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Soft tissue tuberculosis detected by next-generation sequencing:A case report and review of literature
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作者 Yan-Gai He Ya-Hui Huang +5 位作者 Xiao-Lan Yi Kao-Liang Qian Ying Wang Hui Cheng Jun Hu Yuan Liu 《World Journal of Clinical Cases》 SCIE 2023年第3期709-718,共10页
BACKGROUND Soft tissue tuberculosis is rare and insidious,with most patients presenting with a localized enlarged mass or swelling,which may be factors associated with delayed diagnosis and treatment.In recent years,n... BACKGROUND Soft tissue tuberculosis is rare and insidious,with most patients presenting with a localized enlarged mass or swelling,which may be factors associated with delayed diagnosis and treatment.In recent years,next-generation sequencing has rapidly evolved and has been successfully applied to numerous areas of basic and clinical research.A literature search revealed that the use of next-generation sequencing in the diagnosis of soft tissue tuberculosis has been rarely reported.CASE SUMMARY A 44-year-old man presented with recurrent swelling and ulcers on the left thigh.Magnetic resonance imaging suggested a soft tissue abscess.The lesion was surgically removed and tissue biopsy and culture were performed;however,no organism growth was detected.Finally,Mycobacterium tuberculosis was confirmed as the pathogen responsible for infection through next-generation sequencing analysis of the surgical specimen.The patient received a standardized anti-tuberculosis treatment and showed clinical improvement.We also performed a literature review on soft tissue tuberculosis using studies published in the past 10 years.CONCLUSION This case highlights the importance of next-generation sequencing for the early diagnosis of soft tissue tuberculosis,which can provide guidance for clinical treatment and improve prognosis. 展开更多
关键词 mycobacterium tuberculosis Soft tissue infection Next-generation sequencing Extrapulmonary tuberculosis DIAGNOSIS Case report
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Diagnosis of Crohn's disease in India where tuberculosis is widely prevalent 被引量:24
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作者 Deepak N Amarapurkar Nikhil D Patel Priyamvada S Rane 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2008年第5期741-746,共6页
AIM:To define the parameters that positively predict diagnosis of Crohn's disease (CD) and differentiate it from gastrointestinal tuberculosis (GITB). METHODS:This prospective study over 3 years was carried out in... AIM:To define the parameters that positively predict diagnosis of Crohn's disease (CD) and differentiate it from gastrointestinal tuberculosis (GITB). METHODS:This prospective study over 3 years was carried out in the consecutive Indian patients with definite diagnosis of CD and equal numbers of patients with definite diagnosis of GITB. Demographic, clinical, laboratory, morphological and histological features were noted in all the patients. Serological tests such as p-ANCA, c-ANCA, IgA ASCA and IgG ASCA, were performed. Endoscopic biopsy and/or surgical tissue specimens were subjected to smear and culture for acid-fast bacilli (AFB) and tissue polymerase chain reaction for tuberculosis (TB PCR). Diagnosis of CD and GITB was based on the standard criteria. Data were analyzed using univariate Chi-square test and multiple logistic regression (MLR). RESULTS:The study is comprised of 26 patients with CD (age 36.6 ± 8.6 year, male:female, 16:10) and 26 patients with GITB (age 37.2 ± 9.6 year, male:female, 15:11). The following clinical variables between the two groups (CD vs TB) were significant in univariate analysis:duration of symptoms (58.1 ± 9.8 vs 7.2 ± 3.4 mo), diarrhoea (69.2% vs 34.6%), bleeding per rectum (30.7% vs 3.8%), fever (23.1% vs 69.2%), ascites (7.7% vs 34.6%) and extra-intestinal manifestations of inflammatory bowel disease (61.5% vs 23.1%). Of these, all except ascites and extra-colonic manifestations were found statistically significant by MLR. Accuracy of predicting CD was 84.62% based on the fever, bleeding P/R, diarrhoea and duration of symptoms while it was 63.4% when histology was reported as inflammatory bowel disease and 42.3% when there was recurrence of disease after surgery. Accuracy of predicting GITB was 73.1% when there was co-existing pulmonary lesions and/or abdominal lymphadenopathy;75% when tuberculosis was reported in histology;63.4% when granuloma was found in histology;82.6% when TB PCR was positive;and 61.5% when smear and/ or culture was positive for AFB. Serological test was not useful in differentiation of CD from GITB. Positivity rates for CD and GITB were:p-ANCA-3.8% and 3.8%, c-ANCA-3.8% and 0%, IgA ASCA-38.4% and 23.1%, and IgG ASCA-38.4% and 42.3%, respectively. CONCLUSION:Simple clinical parameters like fever, bleeding P/R, diarrhoea and duration of symptoms have the highest accuracy in differentiating CD from GITB. 展开更多
关键词 Crohn's disease Gastrointestinal tuberculosis Differential diagnosis Inflammatory bowel disease Anti-neutrophil cytoplasmic antibody Anti-Saccharomyces Cerevisiae antibody tissue polymerase chain reaction mycobacterium tuberculosis Acid-fact bacilli
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组织激肽释放酶家族在病原微生物感染中的作用
3
作者 尚雪恬 潘丽萍 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期239-244,共6页
组织激肽释放酶(tissue kallikrein-related peptidase, KLK)家族是丝氨酸蛋白酶家族中一种具有胰蛋白酶或胰凝乳蛋白酶性质的蛋白水解酶亚群,有15个家族蛋白,分别为KLK1~KLK15。近年来,越来越多的研究表明,KLK家族可通过切割病毒和细... 组织激肽释放酶(tissue kallikrein-related peptidase, KLK)家族是丝氨酸蛋白酶家族中一种具有胰蛋白酶或胰凝乳蛋白酶性质的蛋白水解酶亚群,有15个家族蛋白,分别为KLK1~KLK15。近年来,越来越多的研究表明,KLK家族可通过切割病毒和细菌关键蛋白、激活多种宿主受体、调控激肽系统等方式参与机体的多种生理活动,影响着病毒、细菌和真菌中多种病原微生物感染的进程,作用机制复杂且广泛。本文通过对近年来KLK家族蛋白在微生物感染中的作用和机制进行综述,以更好地探究KLK在微生物感染中的重要作用,特别是为其在结核分枝杆菌感染中的研究提供思路,也为KLK家族蛋白作为抗结核治疗靶点提供理论基础。 展开更多
关键词 病原 分枝杆菌 结核 感染 组织激肽释放酶类 综述文献(主题)
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病理组织结核分枝杆菌阳性患者临床及病理特征分析
4
作者 徐宝卿 欧阳小娟 张方琪 《联勤军事医学》 CAS 2024年第2期129-132,共4页
目的 探讨病理组织结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)阳性患者的临床及病理特征,为疑似结核病患者的诊断提供参考。方法 回顾性分析2020-01/2022-10月作者医院科室疑似MTB感染1130例患者资料,采用金胺O荧光染色法、分子生... 目的 探讨病理组织结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)阳性患者的临床及病理特征,为疑似结核病患者的诊断提供参考。方法 回顾性分析2020-01/2022-10月作者医院科室疑似MTB感染1130例患者资料,采用金胺O荧光染色法、分子生物学检测法确诊MTB感染患者235例,分析患者性别、年龄、组织种类、标本类型和病理特征与病理组织MTB阳性的相关性。结果 235例病理组织MTB阳性患者中,男性164例,占比69.79%,女性71例,占比30.21%,男性感染者占比显著高于女性;未成年3例,占比1.28%,成年232例,占比98.72%,以成年感染者为主。235例MTB阳性的病例中,以肺组织(107例,45.53%),淋巴结组织(37例,15.74%)和骨与关节组织(25例,10.64%)最为常见。手术标本MTB阳性率50.64%,显著高于穿刺标本的49.36%(χ^(2)=9.993,P=0.002)。肉芽肿病变标本MTB阳性率84.68%,显著高于非肉芽肿病变标本的15.32%(χ^(2)=29.510,P<0.001)。结论 对于病理组织MTB感染的患者,男性、成年、肺、淋巴结和骨与关节组织等因素有助于结核病的组织病理学诊断;而手术标本相对于穿刺标本、肉芽肿病变相对于非肉芽肿病变MTB阳性率高。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 病理组织 肉芽肿 临床分析
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肺组织结核菌培养和结核分枝杆菌-DNA检测对菌阴肺结核患者的诊断价值
5
作者 马杰 林震宇 +1 位作者 邓建宁 吴金伟 《中外医药研究》 2023年第25期145-147,共3页
目的:探讨肺组织结核菌培养、结核分枝杆菌-DNA(TB-DNA)检测在菌阴肺结核诊断中的应用价值。方法:选取南宁市第四人民医院2015年9月—2020年1月收治的68例疑似菌阴肺结核患者作为研究对象,所有患者采用全胸腔镜或胸腔镜辅助小切口行肺... 目的:探讨肺组织结核菌培养、结核分枝杆菌-DNA(TB-DNA)检测在菌阴肺结核诊断中的应用价值。方法:选取南宁市第四人民医院2015年9月—2020年1月收治的68例疑似菌阴肺结核患者作为研究对象,所有患者采用全胸腔镜或胸腔镜辅助小切口行肺切除术,将手术切除的肺病灶组织浸泡在福尔马林溶液中固定,取部分组织进行肺组织结核菌培养和TB-DNA检测,剩余肺病灶组织进行病理检查。同时对患者痰液样本进行痰涂片检查。以病理检查结果为金标准,比较单独采用肺组织结核菌培养、TB-DNA检测及二者联合检测对菌阴肺结核的诊断价值。结果:68例患者痰涂片及病理检查诊断结果显示,菌阴肺结核42例,肺部其他疾病26例。肺组织结核菌培养检出菌阴肺结核与痰涂片及病理检查诊断一致性较高(Kappa=0.646,P<0.05),TB-DNA检测检出菌阴肺结核与痰涂片及病理检查诊断中度一致(Kappa=0.529,P<0.05),肺组织结核菌培养联合TB-DNA检测检出菌阴肺结核与痰涂片及病理检查诊断一致性极好(Kappa=0.816,P<0.05)。肺组织结核菌培养联合TB-DNA检测诊断菌阴肺结核的敏感度、正确率高于肺组织结核菌培养、TB-DNA单独检测,漏诊率低于肺组织结核菌培养、TB-DNA单独检测,差异有统计学意义(P<0.05);肺组织结核菌培养联合TB-DNA检测诊断菌阴肺结核的特异性、阳性预测值、阴性预测值高于二者单独检测,误诊率低于二者单独检测,但差异无统计学意义(P>0.05)。结论:肺组织结核菌培养、TB-DNA检测均是诊断菌阴肺结核的有效指标,且与二者单独检测相比,联合检测的检出率、敏感度和特异性更高。 展开更多
关键词 菌阴肺结核 肺组织结核菌培养 结核分枝杆菌-DNA检测
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实时荧光定量PCR在结核病理诊断中的应用 被引量:1
6
作者 袁风菊 王宪伟 +3 位作者 徐培 成思颖 李慧 丁兀兀 《诊断病理学杂志》 2023年第6期541-544,548,共5页
目的探讨实时荧光定量PCR(qPCR)在结核病理诊断中的应用价值。方法回顾性分析1323例疑似结核病的石蜡包埋组织qPCR结果,并与临床诊断结果、抗酸染色结果进行对比分析。结果1323例病例中1073例有明确的诊断结果,其中结核阳性率为68.22%(7... 目的探讨实时荧光定量PCR(qPCR)在结核病理诊断中的应用价值。方法回顾性分析1323例疑似结核病的石蜡包埋组织qPCR结果,并与临床诊断结果、抗酸染色结果进行对比分析。结果1323例病例中1073例有明确的诊断结果,其中结核阳性率为68.22%(732/1073)。1073例病例中,qPCR阳性率为45.39%、敏感性为0.663、特异性为0.994,肺、胸膜、骨、淋巴结、肠中qPCR敏感性分别为0.706、0.676、0.437、0.678、0.625,特异性分别为0.993、1.000、1.000、1.000、1.000,手术组织阳性率和敏感性分别为48.42%、0.692,均高于活检组织,且差异有统计学意义(P<0.05)。755例同时具有qPCR结果和抗酸染色结果的病例中,qPCR与抗酸染色法符合率75.36%(95%CI 72.17~78.30),qPCR阳性率(43.44%,328/755)高于抗酸染色的阳性率(21.5%,162/755)(P<0.05),qPCR的AUC(95%CI)=0.837(0.817~0.859)高于抗酸染色AUC(95%CI)=0.656(0.634~0.678)(P<0.05),敏感性高于抗酸染色(0.677 vs 0.327)(P<0.05)。结论qPCR在结核病的病理诊断中具有良好的应用价值,联合抗酸染色可以更准确地进行鉴别诊断。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 石蜡包埋组织 荧光定量PCR 抗酸染色
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结核分枝杆菌感染实验模型 被引量:9
7
作者 张交儿 周向梅 +3 位作者 孙斌 尹晓敏 杨建民 赵德明 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 2008年第5期385-390,共6页
结核分枝杆菌是引起人结核病的主要病原,全世界约有1/3人口感染结核分枝杆菌。尽管该病原可感染并引起许多动物疾病,但人类是其中心宿主。为研究结核分枝杆菌的致病机理及宿主对本病原的保护性和免疫病理学反应,选择合适的动物模型非常... 结核分枝杆菌是引起人结核病的主要病原,全世界约有1/3人口感染结核分枝杆菌。尽管该病原可感染并引起许多动物疾病,但人类是其中心宿主。为研究结核分枝杆菌的致病机理及宿主对本病原的保护性和免疫病理学反应,选择合适的动物模型非常必要。本文阐述了结核病研究中常用的实验模型及各种模型的优缺点。实验模型的合理应用将促进我们对结核病的认识,从中获取的资料将有助于我们发现更好的预防和治疗方案。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 动物模型 组织培养模型
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PCR-膜芯片检测石蜡包埋组织中结核杆菌耐药基因突变 被引量:7
8
作者 谭景尹 韦世录 +5 位作者 李翠萍 何晓 胡水秀 何敏 郑艳燕 周昌明 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第8期895-899,共5页
目的探讨PCR-膜芯片技术检测石蜡包埋组织中结核杆菌耐药基因突变的可行性及其在临床病理中的应用价值。方法采集100例石蜡包埋的肺或淋巴结组织标本(临床诊断为结核患者80例,非结核患者20例),TB膜芯片检测标本中的结核杆菌IS6110基因,... 目的探讨PCR-膜芯片技术检测石蜡包埋组织中结核杆菌耐药基因突变的可行性及其在临床病理中的应用价值。方法采集100例石蜡包埋的肺或淋巴结组织标本(临床诊断为结核患者80例,非结核患者20例),TB膜芯片检测标本中的结核杆菌IS6110基因,阳性者利用12对特异性引物进行多重PCR,扩增产物与含有59个探针的耐药-TB膜芯片反向点杂交检测结核杆菌耐药基因突变并测序验证。结果 TB膜芯片检测石蜡包埋组织标本中的结核杆菌IS6110基因,以临床诊断为标准时,灵敏度为52.5%(42/80),特异度为100%(20/20);以抗酸染色结果为标准时,灵敏度为90.5%(19/21),特异度为61.0%(36/59)。耐药-TB膜芯片检测石蜡包埋组织结核杆菌耐药基因突变,在42例结核杆菌IS6110基因阳性的标本中,检出INH基因突变2例,RFP或SM基因突变各1例,INH、RFP和EMB基因同时突变1例,与测序结果基本符合,提示上述5例可能为耐药结核病。结论应用PCR-膜芯片技术可提高石蜡包埋组织中结核杆菌基因的检出率,耐药-TB膜芯片检测结果可为耐药结核病的病理学诊断提供有价值的参考。 展开更多
关键词 结核杆菌 石蜡包埋组织 膜芯片 耐药 基因突变
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PCR-反向杂交膜片技术检测石蜡包埋组织中的结核杆菌 被引量:4
9
作者 何晓 周凌云 +3 位作者 何敏 刘斐 韦世录 罗殿中 《现代预防医学》 CAS 北大核心 2008年第4期766-768,共3页
[目的]探讨PCR-膜片RDB(recersedotblot)技术检测石蜡包埋组织中的结核杆菌的方法。[方法]合成检测结核杆菌的寡核苷酸探针并制作膜芯片,扩增结核分支杆菌插入序列IS6110基因片段,利用PCR-膜片RDB技术,检测12株结核分支杆菌临床分离株、... [目的]探讨PCR-膜片RDB(recersedotblot)技术检测石蜡包埋组织中的结核杆菌的方法。[方法]合成检测结核杆菌的寡核苷酸探针并制作膜芯片,扩增结核分支杆菌插入序列IS6110基因片段,利用PCR-膜片RDB技术,检测12株结核分支杆菌临床分离株、2株大肠杆菌,120例结核病人及38例非结核病人石蜡包埋组织中结核杆菌。石蜡组织的膜片检测结果与抗酸染色法和PCR检测结果比较。[结果]12株扩增阳性的结核分支杆菌,膜片检测11株杂交阳性,2株大肠杆菌和阴性对照结果均为阴性。120例结核病人石蜡组织标本,抗酸染色,PCR和PCR-膜片RDB技术检测灵敏度分别为43.3%(52/120),76.7%(92/120)和87.5%(105/120),三者比较差异有统计学意义(P﹤0.01)。38例非结核病人石蜡组织标本,抗酸染色,PCR和PCR-膜片RDB技术检测特异度分别为100%(38/38),94.7%(36/38)和100%(38/38),三者比较差异无统计学意义(P﹥0.05)。[结论]PCR-膜片RDB技术有助于提高石蜡包埋组织中结核杆菌检出率。 展开更多
关键词 反向杂交膜片 石蜡包埋组织 结核杆菌
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石蜡包埋脱钙骨组织中结核杆菌DNA不同提取方法比较 被引量:3
10
作者 潘鑫艳 王丽 +3 位作者 杨长绍 黎贵芸 杨举伦 蔡琳 《西南国防医药》 CAS 2014年第2期160-163,共4页
目的探讨石蜡包埋的10%硝酸脱钙骨组织中简易有效的结核杆菌DNA提取方法并进行验证。方法以20例石蜡包埋、10%硝酸脱钙的坏死性肉芽肿炎疑为骨结核的组织标本为研究对象,常规法直接采用德国QIAGEN公司的QIAampDNA FFPE Tissue Kit方... 目的探讨石蜡包埋的10%硝酸脱钙骨组织中简易有效的结核杆菌DNA提取方法并进行验证。方法以20例石蜡包埋、10%硝酸脱钙的坏死性肉芽肿炎疑为骨结核的组织标本为研究对象,常规法直接采用德国QIAGEN公司的QIAampDNA FFPE Tissue Kit方法提取DNA,而改良法中加入QIAampDNA Micro Kit试剂盒中的carrier RNA,以两种方法分别提取20例标本中结核杆菌DNA,通过荧光定量PCR,比较常规试剂盒提取法和改良提取法对结核杆菌检测结果的影响。结果改良法提取的DNA[(35.32±3.48)ng/μl]比常规法[(6.68±3.72)ng/μl]提取的DNA显著增多(P<0.05),改良法提取的DNA经荧光定量PCR检测结核杆菌的阳性率(55%)明显高于常规法(15%,P<0.01)。结论改良法提取石蜡包埋脱钙骨组织中结核杆菌DNA具有高效简便的特点,是较为理想的方法,值得在puncture和极微小石蜡样本中推广。 展开更多
关键词 脱钙骨组织 结核杆菌DNA 荧光定量PCR
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应用多重PCR方法检测石蜡包埋组织标本中的分枝杆菌DNA 被引量:3
11
作者 李子玲 秦卫松 +2 位作者 岳清华 孟奎 林勍 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第1期69-75,共7页
应用多重PCR方法检测并鉴别石蜡包埋组织中的结核分枝杆菌复合体与非结核分枝杆菌DNA扩增片段类型 ,为结核分枝杆菌复合体感染与非结核分枝杆菌感染的病理学诊断提供一种补充的鉴别诊断方法。应用三对具有特异性的寡核苷酸引物 ,进行多... 应用多重PCR方法检测并鉴别石蜡包埋组织中的结核分枝杆菌复合体与非结核分枝杆菌DNA扩增片段类型 ,为结核分枝杆菌复合体感染与非结核分枝杆菌感染的病理学诊断提供一种补充的鉴别诊断方法。应用三对具有特异性的寡核苷酸引物 ,进行多重PCR扩增。这三对引物分别对应于分枝杆菌 6 5kD表面抗原、结核分枝杆菌插入序列IS6 1 1 0及人类β 珠蛋白基因的部分序列 ,其扩增产物分别为 3 83bp、1 2 3bp和 2 6 8bp。此种多重PCR方法检测的灵敏度为 0 6pg。经多重PCR扩增后进行凝胶电泳 ,结核分枝杆菌复合体 (结核分枝杆菌、牛型结核分枝杆菌、BCG)均可见 3 83bp、1 2 3bp片段 ,而非结核分枝杆菌 (鸟、龟、瘰疬、蟾蜍、堪萨斯、胞内、耻垢分枝杆菌 )仅见 3 83bp片段 (猿猴分枝杆菌与结核分枝杆菌复合体相同 )。与上述相比 ,分枝杆菌感染的临床标本分别增加了一条 2 6 8bp片段。对 2 0 9例临床初步诊断为淋巴结结核病人的石蜡包埋组织标本进行了多重PCR检测 ,1 93例病理诊断为淋巴结结核、结核性肉芽组织、结核性肉芽肿性炎症病人的标本 ,检测结果符合结核分枝杆菌复合体感染。1 6例病理诊断为可疑淋巴结结核病人的标本 ,1 5例检测结果符合结核分枝杆菌复合体感染 ,1例符合非结核分枝杆菌感染。此种多重PCR方法可? 展开更多
关键词 多重聚合酶链反应 结核分枝杆菌复合体 非结构分枝杆菌 石蜡包埋组织标本 病毒DNA 检测
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实时荧光定量PCR在结核病中的诊断价值 被引量:5
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作者 曹燕珍 胡佳捷 +1 位作者 王翠翠 赵峰 《医学理论与实践》 2015年第23期3178-3179,3185,共3页
目的:探讨实时荧光定量PCR(FQ-PCR)在结核病诊断中的价值。方法:收集我院2013-2014年289例疑似结核组织,对组织进行常规组织病理学检查、抗酸特殊染色,并利用FQ-PCR技术对组织中特异性结核分枝杆菌复合物IS986基因区域进行扩增检测。结... 目的:探讨实时荧光定量PCR(FQ-PCR)在结核病诊断中的价值。方法:收集我院2013-2014年289例疑似结核组织,对组织进行常规组织病理学检查、抗酸特殊染色,并利用FQ-PCR技术对组织中特异性结核分枝杆菌复合物IS986基因区域进行扩增检测。结果:抗酸特殊染色结果显示,289例疑似结核组织中抗酸染色阳性94例,检出率为32.5%;FQ-PCR检测显示,阳性182例,检出率63.0%。经比对分析,抗酸染色与FQ-PCR的符合率为81.32%。结论:FQ-PCR对石蜡包埋组织中结核分枝杆菌检测率高于抗酸特殊染色。同时应用两种方法可以提高结核病的检出率,可为结核分枝杆菌感染的病理诊断提供更准确的依据。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 实时荧光定量PCR 组织
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荧光定量PCR检测石蜡组织中结核杆菌的临床应用 被引量:1
13
作者 韩文灿 郑茂金 +1 位作者 郭羽白 柳红 《徐州医学院学报》 CAS 2014年第12期868-870,共3页
目的探讨荧光定量聚合酶链反应(FQ—PCR)检测石蜡包埋组织结核分枝杆菌DNA(TB—DNA)在结核病诊断中的应用价值。方法33例石蜡包埋组织标本采用FQ—PCR技术检测TB—DNA,同时进行组织病理学检查,分别计算FQ—PCR和病理学检查的灵敏... 目的探讨荧光定量聚合酶链反应(FQ—PCR)检测石蜡包埋组织结核分枝杆菌DNA(TB—DNA)在结核病诊断中的应用价值。方法33例石蜡包埋组织标本采用FQ—PCR技术检测TB—DNA,同时进行组织病理学检查,分别计算FQ—PCR和病理学检查的灵敏度和准确度。结果29例临床诊断为结核病的组织标本中,FQ—PCR检测阳性26例,病理学拟诊为结核阳性20例,4例临床诊断非结核病的标本中,FQ—PCR检测和病理学检查都为阴性,两者的灵敏度和准确度分别为89.66%、90.91%和68.97%、72.73%。结论FQ—PCR技术检测石蜡包埋组织的TB—DNA用于结核病的诊断具有较高的灵敏度和准确度,与病理学检查相结合可以大大提高结核病的检出率。 展开更多
关键词 石蜡包埋组织 结核分枝杆菌 荧光定量聚合酶链反应
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石蜡包埋组织实时荧光定量PCR技术在结核病诊断中的应用 被引量:10
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作者 娄丽萍 张文迪 《锦州医科大学学报》 CAS 2019年第3期74-76,I0007,共4页
目的探讨石蜡包埋组织实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测结核分枝杆菌DNA在结核病诊断中的应用价值。方法收集58例临床确诊为结核病与40例非结核肉芽肿性疾病的石蜡包埋组织标本,应用RT-qPCR检测标本中结核分枝杆菌DNA,同时进行Ziehl-Neelse... 目的探讨石蜡包埋组织实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测结核分枝杆菌DNA在结核病诊断中的应用价值。方法收集58例临床确诊为结核病与40例非结核肉芽肿性疾病的石蜡包埋组织标本,应用RT-qPCR检测标本中结核分枝杆菌DNA,同时进行Ziehl-Neelsen抗酸染色,比较RT-qPCR与抗酸染色检测结果的差异。结果58例结核病例中通过RT-qPCR检测有56例为阳性,灵敏度为96.6%(56/58);通过抗酸染色检测有16例为阳性,灵敏度为27.6%(16/58),两者灵敏度差异有统计学意义(P<0.001)。而40例非结核性肉芽肿病例通过RT-qPCR检测有39例为阴性,特异度为97.5%(39/40),通过抗酸染色检测有36例为阴性,特异度为90.0%(36/40),两者特异度差异无统计学意义(P=0.359)。结论相对结核抗酸染色,RT-qPCR灵敏度较高,是石蜡包埋组织快速检测结核分枝杆菌DNA的有效工具,是快速诊断结核病的重要手段。 展开更多
关键词 石蜡包埋组织 结核病 实时荧光定量PCR 抗酸染色
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神经损伤标志物在儿童结核性脑膜炎中的动态变化特征及意义 被引量:1
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作者 石家云 王曼知 +2 位作者 周海依 张小佛 危松青 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2022年第12期1338-1344,共7页
目的:分析神经元特异性烯醇化酶(neuron specific enolase,NSE)、S100B、胶质纤维酸性蛋白(glial fibrillary acidic protein,GFAP)在结核性脑膜炎(tuberculous meningitis,TBM)患儿血清及脑脊液中表达的动态变化特征及其对患儿预后预... 目的:分析神经元特异性烯醇化酶(neuron specific enolase,NSE)、S100B、胶质纤维酸性蛋白(glial fibrillary acidic protein,GFAP)在结核性脑膜炎(tuberculous meningitis,TBM)患儿血清及脑脊液中表达的动态变化特征及其对患儿预后预测价值。方法:采用前瞻性研究方法,连续纳入2018年1月1日至2021年12月31日于南华大学附属长沙中心医院儿童结核科收治的72例TBM患儿作为TBM组。搜集同期住院,诊断为肺结核同时排除TBM的患儿20例作为肺结核组。TBM组患儿治疗6个月后根据预后情况,分为完全康复组(47例)和预后不良组(25例)。采用酶联免疫吸附试验法测定TBM组入院48 h内及治疗后(1、2、3周)和肺结核组入院48 h内的血清和脑脊液NSE、S100B、GFAP水平,并进行比较。采用受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线及曲线下面积(area under the curve,AUC)分析TBM患儿入院时脑脊液NSE、S100B、GFAP水平,预测其不良预后的阈值、敏感度及特异度。结果:入院时血清及脑脊液NSE、S100B、GFAP水平[中位数(四分位数)],TBM组分别为15.12(3.22,26.90)μg/L、1.11(0.40,3.20)μg/L、15.34(3.44,45.82)μg/L和37.90(6.50,142.70)μg/L、2.31(1.02,10.20)μg/L、65.31(10.87,252.60)μg/L,均明显高于肺结核组[分别为7.03(2.48,13.23)μg/L、0.25(0.12,0.36)μg/L、10.38(2.41,19.00)μg/L和7.56(2.12,12.79)μg/L、0.35(0.05,0.51)μg/L、7.86(2.41,13.80)μg/L],差异均有统计学意义(血清水平:Z值分别为-5.064、-6.817、-2.693,P值分别为0.000、0.000、0.007;脑脊液水平:Z值分别为-6.465、-6.816、-6.778,P值均为0.000);预后不良组脑脊液NSE、S100B、GFAP水平分别为60.16(24.90,142.70)μg/L、2.59(1.32,10.20)μg/L、118.74(58.83,252.60)μg/L,明显高于完全康复组[分别为29.37(6.50,68.82)μg/L、1.97(1.02,6.10)μg/L、45.39(10.87,84.93)μg/L],差异均有统计学意义(Z值分别为-4.855、-3.212、-6.334,P值分别为0.000、0.001、0.000)。治疗后1、2、3周,预后不良组脑脊液NSE分别为49.58(15.38,87.56)μg/L、41.53(9.60,82.00)μg/L、25.97(5.56,58.49)μg/L,S100B分别为10.15(3.63,15.72)μg/L、1.60(0.41,3.28)μg/L、0.75(0.41,1.60)μg/L,GFAP分别为99.75(65.79,180.84)μg/L、63.94(13.65,120.59)μg/L、38.03(10.87,85.40)μg/L,均明显高于完全康复组[NSE分别为18.49(4.87,36.12)μg/L、14.51(4.87,35.70)μg/L、8.53(2.12,21.70)μg/L;S100B分别为5.34(2.19,10.08)μg/L、0.66(0.19,1.56)μg/L、0.40(0.11,0.74)μg/L;GFAP分别为45.39(10.87,84.93)μg/L、17.77(5.66,38.15)μg/L、12.82(5.04,26.90)μg/L,差异均有统计学意义(NSE:Z值分别为-2.496、-3.815、-4.041,P值分别为0.013、0.000、0.000;S100B:Z值分别为-3.331、-4.745、-1.207,P值分别为0.047、0.000、0.036;GFAP:Z值分别为-4.940、-2.337、-3.745,P值分别为0.000、0.016、0.012)。ROC曲线分析,获得最大约登指数下入院时TBM患儿脑脊液NSE、S100B、GFAP水平对预后不良的预测阈值分别为51.92μg/L、2.75μg/L、77.54μg/L。结论:TBM患儿血清及脑脊液NSE、S100B、GFAP水平明显增高,经治疗后血清NSE、S100B、GFAP水平快速降至正常,而脑脊液NSE、S100B、GFAP水平下降缓慢。TBM患儿入院时脑脊液NSE≥51.92μg/L、S100B≥2.75μg/L或GFAP≥77.54μg/L,且经治疗后脑脊液NSE、S100B、GFAP下降缓慢,提示预后不良的可能。 展开更多
关键词 脑膜炎 细菌性 分枝杆菌 结核 儿童 神经组织蛋白质类
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组织驻留记忆T细胞在抗结核分枝杆菌感染中的研究进展 被引量:1
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作者 耿雪 宫照乾 +2 位作者 于嘉霖 邓光存 吴晓玲 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期1507-1513,共7页
结核病(tuberculosis,TB)是由结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)感染引起的一种严重威胁人畜健康的传染性疾病,目前仍然是全球十大致死率疾病之一[1]。据WHO报告指出:由于这两年受到COVID-19大流行的影响,TB患者的数量大幅... 结核病(tuberculosis,TB)是由结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)感染引起的一种严重威胁人畜健康的传染性疾病,目前仍然是全球十大致死率疾病之一[1]。据WHO报告指出:由于这两年受到COVID-19大流行的影响,TB患者的数量大幅度下降,但由于多重耐药、共患病等因素的上升以及对TB诊断、预防和服务支出的下降,导致TB的预防和治疗现状变得更加棘手[2-3]。据不完全统计,全球目前有近四分之一的MTB潜伏感染者,这部分感染者免疫力下降后,就可能发展为活动性TB患者。由此可见,结核病发生发展与机体免疫应答功能密切相关。 展开更多
关键词 组织驻留记忆T细胞 结核分枝杆菌 疫苗
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扩增子测序技术检测石蜡包埋组织标本耐药结核基因的研究
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作者 宋婧 张治国 +7 位作者 董宇杰 杜伟丽 王宇轩 刘子臣 李琨 张倩 孙倩 车南颖 《结核病与胸部肿瘤》 2020年第2期95-101,共7页
目的用基于多重PCR(mutiplex PCR,mPCR)扩增子的二代测序(next-generation sequencing,NGS)技术(mPCR-NGS)检测MTB的耐药基因突变,并评估其检测石端包埋组织标本诊断耐药结核病的临床应用价值。方法选取北京市昌平区结核病防治所2013年... 目的用基于多重PCR(mutiplex PCR,mPCR)扩增子的二代测序(next-generation sequencing,NGS)技术(mPCR-NGS)检测MTB的耐药基因突变,并评估其检测石端包埋组织标本诊断耐药结核病的临床应用价值。方法选取北京市昌平区结核病防治所2013年4月至2015年10月常规进行了利福平、异烟阱、乙胺丁醇、链霉素、卷曲霉素、卡那霉素、阿米卡星和氧氟沙星比例法检测且具有药敏试验结果的50栋MTB临床分离株,包括42株耐药MTB和8株敏感MTB菌株。参考耐药基因数据库及相关文献,针对以上8种抗结核药物主要耐药基因及常见位点设计耐药基因组合,建立有效的检测方案。收集首都医科大学附属北京胸科医院病理科2017年11月至2018年9月耐药结核病患者55例的石蜡包埋组织标本,探针熔解曲线法检测结果为利福平、异烟腓、乙胺丁醇和氟喹诺酮类至少存在一种耐药相关基因突变。首先对已知表型药敏试验结果的MTB临床分离株进行mPCR-NGS检测,验证该方法检测纯菌样本的有效性,再进一步检测结核病患者石蜡包埋组织标本进行临床验证。主要评价指标为敏感度和特异度以及一致性。结果以比例法为金标准,mPCR-NGS检测利福平、异烟阱、链霉素和乙胺丁酶的敏感度分别为95%(3840)、93%(2729)、93%(217129)和72%(13/18),特异度分别为100%(10/10)、95%(20/21)、100%(21/21)和94%(30/32);二线注射类药物卷曲霉素、卡那霉素和阿米卡星敏感度均为100%(22,3/3,3/3),特异度分别为9%(47148)、100%(3/33)和100%(4747),氧氟沙星的敏感度为70%(710),特异度为100%(40/40)。总符合率为94%,一致性检验Kappa值为0.87。纳人的55例石蜡包埋组织标本经探针熔解曲线法检测,28例利福平耐药,37例异烟腆耐药,13例乙胺丁醇耐药,17例氟喹诺酮类耐药。mPCR-NGS与探针熔解曲线法比较,利福平、异烟阱、乙胺丁醇和氟喹诺郦类的敏感度分别为100%(28/28)95%(35/37)、:100%(13/13)和100%(17/17);特异度均为100%(27/27,18/18,42/42,38/8)。两种方法总符合率为99%,一致性检验Kappa值为0.98。结论mPCR-NGS检测MTB临床分离株及结核病患者石蜡包埋组织标本耐药基因突变的敏感度、特异度和符合率较高,有望成为耐药结核病准确、快速的分子病理诊断新技术。 展开更多
关键词 分枝杆菌 结核 石蜡包埋组织 抗药性 基因测定
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GeneXpert MTB/RIF检测胸膜活检组织对结核性胸膜炎的诊断价值 被引量:1
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作者 卢飞燕 曾忠 +1 位作者 蒋凛 彭平华 《当代医学》 2022年第26期116-119,共4页
目的探究GeneXpert结核分枝杆菌/利福平耐药(MTB/RIF)检测胸膜活检组织对结核性胸膜炎的诊断价值。方法选取2019年1月至2021年3月赣州市第五人民医院收治的60例有胸腔积液疑似结核性胸膜炎患者作为研究对象,均行常规胸水检测和GeneXpert... 目的探究GeneXpert结核分枝杆菌/利福平耐药(MTB/RIF)检测胸膜活检组织对结核性胸膜炎的诊断价值。方法选取2019年1月至2021年3月赣州市第五人民医院收治的60例有胸腔积液疑似结核性胸膜炎患者作为研究对象,均行常规胸水检测和GeneXpert MTB/RIF检测胸膜活检组织。以痰培养结果作为金标准,比较两种检测方法的诊断效能。结果60例疑似结核性胸膜炎患者中,痰培养确诊结核性胸膜炎52例,非结核性胸腔积液8例。GeneXpert MTB/RIF检测胸膜活检组织诊断的灵敏度、准确度分别为96.15%、95.00%,均高于常规胸水检测的80.77%、76.67%,差异有统计学意义(P<0.05);GeneXpert MTB/RIF检测胸膜活检组织诊断的特异度为87.50%,高于常规胸水检测的50.00%,但差异无统计学意义。结论GeneXpert MTB/RIF检测胸膜活检组织对结核性胸膜炎诊断的灵敏度、特异度及准确度均较高,能为结核性胸膜炎的诊治提供重要参考信息。 展开更多
关键词 结核性胸膜炎 胸腔镜 GeneXpert核酸扩增检测技术 结核分枝杆菌 胸膜活检组织
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抗酸染色与PCR-荧光探针法在石蜡包埋组织结核分枝杆菌检测的比较 被引量:4
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作者 吴俊峰 任淑婷 《智慧健康》 2021年第1期34-37,共4页
目的比较抗酸染色与PCR-荧光探针法检测在福尔马林固定、石蜡包埋组织中结核分枝杆菌(Mycobaeterium tuberculosis,MTB)检测的应用。方法收集西京医院2018年1月至2019年10月共543例疑似结核患者,所有组织标本均经10%中性福尔马林固定,... 目的比较抗酸染色与PCR-荧光探针法检测在福尔马林固定、石蜡包埋组织中结核分枝杆菌(Mycobaeterium tuberculosis,MTB)检测的应用。方法收集西京医院2018年1月至2019年10月共543例疑似结核患者,所有组织标本均经10%中性福尔马林固定,常规石蜡包埋、切片,HE染色,行抗酸染色及PCR-荧光探针法检测。结果 543例疑似结核患者的石蜡包埋组织中,抗酸法检测MTB阳性58例,阳性率为10.68%,PCR-荧光探针法检测MTB阳性211例,阳性率为38.86%,两者阳性率比较差异有统计学意义(P<0.05),两种方法符合率为69.98%。其中明确临床诊断结果者187例,PCR-荧光探针法Youden指数(J=0.5245)较抗酸染色法Youden指数(J=0.2095)高。结论 PCR-荧光探针法检测石蜡包埋组织中的结核分枝杆菌,阳性检出率显著高于抗酸染色法,且诊断价值高,能够为临床提供可靠的诊断依据。 展开更多
关键词 抗酸染色 PCR-荧光探针法 石蜡包埋组织 结核分枝杆菌
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石蜡包埋组织中结核杆菌DNA不同提取方法比较 被引量:3
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作者 谭景尹 蒙南新 +3 位作者 何晓 韦世录 李翠萍 何敏 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期655-656,共2页
目的探讨结核患者石蜡包埋组织中简易有效的结核杆菌DNA提取方法并进行验证。方法 20份4%甲醛固定石蜡包埋的肺或淋巴结结核组织标本,分别以氯化钠盐析法、酚-氯仿抽提法、一步法、试剂盒法提取其DNA,并通过琼脂糖凝胶电泳、聚合酶链反... 目的探讨结核患者石蜡包埋组织中简易有效的结核杆菌DNA提取方法并进行验证。方法 20份4%甲醛固定石蜡包埋的肺或淋巴结结核组织标本,分别以氯化钠盐析法、酚-氯仿抽提法、一步法、试剂盒法提取其DNA,并通过琼脂糖凝胶电泳、聚合酶链反应(PCR)及膜芯片法分析所提取DNA的质量。结果氯化钠盐析法提取的DNA〔(19.338±6.270)μg〕和一步法提取的DNA〔(20.050±5.591)μg〕最多(P<0.001),一步法的A260/A280比值(1.044±0.137)明显低于其他3种方法(P<0.001);电泳结果显示4种提取方法均得到了基因组DNA;PCR与膜芯片验证显示除一步法外其余3种方法提取的DNA中均检测到结核杆菌DNA。结论氯化钠盐析法提取石蜡包埋组织结核杆菌DNA具有高效简便的特点,是较为理想的方法。 展开更多
关键词 石蜡包埋组织 结核杆菌DNA 提取方法
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