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题名植物Ⅲ型聚酮合酶基因家族的分子进化分析
被引量:2
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作者
王波
孙君社
翟玉盼
孙立伟
张秀清
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机构
中国农业大学食品科学与营养工程学院
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出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第1期83-89,94,共8页
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基金
中央高校基本科研业务费专项资金项目(2010JS083)
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文摘
Ⅲ型聚酮合酶(type Ⅲ polyketide synthase,PKSⅢ)广泛存在于细菌、真菌和植物中,目前数据库中已积累了大量的序列资料。为了进一步了解植物Ⅲ型聚酮合酶基因家族的分子进化,以及其作为系统进化研究材料的可能性,选取了75条来自不同植物物种包括苔藓类植物、蕨类植物、裸子植物、单子叶植物和双子叶植物的PKSⅢ蛋白序列,用CLUSTAL X软件对其氨基酸序列进行了比对,并用邻位相接法构建了系统进化树。结果表明,尽管不同来源的PKSⅢ序列表现了很大的差异,但保守结构域CHS-like所包含的主要功能位点半胱氨酸(Cys184)、苯丙氨酸残基(Phe236和Phe286)、组氨酸残基(His335)、天冬酰氨残基(Asn369)在各植物物种中具有很好的保守性;同时发现,在植物PKSⅢ序列中多数的Cys位点均具有较好的保守性,而且蕨类植物PKSⅢ和单子叶植物PKSⅢ在Cys保守位点有很好的相似性;进一步构建分子进化树表明,PKSⅢ基因基本上首先根据功能而聚类,明显地划分为CHSs和non-CHSs两类,其次按照不同的植物物种聚类。
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关键词
植物ⅲ型聚酮合酶
序列比对
分子进化
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Keywords
plant-specific type ⅲ pks Sequence alignments Molecular evolution
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分类号
Q943
[生物学—植物学]
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题名查尔酮合酶蛋白表达技术、结构、活性和进化
被引量:5
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作者
陈俊毅
柴友荣
姚永宏
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机构
西南大学农学与生物科技学院
重庆市农业科学院
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出处
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2012年第1期328-336,共9页
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基金
重庆市科技攻关项目(CSTC 2009AB1030)
国家“863”计划(2006AA10Z110)
西南大学农生院本科生创新性研究项目共同资助
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文摘
查尔酮合酶(CHS)是类黄酮途径的首步关键酶,参与合成所有类黄酮和异黄酮物质,参与决定多种植物重要性状。NCBI已有2917条CHS序列登录和释放。单个物种基因组中的CHS普遍由基因家族编码,通过基因加倍而产生。CHS蛋白的表达技术目前均是基于大肠杆菌的原核表达,多采用Novagen公司的pET载体系统,最通行参数为37℃条件下1 mmol/L IPTG诱导3h,表达蛋白普遍采用His-Tag进行亲和纯化,采用质谱或免疫分析技术进行身份检测,通过对生化反应底物和产物的HPLC检测可以精确分析酶活。苜蓿等植物的CHS蛋白已完成X射线晶体衍射研究,获得了三维结构和活性位点构象的初步解析,并与植物Ⅲ型PKS超家族中的其它酶类进行了比较。CHS蛋白的催化活性中心含有一个Cys-His-Asn三联体,另外CoA结合通道和内部的起始/延伸/环化腔关系到CHS蛋白的底物特异性及聚酮化合物链延伸的长度。植物Ⅲ型PKS超家族中,其它酶的结构骨架和催化方式与CHS相似,但活性位点残基的变化可能会造成活性中心结构的改变,进而产生底物特异性、催化能力和产物种类的显著变化,是蛋白水平进化的根本动力。
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关键词
查尔酮合酶(CHS)
植物ⅲ型pks超家族
原核表达
结构
活性
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Keywords
Chalcone synthase(CHS)
plant type ⅲ pks superfamily
Prokaryotic expression
Structure
Activity
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分类号
Q943.2
[生物学—植物学]
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