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西江野生鲮与养殖群体的遗传分析
被引量:
6
1
作者
张丹丹
郑光明
+3 位作者
朱新平
赵建
陈昆慈
潘德博
《华南农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第3期81-85,共5页
利用部分鲤科鱼类中具多态位点的74对微卫星引物对鲮基因组DNA进行筛选扩增,其中11对引物可稳定扩增且有较高的多态性,占总引物数的14.86%,并利用筛选的引物对西江段3个野生鲮群体(深色群体、浅色群体、西江群体)和1个养殖群体...
利用部分鲤科鱼类中具多态位点的74对微卫星引物对鲮基因组DNA进行筛选扩增,其中11对引物可稳定扩增且有较高的多态性,占总引物数的14.86%,并利用筛选的引物对西江段3个野生鲮群体(深色群体、浅色群体、西江群体)和1个养殖群体进行遗传多样性分析.结果显示:11个引物扩增得到等位基因数为4~23个,大小为100—374bp,平均多态信息含量为0.7498,不同群体的观测杂合度为0.5105~0.6273,期望杂合度为0.7120~0.7656,深色群体、浅色群体、西江群体和养殖群体的Nei氏基因多样度分别为0.7451±0.3884,0.7632±0.3968,0.7081±0.3712,0.7392±0.3852,野生群体与养殖群体相比,杂合度和遗传多样性水平基本一致.运用Genetix软件计算得到4个群体间的基因分化系数为0.0268~0.0703。AMOVA分析表明群体间的变异占总变异的6.96%,群体内个体间的变异占93.04%,固定系数为0.06964,群体间具有一定程度的分化,但分化主要表现在野生群体和养殖群体之间,而野生群体之间的分化不明显.
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关键词
鲮
野生群体
养殖群体
pcr
扩增
微卫星标记
遗传变异
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职称材料
题名
西江野生鲮与养殖群体的遗传分析
被引量:
6
1
作者
张丹丹
郑光明
朱新平
赵建
陈昆慈
潘德博
机构
中国水产科学研究院珠江水产研究所
上海海洋大学水产与生命学院
出处
《华南农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第3期81-85,共5页
基金
国家自然科学基金(30271022)
国家重点基础研究发展计划项目(2004CB117401)
+2 种基金
广东省科技计划项目(2005B20301007
2005A20105001)
国家科技基础条件平台建设项目(2006DKA30470-008)
文摘
利用部分鲤科鱼类中具多态位点的74对微卫星引物对鲮基因组DNA进行筛选扩增,其中11对引物可稳定扩增且有较高的多态性,占总引物数的14.86%,并利用筛选的引物对西江段3个野生鲮群体(深色群体、浅色群体、西江群体)和1个养殖群体进行遗传多样性分析.结果显示:11个引物扩增得到等位基因数为4~23个,大小为100—374bp,平均多态信息含量为0.7498,不同群体的观测杂合度为0.5105~0.6273,期望杂合度为0.7120~0.7656,深色群体、浅色群体、西江群体和养殖群体的Nei氏基因多样度分别为0.7451±0.3884,0.7632±0.3968,0.7081±0.3712,0.7392±0.3852,野生群体与养殖群体相比,杂合度和遗传多样性水平基本一致.运用Genetix软件计算得到4个群体间的基因分化系数为0.0268~0.0703。AMOVA分析表明群体间的变异占总变异的6.96%,群体内个体间的变异占93.04%,固定系数为0.06964,群体间具有一定程度的分化,但分化主要表现在野生群体和养殖群体之间,而野生群体之间的分化不明显.
关键词
鲮
野生群体
养殖群体
pcr
扩增
微卫星标记
遗传变异
Keywords
Cirrhina molitorella
wild population
cultured population
pcr amplificatioin
microsatellite marker
genetic variation
分类号
Q959.468 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
西江野生鲮与养殖群体的遗传分析
张丹丹
郑光明
朱新平
赵建
陈昆慈
潘德博
《华南农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
6
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