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沙丘芦苇胸腺嘧啶二磷酸葡萄糖脱水酶的序列分析与结构预测
1
作者
邢家强
浦铜良
《生物技术通讯》
CAS
2007年第5期731-734,共4页
目的:用生物信息学方法对沙丘芦苇胸腺嘧啶二磷酸葡萄糖脱水酶(PcTGD)的序列进行分析与结构预测,为后续研究提供参考。方法:以GOR法预测了PcTGD的二级结构,以ProtScale分析它的疏水性,最终通过现有的序列同源性比较,用MODELLER预测了Pc...
目的:用生物信息学方法对沙丘芦苇胸腺嘧啶二磷酸葡萄糖脱水酶(PcTGD)的序列进行分析与结构预测,为后续研究提供参考。方法:以GOR法预测了PcTGD的二级结构,以ProtScale分析它的疏水性,最终通过现有的序列同源性比较,用MODELLER预测了PcTGD的三维结构。结果:PcTGD具有高度保守的活性中心Tyr***Lys和N末端的Gly*Gly**Gly的高度保守结构。结论:PcTGD属于一个短链脱氢酶/还原酶家族。
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关键词
疏水性
短链脱氢酶/还原酶
二级结构
沙丘芦苇胸腺嘧啶二磷酸葡萄糖脱水酶
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题名
沙丘芦苇胸腺嘧啶二磷酸葡萄糖脱水酶的序列分析与结构预测
1
作者
邢家强
浦铜良
机构
兰州大学生命科学学院
出处
《生物技术通讯》
CAS
2007年第5期731-734,共4页
基金
国家自然科学基金项目(30470163)
文摘
目的:用生物信息学方法对沙丘芦苇胸腺嘧啶二磷酸葡萄糖脱水酶(PcTGD)的序列进行分析与结构预测,为后续研究提供参考。方法:以GOR法预测了PcTGD的二级结构,以ProtScale分析它的疏水性,最终通过现有的序列同源性比较,用MODELLER预测了PcTGD的三维结构。结果:PcTGD具有高度保守的活性中心Tyr***Lys和N末端的Gly*Gly**Gly的高度保守结构。结论:PcTGD属于一个短链脱氢酶/还原酶家族。
关键词
疏水性
短链脱氢酶/还原酶
二级结构
沙丘芦苇胸腺嘧啶二磷酸葡萄糖脱水酶
Keywords
hydrophobicity
short-chain dehydrogenase/reductase
secondary structure
phragrnites communis dtdp-d- glucose dehydratase
分类号
Q811.4 [生物学—生物工程]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
沙丘芦苇胸腺嘧啶二磷酸葡萄糖脱水酶的序列分析与结构预测
邢家强
浦铜良
《生物技术通讯》
CAS
2007
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