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2021—2022年我国部分地区鸽圆环病毒感染状况调查 被引量:3
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作者 邢安琪 于晓慧 +8 位作者 彭真奇 蒋文明 克军宏 李阳 李金平 袁丽萍 许立华 王静静 刘华雷 《中国动物检疫》 CAS 2023年第7期1-7,共7页
为了解目前我国鸽群中鸽圆环病毒(pigeon circovrius,PiCV)的流行现状及遗传变异情况,2021—2022年对山东等11个省(自治区)PiCV感染状况进行了调查,共采集鸽相关样品658份,采用PCR方法进行PiCV病原学检测,并对3份PiCV病原学阳性样品进... 为了解目前我国鸽群中鸽圆环病毒(pigeon circovrius,PiCV)的流行现状及遗传变异情况,2021—2022年对山东等11个省(自治区)PiCV感染状况进行了调查,共采集鸽相关样品658份,采用PCR方法进行PiCV病原学检测,并对3份PiCV病原学阳性样品进行基因组序列测定及遗传进化分析。结果显示:在主动监测的9个省(自治区)49个采样点中,检出464份PiCV病原学阳性样品,个体阳性率为75.20%(464/617),场点阳性率为91.84%(45/49),其中河南省个体阳性率最高(100%);在被动监测的3个省41份病死鸽组织样品中,共检出28份PiCV病原学阳性样品;3份病原学阳性代表样品(QingDao 957、JiLin2、FuJian 1179)与已报道的24条PiCV全基因组序列同源性为87.30%~95.90%;QingDao 957和JiLin 2与国内报道的JS15-1序列亲缘关系较近,而FuJian 1179与国外报道的PL53参考序列属于同一分支,推测QingDao 957和JiLin2毒株在国内流行的PiCV中占主导地位,而FuJian 1179可能是通过国际贸易等传入的新病原。结果表明,PiCV在我国部分地区鸽群中污染面较广,感染较严重,且来源复杂。因此,应加强鸽场的饲养管理,提高鸽群抵抗力,同时在外部引种时要做好病毒检测,以有效控制PiCV流行。 展开更多
关键词 鸽圆环病毒 流行病学调查 遗传进化分析
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北京地区1株鸽圆环病毒全基因组测定及遗传进化分析 被引量:5
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作者 亓玉卓 梁琳 +3 位作者 韩坤 梁瑞英 贾亚雄 崔尚金 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第1期32-42,共11页
【目的】了解北京地区流行的鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PiCV)的基因组特征及变异规律。【方法】以3只发病鸽的肝脏和脾脏组织为模板,采用PCR技术检测病原。以检测阳性的肝脏组织DNA为模板,应用PCR技术分段扩增PiCV的全基因序列。应... 【目的】了解北京地区流行的鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PiCV)的基因组特征及变异规律。【方法】以3只发病鸽的肝脏和脾脏组织为模板,采用PCR技术检测病原。以检测阳性的肝脏组织DNA为模板,应用PCR技术分段扩增PiCV的全基因序列。应用DNAStar和Mega 7.0软件对扩增得到的全序列进行拼接和核苷酸序列比对,并构建系统进化树,对病毒基因组的2个开放阅读框分别进行核苷酸和氨基酸序列比对,并构建系统进化树。【结果】经PCR检测,3只病鸽中有1只病鸽的组织中检测到PiCV阳性,并未检出其他病毒。采用PCR分段扩增成功获得了1株PiCV的全基因组序列,命名为PiCV BJ,该病毒基因组大小为2034 bp,包含有2个主要的开放阅读框(ORFs),ORF-V1编码Rep蛋白,ORF-C1编码Cap蛋白。相似性比对结果显示,PiCV BJ株基因组序列与GenBank上登录的其他参考序列的核苷酸相似性在86.0%~97.0%之间,与2011年分离自波兰的PL53相似性为97.0%。遗传进化结果显示,PiCV BJ株与2014年分离自波兰的PL124在同一分支,亲缘关系较近;与其他禽源圆环病毒不在同一分支,亲缘关系较远。PiCV BJ株Cap基因的起始密码子为ATG,与2011年分离自比利时的11-08304株核苷酸、氨基酸序列相似性高达95.8%和85.2%;Rep基因与2011年分离自波兰的PL53相似性最高,核苷酸和氨基酸相似性分别高达94.6%和96.2%;Cap和Rep基因的进化树分析结果也显示,PiCV BJ株均与PL53和11-08304株在同一分支,亲缘关系较近,这与相似性分析的结果一致。【结论】PiCV BJ株来自国外,可能由赛鸽引种传入中国,提示在外部引种时要做好病毒监测。本研究丰富了PiCV的遗传学研究资料,为进一步探究PiCV的遗传变异及传播机制提供了参考依据,也为PiCV的防控提供了重要的理论基础。 展开更多
关键词 鸽圆环病毒(picv) 全基因组 遗传进化分析
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鸽圆环病毒Cap及Rep基因的克隆与进化分析 被引量:3
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作者 日孜瓦古·努尔东 米晓云 +7 位作者 魏玉荣 吴建勇 苗书魁 马文戈 韩涛 葛丽娟 魏婕 黄炯 《塔里木大学学报》 2020年第1期1-6,共6页
为了解新疆和田地区某规模化种鸽场鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PiCV)感染情况和潜在来源,本研究采集了200份鸽粪便和3份鸽病料样本,对其进行PiCV Cap及Rep基因的PCR扩增、序列测定与分析。研究结果表明,PiCV检出率为47.29%(96/203)... 为了解新疆和田地区某规模化种鸽场鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PiCV)感染情况和潜在来源,本研究采集了200份鸽粪便和3份鸽病料样本,对其进行PiCV Cap及Rep基因的PCR扩增、序列测定与分析。研究结果表明,PiCV检出率为47.29%(96/203)。测序毒株被命名为PiCV-XJ2018,其Cap基因与GF82/Guangdong/2014毒株核苷酸同源性为94.98%,Rep基因与GF71/Guangdong/2014毒株核苷酸同源性为97.17%。遗传进化分析结果显示,PiCV-XJ2018毒株与国内2014年检测的广东株及上海株亲缘关系较近。本研究将为本地区鸽圆环病毒的诊断与防控提供参考数据。 展开更多
关键词 鸽圆环病毒 Rep基因 Cap基因 进化分析
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中央空调冷冻水系统设计的演变
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作者 黄赟 孙远 《上海节能》 2008年第3期48-52,共5页
通过回顾20世纪80年代至今近30年间的中央空调冷冻水系统设计的发展轨迹,详细阐述了一次水泵、二次水泵定速及变速系统原理,分析各个阶段设计理念的侧重点,比较各个时期设计方案的优缺点,最终提出目前可行的节能方案。
关键词 中央空调 一次水泵 二次水泵 压差传感器 压力无关型控制阀
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2001—2022年鸽圆环病毒的遗传变异分析
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作者 郎雯 陈煜杰 +3 位作者 吴敏慧 苏梦容 阮莲 吕其壮 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第1期109-116,共8页
鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PiCV)是近几年发现的一种能引起感染鸽免疫抑制的病毒,属于圆环病毒科圆环病毒属。为研究PiCV的流行特征和遗传进化规律,试验从GenBank中选取208株PiCV全基因组序列,利用生物信息学软件,通过构建PiCV全基... 鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PiCV)是近几年发现的一种能引起感染鸽免疫抑制的病毒,属于圆环病毒科圆环病毒属。为研究PiCV的流行特征和遗传进化规律,试验从GenBank中选取208株PiCV全基因组序列,利用生物信息学软件,通过构建PiCV全基因组系统发育树,进行核苷酸同源性比较、氨基酸序列比对分析、抗原表位分析和基因重组等方式对其进行遗传变异分析。结果表明:基于构建的系统发育树可将208株PiCV毒株分为A(54.81%,114/208)和B(45.19%,94/208)两个基因型,其中A基因型可进一步分为A-1、A-2、A-3、A-4、A-55个不同的亚群,B基因型可进一步分为B-1、B-2、B-3、B-44个不同的亚群。208株PiCV全基因组序列的相似性为83.8%~100%。PiCV Cap蛋白氨基酸序列上存在氨基酸的点突变、缺失和插入等情况。208株PiCV全基因组序列中存在大量重组事件(44个),涉及A基因型序列中所包含的遗传物质的直接交换及ORF C1基因小片段的转移。说明PiCV的变异具有多样性。 展开更多
关键词 鸽圆环病毒(picv) 遗传变异分析 重组分析 系统发育树 氨基酸序列分析
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一株赛鸽源鸽圆环病毒全基因克隆与序列分析 被引量:15
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作者 孙兴臣 熊晓妍 +5 位作者 李敏婕 李玉峰 姚大伟 万玉萌 孔志龙 许家荣 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期720-727,共8页
鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PiCV)是圆环病毒科的一个成员,是一种免疫抑制性病原。为了研究PiCV中国流行毒株的基因特征和遗传进化关系,本研究应用PCR方法对江苏省某赛鸽公棚的22份样品进行了PiCV检测,结果有6份样品为阳性。采用重叠... 鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PiCV)是圆环病毒科的一个成员,是一种免疫抑制性病原。为了研究PiCV中国流行毒株的基因特征和遗传进化关系,本研究应用PCR方法对江苏省某赛鸽公棚的22份样品进行了PiCV检测,结果有6份样品为阳性。采用重叠PCR技术得到一株鸽圆环病毒全基因序列,命名为JS15-1(GenBank登录号:KX431143)。基因序列分析表明,JS15-1全长为2 034bp,包含3个主要开放阅读框。核苷酸同源性比较结果显示JS15-1与GenBank上登录的其他鸽圆环病毒分离株的全基因核苷酸同源性为85.3%~97.1%,与比利时分离的Bel20株同源性最高。不同鸽圆环病毒Rep基因同源性为92.1%~96.6%,Cap基因同源性为72.2%~99.4%。全基因遗传进化树显示JS15-1与之前的中国分离株处于不同的分支,而与Bel20的亲缘关系最近,Rep基因进化树显示JS15-1与Bel20、PiCV/Japan/2010、Ita4B位于同一分支,Cap基因进化树显示JS15-1与Bel20处于同一分支,亲缘关系最近。氨基酸序列比较发现,JS15-1与Bel20在Rep蛋白存在6个氨基酸残基的差异,而Cap蛋白存在1个氨基酸残基的差异和1个氨基酸残基的插入。研究结果表明,JS15-1极可能来源于比利时,而且发生了变异。 展开更多
关键词 鸽圆环病毒(picv) 赛鸽 基因 遗传进化分析
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Blue-White Colony Selection of Virus-Infected Isogenic Recipients Based on a Chrysovirus Isolated from Penicillium italicum 被引量:2
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作者 Tingfu Zhang Na Li +5 位作者 Yongze Yuan Qianwen Cao Yanfen Chen Binglan Tan Guoqi Li Deli Liu 《Virologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2019年第6期688-700,共13页
Mycoviruses have been found to infect more than 12 species of Penicillium, but have not been isolated from Penicillium italicum(P. italicum). In this study, we isolated and characterized a new double-stranded RNA(ds R... Mycoviruses have been found to infect more than 12 species of Penicillium, but have not been isolated from Penicillium italicum(P. italicum). In this study, we isolated and characterized a new double-stranded RNA(ds RNA) virus, designated Penicillium italicum chrysovirus 1(Pi CV1), from the citrus pathogen P. italicum HSPi-YN1. Viral genome sequencing and molecular characterization indicated that Pi CV1 was highly homologous to the previously described Penicillium chrysogenum virus. We further constructed the mutant HSPi-YN1 Dpks P defective in the polyketide synthase gene(pks P), which is involved in pigment biosynthesis, and these mutants formed albino(white) colonies. Then we applied hyphal anastomosis method to horizontally transmit Pi CV1 from the white virus-donors(i.e., HSPi-YN1 mutants) to wild-type recipients(i.e., P.italicum strains HSPi-CQ54, HSPi-HB4, and HSPi-HN1), and the desirable Pi CV1-infected isogenic recipients, a certain part of blue wild-type strains, can be eventually selected and confirmed by viral genomic ds RNA profile analysis. This bluewhite colony screening would be an easier method to select virus-infected P. italicum recipients, according to distinguishable color phenotypes between blue virus-recipients and white virus-donors. In summary, the current work newly isolated and characterized Pi CV1, verified its horizontal transmission among dually cultured P. italicum isolates, and based on these, established an effective and simplified approach to screen Pi CV1-infected isogenic recipients. 展开更多
关键词 Penicillium italicum chrysovirus 1(picv1) pksP knockout White-blue colony screening Isogenic recipients Horizontal transmission
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