结果:共14例患者检测为野生型(20.29%),55例患者检测为突变型(79.71%)。野生型较突变型HBeAg基线水平更高(P=0.024)。患者基线和72周时野生型、PC突变型、BCP突变型和PC+BCP突变型所占构成比发生明显变化(P=0.004)。野生型、PC突变型、BCP突变型和PC+BCP突变型患者在72周的HBeAg血清转换率和联合应答率差异均无统计学意义。结论:PC区和BCP区突变对HBeAg阳性B/C基因型CHB患者Peg-IFNα-2b治疗应答无明显影响,但治疗前后各突变所占构成比发生明显变化。 展开更多
关键词 前核心区 基本核心启动子区 聚乙二醇化干扰素α-2b 慢性乙型肝炎 突变
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HBV前C/C基因启动子区变异与HBeAg阴性CHB患者肝组织病理变化的关系 被引量:7
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作者 廖宝林 林思炜 +4 位作者 陈伟烈 刘惠媛 陈铿 刘丽儿 施海燕 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2016年第14期2347-2350,共4页
目的:探讨乙型肝炎病毒(HBV)前C/C基因启动子区变异与HBe Ag阴性慢性乙型肝炎(CHB)患者肝组织病理变化的关系。方法:将2012年4月至2013年12月在广州市第八人民医院住院诊治所有伴肝活检的HBeAg阴性CHB患者71例纳入本项研究,提取血... 目的:探讨乙型肝炎病毒(HBV)前C/C基因启动子区变异与HBe Ag阴性慢性乙型肝炎(CHB)患者肝组织病理变化的关系。方法:将2012年4月至2013年12月在广州市第八人民医院住院诊治所有伴肝活检的HBeAg阴性CHB患者71例纳入本项研究,提取血清DNA后通过巢式PCR扩增HBV的S基因区与前C/C基因启动子区并测序分析,Logistic回归分析与显著性肝脏组织学异常相关的病毒性因素指标。结果:基因型B患者组与基因型C患者组比较,显著性肝脏炎症发生率(15.8%vs.27.3%,χ^2=1.398,P=0.237)及显著性肝纤维化发生率(71.1%vs.84.4%,χ^2=1.926,P=0.165)均无显著差异。纳入年龄、性别、HBV基因型以及变异位点(T1753V、A1762T/G1764A、A1846T和G1896A)进行Logistic回归分析,HBV基因的A1762T/G1764A变异与显著性肝脏炎症相关(OR=4.296,P=0.037),而年龄、性别、基因型和其他位点变异与显著性肝组织病理学改变无显著相关性(均P〉0.05)。结论:HBV前C/C基因区变异可能可作为评估肝组织病理变化的生化指标。 展开更多
关键词 HBV 前C/C基因区 变异 肝纤维化
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慢性乙型肝炎乙型肝炎病毒核心启动子区和前核心区基因变异后的预后分析 被引量:2
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作者 刘新钰 张汉荣 +2 位作者 孙梅 曹利 谈国蕾 《临床荟萃》 CAS 北大核心 2005年第16期905-907,共3页
目的为了解慢性乙型肝炎患者乙型肝炎病毒(HBV)核心启动子(BCP)区和前核心(前C)区基因变异后的临床转归及其预后。方法采用DNA序列分析法检测123例HBVDNA阳性的慢性乙型肝炎患者血清HBVBCP区(nt1762、nt1764)和前C区(nt1896)基因序列,... 目的为了解慢性乙型肝炎患者乙型肝炎病毒(HBV)核心启动子(BCP)区和前核心(前C)区基因变异后的临床转归及其预后。方法采用DNA序列分析法检测123例HBVDNA阳性的慢性乙型肝炎患者血清HBVBCP区(nt1762、nt1764)和前C区(nt1896)基因序列,并同步进行乙型肝炎e抗原(HBeAg)、乙型肝炎e抗体(抗-HBe)定量及肝功能检测。结果123例患者HBVBCP区(A1762T、G1764A)和前C区(G1896A)基因变异检出率为76.42%;其中肝炎肝硬化(HLC)患者双变异(A1762T、G1764A)和联合变异(A1762T、G1764A、G1896A)率最高(52.94%与29.41%);慢性重型肝炎患者终止变异(G1896A)率最高(42.86%);HBeAg/抗HBe转换率分别为:双变异组23.91%,终止变异组75.00%,联合变异组84.00%,无变异组13.79%。结论HBVBCP双变异、前C终止变异和联合变异均可引起慢性乙型肝炎病情加重及肝硬化的发生,但严重肝损伤与这3种变异之间可能无因果关系,只是HBV减少病毒蛋白的产生,逃避免疫监视的一种方式;推测BCP双变异和联合变异可能是引起HLC的重要病因之一;BCP区变异患者对干扰素治疗敏感。 展开更多
关键词 肝炎 乙型 慢性 肝炎病毒 乙型 核心启动子区 前核心区 基因变异
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鸡lncRNA-CEPT8启动子验证及活性核心区域筛选 被引量:1
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作者 金晶 余昕健 +4 位作者 靳锴 李婷婷 张晨 左其生 李碧春 《中国家禽》 北大核心 2020年第6期15-20,共6页
研究旨在筛选鸡lncRNA-CEPT8启动子核心区域并验证其启动活性。采用qRT-PCR检测lncRNA-CEPT8在鸡不同组织中表达情况。生物信息学预测lncRNA-CEPT8启动子区域,PCR扩增启动子并构建pEGFP-lncCEPT8重组载体,转染DF-1细胞后48 h进行荧光观... 研究旨在筛选鸡lncRNA-CEPT8启动子核心区域并验证其启动活性。采用qRT-PCR检测lncRNA-CEPT8在鸡不同组织中表达情况。生物信息学预测lncRNA-CEPT8启动子区域,PCR扩增启动子并构建pEGFP-lncCEPT8重组载体,转染DF-1细胞后48 h进行荧光观察。再构建启动子系列缺失载体(pGL3-p1、pGL3-p2、pGL3-p3、pGL3-p4、pGL3-p5),分别转染DF-1细胞后48 h检测双荧光素酶活性,分析缺失载体的启动活性。结果表明,lncRNA-CEPT8在鸡生殖嵴中特异性高表达,pEGFP-lncCEPT8重组载体转染DF-1细胞后有绿色荧光。缺失载体pGL3-p4与pGL3-p3相比,活性极显著下降(P<0.01)。研究明确了lncRNA-CEPT8上游-1174^-1 bp处为启动子,且-627^-429bp是启动子核心区域,为进一步研究其表达调控机制提供理论依据。 展开更多
关键词 启动子 lncRNA 核心区域
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猪ATP6V0A4基因启动子核心区的筛选与分析 被引量:1
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作者 汪亮 李忠秋 +3 位作者 唐晓东 张海峰 刘娣 张冬杰 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2021年第3期216-221,共6页
ATP6V0A4基因编码V-ATP酶的一个亚基,与H+转运相关,是遗传性远端肾小管性酸中毒的致病基因。在前期研究中发现,民猪在遭受冷应激后其背脂中ATP6V0A4基因的转录水平发生了显著上升(P<0.05)。为了分析ATP6V0A4基因在转录水平的调控机制... ATP6V0A4基因编码V-ATP酶的一个亚基,与H+转运相关,是遗传性远端肾小管性酸中毒的致病基因。在前期研究中发现,民猪在遭受冷应激后其背脂中ATP6V0A4基因的转录水平发生了显著上升(P<0.05)。为了分析ATP6V0A4基因在转录水平的调控机制,构建了一系列长度不同的含有该基因5′端启动子区域的双荧光素酶报告基因质粒,转染PK15细胞并检测双荧光素酶的相对活性。根据检测结果,利用重叠PCR技术定点靶序列,预判可能存在的转录调控因子。结果发现,该基因启动子区的-1504~-1 bp片段具有转录活性,通过2轮启动子截短试验后判定-265~-1 bp区域内存在正调控元件,-581~-265 bp区域内存在负调控元件。定向缺失-205~-190 bp,-120~-110 bp小片段后,确定-205~-190 bp区域内存在调控该基因转录的正调控元件结合位点,通过在线软件预测后发现E2F3、SP2、EGR1、E2F6、CTCFL、E2F1、SP1和ETF可能是该基因的正调控转录因子。首次克隆了猪的ATP6V0A4基因的启动子区域并进行了转录因子结合位点的筛选与鉴定,为后续研究其在冷应激状态下的转录调控奠定了基础。 展开更多
关键词 ATP6V0A4 启动子 核心区 双荧光素酶报告系统
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慢加急性乙型肝炎肝衰竭患者乙型肝炎病毒前C/CP区变异研究进展 被引量:7
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作者 黄鹏宇 徐东平 《实用肝脏病杂志》 CAS 2016年第2期241-244,共4页
慢加急性肝衰竭(ACLF)是我国肝衰竭的主要类型,其病情发展迅速、预后不良、病死率较高。在我国,乙型肝炎病毒(HBV)感染是导致ACLF的主要病因,其中HBV前C(PC)/核心启动子(CP)区基因变异与ACLF的发生密切相关。本文重点介绍HBV PC/CP区基... 慢加急性肝衰竭(ACLF)是我国肝衰竭的主要类型,其病情发展迅速、预后不良、病死率较高。在我国,乙型肝炎病毒(HBV)感染是导致ACLF的主要病因,其中HBV前C(PC)/核心启动子(CP)区基因变异与ACLF的发生密切相关。本文重点介绍HBV PC/CP区基本结构和功能、PC/CP区变异后生物学特性的改变、ACLF的免疫病理损伤机制、PC/CP区变异与ACLF疾病进展的临床意义等方面的研究进展。 展开更多
关键词 慢加急性肝衰竭 乙型肝炎病毒 前C区 核心启动子 变异
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慢性乙型肝炎患者HBV前C区A1896变异和BCP T1762/A1764双变异与临床相关性分析 被引量:2
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作者 刘成忠 王琴 +3 位作者 肖传宇 王建伟 谢强 侯文华 《现代检验医学杂志》 CAS 2010年第2期81-83,86,共4页
目的探讨慢性乙型肝炎病毒(HBV)前C区和基本核心启动子(BCP)突变与HBV—DNA载量之间的关系,明确检测突变的意义。方法PCR扩增HBV—DNA前C区序列,进行PCR产物直接测序,测序HBV感染者血清中HBV前C区A1896突变及BCP T1762/A1764双... 目的探讨慢性乙型肝炎病毒(HBV)前C区和基本核心启动子(BCP)突变与HBV—DNA载量之间的关系,明确检测突变的意义。方法PCR扩增HBV—DNA前C区序列,进行PCR产物直接测序,测序HBV感染者血清中HBV前C区A1896突变及BCP T1762/A1764双突变例数。结果31例慢性乙型肝炎患者血清HBV—DNA发生nt1896住核苷酸G—A点突变18例;发生nt1762位A—T16例;发生nt1764位G〉A18例;发生nt1762位A—T与1764位G—A双突变16例;1762住A—T1764位G—A双变异和1896位G~A变异的联合变异频率明显高于单个变异。用SPSS16.0软件分析突变与HBV—DNA载量的关系。前C区A1896变异,BCPT1762/A1764变异均与HBV—DNA载量差异无统计学意义。结论HBV—DNA载量仅能反映实时病毒载量,HBV前C区A1896变异和BCPT1762/A1764双变异在各种病毒载量感染者中存在,仅依靠血清学指标及HBV—DNA载量来判断传染性是不够的。检测HBV—DNA前C区A1896变异和BCPT1762/A1764双变异,可辅助判断传染性及制定抗病毒治疗方案。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 基本核心启动子 前C基因 突变 DNA序列分析
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牦牛FKBP6基因启动子区克隆、鉴定与分析 被引量:1
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作者 姚一龙 李伯江 李齐发 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期52-59,共8页
本研究旨在了解牦牛FKBP6基因5′调控区和启动子区特征,为探讨牦牛和犏牛睾丸组织中FKBP6基因差异表达机制提供依据。利用克隆测序获得牦牛FKBP6基因5′调控区序列,采用生物信息学方法分析其序列特征;采用双荧光素酶报告基因系统鉴定牦... 本研究旨在了解牦牛FKBP6基因5′调控区和启动子区特征,为探讨牦牛和犏牛睾丸组织中FKBP6基因差异表达机制提供依据。利用克隆测序获得牦牛FKBP6基因5′调控区序列,采用生物信息学方法分析其序列特征;采用双荧光素酶报告基因系统鉴定牦牛FKBP6基因核心启动子区,利用生物信息学软件预测与精子发生有关的转录因子结合位点。通过克隆测序和序列拼接获得了1 354bp的牦牛FKBP6基因5′调控区序列,与普通牛的一致性为99.71%;牦牛FKBP6基因5′调控区序列含有潜在的启动子区、典型的CAAT-Box和CpG岛,但未见TATA-Box;荧光素酶活性分析发现,牦牛FKBP6基因的核心启动子区位于5′调控区的-263^-167nt区域,含有CAAT-Box、E-Box、CTCF和CREB等与精子发生相关的转录因子结合位点。牦牛FKBP6基因核心启动子的鉴定和精子发生相关转录因子结合位点的发现为进一步研究牦牛睾丸组织中FKBP6基因的表达调控奠定了基础。 展开更多
关键词 牦牛 FKBP6 5′调控区 核心启动子
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乙型肝炎病毒基本核心启动子和前C基因序列分析 被引量:5
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作者 贾因棠 黄彤 +2 位作者 刘宝芳 宋红波 武俊香 《山西医科大学学报》 CAS 2009年第4期302-307,共6页
目的研究乙型肝炎病毒(HBV)基本核心启动子(BCP)区及前C(PreC)区基因的变异情况,并且分析其发生频率、分布规律及其与临床病情的关系。方法应用套式PCR扩增nt1660-1935的HBV DNA片段及PCR产物直接测序的方法检测BCP区及Pre-C区基因的变... 目的研究乙型肝炎病毒(HBV)基本核心启动子(BCP)区及前C(PreC)区基因的变异情况,并且分析其发生频率、分布规律及其与临床病情的关系。方法应用套式PCR扩增nt1660-1935的HBV DNA片段及PCR产物直接测序的方法检测BCP区及Pre-C区基因的变异情况。结果130例乙型肝炎患者标本中,BCP区nt1762/nt1764发生双突变者75例(57.69%),Pre-C区nt1896发生突变者20例(15.38%),并且这两种突变在重型肝炎组(75.00%)及肝硬化组(72.22%)所占比例均明显高于慢性肝炎组(52.56%);此外,在BCP区及Pre-C/C区还发现了一些突变频率较高的其他突变位点(如nt1753,nt1766,nt1846,nt1899,nt1915),其中nt1753突变仅发生于有nt1762/1764双突变的患者,与重型肝炎及肝硬化的发生有一定关系;在BCP区有4处核苷酸突变共存者10例,其中重型肝炎组(12.50%)及肝硬化组(13.88%)所占比例明显高于慢性肝炎组(5.12%)。结论HBV BCP区nt1762/nt1764双突变和Pre-C区nt1896突变与肝炎的活动、重型化及肝硬化的发生有关;BCP区其他位点的突变共存对肝炎病情的进展也有重要影响。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒:突变:基本核心启动子:前C区
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原发性肝癌患者乙型肝炎病毒前C区联合基本核心启动子变异的分析 被引量:2
12
作者 刘悦晖 丁静娟 范学工 《现代生物医学进展》 CAS 2008年第5期888-889,904,共3页
目的:研究原发性肝癌患者乙型肝炎病毒前C区联合基本核心启动子变异情况及与基因型的关系。方法:收集乙型肝病毒感染者血清132份,HBVDNA均阳性,用半巢式聚合酶链反应扩增HBV前C及C基因部分片段,产物纯化后直接测序,检测前CA1896联合BCPT... 目的:研究原发性肝癌患者乙型肝炎病毒前C区联合基本核心启动子变异情况及与基因型的关系。方法:收集乙型肝病毒感染者血清132份,HBVDNA均阳性,用半巢式聚合酶链反应扩增HBV前C及C基因部分片段,产物纯化后直接测序,检测前CA1896联合BCPT1762/A1764变异。用S基因PCR-RFLP方法确定HBV基因型。结果:乙型肝炎病毒前C区联合基本核心启动子变异在原发性肝癌组的阳性率为41.18%(14/34),显著高于慢性肝病组的11.22%(11/98)(P<0.01)。前C A1896联合BCP T1762/A1764变异在B基因型检出率与C基因型相比,差异无显著性(P>0.05)。结论:乙型肝炎病毒前C区联合基本核心启动子变异与原发性肝癌关系密切,与基因型无相关性。 展开更多
关键词 原发性肝癌 乙型肝炎病毒前C区联合基本核心启动子 变异 基因型
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基于区域比较视角的哈尔滨创新能力提升研究 被引量:1
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作者 张欣 于渤 《科技与经济》 CSSCI 2011年第2期20-24,共5页
以在东北老工业基地振兴战略中占有重要地位的沈阳、哈尔滨、长春、大连4个区域核心城市为研究背景,通过构建评价指标体系,对样本城市的创新要素和能力进行比较分析。通过对哈尔滨的剖析可知,其优势在于:区位优势和对俄合作;经济基础和... 以在东北老工业基地振兴战略中占有重要地位的沈阳、哈尔滨、长春、大连4个区域核心城市为研究背景,通过构建评价指标体系,对样本城市的创新要素和能力进行比较分析。通过对哈尔滨的剖析可知,其优势在于:区位优势和对俄合作;经济基础和城市综合服务后发优势;国家级园区对科技创新强势带动作用。其不足在于:多元投融资体系未形成;科研成果转化渠道少;自主创新能力弱,品牌竞争力不强;对人才吸引乏力;产业集群与技术链条缺失;对创新缺乏宽容持续性。最后,针对问题提出对策建议。 展开更多
关键词 哈尔滨 区域核心城市 区域比较 创新能力提升
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大鼠NR2B基因核心启动子区单核苷酸多态性研究
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作者 田大为 王丽峰 +6 位作者 杨晓扬 王少霞 王长振 张硌 高亚兵 彭瑞云 胡向军 《武警医学》 CAS 2011年第5期385-388,391,共5页
目的对大鼠NR2B基因核心启动子区进行单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)筛查及分析。方法提取16只健康SD大鼠海马组织基因组DNA,聚合酶链式反应(PCR)扩增NR2B基因核心启动子区序列和SNP库已报道的rs8169392所在区域序... 目的对大鼠NR2B基因核心启动子区进行单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)筛查及分析。方法提取16只健康SD大鼠海马组织基因组DNA,聚合酶链式反应(PCR)扩增NR2B基因核心启动子区序列和SNP库已报道的rs8169392所在区域序列,结合DNA测序方法进行SNP筛查和验证。结果在大鼠NR2B核心启动子区705bp中,发现1个新的SNP位点,为-217位C/T多态;本研究中未筛查到NCBI-SNP库报道的rs8169392。结论 -217位C/T多态的发现为NR2B基因多态性数据库提供了新信息。 展开更多
关键词 NR2B基因 核心启动子区 单核苷酸多态性 大鼠
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基因芯片技术检测肝细胞癌前C区/BCP区基因突变
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作者 周秀梅 曲迅 +1 位作者 邹明谨 孙成刚 《实用医药杂志》 2003年第12期916-918,共3页
目的应用基因芯片技术探讨HBV慢性感染并发肝细胞癌(HCC)前C区/BCP区基因突变的临床意义。方法应用基因芯片杂交技术检测46例HBV慢性感染并发肝细胞癌前C区A1896、A1899及BCP区nt1762、nt1764四位点突变,比较各位点突变的发生率;据乙肝... 目的应用基因芯片技术探讨HBV慢性感染并发肝细胞癌(HCC)前C区/BCP区基因突变的临床意义。方法应用基因芯片杂交技术检测46例HBV慢性感染并发肝细胞癌前C区A1896、A1899及BCP区nt1762、nt1764四位点突变,比较各位点突变的发生率;据乙肝血清学标志熏将研究对象分为HBeAg阳性组、HBeAg阴性组两组,比较前C区/BCP区变异与HBeAg分泌障碍的关系,分析前C区/BCP区基因突变与血清HBVDNA定量的关系。结果①用基因芯片法测定46例患者,阳性率91.3%(42/46),A1896突变率52.4%,A1899突变率19%熏nt1762/nt1764联合突变率66.7%。②HBeAg阴性组与HBeAg阳性组比较,A1896突变率、nt1762nt1764联合突变率及多位点突变率明显为高,P<0.05。前C区/BCP区变异组与非变异组比较,HBVDNA定量无显著性差异。结论应用基因芯片法可一次同时检测乙型肝炎病毒多个突变位点熏HBV持续慢性感染并发的HCC前C区/BCP区变异的发生率较高,该变异与HBeAg分泌障碍有关,但与HBVDNA复制水平并无明显相关性。 展开更多
关键词 HBV 肝细胞癌 前C区/BCP区基因 变异 基因芯片
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HBV慢性感染者前C/BCP区变异特点及与疾病发展关系分析
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作者 孙敏 孙波 +1 位作者 吕开雪 陈巧真 《中国民康医学》 2017年第17期1-3,35,共4页
目的:探讨慢性HBV感染者前C/BCP区突变与血清HBeAg、HBs Ag、DNA、甲胎蛋白(AFP)及肝硬度值(LSM)的关系及对疾病进展的预测性。方法:收集101例未经抗病毒治疗的慢性HBV感染者和47例乙型肝炎肝硬化(LC)患者清晨空腹血清。以免疫化学发光... 目的:探讨慢性HBV感染者前C/BCP区突变与血清HBeAg、HBs Ag、DNA、甲胎蛋白(AFP)及肝硬度值(LSM)的关系及对疾病进展的预测性。方法:收集101例未经抗病毒治疗的慢性HBV感染者和47例乙型肝炎肝硬化(LC)患者清晨空腹血清。以免疫化学发光法检测血清HBeAg、HBs Ag、AFP含量,采用磁珠法检测HBV-DNA,应用半巢式聚合酶链反应检测前C/BCP区基因突变,采用无创实时检测设备检测LSM。结果:101例慢性HBV感染者中,HBeAg阴性组的前C、BCP、前C+BCP区的变异率显著高于HBeAg阳性组(P<0.01)。而LC组总变异率显著高于慢性HBV感染者HBeAg阴性组和HBeAg阳性组(P<0.01)。148例HBV感染者中前C区、BCP区和前C+BCP变异株共87例,野生株61例,变异型组与野生型组比较,HBeAg含量减少(P<0.05),HBs Ag含量增加(P<0.01),AFP水平和LSM值增高(P<0.05),DNA水平无统计学意义(P>0.05)。结论:HBeAg阴性的慢性HBV感染患者中前C/BCP区变异率较高,变异可能导致更易发展为肝硬化,病情加重。监测HBeAg阴转的慢性HBV感染患者的DNA、HBs Ag、AFP、LSM指标,对了解病情及体内病毒是否确实已被免疫清除有参考价值。 展开更多
关键词 HBEAG 乙型肝炎病毒 变异 肝硬化 前C区 基本核心启动子
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银黑狐MC1R基因核心启动子区的鉴定 被引量:1
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作者 刘华云 张磊 +5 位作者 徐桂利 张天浩 谢遇春 段玲欣 刘铮铸 巩元芳 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第7期2442-2450,共9页
【目的】确定银黑狐黑素皮质激素受体1(melanocortin 1 receptor,MC1R)基因的核心启动子区,为探究该基因的表达调控机制提供理论依据。【方法】以银黑狐基因组DNA为模板,PCR扩增获得MC1R基因5′-UTR区序列,利用3个在线生物学软件综合预... 【目的】确定银黑狐黑素皮质激素受体1(melanocortin 1 receptor,MC1R)基因的核心启动子区,为探究该基因的表达调控机制提供理论依据。【方法】以银黑狐基因组DNA为模板,PCR扩增获得MC1R基因5′-UTR区序列,利用3个在线生物学软件综合预测MC1R基因启动子活性区;PCR扩增获得该基因5′-UTR区不同长度的缺失片段,并克隆至pMD19-T载体,将重组质粒转染至黑色素B16细胞中,利用双荧光素酶检测技术对10个缺失片段进行荧光素酶活性检测。【结果】成功获得银黑狐MC1R基因5′-UTR区序列,软件预测显示-596/+73 bp可能为启动子活性区。双荧光素酶活性检测发现,构建的10个缺失片段的荧光素酶表达载体均具有启动子活性,其中pGL3-MC1RP8(-520/+73 bp)有较强的活性,提示其为核心启动子区,与软件预测结果基本一致。【结论】试验确定了银黑狐MC1R基因的核心启动子区为―520/+73 bp,为深入研究该基因的毛色调控机制奠定了理论基础。 展开更多
关键词 银黑狐 MC1R基因 启动子 核心区
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MicroRNA-4279通过靶向核心启动子区域上调Notch-1基因表达进而抑制细胞凋亡
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作者 彭高 黄卓琼 +2 位作者 罗海华 刘超 张意军 《中山大学学报(医学科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期641-649,共9页
【目的】寻找与Notch-1基因核心启动子结合的micro RNA(miRNA)并阐明其调控功能,研究免疫细胞肿瘤的发生发展机制。【方法】首先使用生物信息学手段筛选与Notch-1基因核心启动子区域结合的miRNA,进而利用荧光素酶报告系统对其调控作用... 【目的】寻找与Notch-1基因核心启动子结合的micro RNA(miRNA)并阐明其调控功能,研究免疫细胞肿瘤的发生发展机制。【方法】首先使用生物信息学手段筛选与Notch-1基因核心启动子区域结合的miRNA,进而利用荧光素酶报告系统对其调控作用进行实验验证;通过突变核心启动子上的结合位点进一步确定该miRNA特异性靶向基因核心启动子区域。检测转染该miRNA后H9细胞中Notch-1的mRNA与内源蛋白表达水平。另外通过转染该miRNA并用H2O2诱导凋亡,研究该miRNA对H9细胞凋亡的影响。进一步在上述实验条件下,使用siRNA降低靶基因(Notch-1)的表达,然后检测miRNA对H9细胞系的凋亡的影响。【结果】首先通过软件预测,我们发现了miR-4279可以与Notch-1的核心启动子序列结合。荧光素酶报告实验表明miR-4279可以增强Notch-1启动子的转录活性;而在miR-4279的靶位点引入突变后,该增强作用消失。RT-qPCR和Western Blot实验表明miR-4279能够显著增强内源Notch-1 mRNA与蛋白的表达。H2O2诱导凋亡实验表明,miR-4279可以抑制H9细胞的凋亡。siRNA干扰实验表明,当Notch-1通路被抑制后,miR-4279导致的细胞凋亡抑制的效果消失。【结论】miR-4279通过靶向Notch-1基因核心启动子区域,特异性增加Notch-1基因的表达,进而增强H9细胞对H2O2诱导的凋亡的抗性。 展开更多
关键词 miR-4279 核心启动子 Notch-1基因 凋亡 H9细胞系
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奶山羊ATGL基因启动子鉴定与转录活性分析 被引量:1
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作者 李君 闫志浩 +5 位作者 贾万里 许蒙蒙 张景锋 徐秋良 韩浩园 权凯 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2022年第2期223-230,共8页
脂肪甘油三酯水解酶(ATGL)是脂肪水解过程中的主要限速酶,是调控细胞中甘油三酯和脂肪酸之间平衡的关键因子。为了分析奶山羊ATGL基因启动子的结构及转录调控机制,以奶山羊全血DNA为模板,通过PCR技术扩增出ATGL基因5′侧翼序列并进行生... 脂肪甘油三酯水解酶(ATGL)是脂肪水解过程中的主要限速酶,是调控细胞中甘油三酯和脂肪酸之间平衡的关键因子。为了分析奶山羊ATGL基因启动子的结构及转录调控机制,以奶山羊全血DNA为模板,通过PCR技术扩增出ATGL基因5′侧翼序列并进行生物信息学分析;构建了5个不同长度的启动子缺失片段报告基因载体,通过转染奶山羊乳腺上皮细胞并检测其活性,确定其核心区域;分别用PPARG激动剂罗格列酮和SREBP1激动剂T0901317处理细胞,检测其对ATGL启动子活性的影响。结果表明,克隆得到奶山羊ATGL基因5′侧翼序列2721 bp,包含转录起始位点上游2024 bp。经在线软件分析发现,ATGL启动子含有真核生物启动子元件TATA-box和CpG岛;对转录因子结合位点预测发现,其上含有FOXO、SREBF1、PPARG、C/EBPα和E2F1等结合位点。启动子活性分析结果表明,ATGL启动子核心区域位于转录起始位点上游-256—+1位,且在-527—-256位存在负调控元件。用罗格列酮和T0901317处理细胞后发现,二者均能显著上调ATGL启动子活性,且罗格列酮作用的区域为-527—-256位,T0901317在-882—-527位发挥作用,表明PPARG和SREBP1调控ATGL启动子活性。 展开更多
关键词 奶山羊 ATGL 启动子 核心区域 转录活性
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鼻咽癌STGC3基因转录调控元件分析与鉴定 被引量:1
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作者 李素云 吴冬梅 +4 位作者 刘慧晴 唐磊 袁靖哲 尹菊梅 贺修胜 《解剖学杂志》 CAS 2020年第6期487-491,516,共6页
目的:分析并鉴定STGC3基因转录调控元件,探讨鼻咽癌STGC3基因的转录调控分子机制。方法:运用生物信息学,预测并分析STGC3基因核心启动子区的转录因子结合位点;将相关转录因子结合位点,制备3种探针即生物素标记野生型、突变型及未标记野... 目的:分析并鉴定STGC3基因转录调控元件,探讨鼻咽癌STGC3基因的转录调控分子机制。方法:运用生物信息学,预测并分析STGC3基因核心启动子区的转录因子结合位点;将相关转录因子结合位点,制备3种探针即生物素标记野生型、突变型及未标记野生型;提取CNE2细胞核蛋白,利用电泳迁移率变动分析(EMSA)及染色质免疫共沉淀(ChIP)分析,体内外鉴定转录因子结合位点。结果:在STGC3基因核心启动子区存在21个转录因子结合位点,其中9个为Sp1转录因子结合位点;进一步严格限定参数,STGC3基因核心启动子区域含有转录因子结合位点5个,其中Sp1转录因子结合位点2个;EMSA和ChIP实验结果显示,STGC3基因中存在转录因子Sp1特异性结合位点,从而鉴定出STGC3基因转录调控元件。结论:STGC3基因核心启动子区含有Sp1特异性结合位点,为该基因的转录调控元件。 展开更多
关键词 STGC3基因 转录调控元件 核心启动子区
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