PCR-STR用于异基因造血干细胞移植后的骨髓和外周血嵌合状态的监测及作用

目的用PCR-STR检测观察比较异基因造血干细胞移植术后,骨髓和外周血嵌合状态和植入状态。方法提取17例异基因造血干细胞移植术中的供者外周血及受者移植前后各阶段外周血和骨髓的DNA,PCR PCR-STR检测扩增15个基因位点,和1个性别位点AMEL。用遗传分析仪进行毛细管电泳,确定基因位点,根据基因型的差异选择嵌合率计算公式,分析植入情况和嵌合状态。结果12名患者完全植入,骨髓和外周血的PCR-STR结果一致;1名患者骨髓PCR-STR显示为持续未植入,外周血PCR-STR显示为短期混合植入;4名患者骨髓和外周血PCR-STR显示嵌合状态时间不一致,骨髓PCR-STR显示嵌合状态时间明显早于外周血(P<0.05)。结论PCR-STR是分析异基因造血干细胞移植后供体是否植入的灵敏、准确度高的方法,骨髓嵌合状态的变化的出现早于外周血,混合嵌合状态对白血病复发有预警作用,骨髓嵌合状态的早期变化对实施临床干预治疗尤为重要。

两个体混合样本比例的PCR-STR检测研究

目的探讨PCR-STR检测两个体混合样本比例的灵敏度。方法按不同比例将两个体全血、单个核细胞及纯DNA 3种不同的样本进行混合,应用AB I公司生产的profile p lus商品化试剂盒多重PCR扩增后,用AB I3100基因分析仪进行毛细管电泳,检测基因座及其峰面积,并就混合样本中两单个核细胞样本DNA含量百分比与扩增前混合样本比例的关系进行相关分析。结果当样本混合比例为4%+96%时,可明确区分混合样本中两个体的基因型,且扩增前混合细胞百分率与扩增后两者峰面积比值呈直线相关。结论PCR-STR检测两个体混合样本比例的灵敏度有一定范围,并可进行半定量。

两组引物对无毛囊毛根的PCR-STR分型

目的了解无毛囊毛根的短扩增子引物和通用引物PCR-STR分型在法医实践中应用的可行性。方法应用5对Bulter设计的短扩增子引物D8S1179、D21S11、THO1、D16S539和VWA与其对应的STR通用引物,利用非变性PAGE,对无毛囊毛根进行PCR-STR分型的对比研究。结果短扩增子引物与通用引物对无毛囊毛根分型的正确率:D8S1179为11.4%和17.1%、D21S11为3.7%和5.9%、vWA为22.2%和33.3%、THO1为9.3%和5.6%、D16S539为0和9.2%。毛根的短扩增子引物和通用引物部分STR分型出现了干扰结果的Ladder-like背景条带。结论在对无毛囊毛根检材进行通用引物和短扩增子引物PCR-STR分型时,五个STR位点分型检测的成功率有限,还需注意Ladder-like条带的干扰。

福尔马林固定石蜡包埋组织的PCR-STR分型

分析福尔马林固定石蜡包埋组织的DNA多态性,对某些医疗纠纷或陈年旧案的解决或侦破具有重要作用.本文作者用Promega公司提供的GeneprintSTR system复合扩增试剂盒,检测了1～20年的福尔马林固定石蜡包埋的同一个体不同组织块的DNA,取得满意的效果,现报道如下.

PCR-STR分型在刑事案件中的应用

应用PCR技术对多态DNA位点分型,使犯罪现场生物物证的个人识别鉴定取得了长足的进展,检测灵敏度明显提高,检验结论从否定到肯定.以往报告多为PCR-VNTR.PCR-ASO技术的应用.近几年PCR-STR分型成为法医学应用研究的热点.本文收集实际鉴定案件,着重对PCR-STR技术在刑事案件中的应用范围、热点及前景进行了讨论,现报告如下:1.材料我室自1995年4月至1997年12月受理的PCR检验案件中的7例典型案例,检材为血液(痕).混合斑、组织块等.

从指甲中提取DNA进行PCR-STR初步研究

本文成功的提取了指甲中的细胞核DNA,并进行多个PCR-STR位点扩增,具有实际应用价值.

PCR-STR分型技术的研究发展

本文系统的介绍了 PCR- STR分型技术的诞生、发展及其应用 ,并阐述了研究制备 STR等位基因阶梯的重要性及研究现状。

PCR-STR分型技术用于亲权鉴定疑难案1例调查

目的:对一例经血清学检测难以判断亲子关系的案例应用STR位点多态性进行亲权鉴定。方法:从冻存的当事人的样本中提取基因组DNA,体外扩增D19S253等13个STR位点DNA片段,扩增产物用聚丙烯酰胺凝胶电泳进行分离,银染显带。根据各STR位点基因型的检测结果判定亲子关系。结果:受检男孩在D1S1656、D8S1132、D8S1179、D21S11、FGA等5个位点与可疑父不符合遗传学规律,以及在D1S1656、D3S1358、D8S1132、D8S1179、vWA等5个位点与“亲生母亲”不符合遗传学规律,进而排除亲权关系。结论:STR位点具有高度的遗传多态性,聚合酶链反应检测STR位点基因型能够有效地开展亲权鉴定。

PCR-STR分型技术在尿样DNA分型中的应用

目的 对尿样的DNA分型进行研究。 方法 10份尿样随机收集于无关个体 ,同时采集血液样本做DNA分型对照 ,用PCR -STR分型技术对尿样DNA进行FIBRA和D18S5 35基因座分型。 结果 10份尿样 10ml、1ml及 0 .2ml体积均获得准确的分型结果 ,且与同一个体的血样DNA分型结果完全相同 ;室温储存 4天及 4℃保存 4周的尿样均分型成功。 结论PCR -STR分型技术对尿样DNA分型是一种有效的方法 ,在尿样的个人识别中具有极高的实用价值。

基于染色体短串联重复序列的荧光定量PCR技术在产前诊断中的实际应用

目的本研究旨在探讨基于染色体短串联重复序列(short tandem repeat,STR)的荧光定量PCR(quantitative fluorescence PCR,QF-PCR)在产前诊断中的应用潜力及其价值。方法通过基于STR的QF-PCR技术结合染色体核型分析技术和染色体微阵列分析技术(chromosomal microarray analysis,CMA),我们对635例产前筛查异常的羊水样本进行了筛查,从而有效地排除了母源细胞污染(maternal cell contamination,MCC)(>20%),为后续的产前检测提供了可靠的依据。此外,为了快速诊断胎儿及其相应的孕妇样本,我们检测了包括13、18、21、X、Y在内的五条染色体,并将其与核型分析的结果进行比较。结果通过QF-PCR检测,在635例样本中,发现了3例母源污染,1例三倍体,1例与母亲的亲缘关系不符,12例21三体,6例18三体,1例13三体。除此之外,还有10例性染色体异常和1例21三体嵌合。与CMA结果比较,QF-PCR检测结果均符合试剂盒的检测范围。值得一提的是,QF-PCR检测还额外的发现了5例母亲的性染色体异常,同时若在试剂盒检测范围内发现了三体还可以结合亲本的STR分型结果分析额外染色体的亲本来源并且推测异常染色体减数分裂不分离发生时期。结论基于STR位点的QF-PCR技术是一种快速检测方法,不仅适用于非整倍体倍型的检测,还可用于母源细胞污染检测、亲缘溯源检测以及染色体嵌合体的检测,同时还可以检测染色体三体的亲本来源。QF-PCR技术在产前诊断中具有广泛的应用前景,可以为医生和家庭提供更准确、更可靠的诊断结果。

广西仫佬族9个STR的遗传多态性研究

本文采用PCR-STR及基因分型技术,研究广西仫佬族183例无关个体9个STR位点的遗传多态性分布,建立仫佬族群体的遗传学数据库.经统计分析,在9个STR位点共检出70种等位基因,其频率分布在0.0027～0.5301之间;207种基因型,其频率分布在0.0055～0.338 8之间;平均杂合度为0.7298,平均多态信息总量为0.7016,累积个体识别力达0.999999999,累积非父排除率达0.999098.与不同民族比较结果显示:广西仫佬族与广西苗、回族及云南、北方各民族之间绝大多数基因座存在显著差异,而与广西壮族和湖南汉族之间绝大多数基因座均无差异.以上数据可为群体遗传学、法医学及人类学等研究提供重要的资料.

PowerPlex^(TM) 16体系在中国人群中罕见等位基因及其类型

目的 分析PowerPlexTM 16体系基因座在中国人群中的罕见等位基因及其类型。方法 应用PCR-STR和DNA序列分析技术,对4650个无关个体在15个STR基因座中的罕见等位基因进行检测。结果 在PowerPlexTM16体系中的D7S820、D16S539、Penta E基因座,检测到2种类型的罕见等位基因,而TH01、D21S11、D5S818、D13S317、Penta D、D8S1179、TPOX、FGA基因座检测出1种类型。其等位基因频率均较低(0.215‰-7.097‰)。结论 超出ladder范围的罕见等位基因序列比相邻等位基因增加(或减少)1个或数个重复单位,因碱基的插入或缺失的罕见等位基因出现在两等位基因之间。

应用15个STRs揭示广西4个少数民族的遗传关系(英文)

为研究广西仫佬、毛南、苗和瑶族的15个短串联重复序列(STR)基因座的遗传多态性,探讨这4个民族群体的遗传差异和进化关系。通过PCR-STR及测序仪,检测了广西4个民族766例无关个体的15个STR位点基因频率的分布并比较各民族间的差异,计算遗传学参数、遗传距离和构建系统进化树。结果显示:仫佬、毛南、苗和瑶族的15个STR位点分别共检出135,134,148,145种等位基因和424,432,445,436种基因型;各民族的平均Ho>0.7,累积DP,EPP和PIC均在0.99999以上;毛南族和苗族,瑶族和其他民族间在多数位点的基因频率分布上存在显著差异,而仫佬族和毛南族或苗族间在多数位点上不存在差异;4个民族在进化树上被分为两组,仫佬族和毛南族聚成一组,苗族和瑶族聚成另一组。说明广西仫佬、毛南、苗和瑶族的15个STR基因座具有高度的遗传多态性,实用价值较高,是一组可用于人类群体遗传学、法医学个体识别和亲子鉴定等研究的有力工具;4个民族STR的遗传差异性和遗传关系与他们的语言文化和民族历史基本一致。

干细胞移植患者口腔粘膜上皮细胞基因型观察

目的观察异基因外周血干细胞移植患者口腔上皮细胞基因型的变化,判断干细胞生长情况。方法采用PCR-STR分型技术对31例外周血干细胞移植患者血液、口腔拭子及部分患者毛根进行基因分型。结果31例患者移植后血液均为供体基因型;25例患者口腔上皮细胞基因型为受体与供体嵌合体型,4例为受体原有基因型,2例转为供体基因型;11例检测了毛根基因型,均为受体的原有基因型。结论移植后外周血干细胞可以转变为口腔粘膜上皮细胞,这种转变有望成为判断患者干细胞生长情况及移植后治疗效果的一项新指标。这对干细胞治疗各种血液恶性疾病及法医学应用具有较高的参考价值。

STR分型中无效等位基因的分析研究

PCR-STR自动分型技术是当前法医学个体识别和亲权鉴定的主要技术,具有高灵敏度、高鉴别能力和标准化自动分型等特征[1].在STR自动分型时,也会出现一些影响其准确分型的因素,本文结合1例三联体亲权鉴定中父亲与孩子Penta基因座上不符合遗传规律现象,通过用3种不同试剂盒、改变退火温度、重新设计引物以及测序等方法,对STR分型中无效等位基因现象进行分析和探讨.

联合应用多种技术分析性别异常者

目的对1例Amelogenin基因座分型结果为"X,Y"的"女性"进行分子遗传学分析。方法采用PCR-STR技术检测Y-STR和X-STR基因座,实时荧光定量PCR技术检测SRY基因,原位荧光杂交(FISH)技术分析外周血细胞性染色体情况。结果采用Y-filer试剂盒仅检见短臂上的4个Y-STR基因座,AGCU X19试剂盒的19个X-STR基因座全部检出,但均为纯合子;SRY基因检测为阳性;外周血细胞FISH检测结果显示只有一条X染色体。结论推断该个体是伴有Y染色体物质隐匿嵌合的Turner综合征患者。在法医物证检验中,应重视该类社会性别与Amelogenin基因座检测结果不符的特殊个体,防止发生性别误判。