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北京地区核桃黑斑病病原菌的分离、致病性测定和16S rDNA序列分析 被引量:41
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作者 陈善义 陶万强 +2 位作者 王合 李金钟 周涛 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期469-473,I0001,共6页
核桃黑斑病是危害核桃生产的重要细菌病害,造成树势衰弱,减产严重,甚至树体死亡。2008年在北京郊区栽植的幼树上发现疑似病害,且呈爆发之势。为确定其病原菌分类地位,用组织分离法分离核桃黑斑病菌,纯化培养后用针刺接种法回接到健康核... 核桃黑斑病是危害核桃生产的重要细菌病害,造成树势衰弱,减产严重,甚至树体死亡。2008年在北京郊区栽植的幼树上发现疑似病害,且呈爆发之势。为确定其病原菌分类地位,用组织分离法分离核桃黑斑病菌,纯化培养后用针刺接种法回接到健康核桃树枝条和叶片上,14 d后叶片和枝条分别出现典型病斑,接种发病组织再分离所得病菌性状、16S rDNA与初分离的一致,完成柯赫氏法则验证;以分离的核桃黑斑病菌总DNA为模板,采用细菌16SrDNA的通用引物,通过PCR扩增到约1.5 kb的片段,克隆到pMD-18T载体。测序结果表明克隆的16S rDNA片段长为1 453个核苷酸,通过GenBank上BLAST分析,表明该病原细菌为Xanthomonas campestris。 展开更多
关键词 核桃黑腐病 细菌 致病变种
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落葵上发现短小杆菌属(Curtobacterium)一个新的致病变种 被引量:8
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作者 陈永芳 郭坚华 方中达 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第2期171-175,共5页
1994年在江苏省南京及镇江地区新发现了落葵细菌性叶斑病 ,从病斑所分离的 10个细菌菌株经柯赫氏法则验证 ,均确系该病的病原菌。采用形态观察、表型特征和生理生化特性测定、数值分析、血清学反应、细胞化学成分分析和 DNA G+C mol%测... 1994年在江苏省南京及镇江地区新发现了落葵细菌性叶斑病 ,从病斑所分离的 10个细菌菌株经柯赫氏法则验证 ,均确系该病的病原菌。采用形态观察、表型特征和生理生化特性测定、数值分析、血清学反应、细胞化学成分分析和 DNA G+C mol%测定进行了鉴定 ,并与植物病原棒形细菌 15个标准菌株进行了比较。该病原菌为革兰氏阳性细菌 ,不规则短杆状 ,有一根鞭毛 ,亚极生或侧生 ,结合其生理生化特性、细胞化学成分和 DNA G+C mol%测定结果 ,认为应属于短小杆菌属( Curtobacterium)的萎蔫短小杆菌 ( Cur.flaccumfaciens) ,数值分析也支持这一结论。此外 ,据血清学反应结果及其对短小杆菌属的其它植物寄主的致病情况 ,认为该病原菌应是萎蔫短小杆菌种下一个新的致病变种 ,定名为 Curtobacterium flaccumfaciens pv.basellae pv.nov.(萎蔫短小杆菌落葵致病变种 )。 展开更多
关键词 落葵 细菌性叶斑病 鉴定 萎蔫短小杆菌 致病变种
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引起糖甜菜细菌性叶斑病的萎蔫短小杆菌新致病变种 被引量:5
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作者 陈永芳 郭坚华 方中达 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期396-400,共5页
1995年在内蒙古临河市新发现了糖甜菜细菌性叶斑病 ,从病斑所分离的 10个细菌菌株经柯赫氏法则验证 ,均确系该病的病原菌。采用形态观察、表型特征和生理生化特性测定、数值分析、血清学反应、细胞化学成分分析、DNAG +Cmol%和DNA DNA... 1995年在内蒙古临河市新发现了糖甜菜细菌性叶斑病 ,从病斑所分离的 10个细菌菌株经柯赫氏法则验证 ,均确系该病的病原菌。采用形态观察、表型特征和生理生化特性测定、数值分析、血清学反应、细胞化学成分分析、DNAG +Cmol%和DNA DNA同源性测定进行了鉴定 ,并与植物病原棒形细菌 15个标准菌株进行了比较。该病原菌为革兰氏阳性细菌 ,不规则短杆状 ,有一根鞭毛、亚极生或侧生 ,结合其生理生化特性、细胞化学成分和DNAG +Cmol%和DNA DNA同源性测定结果 ,认为应属于短小杆菌属 (Curtobacterium)的萎蔫短小杆菌 (Cur.flaccumfaciens) ,数值分析也支持这一结论。此外 ,据血清学反应结果及其对短小杆菌属的其它植物寄主的致病情况 ,认为该病原菌应是萎蔫短小杆菌种下的一个新的致病变种 ,定名为Curtobacteriumflaccumfacienspv .beticolapv.nov.Chenetal.,2 0 0 0 (萎蔫短小杆菌糖甜菜致病变种 ) 展开更多
关键词 糖甜菜 细菌性叶斑病 萎蔫短小杆菌 致病变种 鉴定 菌株 致病性 细菌形态 培养特征 生理生化特性 血清学反应 细胞化学成分
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构树上一种新的丁香假单胞菌致病变种的研究 被引量:3
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作者 任欣正 黄琼 杨合同 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 1995年第2期179-183,共5页
构树细菌性疫病是一种荧光假单胞菌引起的新病害。主要症状有叶片角斑,嫩梢肿大和幼枝溃疡。从江苏一带分离获得的12个构树菌株和3个桑树对比菌株进行交互接种试验,发现构树菌株与桑树菌株之间不能交互侵染其寄主。细菌学特征和LOPAT试... 构树细菌性疫病是一种荧光假单胞菌引起的新病害。主要症状有叶片角斑,嫩梢肿大和幼枝溃疡。从江苏一带分离获得的12个构树菌株和3个桑树对比菌株进行交互接种试验,发现构树菌株与桑树菌株之间不能交互侵染其寄主。细菌学特征和LOPAT试验及其它37项生理生化和营养特性试验表明,两种菌的表型特征基本相似,仅在7种化合物的利用上存在差异。两种菌的血清学反应无相关性。细胞全蛋白SDS一聚丙烯酰胺凝胶电泳图谱也略有不同。试验结果证明,构树细菌性疫病细菌属于假单胞菌属(Pseudomonas),丁香假单胞菌(P.syringae)的一个新致病变种,定名为Pseudomonas syrzngae pv. broussonetiae pv. nov. 展开更多
关键词 构树 细菌性疫病 丁香假单细菌 致病变种
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丁香假单胞菌中六个致病变种的全细胞蛋白质电泳分析 被引量:2
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作者 黄琼 任欣正 《云南农业大学学报》 CAS CSCD 1996年第4期197-202,共6页
利用聚丙稀酰胺电泳技术首次对丁香假单胞菌中6个致病变种全细胞蛋白电泳,发现同一致病变种内菌株蛋白条带一致,不同致病变种之间存在差异。以往对丁香假单胞菌中致病变种的鉴定方法主要是根据致病性的差异,结合营养筛选和血清学方... 利用聚丙稀酰胺电泳技术首次对丁香假单胞菌中6个致病变种全细胞蛋白电泳,发现同一致病变种内菌株蛋白条带一致,不同致病变种之间存在差异。以往对丁香假单胞菌中致病变种的鉴定方法主要是根据致病性的差异,结合营养筛选和血清学方法来进行。对丁香假单胞菌的6个致病变种的全细胞蛋白分析表明:全细胞蛋白质电泳能成功地鉴定到致病变种。 展开更多
关键词 丁香假单胞菌 致病变种 蛋白质
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大肠杆菌全局调控蛋白CsrA中抑制十字花科黑腐病菌胞外蛋白酶活性所必需的氨基酸残基的鉴定
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作者 唐东阶 钟婉莹 +2 位作者 秦春铃 唐纪良 晁耐霞 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期440-448,共9页
CsrA/RsmA蛋白家族是细菌中一类重要的转录后全局调控因子,它们调控细菌的碳代谢、次生代谢、运动、生物被膜形成以及致病等过程。CsrA/RsmA蛋白家族通常由60~72个氨基酸基组成,其中第1至第52位氨基酸高度保守,而第53位以后的氨... CsrA/RsmA蛋白家族是细菌中一类重要的转录后全局调控因子,它们调控细菌的碳代谢、次生代谢、运动、生物被膜形成以及致病等过程。CsrA/RsmA蛋白家族通常由60~72个氨基酸基组成,其中第1至第52位氨基酸高度保守,而第53位以后的氨基酸则高度可变。目前人们认为其氨基酸高度保守性是不同种属细菌CsrA/RsmA功能和作用机理相似的基础,但是其高度可变区与不同种属CsrA/RsmA蛋白功能差异的关系尚不清楚。我们之前的研究显示,大肠杆菌(Escherichiacoli)的CsrA(CsrAE删)蛋白的高度可变区(第53至第61位氨基酸残基)具有强烈的抑制十字花科黑腐病菌(XanthomonztscampeStr/spathovarcampestris,简称‰c)胞外蛋白酶活性的能力。本研究中,我们采用丙氨酸置换方法,确定了CsrA。蒯可变区中抑制xcc胞外蛋白酶活性必需的氨基酸残基。结果显示,CsrAE枷蛋白的第54位赖氨酸(K54)、第60位丝氨酸(S60)和第61位酪氨酸(Y61)置换成丙氨酸后,csrA‰。蛋白丧失了抑制Xcc胞外蛋白酶活性的能力;而其它位点的丙氨酸置换不影响其抑制Xcc胞外蛋白酶活性的能力。这个结果证明K54、S60和Y61是CsrAE.coli抑制Xcc胞外蛋白酶活性所必需的,为揭示大肠杆菌的CsrA。融蛋白抑制Xcc胞外蛋白酶活性的分子机理奠定基础。 展开更多
关键词 十字花科黒腐病菌 胞外蛋白酶 大肠杆菌 CsrA 丙氨酸置换
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大肠杆菌转录后调控蛋白CsrA的C末端具有抑制十字花科黑腐病菌胞外蛋白酶活性的功能 被引量:3
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作者 黄明慧 陈承晓 +3 位作者 覃振萍 唐纪良 唐东阶 晁耐霞 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期341-348,共8页
CsrA(在有些细菌例如十字花科黒腐病菌中也称为RsmA,统称CsrA/RsmA)是一类在细菌中广泛分布而且氨基酸序列非常保守的RNA结合蛋白。研究表明,CsrA/RsmA作为转录后全局调控因子参与了包括细胞碳代谢、次生代谢、运动性、生物被膜形成以... CsrA(在有些细菌例如十字花科黒腐病菌中也称为RsmA,统称CsrA/RsmA)是一类在细菌中广泛分布而且氨基酸序列非常保守的RNA结合蛋白。研究表明,CsrA/RsmA作为转录后全局调控因子参与了包括细胞碳代谢、次生代谢、运动性、生物被膜形成以及动植物病原菌的致病过程等许多细胞过程的调控。CsrA/RsmA在不同的细菌中的生物学功能各有异同。在大肠杆菌中,CsrA的主要功能是控制细胞的碳代谢、运动性和生物被膜形成;而在十字花科黑腐病菌(Xanthomonas campestris pathovar campestris,Xcc)中,CsrA的同源蛋白RsmA的主要功能除了控制碳代谢、运动性和生物被膜形成外,还控制致病性和胞外酶的产生。大肠杆菌的CsrA(CsrAE.coli)是否具有XccRsmA(RsmAXcc)的功能?为了回答这个问题,我们用大肠杆菌的csrA基因(csrAE.coli)互补Xcc的rsmA基因(rsmAXcc)的缺失突变体DM2506。结果显示,csrAE.coli能够互补DM2506的所有表型,说明CsrAE.coli具有RsmAXcc的全部功能。更重要的是,我们发现,无论是rsmAXcc突变体还是野生型菌株,导入表达CsrAE.coli的质粒后均导致其致胞外蛋白酶活性的严重下降,证明CsrAE.coli具有抑制Xcc胞外蛋白酶活性的作用。进一步的实验证实,CsrAE.coli的C末端第53~61位氨基酸残基具有抑制Xcc胞外蛋白酶活性的功能。 展开更多
关键词 十字花科黑腐病菌Xcc 大肠杆菌 转录后调控蛋白CsrA 胞外蛋白酶
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3种接种方法对十字花科黑腐病菌Xcc8004菌株在拟南芥Col-0上致病力的影响 被引量:1
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作者 梅雄 李振江 +2 位作者 张慧 唐纪良 唐东阶 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期365-370,共6页
十字花科黑腐病菌(Xanthomonas campestris pathovar campestris,Xcc)是引起十字花科植物黑腐病的病原菌,也是研究寄主与病原微生物相互作用分子机理的模式菌之一。Xcc可以感染白菜、萝卜和甘蓝等十字花科农作物,也可以感染重要的模式... 十字花科黑腐病菌(Xanthomonas campestris pathovar campestris,Xcc)是引起十字花科植物黑腐病的病原菌,也是研究寄主与病原微生物相互作用分子机理的模式菌之一。Xcc可以感染白菜、萝卜和甘蓝等十字花科农作物,也可以感染重要的模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)。由于拟南芥的全基因组测序已经完成,因此,拟南芥是研究寄主植物对Xcc浸染的防卫反应的分子机理的最理想的寄主材料。但是,到现在为止,一套完善的在拟南芥上进行Xcc致病检测的实验系统还没有建立。为此,本研究比较了"叶片压渗法"、"剪叶法"和"叶片中脉穿刺法"这3种常用的病原细菌接种方法对Xcc的实验室菌株8004(以下简称Xcc8004)在哥伦比亚生态型拟南芥(A.thanliana ecoype Colombia0,Col-0)上的致病力的影响。结果发现,在拟南芥Col-0叶片上用"叶片压渗法"接种Xcc8004可以引起明显致病症状,而用"剪叶法"和"叶片中脉穿刺法"接种均不能引起病症。这一结果说明,不同的接种方法的对Xcc在拟南芥上的致病力有很大的影响。因此,要在拟南芥Col-0上进行Xcc8004的致病力检测,本研究建议采用"叶片压渗法"而不用"剪叶法"和"叶片中脉穿刺法"。此外,本研究还建立了一套简易的拟南芥试验用苗的栽培方法。 展开更多
关键词 十字花科黑腐病菌Xcc 拟南芥 致病检测 叶片压渗法 剪叶法 叶片中脉穿刺法
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水稻细菌性条斑病菌的相关研究 被引量:2
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作者 温志杰 《大众科技》 2013年第7期130-131,134,共3页
水稻细菌性条斑病菌(Xanthomonas oryzae pathovar oryzicola,简称Xoc),它是使水稻致病的主要病原菌之一,其引发的水稻细菌性条斑病目前还没有有效的方法控制。文章主要介绍了水稻细菌性条斑病的病原菌、致病机理、研究方法以及防治措施。
关键词 水稻细菌性条斑病 病原菌 致病机理 防治措施
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唐菖蒲伯克霍尔德菌椰毒致病变种污染调查及其生长与产毒特性分析
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作者 李兵 叶青华 +4 位作者 赵美平 陈维 黄乙卿 吴清平 张菊梅 《现代食品科技》 CAS 北大核心 2022年第10期283-289,共7页
唐菖蒲伯克霍尔德菌椰毒致病种(Burkholderia gladioli pathovar cocovenenans,BGC)是迄今我国发现的发病率和死亡率最高的食源性致病菌。为调查广州市市售湿米面制品、银耳及木耳中BGC的污染状况,同时掌握在不同培养条件下BGC的生长与... 唐菖蒲伯克霍尔德菌椰毒致病种(Burkholderia gladioli pathovar cocovenenans,BGC)是迄今我国发现的发病率和死亡率最高的食源性致病菌。为调查广州市市售湿米面制品、银耳及木耳中BGC的污染状况,同时掌握在不同培养条件下BGC的生长与产毒规律,依据GB 4789.29-2020对100份食品样品进行定性分析;通过测定BGC菌株在各培养条件下菌液的OD600值和毒素含量,分析了不同的温度、时间、pH及NaCl浓度下BGC的生长状况与产毒能力。结果表明,100份食品样品中共检出1份(湿木耳)BGC阳性样品,污染率为1%(1/100);BGC的生长与产毒受培养基的影响较大,碱性(pH值为9.5~10.5)与一定渗透压(NaCl质量浓度为0.02~0.04 g/mL)环境下,BGC在马铃薯葡萄糖水中能生长,而在脑心浸液肉汤中几乎不生长,BGC在马铃薯半固体琼脂中的产毒量(231.24μg/mL)远大于BHI半固体琼脂和LB半固体琼脂;BGC适宜生长和产毒的温度为20~37℃、适宜pH值为4~8.5,其中最适生长温度与pH值分别为37℃、6.0,最佳产毒温度与pH值为30℃、7.0;BGC在低温(4~15℃)下仍能存活,且有少量的毒素产生(2.11μg/mL);当NaCl质量浓度为0.005 g/mL时,产毒量从未添加前的139.80降至52.27μg/mL,达到0.04 g/mL时,产毒为0。结果提示,广州市市售木耳中存在BGC污染的风险,在食品加工或贮存过程中添加一定浓度的NaCl可减少由BGC引起的食物中毒。 展开更多
关键词 唐菖蒲伯克霍尔德菌椰毒致病变种 污染调查 生长特性 产毒能力
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Genetic diversity of Harpins from Xanthomonas oryzae and their activity to induce hypersensitive response and disease resistance in tobacco 被引量:15
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作者 LI Ping, LU Xuzhong, SHAO Min, LONG Juying & WANG Jinsheng Department of Plant Pathology, Nanjing Agricultural University Key Laboratory of Monitoring and Management of Plant Disease and Pests, Ministry of Agriculture, Nanjing 210095, China 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 2004年第5期461-469,共9页
Three hrfA (hypersensitive response-functioning faction A) homologues (hrf1, hrf2 and hrf3) are cloned from 12 strains of Xanthomonas oryzae using PCR based techniques. Hrf1, hrf2 and hrf3 are derived from strains bel... Three hrfA (hypersensitive response-functioning faction A) homologues (hrf1, hrf2 and hrf3) are cloned from 12 strains of Xanthomonas oryzae using PCR based techniques. Hrf1, hrf2 and hrf3 are derived from strains belonging to X. o. pv. oryzae, X. o. pv. oryzicola and X. o. pv. oryzae respectively. Sequence analysis shows that all three genes encode glycine-rich pro-teins with various numbers of GGG-GG motifs. They all share a conserved cysteine residue at position 45 or 47. Hrf1 and hrf3 encode HarpinXoo while hrf2 encodes Harpinxooc. Hrf1 and hrf3 encodes two different types of HarpinXoo proteins. Hrf1 from X. o. pv. oryzae strains ( JxoIII, JxoIV, Jxov, Pxo61, Pxo76, Pxo79, Pxo99, Pxo99 and Pxo124) encodes a 15.6 kD HarpinXoo with 3 GGG-GG motifs while Hrf3 from strain Pxo86 and Pxo112 encodes a 15.9 kD Harpinxoo with 4 GGG-GG motifs. Harpinxooc encoded by hrf2 from X. o. pv. oryzicola (strain RS105) has the mo-lecular weight of 15.3 kD and contains 2 GGG-GG motifs. Cluster analysis is performed using deduced sequences of hrf1, hrf2 and hrf3 as well as previously reported Hpa1 and XopI protein sequence. The results indicated that Harpinxoo and Harpinxooc belong to two closely related sub-groups. Hrf, hrf2 and hrf3 are expressed in E. coli strain BL21 successfully. Under the same condition, hrf1, hrf2 and hrf3 are expressed at the level of 0.389, 0.530 and 0.083 mg/mL re-spectively. All expressed hrf1, hrf2 and hrf3 proteins (Harpins) are shown to be able to induce hypersensitive reaction and TMV resistance on tobacco. Among the three proteins, Hrf2 has the highest activity while Hrf3 has the lowest activity. 展开更多
关键词 pathovars of XANTHOMONAS oryzae harpins hrfA hpal hypersensitive reaction induced resistance.
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十字花科黑腐病菌pilY基因与涌动有关
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作者 李晓霞 唐东阶 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期1017-1024,共8页
细胞的运动在细菌的趋化、粘附、生物膜形成以及致病等过程中发挥关键作用。细菌的运动方式主要有三种:游动(Swimming motility)、涌动(Swarming motility)和颤动(Twitching motility)。游动和涌动由鞭毛介导,而颤动由Ⅳ型纤毛介导。全... 细胞的运动在细菌的趋化、粘附、生物膜形成以及致病等过程中发挥关键作用。细菌的运动方式主要有三种:游动(Swimming motility)、涌动(Swarming motility)和颤动(Twitching motility)。游动和涌动由鞭毛介导,而颤动由Ⅳ型纤毛介导。全基因组测序结果显示,十字花科黑腐病菌(Xanthomonas campestris pv.campestris,Xcc)存在一套完整的合成Ⅳ型纤毛的基因,而且能够产生Ⅳ型纤毛;但有证据表明Xcc不能进行颤动。在实验室之前的研究中发现,Ⅳ型纤毛基因pilH和pilG与Xcc的游动和涌动有关。在本研究中,通过缺失突变体和互补菌的构建,以及表型分析策略,对Ⅳ型纤毛基因pilY进行了生物学功能鉴定。结果发现,pilY缺失突变体的涌动能力比野生型菌株显著增强,而互补菌株的涌动能力与野生型的相似,证明pilY基因具有抑制Xcc涌动的功能。此外,本研究还发现pilY缺失不影响Xcc的生长繁殖、致病力以及致病因子的产生。 展开更多
关键词 十字花科黑腐病菌 Ⅳ型纤毛 pilY 涌动
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十字花科黑腐病菌hrp基因致病功能分析 被引量:1
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作者 曾献莹 李婉莲 +5 位作者 杨丽超 蒋国凤 王凛 甘永亮 阳丽艳 姜伯乐 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期606-618,共13页
通过对Xcc 8004菌株的hrp基因进行逐一敲除,系统研究单个hrp基因对Xcc致病性的贡献。结果表明,9个hrc(hypersensitive response and conserved)基因单独突变后在满身红萝卜上的致病性和在辣椒ECW-10R上激发HR的能力完全丧失;9个hrp基因... 通过对Xcc 8004菌株的hrp基因进行逐一敲除,系统研究单个hrp基因对Xcc致病性的贡献。结果表明,9个hrc(hypersensitive response and conserved)基因单独突变后在满身红萝卜上的致病性和在辣椒ECW-10R上激发HR的能力完全丧失;9个hrp基因中,hrpW突变后在辣椒ECW-10R上仍能产生HR,满身红萝卜上致病性减弱,其余hrp基因突变后致病性和过敏反应均丧失;4个hpa(hrp associated protein)基因突变后,hpaA和hpaB突变体完全丧失在满身红萝卜上的毒性也不能在辣椒ECW-10R上引起HR,hpa1和hpaP突变后致病性和HR显著减弱。另外,通过RT-PCR对Xcc 8004 hrp基因簇的每个基因受hrpX和hrpG的调控情况进行分析,结果表明所有hrp基因在不同程度上都受到hrpG、hrpX的正向调控。 展开更多
关键词 十字花科黑腐病菌 HRP基因 致病性 HR反应
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十字花科黑腐病菌中一个与抗逆有关的小RNA的鉴定 被引量:1
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作者 张建玲 赖洁玲 +1 位作者 何媛平 唐东阶 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期614-620,共7页
十字花科黑腐病菌(Xanthomonas campestris pathovar campestris,Xcc),是引起十字花科植物黑腐病的病原菌。Xcc要经历寄生、腐生等多种环境变化,为适应这些环境变化,需要调控相应基因的表达。除蛋白外,小RNA在基因表达调控中也起到关键... 十字花科黑腐病菌(Xanthomonas campestris pathovar campestris,Xcc),是引起十字花科植物黑腐病的病原菌。Xcc要经历寄生、腐生等多种环境变化,为适应这些环境变化,需要调控相应基因的表达。除蛋白外,小RNA在基因表达调控中也起到关键作用。本实验室前期实验从Xcc 8004中鉴定出数百个小RNA,但是绝大多数小RNA的功能仍然未知。本研究通过构建一个小RNA(sRNA3843)的过量表达株来研究其生物学功能。确定该小RNA过量表达后,对其过量表达株OE3843进行了一系列的表型检测。结果发现,s RNA3843过量表达株OE3843对金属离子Cu^2+、Zn^2+、Cd^2+及蛋白变性剂SDS的耐受能力明显下降,表明s RNA3843与Xcc的抗逆有关。本研究的实验结果为深入研究小RNA在Xcc抗逆中所起的作用及其作用机理打下基础。 展开更多
关键词 十字花科黑腐病菌 小RNA 过量表达 抗逆作用
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十字花科黑腐病菌中存在tRNA衍生片段(tRF)的证据
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作者 刘金阳 黄小英 +1 位作者 陈妍妙 唐东阶 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期264-269,共6页
tRNA衍生片段(tRNA-derived fragment, tRF)是一种由内切核糖核酸酶将初级tRNA (primary tRNA)或成熟tRNA分子剪切后形成的长度为14~30 nt (核苷酸)的稳定的RNA片段。研究表明,tRF广泛存在于各种真核生物中,它们既可以作为信号分子,又... tRNA衍生片段(tRNA-derived fragment, tRF)是一种由内切核糖核酸酶将初级tRNA (primary tRNA)或成熟tRNA分子剪切后形成的长度为14~30 nt (核苷酸)的稳定的RNA片段。研究表明,tRF广泛存在于各种真核生物中,它们既可以作为信号分子,又可以作为基因表达的调控因子,在细胞的各种生理过程中发挥重要的调控作用。但至今除了在大肠杆菌(Escherichia coli)和沃氏富盐菌(Haloferax volcanii)中发现了tRF外,在其他原核生物中未见有关tRF的报道。本研究采用高灵敏度的Northern杂交技术对十字花科黑腐病菌(Xanthomonas campestris pv. campestris, Xcc)的苏氨酸-tRNA (threonine-tRNA, tRNAThr)和甲硫氨-tRNA (methionine-tRNA, tRNAMet)进行了检测。结果显示,除了检测到全长的成熟tRNAThr和tRNAMet外,还检测到多个丰度各异的稳定的tRF,而且一些tRF的产生受营养胁迫的诱导。此外,我们还发现,编码tRNAMet的基因XC4381已经退化为非编码RNA基因。本研究证明了tRF在Xcc中的存在,为深入研究tRF的功能,特别是在Xcc致病中的作用奠定了基础。 展开更多
关键词 十字花科黑腐病菌 tRNA衍生片段 高灵敏度Northern杂交 tRNA基因退化
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