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Genotyping of human platelet antigen (HPA) system 5 of Chinese Han population in Shanghai by PCR restriction fragment length polymorphism(PCRRFLP)
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《中国输血杂志》 CAS CSCD 2001年第S1期376-,共1页
关键词 pcrrflp length Genotyping of human platelet antigen system 5 of Chinese Han population in Shanghai by pcr restriction fragment length polymorphism HPA
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PCR-RFLP鉴定隐孢子虫种类研究 被引量:23
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作者 张龙现 蒋金书 +3 位作者 刘群 宁长申 赵金凤 刘红英 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期555-559,共5页
为快速、准确鉴别人畜隐孢子虫种类,建立了巢式PCR扩增隐孢子虫18SrRNA基因的特殊区域,扩增片段测序结果表明:安徽牛源分离株(Cryptosporidiummuris)781bp;北京鸡源分离株(C.baileyi)776bp;北京牛源分离株(C.muris)781bp;河南牛源分离株... 为快速、准确鉴别人畜隐孢子虫种类,建立了巢式PCR扩增隐孢子虫18SrRNA基因的特殊区域,扩增片段测序结果表明:安徽牛源分离株(Cryptosporidiummuris)781bp;北京鸡源分离株(C.baileyi)776bp;北京牛源分离株(C.muris)781bp;河南牛源分离株(C.muris)725bp;长春牛源分离株(C.muris)776bp;宁夏鸡源分离株(C.baileyi)725bp,该片段位于18SrRNA全序列271~1103bp之间。使用Ssp 限制性内切酶消化发现C.muris产生418~420bp和305~363bp两个片段,C.baileyi产生544~545bp和185~231bp两个片段。所检测的6个分离株可以显著区分为C.muris和C.baileyi两个种,所建立的PCR-RFLP可以有效鉴别隐孢子虫种类。 展开更多
关键词 隐孢子虫 种类鉴定 pcr-rflp 人兽共患病
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猪品种间ESR基因PCR-RFLP的初步研究 被引量:26
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作者 李凤娥 熊远著 +2 位作者 邓昌彦 郑嵘 屈彦纯 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第1期37-39,共3页
利用聚合酶链反应 (PCR)技术 ,检测了不同猪品种的ESR基因PvuⅡ RFLP。结果表明 :品种间基因频率差异极显著 (P <0 .0 1 )。并试分析了PvuⅡ
关键词 聚合酶链反应-限制性片段长度多态性 雌激素受体(ESR)基因 产仔数
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中国脊髓灰质炎Ⅰ型野毒株的PCR-RFLP法分析 被引量:9
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作者 张礼壁 李杰 +5 位作者 原稔 郑红 侯晓辉 陆群 方勇 吉仓广 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 1994年第2期145-153,共9页
近年来我国流行地区分离的脊髓灰质炎病毒多为Ⅰ型野毒。本文报导对我国一些省、自治区防疫站从急性驰缓性麻痹病人粪便中分离的77株Ⅰ型野毒株,经PCR-RFLP法分析结果,发现不同地区分离的野毒株在电泳图像上有明显差异。根... 近年来我国流行地区分离的脊髓灰质炎病毒多为Ⅰ型野毒。本文报导对我国一些省、自治区防疫站从急性驰缓性麻痹病人粪便中分离的77株Ⅰ型野毒株,经PCR-RFLP法分析结果,发现不同地区分离的野毒株在电泳图像上有明显差异。根据电泳图像所显示的三种酶切条带的数目,可分为14个类型,而且同一省、自治区内不同地区(如新疆),或同一地区不同年份(如广东)的毒株也存在着明显差异。但在某些相邻省份如广东省与海南省,92年流行毒株电泳图像完全一致。说明本法虽不如核酸序列分析精确,但在一定程度上也能反映毒株间的差异,有助于说明流行株的亲疏关系,可用于研究毒株的分子流行病学。 展开更多
关键词 脊髓灰质炎 病毒 I型毒株 rflp
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三大不同品种马mtDNA Cytb基因PCR-RFLP分析 被引量:16
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作者 李金莲 石有斐 +1 位作者 布仁其其格 芒来 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第8期933-938,共6页
用BamHⅠ、TaqⅠ、HaeⅢ、RsaⅠ和HincⅡ5种限制性内切酶通过PCR-RFLP技术检测了包括引入品种、培育品种和地方品种的6个类型(纯血马、三河马、乌珠穆沁马、锡尼河马、乌审马和矮马)共256匹马的mtDNACytb基因部分序列多态性。用8%非变... 用BamHⅠ、TaqⅠ、HaeⅢ、RsaⅠ和HincⅡ5种限制性内切酶通过PCR-RFLP技术检测了包括引入品种、培育品种和地方品种的6个类型(纯血马、三河马、乌珠穆沁马、锡尼河马、乌审马和矮马)共256匹马的mtDNACytb基因部分序列多态性。用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳将酶切产物分离,并用银染法显色。结果BamHⅠ和TaqⅠ表现出多态,5种酶共检测到7种态型,归纳为3种单倍型,以单倍型Ⅰ和Ⅲ为主体单倍型,但通过一个特殊的酶型BamHⅠ-B分析推测所研究的马可能起源于一个母系祖先。 展开更多
关键词 限制性内切酶 pcr-rflp 马mtDNA CYTB基因 多态性
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应用PCR-RFLP和芯片生物分析系统鉴别河豚鱼品种 被引量:8
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作者 陈双雅 陈文炳 +3 位作者 张津 陈伟玲 徐敦明 周昱 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2012年第22期200-202,共3页
应用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态分析和芯片生物分析系统建立5种河豚的分子生物学品种鉴定新方法。首先提取鱼的DNA进行细胞色素b基因的PCR扩增,然后用DdeⅠ、HaeⅢ和NlaⅢ三种限制性内切酶进行酶切,在Agilent DNA1000芯片上对... 应用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态分析和芯片生物分析系统建立5种河豚的分子生物学品种鉴定新方法。首先提取鱼的DNA进行细胞色素b基因的PCR扩增,然后用DdeⅠ、HaeⅢ和NlaⅢ三种限制性内切酶进行酶切,在Agilent DNA1000芯片上对酶切片段进行分离。该方法可成功区分5个河豚鱼品种,是一种快速、简便、有效的鱼类品种鉴定分析手段。 展开更多
关键词 河豚 pcr-rflp 芯片生物分析系统 品种鉴定
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RT-PCR检测健康猪扁桃体和流产死胎猪瘟病毒的应用及RFLP分析 被引量:14
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作者 罗廷荣 孙敬锋 +6 位作者 莫扬 刘芳 黄伟坚 陆芹章 温荣辉 秦爱珍 余克伦 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期192-195,共4页
本研究用反转录_聚合酶链反应(RT_PCR)技术对广西部分猪场的健康猪扁桃体材料以及流产胎儿和死胎中的猪瘟病毒(HCV)进行检测。70份健康猪扁桃体材料中阳性11份,阳性率达15 7%;52份流产胎儿及死胎材料中检出阳性9份,阳性率达17 3%。表... 本研究用反转录_聚合酶链反应(RT_PCR)技术对广西部分猪场的健康猪扁桃体材料以及流产胎儿和死胎中的猪瘟病毒(HCV)进行检测。70份健康猪扁桃体材料中阳性11份,阳性率达15 7%;52份流产胎儿及死胎材料中检出阳性9份,阳性率达17 3%。表明广西猪场中有比较严重的健康带毒情况。用限制性片段长度多态性分析法(RFLP)对25份阳性材料、HCLV和石门毒的引物A1/A2的PCR产物进行分析,发现HCLV、石门强毒和广西流行野毒的RT_PCR扩增产物中均有RsaⅠ的一个识别序列,但HCLV上的识别序列所在位置不同。本研究表明,用引物A1/A2作RT_PCR检测,并结合RFLP分析技术可把兔化弱毒和流行野毒区分开来,这将对预防猪瘟起到十分重要的作用。 展开更多
关键词 猪瘟病毒 反转录-聚合酶链式反应 限制性片段长度多态性分析法
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PCR-TRFLP研究托盘包装冷却猪肉冷藏过程中的菌相变化 被引量:5
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作者 江芸 高峰 +2 位作者 徐幸莲 叶可萍 周光宏 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期565-572,共8页
应用PCR-末端限制性片段长度多态性分析(PCR-TRFLP),结合16S rRNA基因克隆文库和序列分析,研究托盘包装冷却猪肉在4℃贮藏过程中的菌相变化.结果表明:在整个贮藏过程的肉样TRFLP图谱中共产生35种谱带,表明冷却肉中微生物组成十分复杂;... 应用PCR-末端限制性片段长度多态性分析(PCR-TRFLP),结合16S rRNA基因克隆文库和序列分析,研究托盘包装冷却猪肉在4℃贮藏过程中的菌相变化.结果表明:在整个贮藏过程的肉样TRFLP图谱中共产生35种谱带,表明冷却肉中微生物组成十分复杂;对应于假单胞菌(Pseudomonas)的谱带峰在贮藏过程中变化明显,其相对峰面积由0 d的5.7%至贮藏末期达到83.4%,表明贮藏末期主要优势腐败菌为假单胞菌. 展开更多
关键词 冷却猪肉 托盘包装 菌相组成 pcr-末端限制性片段长度多态性分析
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PCR-RFLP检测载脂蛋白CⅢ基因T-455C多态性方法的建立及应用 被引量:5
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作者 俞娟 王惠民 +3 位作者 张志泉 陈连英 周锦红 于婷 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期276-279,共4页
目的建立聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术(PCR-RFLP)检测载脂蛋白CⅢ(apoCⅢ)T-455C多态性的方法,探讨南通汉族人群中apoCⅢ多态性与高三酰甘油血症(HTG)的相关性。方法用PCR扩增apoCⅢ基因启动子区包含T-455C多态性在内的DNA片... 目的建立聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术(PCR-RFLP)检测载脂蛋白CⅢ(apoCⅢ)T-455C多态性的方法,探讨南通汉族人群中apoCⅢ多态性与高三酰甘油血症(HTG)的相关性。方法用PCR扩增apoCⅢ基因启动子区包含T-455C多态性在内的DNA片段,扩增产物用限制性内切酶BseGⅠ酶切后电泳,分析apoCⅢ基因型,同时采用生化方法检测研究对象的血脂和载脂蛋白水平。结果检测到3种基因型,分别为-455TT、-455TC和-455CC。HTG患者组和健康对照组apoCⅢ-455C等位基因频率(50.44%比33.11%)和apoCⅢ-455CC基因型频率(26.55%比12.16%)均有显著差异(P<0.01);C等位基因携带者患HTG的风险是非携带者的2.06倍(95%CI:1.31~3.24);-455C等位基因携带者有较高的三酰甘油(TG)和apoCⅢ蛋白水平(P<0.05)。结论PCR-RFLP是一种快速、敏感的分析apoCⅢ基因启动子区T-455C多态性的方法;apoCⅢ-455C等位基因与HTG的发生相关。 展开更多
关键词 载脂蛋白CⅢ 多态性 聚合酶链反应-限制性片段长度多态性 高三酰甘油血症
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PCR-RFLP法检测亚甲基四氢叶酸还原酶基因C677T突变 被引量:2
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作者 刘建伟 吴多斌 +2 位作者 叶玲 王磊 王鲁宁 《中国老年学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期210-212,共3页
目的 建立一种简便、实用的检测亚甲基四氢叶酸还原酶 (MTHFR)等位基因 C677T点突变的方法 ,并初步观察部分健康老人和老年血管性痴呆 (VD)患者中 MTHFR等位基因 C677T点突变情况。方法  PCR特异性扩增 MTHFR基因序列 ,扩增产物用限... 目的 建立一种简便、实用的检测亚甲基四氢叶酸还原酶 (MTHFR)等位基因 C677T点突变的方法 ,并初步观察部分健康老人和老年血管性痴呆 (VD)患者中 MTHFR等位基因 C677T点突变情况。方法  PCR特异性扩增 MTHFR基因序列 ,扩增产物用限制性内切酶 Hinf 酶切 ,经聚丙烯酰胺凝胶电泳 (PAGE)分离、溴化乙锭染色后 ,观察酶切位点的限制性片段长度多态性 (RFLP)图谱。共检测标本 1 67例 ,其中健康老人(≥ 65岁 ) 1 38例、老年 VD 2 9例 ,并计算了各基因型频率和等位基因频率。结果 健康老人组和老年 VD患者组均检测到 C等位基因野生型 (CC)、杂合子 (CT)和 T等位基因纯合子 (TT)基因型 ,各组 MTHFR基因的 C677T点突变中 T突变位点的频率分别为 43.8%、51 .7%。结论 该方法简便、实用 ,适于一般实验室应用及流行病学调查。 展开更多
关键词 pcrrflp 检测 亚甲基四氢叶酸还原酶基因 老年血管性痴呆 VD 聚丙烯酞胺凝胶电泳 溴化乙锭染色 聚合酶链反应 限制性片段长度多态性
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区别鹅细小病毒和番鸭细小病毒的PCR-RFLP方法的建立 被引量:6
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作者 万春和 潘异哲 +4 位作者 陈红梅 施少华 傅光华 程龙飞 黄瑜 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第9期56-59,共4页
根据GenBank登录的鹅细小病毒(GPV)和番鸭细小病毒(MDPV)非结构蛋白(NS)基因特征,本研究设计1对特异性引物对GPV和MDPV基因组DNA进行PCR扩增,目的片段大小均为810bp,并对PCR产物进行切胶回收。用EcoRⅠ酶对GPV和MDPV特异性胶回收产物进... 根据GenBank登录的鹅细小病毒(GPV)和番鸭细小病毒(MDPV)非结构蛋白(NS)基因特征,本研究设计1对特异性引物对GPV和MDPV基因组DNA进行PCR扩增,目的片段大小均为810bp,并对PCR产物进行切胶回收。用EcoRⅠ酶对GPV和MDPV特异性胶回收产物进行酶切鉴定,结果显示MDPV经EcoRⅠ酶切后琼脂糖凝胶电泳检测片段为2段,大小为530和280bp;而GPV经EcoRⅠ酶切后琼脂糖凝胶电泳检测片段大小不变。本研究建立了一种快速区别GPV和MDPV感染的检测方法,可对番鸭感染水禽细小病毒的情况进行快速鉴别诊断。 展开更多
关键词 鹅细小病毒 番鸭细小病毒 EcoRⅠ限制性内切酶 聚合酶链式反应—限制性片段长度多态性
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PCR-RFLP鉴别念珠菌、曲霉和隐球菌的探讨 被引量:3
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作者 秦振宇 吴绍熙 +3 位作者 吕桂霞 Roy L.Hopfer 张宏 郭宁如 《临床皮肤科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2000年第2期76-78,共3页
为快速鉴别 3类医学上重要真菌———念珠菌、曲霉和隐球菌 ,应用聚合酶链反应 限制性片段长度多态(PCR RFLP)的分子生物学方法对白念珠菌、克柔念珠菌、季也蒙念珠菌、近平滑念珠菌、热带念珠菌、乳酒念珠菌、新生隐球菌格梯变种、新... 为快速鉴别 3类医学上重要真菌———念珠菌、曲霉和隐球菌 ,应用聚合酶链反应 限制性片段长度多态(PCR RFLP)的分子生物学方法对白念珠菌、克柔念珠菌、季也蒙念珠菌、近平滑念珠菌、热带念珠菌、乳酒念珠菌、新生隐球菌格梯变种、新生隐球菌新生变种、罗伦隐球菌、烟曲霉、黄曲霉和杂色曲霉进行体外研究。经PCR念珠菌、曲霉和隐球菌均扩增出 3 10bp的DNA片段 ,再行限制性内切酶HaeIII消化后分别呈现 2条、4条和 3条片段。本实验建立的PCR RFLP技术鉴别念珠菌、曲霉和隐球菌感染 ,具有快速和特异的特点 ,是对PCR诊断的重要补充 ,有潜在的临床应用价值。 展开更多
关键词 念珠菌 曲霉隐球菌 鉴别诊断 pcr-rflp
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PCR-RFLP在细粒棘球绦虫种株鉴定中的应用 被引量:9
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作者 马秀敏 吾拉木.马木提 +5 位作者 丁剑冰 林仁勇 张亚楼 刘素辉 伊藤亮 温浩 《中国病原生物学杂志》 CSCD 2008年第4期281-283,287,共4页
目的根据细粒棘球绦虫线粒体DNA rrnL区段基因特征,建立一种新的细粒棘球绦虫种株(基因型)鉴定技术。方法应用PCR-RFLP方法,对新疆不同地区44个囊型包虫病(CE)病人分离株标本提取DNA,用特异性引物对mtDNA rrnL基因片段进行PCR扩增,将扩... 目的根据细粒棘球绦虫线粒体DNA rrnL区段基因特征,建立一种新的细粒棘球绦虫种株(基因型)鉴定技术。方法应用PCR-RFLP方法,对新疆不同地区44个囊型包虫病(CE)病人分离株标本提取DNA,用特异性引物对mtDNA rrnL基因片段进行PCR扩增,将扩增产物用限制性内切酶SspI和Bg1Ⅱ消化,再用琼脂糖凝胶电泳分析片段大小,进行基因型鉴别。结果CE病人分离株PCR扩增产物均不能被限制性内切酶SspI酶切,为细粒棘球绦虫;其中43个病人分离株的PCR扩增产物不能被限制性内切酶Bg1Ⅱ酶切,为细粒棘球绦虫G1基因型;1个病人分离株的PCR扩增产物被Bg1Ⅱ切成158 bp和403 bp 2条DNA片段,为细粒棘球绦虫G6基因型。结论根据细粒棘球绦虫线粒体DNA rrnL区段基因特征建立的PCR-RFLP技术可用于细粒棘球绦虫的基因型鉴别。 展开更多
关键词 新疆 细粒棘球绦虫 基因型 聚合酶链式反应连接的限制性片段长度多态性(pcr-rflp)
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应用RTPCR和RFLP分析肾型鸡传染性支气管炎病毒基因型 被引量:7
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作者 何永强 周继勇 +1 位作者 于涟 杜青云 《浙江农业学报》 CSCD 2000年第3期117-120,共4页
对来自浙江省 3个不同地区的肾型鸡传染性支气管炎病毒 (IBV JD ,DQ ,HY)和参考株H12 0 ,通过蛋白酶K SDS处理、酚 氯仿法抽提基因组RNA ,经RT PCR扩增得到了预期为 1.72kb的S1蛋白基因cDNA ,用限制性内切酶HaeIII,PstI,Ksp632I对S1基... 对来自浙江省 3个不同地区的肾型鸡传染性支气管炎病毒 (IBV JD ,DQ ,HY)和参考株H12 0 ,通过蛋白酶K SDS处理、酚 氯仿法抽提基因组RNA ,经RT PCR扩增得到了预期为 1.72kb的S1蛋白基因cDNA ,用限制性内切酶HaeIII,PstI,Ksp632I对S1基因cDNA进行RFLP分析。结果表明JD ,DQ ,HY毒株的RFLP带型相同 ,但与经典的肾型IBV代表株 (即T株、Gray株、Holte株 )以及呼吸型H12 0 均不相同 ,与国内已报道的肾型DL毒株也不同 ,表明浙江省流行的肾型IBV很可能是新的变异株。 展开更多
关键词 RT-pcr rflp 肾型鸡传染性支气管炎病毒 基因型
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应用PCR-RFLP分析鉴别广西鸡毒霉形体 被引量:2
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作者 邓显文 谢芝勋 +4 位作者 谢志勤 唐小飞 刘加波 廖敏 庞耀珊 《中国兽医科技》 CSCD 北大核心 2004年第3期41-44,共4页
针对鸡毒霉形体 (MG) 16S和 2 3SrRNA基因间的高变区序列设计合成了 1对引物 ,对MG菌株进行了PCR扩增 ,获得了 1条 899bp的DNA片段 ,而其他禽病病原DNA无扩增。扩增产物经用限制性内切酶AfaⅠ和DraⅠ进行酶切片段长度多态性分析 ,表明... 针对鸡毒霉形体 (MG) 16S和 2 3SrRNA基因间的高变区序列设计合成了 1对引物 ,对MG菌株进行了PCR扩增 ,获得了 1条 899bp的DNA片段 ,而其他禽病病原DNA无扩增。扩增产物经用限制性内切酶AfaⅠ和DraⅠ进行酶切片段长度多态性分析 ,表明各MG菌株酶切图谱间均存在差异。 展开更多
关键词 鸡毒霉形体 pcr 限制性片段长度多态性 广西
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多重PCR-RFLP检测XRCC1基因两位点多态性 被引量:4
16
作者 王威 金如锋 +1 位作者 吴芬 夏昭林 《中国工业医学杂志》 CAS 北大核心 2008年第1期3-6,共4页
目的探讨多重聚合酶链反应-限制性片断长度多态性(多重PCR-RFLP)技术在单核苷酸多态性检测中的应用。方法应用多重聚合酶链反应(Multiplex)(多重PCR)原理设计人类X射线交错互补修复基因1(XRCC1基因)194、399位点引物,通过PCR-RFLP技术判... 目的探讨多重聚合酶链反应-限制性片断长度多态性(多重PCR-RFLP)技术在单核苷酸多态性检测中的应用。方法应用多重聚合酶链反应(Multiplex)(多重PCR)原理设计人类X射线交错互补修复基因1(XRCC1基因)194、399位点引物,通过PCR-RFLP技术判断XRCC1基因2个SNP位点多态性。结果设计的两对引物可同时PCR扩增分别含2个多态位点的DNA片段,MspI限制性内切酶酶切可判断2位点多态性,PCR和酶切效果均较好。结论多重PCR-RFLP技术可应用于单核苷酸多态位点的检测,并节省时间和费用,提高检测效率。 展开更多
关键词 多重pcr pcr-rflp 单核苷酸多态性 XRCC1 引物设计
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我国4种白蛉的核糖体内转录间隔2区PCR-RFLP多态性分析 被引量:4
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作者 顾灯安 张仪 兰勤娴 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期100-101,108,共3页
采用PCR-RFLP方法对我国内脏利什曼病传播媒介中华白蛉(Phlebotomus chinensis)、吴氏白蛉(Ph.wui)、长管白蛉(Ph.longiductus)和亚历山大白蛉(Ph.alexandri)等4种白蛉的核糖体内转录间隔2区(ITS2)进行分型。PCR-RFLP结果显示,以限制性... 采用PCR-RFLP方法对我国内脏利什曼病传播媒介中华白蛉(Phlebotomus chinensis)、吴氏白蛉(Ph.wui)、长管白蛉(Ph.longiductus)和亚历山大白蛉(Ph.alexandri)等4种白蛉的核糖体内转录间隔2区(ITS2)进行分型。PCR-RFLP结果显示,以限制性内切酶DraⅠ酶切ITS2片段,可分出4种RFLP带型,即A为450 bp,B为154 bp/127 bp/93 bp/66 bp/10 bp,C为311 bp/80 bp/60 bp,D为353 bp/300 bp/160 bp/58 bp。结果显示,4种白蛉均只有1种RFLP带型,中华白蛉为AA型,亚历山大白蛉为BB型,吴氏白蛉为CC型,长管白蛉为DD型。利用PCR-RFLP方法可区分我国4种内脏利什曼病传播媒介的种类。 展开更多
关键词 白蛉 内转录间隔2区(ITS2) 限制性片段长度多态性(rflp)
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PCR-RFLP鉴定我国黑热病流行区6种常见蛉种 被引量:1
18
作者 周正斌 张仪 +4 位作者 朱淮民 施文琦 金长发 危芙蓉 兰勤娴 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期448-452,共5页
目的建立鉴定我国黑热病流行区6种常见蛉种的PCR-RFLP(PCR-restriction fragment length polymorphisms)方法。方法使用一对通用引物扩增线粒体COI基因,比较中华白蛉、长管白蛉、吴氏白蛉、亚历山大白蛉和歌乐山司蛉线粒体COI基因序列,... 目的建立鉴定我国黑热病流行区6种常见蛉种的PCR-RFLP(PCR-restriction fragment length polymorphisms)方法。方法使用一对通用引物扩增线粒体COI基因,比较中华白蛉、长管白蛉、吴氏白蛉、亚历山大白蛉和歌乐山司蛉线粒体COI基因序列,寻找合适的限制性内切酶酶切位点,使用TaqI、PstI内切酶双酶切,通过电泳片段大小鉴别上述6种蛉种。结果长管白蛉、中华白蛉、吴氏白蛉、亚历山大白蛉、歌乐山司蛉和鳞喙司蛉酶切片段呈现长度不同的种特异条带,可以将上述我国常见的6种蛉种区分开来。结论基于COI基因序列差异建立的PCR-RFLP方法简便易行可靠,具有较高的灵敏度和特异性,可用于我国黑热病流行区6种常见蛉种的分类鉴定。 展开更多
关键词 pcr-rflp 白蛉 黑热病 媒介
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茶树叶绿体DNA的PCR-RFLP反应体系优化 被引量:1
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作者 陈盛相 齐桂年 李欢 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第6期73-76,共4页
通过正交设计对影响茶树聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)反应体系的主要因素进行优化,快速确立适合茶树叶绿体DNA PCR-RFLP分析的扩增体系和酶切体系。结果表明:最佳PCR扩增体系为100ng模板DNA、200μmol/L dNTPs、1.5mmol... 通过正交设计对影响茶树聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)反应体系的主要因素进行优化,快速确立适合茶树叶绿体DNA PCR-RFLP分析的扩增体系和酶切体系。结果表明:最佳PCR扩增体系为100ng模板DNA、200μmol/L dNTPs、1.5mmol/L MgCl2、50ng叶绿体引物、3U TaqDNA聚合酶、加ddH2O至25μL;最佳酶切体系为6μL扩增产物用量、2U限制性内切酶量、1×限制性内切酶buffer、加ddH2O至15μL,37℃酶切6h。利用优化的反应体系,对30个茶树品种叶绿体DNA进行PCR-RFLP扩增,可获得清晰扩增图谱和多态性酶切图谱。 展开更多
关键词 茶树 叶绿体DNA pcrrflp 优化
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松江湿地沉积物细菌T-RFLP分析中PCR体系的建立与优化 被引量:1
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作者 李莹 臧淑英 +1 位作者 马大龙 鄂立思 《生命科学研究》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期327-331,共5页
细菌是微生物的重要组成部分,其对保持湿地生态系统平衡起着重要作用,在沉积物细菌T-RFLP(terminal restriction fragment length polymorphism)分析中建立与优化PCR体系对进一步研究沉积物细菌群落组成具有重要意义。此次研究以松江湿... 细菌是微生物的重要组成部分,其对保持湿地生态系统平衡起着重要作用,在沉积物细菌T-RFLP(terminal restriction fragment length polymorphism)分析中建立与优化PCR体系对进一步研究沉积物细菌群落组成具有重要意义。此次研究以松江湿地沉积物细菌基因组DNA为模板,采用正交和单因素试验对PCR体系中各因素(模板DNA、Mg2+、dNTPs、引物、Taq酶)进行优化,系统分析各因素对PCR扩增结果的影响,建立最佳PCR反应体系。在20μL反应体系中,DNA模板30 ng、Mg2+2.0 mmol/L、dNTPs 0.2 mmol/L、引物0.2μmol/L、Taq酶0.5 U。该优化体系确保了沉积物细菌T-RFLP分析过程中PCR产物的质量与效果。 展开更多
关键词 细菌 体系优化 末端限制性片段长度多态性(T-rflp)分析 pcr体系
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