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Construction of Plant-based Expression Vector of Polyphosphate Kinase Gene
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作者 曹访 杨志红 +2 位作者 韩志萍 杨倩 费佳玲 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2012年第10期2073-2075,2079,共4页
[Objective] The aim was to construct the fusion expression vector of polyphosphate kinase(PPK) and green fluorescent protein(GFP) genes.[Method] In this study,the primers were designed based on PPK gene sequence(... [Objective] The aim was to construct the fusion expression vector of polyphosphate kinase(PPK) and green fluorescent protein(GFP) genes.[Method] In this study,the primers were designed based on PPK gene sequence(L03719) of E.coli DH5α in Genbank.Genomic DNA of E.coli DH 5α was extracted as template for the amplification of PPK gene by PCR method.By using In-Fusion@ HD Cloning Kit,the PPK gene was directionally cloned into NcoI site of the pCAMBIA1302 vector.[Result] Sequencing results showed that the 2.0 kb long fragment of PPK gene was inserted into the plant-based expression vector pCAMBIA1302 in front of GFP gene.[Conclusion] The fusion expression vector of PPK and GFP genes were successfully constructed. 展开更多
关键词 Escherichia coli ppk gene Plant-based expression vector CONSTRUCTION
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多聚磷酸盐激酶(PPK)基因植物表达载体的构建
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作者 曹访 杨志红 +2 位作者 韩志萍 杨倩 费佳玲 《安徽农业科学》 CAS 2012年第31期15139-15141,共3页
[目的]构建融合表达PPK和绿色荧光蛋白的融合表达载体pCAMBIA1302-PPK。[方法]根据GenBank中登录的大肠杆菌PPK基因序列(L03719)设计引物,以E.coli DH5α基因组DNA为模板,通过PCR扩增得PPK基因,然后用In-Fusion@HD Cloning Kit将PPK基... [目的]构建融合表达PPK和绿色荧光蛋白的融合表达载体pCAMBIA1302-PPK。[方法]根据GenBank中登录的大肠杆菌PPK基因序列(L03719)设计引物,以E.coli DH5α基因组DNA为模板,通过PCR扩增得PPK基因,然后用In-Fusion@HD Cloning Kit将PPK基因克隆到pCAMBIA1302载体的Nco I酶切位点。[结果]序列测定结果显示,pCAMBIA1302-PPK含有约2.0 kb的PPK基因片段,说明PPK基因已插入植物表达载体pCAMBIA1302的绿色荧光蛋白基因前。[结论]成功构建了融合表达PPK和绿色荧光蛋白的融合表达载体pCAMBIA1302-PPK。 展开更多
关键词 大肠杆菌 多聚磷酸盐激酶基因 植物表达载体 构建
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肠出血型大肠埃希菌O157:H7 ppk基因缺失株的构建及其生物学特性分析 被引量:2
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作者 韩朋 孙琦 +2 位作者 赵素慧 张其威 万成松 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期904-908,共5页
目的利用Red重组系统构建肠出血型大肠埃希菌(EHEC)O157:H7 ppk基因缺失株,并研究其生物特性。方法设计并合成一对同源臂引物,每条引物5'端与ppk基因同源,3'端与卡那霉素抗性基因同源,扩增卡那霉素抗性基因片段;制备含有pKD46... 目的利用Red重组系统构建肠出血型大肠埃希菌(EHEC)O157:H7 ppk基因缺失株,并研究其生物特性。方法设计并合成一对同源臂引物,每条引物5'端与ppk基因同源,3'端与卡那霉素抗性基因同源,扩增卡那霉素抗性基因片段;制备含有pKD46质粒的EHEC O157:H7 EDL933w感受态细菌,然后将该抗性基因片段电击转化入制备的感受态菌株中;利用pKD46介导的Red重组系统,通过同源重组替换EHEC O157:H7 EDL933w ppk基因,PCR和测序验证;通过革兰染色、测D600值、吉姆萨染色比较EHEC O157:H7 EDL933w野生株和突变株的形态结构、生长能力和黏附性。结果构建了ppk基因缺失并含有卡那霉素抗性的EHEC O157:H7 EDL933w突变菌株(EHEC O157:H7 EDL933wΔppk),初步探索了EHEC O157:H7 EDL933w野生株和突变株的生物学特性。结论本研究运用Red重组系统构建了肠出血型大肠埃希菌O157:H7 ppk基因缺失株,为进一步研究肠出血型大肠埃希菌中ppk基因的调控机制奠定了基础。 展开更多
关键词 EHEC O157 H7 ppk基因 RED重组系统 基因突变
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Community structures and population dynamics of “Candidatus Accumulibacter” in activated sludges of wastewater treatment plants using ppk1 as phylogenetic marker 被引量:6
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作者 Wei Zeng Limin Zhang +2 位作者 Pengchao Fan Jingjing Guo Yongzhen Peng 《Journal of Environmental Sciences》 SCIE EI CAS CSCD 2018年第5期237-248,共12页
Candidatus Accumulibacter has been identified as dominant polyphosphate-accumulating organisms(PAOs) in enhanced biological phosphorus(P) removal(EBPR) from wastewater.This study revealed the relevance of commun... Candidatus Accumulibacter has been identified as dominant polyphosphate-accumulating organisms(PAOs) in enhanced biological phosphorus(P) removal(EBPR) from wastewater.This study revealed the relevance of community structure, abundance and seasonal population dynamics of Candidatus Accumulibacter to process operation of wastewater treatment plants(WWTPs) in China using ppk1 gene as phylogenetic marker. All sludge samples had properties of denitrifying P removal using nitrate as an electron acceptor.Accumulibacter abundance in the anaerobic-anoxic-oxic(A^2O) process was the highest(26%of total bacteria), and higher in winter than in summer with a better EBPR performance.Type-II was the dominant Accumulibacter in all processes, and type-I accounted for a small proportion of total Accumulibacter. The abundance of Clade-IIC as the most dominant clade reached 2.59 × 10~9 cells/g MLSS and accounted for 87.3% of total Accumulibacter. Clade IIC mainly contributed to denitrifying P removal. Clades IIA, IIC and IID were found in all processes, while clade-IIF was only found in oxidation ditch process through phylogenetic analysis. High proportion of clade IID to total Accumulibacter led to poor performance of aerobic P-uptake in inverted A^2O process. Therefore, Accumulibacter clades in WWTPs were diverse, and EBPR performance was closely related to the clade-level community structures and abundances of Accumulibacter. 展开更多
关键词 Candidatus Accumulibacter Polyphosphate kinase 1 gene ppk1) Activated sludge Enhanced biological phosphorusremoval (EBPR) Wastewater treatmentplants (W Ps)
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DEG/ENaC基因家族研究进展
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作者 初翔 王彦文 《山东农业大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2013年第1期150-154,共5页
本文对DEG/ENaC基因家族的结构特征、功能与成员组成进行了介绍,分别阐述了各亚家族的特点,并列举了PPK基因的国内外最新研究发现。
关键词 DEG ENaC基因家族 ppk 机械刺激
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微生物聚磷及其酶学调控 被引量:9
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作者 袁林江 周国标 南亚萍 《环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第7期1955-1962,共8页
本文论述了微生物细胞内磷酸盐转运机制和与聚磷相关的酶—PPK、PPX及两者对微生物聚磷行为的调控,并对今后研究重点做出展望.论文认为对于微生物聚磷的研究应从纯种微生物转移到强化生物除磷系统的混合微生物菌群,运用分子生物学和生... 本文论述了微生物细胞内磷酸盐转运机制和与聚磷相关的酶—PPK、PPX及两者对微生物聚磷行为的调控,并对今后研究重点做出展望.论文认为对于微生物聚磷的研究应从纯种微生物转移到强化生物除磷系统的混合微生物菌群,运用分子生物学和生物信息学手段分析聚磷优势菌种的PPK和PPX酶的结构特征及其在活性污泥中的变化规律,进一步深入认识生物除磷调控机理,开辟寻求提高系统除磷效率的新途径. 展开更多
关键词 聚磷菌 多聚磷酸盐 ppk PPX 基因 代谢调控
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多聚磷酸盐激酶基因在污水生物除磷中的功能 被引量:3
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作者 南亚萍 周国标 袁林江 《环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第4期1529-1535,共7页
为验证多聚磷酸盐激酶基因(ppk)在污水生物除磷中的功能.采用Red敲除系统,以p KD4质粒为模板,设计同源短臂,扩增外源线性DNA片段,将外源线性DNA片段电转化整合入已导入p KD46的大肠杆菌ATCC25922野生型菌株.获得重组菌E.coli/ppk^-Kan^+... 为验证多聚磷酸盐激酶基因(ppk)在污水生物除磷中的功能.采用Red敲除系统,以p KD4质粒为模板,设计同源短臂,扩增外源线性DNA片段,将外源线性DNA片段电转化整合入已导入p KD46的大肠杆菌ATCC25922野生型菌株.获得重组菌E.coli/ppk^-Kan^+.将p CP20导入大肠杆菌E.coli/ppk^-Kan^+以消除卡那霉素抗性基因,通过负抗性筛选及正反向引物验证,构建无抗生素抗性的ppk基因缺失工程菌株E.coli/ppk^-Kan^-.比较工程菌株和野生型菌株的生长特性,并比较两者在缺磷诱导/富磷及多次厌氧/好氧诱导条件下的除磷性能.结果表明采用Red重组系统,通过无痕敲除,成功构建了大肠杆菌ppk基因缺失菌株E.coli/ppk^-Kan^-.敲除后的工程菌株和野生型菌株生长整体没有差异,但是4 h前对数期工程菌株生长快于野生型菌株,8 h后稳定期工程菌株生长慢于野生型菌株,表明ppk影响菌体的生长;缺磷诱导/富磷条件下,工程菌株并未表现出因ppk缺失而影响其除磷能力;经过5次厌氧/好氧诱导,两菌菌体含磷量保持在1%~2%,没有因诱导次数的增加而表现出菌体含磷量增加的趋势,也未发现厌氧有PHB好氧有聚磷颗粒生成,表明ppk基因的缺失并没有引起菌体除磷能力的下降.ppk并未表现出明显的与污水生物除磷相关的功能. 展开更多
关键词 污水生物除磷 大肠杆菌 无痕敲除 多聚磷酸盐激酶 除磷性能
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多聚磷酸盐激酶的原核表达、纯化及酶活性测定
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作者 曾李婷 肖仪 彭亮 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2020年第5期493-497,共5页
目的原核表达、纯化多聚磷酸盐激酶(polyphosphate kinase,PPK),并检测其酶活性。方法采用PCR法从尿路致病性E.coli CFT073中扩增ppk基因,克隆至原核表达载体pET-28a中,构建重组表达质粒pET-28a-ppk,转化感受态E.coli BL21(DE3),IPTG诱... 目的原核表达、纯化多聚磷酸盐激酶(polyphosphate kinase,PPK),并检测其酶活性。方法采用PCR法从尿路致病性E.coli CFT073中扩增ppk基因,克隆至原核表达载体pET-28a中,构建重组表达质粒pET-28a-ppk,转化感受态E.coli BL21(DE3),IPTG诱导表达。重组蛋白经His-镍亲和层析柱分离纯化后,采用4',6-二脒基-2-苯基吲哚(4',6-diamidino-2-phenylindole,DAPI)染色法测定纯化蛋白的酶活性。结果重组表达质粒pET-28a-ppk经双酶切及测序鉴定,证明构建正确。重组蛋白的相对分子质量约80000,纯化后蛋白浓度为518.9μg/mL。在加入10μg PPK酶,37℃孵育30 min的条件下测得的PPK酶活性最大,为(645.16±32.98)U/mg。结论成功在E.coli中表达了重组PPK,纯化产物纯度较高,具有PPK酶活性,为后续以PPK为靶点新型抗菌药物的研发奠定了基础。 展开更多
关键词 多聚磷酸盐激酶 基因重组 蛋白表达 酶活性
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