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磷酸二酯酶2(PDE2)结构及其选择性抑制剂的研究进展 被引量:3
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作者 赵新筠 陈喜 湛昌国 《有机化学》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2009年第2期159-165,共7页
磷酸二酯酶2(PDE2)主要分布在大脑、心脏细胞中,作为潜在的药物靶标,通过水解细胞内第二信使cAMP和cGMP,对维持cAMP和cGMP的水平起着重要的作用,其选择性抑制剂有望在内皮渗透性和改善记忆力等方面发挥作用.综述了PDE2的组织分布、生理... 磷酸二酯酶2(PDE2)主要分布在大脑、心脏细胞中,作为潜在的药物靶标,通过水解细胞内第二信使cAMP和cGMP,对维持cAMP和cGMP的水平起着重要的作用,其选择性抑制剂有望在内皮渗透性和改善记忆力等方面发挥作用.综述了PDE2的组织分布、生理功能、催化区域和调节区域晶体结构的特点以及选择性的抑制剂.最后,根据药物设计发展的趋势对未来PDE2抑制剂的设计进行了展望. 展开更多
关键词 磷酸二酯酶2(pde2) 酶功能 酶分布 调节区域 催化区域 选择性抑制剂
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糖尿病胃动力障碍大鼠胃窦平滑肌中PDE2和PDE3蛋白表达变化
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作者 金政 张默函 +2 位作者 姜京植 朴丽花 蔡英兰 《辽东学院学报(自然科学版)》 CAS 2016年第4期272-275,共4页
为了观察糖尿病胃动力障碍大鼠胃窦平滑肌组织中PDE2和PDE3的蛋白含量变化,由腹腔注射STZ制备糖尿病动物模型,利用多道生理信号记录系统记录糖尿病大鼠胃窦平滑肌收缩活动,将发生胃窦平滑肌收缩活动紊乱的大鼠列入糖尿病胃动力障碍模型... 为了观察糖尿病胃动力障碍大鼠胃窦平滑肌组织中PDE2和PDE3的蛋白含量变化,由腹腔注射STZ制备糖尿病动物模型,利用多道生理信号记录系统记录糖尿病大鼠胃窦平滑肌收缩活动,将发生胃窦平滑肌收缩活动紊乱的大鼠列入糖尿病胃动力障碍模型,再采用免疫组织化学方法观察糖尿病胃动力障碍组大鼠胃窦平滑肌中PDE2和PDE3的分布。结果发现,糖尿病发病胃动力障碍大鼠与正常对照组相比,胃窦平滑肌组织PDE2表达无明显差异,但PDE3表达明显减少(P<0.05)。因此,糖尿病大鼠发生胃动力障碍可能与胃窦平滑肌中PDE3下调有关,糖尿病大鼠胃c GMP-PDE3的改变可能参与胃动力障碍的发生。 展开更多
关键词 糖尿病 胃动力障碍 pde2 PDE3
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基于生物信息学分析PDE2A基因在消化系统肿瘤预后及免疫浸润的临床意义 被引量:1
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作者 张钊熊 韩强 刘树业 《世界华人消化杂志》 CAS 2021年第18期1055-1063,共9页
背景消化系统肿瘤是最常见的恶性肿瘤之一,然而其预后仍不好.探索潜在生物标志物是肿瘤研究的重要方向.我们拟利用生物信息学方法探索消化系统的潜在标志物.目的探究在消化系统肿瘤中PDE2A表达与免疫浸润相关性,探索PDE2A在消化系统肿... 背景消化系统肿瘤是最常见的恶性肿瘤之一,然而其预后仍不好.探索潜在生物标志物是肿瘤研究的重要方向.我们拟利用生物信息学方法探索消化系统的潜在标志物.目的探究在消化系统肿瘤中PDE2A表达与免疫浸润相关性,探索PDE2A在消化系统肿瘤中的预后价值.方法通过HPA、TIMER和UALCAN数据库分析PDE2A在不同消化系统肿瘤中的mRNA及蛋白表达,利用GEPIA数据库探索PDE2A在不同消化系统肿瘤患者预后的影响.通过TIMER数据库探索PDE2A表达与不同消化系统肿瘤免疫浸润相关性.利用cBioPortal数据库分析PDE2A在不同消化系统肿瘤的遗传突变信息.通过STRING数据库探索PDE2A的潜在蛋白相互作用网络.结果PDE2A基因mRNA和蛋白在肝癌、胃癌、胰腺癌、结肠癌和食管癌组织中表达低于正常癌旁组织.PDE2A高表达的肝癌和胰腺癌患者较PDE2A低表达的患者预后良好.PDE2A表达与肝癌、胃癌、胰腺癌、结肠癌和食管癌不同免疫细胞如CD4+T淋巴细胞、CD8+T淋巴细胞、B细胞、巨噬细胞和中性粒细胞呈正相关或负相关.PDE2A基因在胃癌、胰腺癌、结肠癌及食管癌中存在错义突变等遗传改变.结论PDE2A表达与消化系统肿瘤免疫浸润有关.PDE2A高表达的肝癌和胰腺癌患者预后良好.PDE2A基因可能为潜在的消化系统肿瘤免疫治疗靶点和预后标志物. 展开更多
关键词 消化系统肿瘤 免疫浸润 预后 pde2A 生物信息学
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以PDE2为靶标的抑制剂药物高通量筛选模型的建立 被引量:1
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作者 许煌 许晓双 +4 位作者 高英 曹依菁 黄险峰 孔韧 宋国强 《中国新药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期1175-1180,共6页
目的:建立稳定可靠,且以二型磷酸二酯酶(PDE2)为靶标,采用AlphaScreencAMP kit为技术的高通量药物筛选模型。方法:利用大肠杆菌原核表达纯化获得目的蛋白,通过AlphaScreen酶活体系摸索MgCl2浓度对PDE2活性影响,测定底物Bio-cAMP的Km值... 目的:建立稳定可靠,且以二型磷酸二酯酶(PDE2)为靶标,采用AlphaScreencAMP kit为技术的高通量药物筛选模型。方法:利用大肠杆菌原核表达纯化获得目的蛋白,通过AlphaScreen酶活体系摸索MgCl2浓度对PDE2活性影响,测定底物Bio-cAMP的Km值,考察二甲基亚砜(dimethyl sulfoxide,DMSO)对体系的影响,最后测定阳性抑制剂Bay 60-7550的半抑制浓度(IC50)验证模型。结果:纯化的PDE2蛋白通过SDS-PAGE检测分子量约为40. 0 kD,测得浓度1. 2 mg·m L-1;反应缓冲液中MgCl2浓度定为10 mmol·L-1,结合米氏方程,测得Km后确定底物工作浓度为200 nmol·L-1,PDE2工作浓度为0. 12 mg·m L-1;体系DMSO含量需低于4%;通过以上条件测得Bay 60-7550的IC50值为8. 4 nmol·L-1,与文献值近似。结论:建立的高通量筛选模型,具备易于操作、信号窗口大、速度快、节省原料等特点,可用于PDE2抑制剂筛选。 展开更多
关键词 二型磷酸二酯酶 ALPHASCREEN 抑制剂 高通量筛选
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磷酸二酯酶2对抑郁焦虑及认知障碍等中枢神经疾病的调节作用 被引量:9
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作者 严伟 陈玲 +2 位作者 王飞 李晴宇 牛国忠 《中国临床药理学与治疗学》 CAS CSCD 2013年第12期1424-1429,共6页
磷酸二酯酶(Phosphodiesterase,PDE)水解细胞内第二信使-环磷酸腺苷和环磷酸鸟苷,降低细胞内第二信使的含量,进而影响下游信号转导,调节细胞内的生命活动。磷酸二酯酶2(PDE2)是磷酸二酯酶大家族的成员之一,在中枢神经系统中分布广泛,尤... 磷酸二酯酶(Phosphodiesterase,PDE)水解细胞内第二信使-环磷酸腺苷和环磷酸鸟苷,降低细胞内第二信使的含量,进而影响下游信号转导,调节细胞内的生命活动。磷酸二酯酶2(PDE2)是磷酸二酯酶大家族的成员之一,在中枢神经系统中分布广泛,尤其在海马和杏仁核部分密集,近年来越来越多的研究表明PDE2可能参与中枢神经系统疾病的调节,而相应的PDE2抑制剂可能具有治疗抑郁、焦虑和学习记忆障碍等中枢神经系统疾病前景。本文综述了PDE2在中枢神经系统疾病调节中的作用及其抑制剂在治疗相关疾病的应用。 展开更多
关键词 磷酸二酯酶2 环磷酸腺苷 环磷酸鸟 中枢神经系统 学习记忆 抑郁焦虑
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Numerical Approaches for Linear Left-invariant Diffusions on SE(2), their Comparison to Exact Solutions, and their Applications in Retinal Imaging
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作者 Jiong Zhang Remco Duits +1 位作者 Gonzalo Sanguinetti Bart Mter Haar Romeny 《Numerical Mathematics(Theory,Methods and Applications)》 SCIE CSCD 2016年第1期1-50,共50页
Left-invariant PDE-evolutions on the roto-translation group SE(2)(and their resolvent equations)have been widely studied in the fields of cortical model-ing and image analysis.They include hypo-elliptic diffusion(for ... Left-invariant PDE-evolutions on the roto-translation group SE(2)(and their resolvent equations)have been widely studied in the fields of cortical model-ing and image analysis.They include hypo-elliptic diffusion(for contour enhance-ment)proposed by Citti&Sarti,and Petitot,and they include the direction process(for contour completion)proposed by Mumford.This paper presents a thorough study and comparison of the many numerical approaches,which,remarkably,are missing in the literature.Existing numerical approaches can be classified into 3 categories:Finite difference methods,Fourier based methods(equivalent to SE(2)-Fourier methods),and stochastic methods(Monte Carlo simulations).There are also 3 types of exact solutions to the PDE-evolutions that were derived explicitly(in the spatial Fourier domain)in previous works by Duits and van Almsick in 2005.Here we provide an overview of these 3 types of exact solutions and explain how they relate to each of the 3 numerical approaches.We compute relative errors of all nu-merical approaches to the exact solutions,and the Fourier based methods show us the best performance with smallest relative errors.We also provide an improvement of Mathematica algorithms for evaluating Mathieu-functions,crucial in implemen-tations of the exact solutions.Furthermore,we include an asymptotical analysis of the singularities within the kernels and we propose a probabilistic extension of un-derlying stochastic processes that overcomes the singular behavior in the origin of time-integrated kernels.Finally,we show retinal imaging applications of combining left-invariant PDE-evolutions with invertible orientation scores. 展开更多
关键词 Brownian motion Euclidean motion group PDE’s on SE(2) Mathieu operators contour completion contour enhancement retinal imaging
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