目的探索miR-93-5p调控直肠癌放疗敏感性的分子基础,挖掘靶基因并探讨其参与直肠癌发生发展的可能机制及临床意义。方法从GEO数据库中收集与放疗疗效相关的直肠癌临床数据集,利用limma.R包计算出与放疗敏感性相关的差异表达基因。在多个...目的探索miR-93-5p调控直肠癌放疗敏感性的分子基础,挖掘靶基因并探讨其参与直肠癌发生发展的可能机制及临床意义。方法从GEO数据库中收集与放疗疗效相关的直肠癌临床数据集,利用limma.R包计算出与放疗敏感性相关的差异表达基因。在多个microRNA靶基因预测数据库中预测miR-93-5p的靶基因。通过对差异表达基因集与靶基因取交集得到PLS1基因。以PLS1的表达水平进行患者的生存分析和基因集富集分析(Gene set enrichment analysis),挖掘PLS1的潜在临床意义及其分子机制。结果PLS1基因高表达患者的预后明显差于低表达患者(P=0.01)。结论在直肠癌中PLS1基因高表达是一种预后不良因子,可以作为预测患者预后的有效生物标志物。展开更多
文摘目的探索miR-93-5p调控直肠癌放疗敏感性的分子基础,挖掘靶基因并探讨其参与直肠癌发生发展的可能机制及临床意义。方法从GEO数据库中收集与放疗疗效相关的直肠癌临床数据集,利用limma.R包计算出与放疗敏感性相关的差异表达基因。在多个microRNA靶基因预测数据库中预测miR-93-5p的靶基因。通过对差异表达基因集与靶基因取交集得到PLS1基因。以PLS1的表达水平进行患者的生存分析和基因集富集分析(Gene set enrichment analysis),挖掘PLS1的潜在临床意义及其分子机制。结果PLS1基因高表达患者的预后明显差于低表达患者(P=0.01)。结论在直肠癌中PLS1基因高表达是一种预后不良因子,可以作为预测患者预后的有效生物标志物。