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PNKP Knockdown by RNA Interference Inhibits Herpes Simplex Virus-1 Replication in Astrocytes
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作者 Lei Yue Sujie Guo +5 位作者 Xia Cao Ying Zhang Le Sun Longding Liu Min Yan Qihan Li 《Virologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2013年第6期345-351,共7页
Herpes simplex virus-1 (HSV-1) is a major pathogen that causes various central nervous system (CNS) diseases,including herpes simplex encephalitis and meningitis.According to recent studies,PNKP significantly affects ... Herpes simplex virus-1 (HSV-1) is a major pathogen that causes various central nervous system (CNS) diseases,including herpes simplex encephalitis and meningitis.According to recent studies,PNKP significantly affects the proliferation of HSV-1 in astrocytes.Here,we used viral proliferation curves to confirm the significant inhibitory effects of PNKP on HSV-1 proliferation.PNKP downregulation was also confirmed by analyzing the transcription of viral genes.We found that PNKP downregulation affects the viral DNA copy number.This study preliminarily confirms that PNKP affects viral proliferation by affecting HSV-1 genome cyclization.These results also suggest that astrocytes play a specific role in preventing HSV-1 infection. 展开更多
关键词 星形胶质细胞 单纯疱疹病毒 RNA干扰 HSV-1 病毒增殖 复制 中枢神经系统 病毒DNA
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PNKP在DNA损伤修复中的作用 被引量:1
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作者 逄璐 孙广毅 +2 位作者 张志慧 任自敬 曾赵军 《生命的化学》 CAS CSCD 2014年第6期787-792,共6页
多聚核苷酸激酶/磷酸酶(polynucleotide kinase/phosphatase,PNKP)是一种DNA末端修复酶,同时具有激酶和磷酸酶活性,在DNA单链断裂修复途径、碱基切除修复途径以及DNA双链断裂修复中的非同源末端连接途径中发挥着至关重要的作用。近年来... 多聚核苷酸激酶/磷酸酶(polynucleotide kinase/phosphatase,PNKP)是一种DNA末端修复酶,同时具有激酶和磷酸酶活性,在DNA单链断裂修复途径、碱基切除修复途径以及DNA双链断裂修复中的非同源末端连接途径中发挥着至关重要的作用。近年来,由于一种与PNKP相关的常染色体隐性遗传病——MCSZ综合征的发现,使得人们对PNKP的关注度进一步增加。笔者从与PNKP相互作用的X射线交叉互补修复基因1(X-ray repair cross-complementing group 1,XRCC1)、X射线交叉互补修复基因4(X-ray repair cross-complementing group 4,XRCC4)和毛细血管扩张性共济失调突变基因(ataxia-telangiectasia mutated,ATM)入手,对PNKP在DNA损伤修复中的作用进行概述。 展开更多
关键词 pnkp XRCC1 XRCC4 ATM DNA损伤修复
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RNA干扰猪NHEJ通路修复因子对HR效率的影响 被引量:2
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作者 全绒 李国玲 +8 位作者 莫健新 钟翠丽 李紫聪 顾婷 郑恩琴 刘德武 蔡更元 吴珍芳 张献伟 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2018年第9期749-757,共9页
非同源末端连接(nonhomologous end joining,NHEJ)是动物基因组DNA双链断裂(double-strand break,DSB)修复的优选途径,通过与同源重组(homologous recombination,HR)竞争DSB靶点,进而抑制HR的效率。为提高HR效率,本研究针对猪NHEJ通路... 非同源末端连接(nonhomologous end joining,NHEJ)是动物基因组DNA双链断裂(double-strand break,DSB)修复的优选途径,通过与同源重组(homologous recombination,HR)竞争DSB靶点,进而抑制HR的效率。为提高HR效率,本研究针对猪NHEJ通路修复关键因子PNKP、LIG4和NHEJ1的编码序列,设计并合成相应的靶向小干扰RNA(small interfering RNA,si RNA),组成若干对RNAi(RNA interference)系统,将RNAi系统与报告质粒SSA-GFP reporter、HDR-GFP system和ss ODN-GFP system共转染至猪胎儿成纤维细胞(porcine fetal fibroblasts,PFFs),检测敲低上述NHEJ关键修复因子后对HR的影响。RNAi结果显示,针对PNKP、LIG4和NHEJ1设计的si RNA均可显著敲低PNKP、LIG4和NHEJ1基因的表达(P<0.05)。选择干扰效果最好的si RNA与报告载体共转染PFFs,结果表明干扰PNKP基因表达后可显著提高单链退火(single strand annealing,SSA)修复效率、双链或单链DNA介导的同源重组定向修复(homology-directed repair,HDR)效率分别为55.7%、37.4%和73.1%(P<0.05),而干扰LIG4和NHEJ1分别提高双链和单链介导的HDR效率为37.5%和76.9%(P<0.05)。 展开更多
关键词 同源重组 RNA干扰 非同源末端连接 pnkp NHEJ1 LIG4
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小头畸形-癫痫-发育迟缓症1例报告及其遗传家系图谱分析 被引量:2
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作者 梅杰 周文莉 +1 位作者 闫佳秀 郭世杰 《吉林大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期422-425,共4页
目的:探讨小头畸形-癫痫-发育迟缓症(MCSZ)的临床特点,分析遗传家系图谱,总结其诊断和治疗方法,提高临床医生对MCSZ的认识。方法:收集1例MCSZ患儿的临床资料,并行头部MRI平扫检查,采集患儿及其父母的血样进行全外显子组基因测序。结果:... 目的:探讨小头畸形-癫痫-发育迟缓症(MCSZ)的临床特点,分析遗传家系图谱,总结其诊断和治疗方法,提高临床医生对MCSZ的认识。方法:收集1例MCSZ患儿的临床资料,并行头部MRI平扫检查,采集患儿及其父母的血样进行全外显子组基因测序。结果:患儿临床表现为前囟和头围小、难治性癫痫、发育迟缓,4个月时因持续抽搐发作死亡。头部MRI平扫,前脑无裂畸形,白质及小脑发育不良,枕大池增大,扁平颅底。全外显子组基因测序,患儿多核苷酸激酶/磷酸酶(PNKP)基因存在杂合致病突变c.976G> A(p.Glu326Lys)和临床意义未明的杂合突变c.1482C>T (p.Gly494=),其母携带c.976G>A (p.Glu326Lys),其父携带c.1482C>T (p.Gly494=)。结论:患儿明确临床诊断为MCSZ,且为严重致死的MCSZ。患儿PNKP基因存在复合杂合突变,其中杂合突变c.1482C>T (p.Gly494=)可能为新发现的致病突变。 展开更多
关键词 小头畸形-癫痫-发育迟缓症 pnkp基因 全外显子组基因测序 遗传家系图谱
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RNA修复研究进展
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作者 李伟 苏泽红 +1 位作者 杨杰 何淑雅 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2014年第6期525-531,共7页
机体DNA损伤修复的机制目前已研究得比较全面,而RNA损伤修复的研究却没有引起广泛的认识.主要由于人们长期以来认为损伤的RNA会被机体特异性降解而不是修复.近年来,随着多个RNA损伤修复系统的相继发现,揭示机体对损伤RNA可能优先选择进... 机体DNA损伤修复的机制目前已研究得比较全面,而RNA损伤修复的研究却没有引起广泛的认识.主要由于人们长期以来认为损伤的RNA会被机体特异性降解而不是修复.近年来,随着多个RNA损伤修复系统的相继发现,揭示机体对损伤RNA可能优先选择进行修复.本文从噬菌体型RNA修复系统、细菌型RNA修复系统、酵母型RNA修复系统和人类的RNA损伤修复系统四个方面对目前RNA损伤修复研究的最新进展做一综述. 展开更多
关键词 RNA损伤 RNA修复 pnkp HeM hABH3
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DNA repair deficiency in neuropathogenesis:when all roads lead to mitochondria 被引量:1
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作者 Luis Bermúdez-Guzmán Alejandro Leal 《Translational Neurodegeneration》 SCIE CAS 2019年第1期157-170,共14页
Mutations in DNA repair enzymes can cause two neurological clinical manifestations:a developmental impairment and a degenerative disease.Polynucleotide kinase 3′-phosphatase(PNKP)is an enzyme that is actively involve... Mutations in DNA repair enzymes can cause two neurological clinical manifestations:a developmental impairment and a degenerative disease.Polynucleotide kinase 3′-phosphatase(PNKP)is an enzyme that is actively involved in DNA repair in both single and double strand break repair systems.Mutations in this protein or others in the same pathway are responsible for a complex group of diseases with a broad clinical spectrum.Besides,mitochondrial dysfunction also has been consolidated as a hallmark of brain degeneration.Here we provide evidence that supports a shared role between mitochondrial dysfunction and DNA repair defects in the pathogenesis of the nervous system.As models,we analyze PNKP-related disorders,focusing on Charcot-Marie-Tooth disease and ataxia.A better understanding of the molecular dynamics of this relationship could provide improved diagnosis and treatment for neurological diseases. 展开更多
关键词 DNA repair Mitochondrial dysfunction NEURODEGENERATION ATAXIA pnkp
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