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Nucleotide Sequence of Polyhedrin Gene of LsNPV and Analysis of Baculovirus Polyhedron Proteins
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作者 Wang Jiawang Qi Yipeng +1 位作者 Deng Yanhui Mallam Nock Joshua 《Wuhan University Journal of Natural Sciences》 CAS 1996年第2期272-278,共7页
The intact 741 hp polyhedrin gene of LsNPV was sequenced by Silver Sequencing System, and shares 90.6% and 97.0% nucleotide identity, 97.2% and 97. 6% amino acid identity with PfNPV and MdNPV polh genes respectively.... The intact 741 hp polyhedrin gene of LsNPV was sequenced by Silver Sequencing System, and shares 90.6% and 97.0% nucleotide identity, 97.2% and 97. 6% amino acid identity with PfNPV and MdNPV polh genes respectively. The 14 hp conservative sequence with the core element GTAAG,is located in the 5'untranslated region of the gene. The polh gene was predicted to encodes a 246 amino sold residures with molecular weight of 29.0 kd, in which the number of acidic amino acids and alkaline amino acids was roughly equal resulting in almost no charges in polyhedrin protein molecule and hence occlusion body. It gives a valuable implication that ionic bonds as well as hydrophobic bonds and hydrogen bond may Play an important role in the crystallization or polyhedrin, by comparing amino acid variation of twenty-one polyhedrin. The comparison of promoter regions of polyhedrin gene and class Ⅲ gene shown that they are very similar, but also have differences in GC content.This could explain that both categories of gene are highly expressed, and polyhedrin genes are expressed more higher than class Ⅲ gene. 展开更多
关键词 LsNPV BACULOVIRUS polyhedrin gene SEQUENCE HOMOLOGY
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EoNPV的限制性酶切图谱及polyhedrin基因和egt基因的定位 被引量:1
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作者 张传溪 孙建新 +2 位作者 王根 胡萃 吴祥甫 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 1998年第1期55-59,共5页
用8种限制性内切酶酶解茶尺蠖Ectropisobliqua核型多角体病毒(EoNPV)基因组DNA,获得大于0.88kb的片段数分别为7、38、19、17、16、9、32和14.由此统计,基因组平均大小大于118.5... 用8种限制性内切酶酶解茶尺蠖Ectropisobliqua核型多角体病毒(EoNPV)基因组DNA,获得大于0.88kb的片段数分别为7、38、19、17、16、9、32和14.由此统计,基因组平均大小大于118.5kb,即Mr约大于78.6×106.用BmNPV的多角体蛋白(ph)基因和AcMNPV的egt基因为探针,应用Southern杂交方法,将EoNPV的ph基因定位于BamHIA、ClaID、EcoRIM、EcoRVL、HindⅢF、PstIA、SalIH和XhoIB片段上,将egt基因定位于BamHIA、ClaIl、EcoRIK、EcoRVA、HindⅢH、PstIA、SalIB、XhoII片段上.通过克隆和酶切鉴定EcoRIM和EcoRVL片段,测定ph基因部分序列,并以EcoRIM为探针对基因组酶切印迹进行杂交,制作了EoNPVph基因和egt基因区的酶切图谱,推定egt基因保守区位于ph基因上游约4.55kb处. 展开更多
关键词 茶尺蠖 核型多角体病毒 酶切图谱 基因定位
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哺乳动物细胞POLK、POLH、POLI基因对甲基硝基亚硝基胍的应答反应及其启动子区转录因子结合部位的生物信息学分析 被引量:2
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作者 蒋余圣 钱羽力 余应年 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第7期1249-1255,共7页
目的:观察甲基硝基亚硝基胍(MNNG)对培养细胞DNA聚合酶κ、η、ι编码基因表达的影响并用生物信息学方法预测它们的启动子区和启动子区中的转录因子结合部位。方法:利用半定量RT-PCR观察POLK、POLH、POLI基因表达改变。利用在线生物信... 目的:观察甲基硝基亚硝基胍(MNNG)对培养细胞DNA聚合酶κ、η、ι编码基因表达的影响并用生物信息学方法预测它们的启动子区和启动子区中的转录因子结合部位。方法:利用半定量RT-PCR观察POLK、POLH、POLI基因表达改变。利用在线生物信息学软件,确定它们的启动子区,然后,用转录因子预测软件并结合进化足迹法检出包括启动子区在内的3000bp碱基上游序列中的转录因子结合部位。结果:0.2μmol·L-1MNNG导致细胞POLH和POLI表达水平在处理后6-24h间逐渐上升,升高约1倍;而POLK则呈下降;通过转录因子预测软件分析,在POLK、H和I启动子区分别检出了384个、413个和689个推断的转录因子结合部位;通过进化足迹法分析有效地降低了假阳性率,推断的转录因子结合部位分别下降到158个、80个和40个。结论:低浓度MNNG导致POLH、POLI表达水平升高,而POLK表达水平降低;通过在线软件,我们成功地在POLK,POLH,POLI启动子区分别检出。158、80和40个推断的转录因子结合部位;进化足迹法分析能够有效降低预测软件的假阳性率。 展开更多
关键词 DNA聚合酶类 转录因子结合部位 基因 POLK 基因 polh 基因 POLI 甲硝基亚硝胍
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Expression of Green Fluorescent Protein Gene with Baculovirus Vectorin Insect Cells
4
作者 Hu Jianhong Zhu Fanxiu +1 位作者 Qi Yipeng Huang Yongxiu 《Wuhan University Journal of Natural Sciences》 CAS 1997年第1期117-121,共5页
The green fluorescence of bioluminescent jellyfish Aequorea victoria is due to the presence of the green fluorescent protein (GFP). To examine whether the GFP gene can be applied as a reporter gene in insect cells... The green fluorescence of bioluminescent jellyfish Aequorea victoria is due to the presence of the green fluorescent protein (GFP). To examine whether the GFP gene can be applied as a reporter gene in insect cells, a baculovirus transfer vector containing the neomycin resistance gene (neo) was established. The GFP gene was subcloned into the vector downstream of the polyhedrin gene (ocu) promoter. In the presence of G418, the recombinant virus can be purified. Expression of the GFP gene in the recombinant virus should give rise to synthesis of the GFP with a molecular weight of 30×10 3 dalton, and is observable by the strong green light irradiated by ultraviolet or blue light in viable intact insect cells. The GFP produced in insect cells has typical fluorescent spectra indistinguishable from those of the purified native GFP. The GFP gene as a good reporter gene can be applied to the baculovirus insect cell expression system. 展开更多
关键词 green fluorescent protein(GFP) BACULOVIRUS transfer vector insect cells polyhedrin gene neomycin resistance gene
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日本三株斜纹夜蛾核型多角体病毒的增殖特性及其多角体蛋白基因的序列分析 被引量:15
5
作者 朱江 沈颂东 +4 位作者 王文兵 朱玉芳 池田素子 胡兆丽 盛晔 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期543-550,共8页
利用斜纹夜蛾Spodopteralitura培养细胞 ,对近年来在日本本州、九州和四国等地发现并筛选出的对斜纹夜蛾幼虫具有强烈杀虫活性的 3株斜纹夜蛾核型多角体病毒 (SpltMNPV) (K 3、G1 2和G10 3)进行了生物学活性和分子生物学的初步研究 ,... 利用斜纹夜蛾Spodopteralitura培养细胞 ,对近年来在日本本州、九州和四国等地发现并筛选出的对斜纹夜蛾幼虫具有强烈杀虫活性的 3株斜纹夜蛾核型多角体病毒 (SpltMNPV) (K 3、G1 2和G10 3)进行了生物学活性和分子生物学的初步研究 ,克隆了多角体蛋白基因 ,并进行了序列分析和比较。结果表明 :(1)SpltMNPV日本分离株K 3、G1 2和G10 3分别具有不同的特征性酶切图谱 ,分别属于 3种基因型 (A型、B型和C型 ) ;(2 ) 3个分离株的芽生型病毒 (buddedvirus)产生能力和多角体产生能力有差异 ,免疫印迹分析表明 ,多角体蛋白的分子量也不同 ;(3)日本株SpltMNPV核型多角体蛋白结构基因由 74 7个核苷酸编码序列 (编码 2 4 9个氨基酸 )组成 ,其序列与中国株SpltMNPV的同源性为 98 9% ,与其他 6种核型多角体病毒有较高的同源性 (6 1 7%~ 74 2 % ) ,但其 5′端侧翼序列 (nt_1~_10 0 )与AcMNPV和BmNPV相比差异显著 ,在对该基因表达调控起决定性作用的 8个高度保守核苷酸序列中 (nt_4 4~_5 1)有 2处发生自然突变。 展开更多
关键词 斜纹夜蛾 核型多角体病毒 多角体蛋白 基因 序列分析 增殖
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从云南蚕区分离BmCPV病毒株的全基因组克隆与系统发育分析 被引量:1
6
作者 张永红 唐芬芬 +2 位作者 邵榆岚 朱峰 白兴荣 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期1036-1043,共8页
家蚕质型多角体病毒(BmCPV)是家蚕中肠型脓病的病原物。从云南蚕区的病蚕样品中分离到一株BmCPV病毒分离株,提取纯化该病毒粒子的总RNA并合成cDNA,克隆病毒全基因组序列,研究该病毒分离株的基因组结构与系统进化。克隆得到该病毒10条d... 家蚕质型多角体病毒(BmCPV)是家蚕中肠型脓病的病原物。从云南蚕区的病蚕样品中分离到一株BmCPV病毒分离株,提取纯化该病毒粒子的总RNA并合成cDNA,克隆病毒全基因组序列,研究该病毒分离株的基因组结构与系统进化。克隆得到该病毒10条dsRNA序列(S1~S10)并提交至NCBI数据库中。序列分析表明该病毒基因组序列全长24810bp,S1~S10片段序列都具有完整的ORF。BLAST比对发现克隆的该病毒基因组各片段编码区序列与已报道的1型BmCPV片段的相似度达88%以上,氨基酸序列相似度达90%以上;10条dsRNA基因组片段末端均有保守帽子结构5'-AGUAA……GUUAGCC-3'。基于S2片段RdRp基因的系统进化分析发现,该病毒与其他3个1型BmCPV分离株BmCPV1-Suzhou、BmCPV1-China、BmCPV1-Ⅰ聚为一支,基于S10片段polh基因的系统进化分析也表明该病毒为1型BmCPV新的分离株系。根据上述研究结果将该病毒定名为BmCPV1-Yunnan。 展开更多
关键词 家蚕质型多角体病毒 分离株 基因组片段 系统进化 RNA聚合酶基因 多角体蛋白基因
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松毛虫质型多角体病毒RT-PCR检测技术的建立 被引量:5
7
作者 赵同海 张永安 +1 位作者 王玉珠 陈昌洁 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2001年第3期78-82,共5页
为研究DsCPV在松毛虫种群中的垂直传递及对松毛虫灾害的持续控制作用 ,通过反转录聚合酶链式反应 (RT PCR)建立了DsCPV的早期检测技术。依据家蚕质型多角体病毒 (BmCPV)质型多角体蛋白的核苷酸序列设计一对引物 ,从纯化的DsCPV、BmCPV... 为研究DsCPV在松毛虫种群中的垂直传递及对松毛虫灾害的持续控制作用 ,通过反转录聚合酶链式反应 (RT PCR)建立了DsCPV的早期检测技术。依据家蚕质型多角体病毒 (BmCPV)质型多角体蛋白的核苷酸序列设计一对引物 ,从纯化的DsCPV、BmCPV和舞毒蛾质型多角体病毒 (LdCPV)的基因组dsRNA可成功地扩增出长 6 14bp的目的片段 ,从提取的健康松毛虫幼虫肠组织的DNA、舞毒蛾核型多角体病毒 (LdNPV)基因组核酸、以及棉铃虫质型多角体病毒 (HaCPV)基因组核酸 ,未能扩增出目的片段。DsCPV基因组dsRNA扩增片段的序列与BmCPV相应基因序列具有 87%的同源性 ,检测敏感度为 1pg的DsCPV基因组dsRNA。由于松毛虫与家蚕、舞毒蛾相互之间食性不同 ,而且BmCPV和LdCPV对松毛虫无感染性 ,即在松毛虫体内不会有Bm CPV病毒和LdCPV病毒的感染 ,因此该结果一方面从分子水平上证实了DsCPV与BmCPV、LdCPV存在基因同源性 ,同时也表明了依据BmCPV的基因序列设计引物对DsCPV基因组核酸建立的RT PCR扩增体系 ,可以作为松毛虫种群中DsCPV的一种敏感、特异、早期、快速的检测手段。 展开更多
关键词 松毛虫质型多角体病毒 多角体蛋白基因 反转录聚合酶链式反应 松毛虫 生物防治
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应用二温式PCR检测家蚕核型多角体病毒的方法 被引量:2
8
作者 覃玥 陈保善 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期565-570,共6页
为了简便、快速、准确地检测家蚕核型多角体病毒(Bm NPV),以Bm NPV广西分离株的多角体蛋白基因(polh)序列(Gen Bank登录号:JQ991011.1)设计引物,以感染Bm NPV(广西宜州分离株)2 h的5龄家蚕幼虫中肠组织提取的DNA为模板,建立二温式PCR检... 为了简便、快速、准确地检测家蚕核型多角体病毒(Bm NPV),以Bm NPV广西分离株的多角体蛋白基因(polh)序列(Gen Bank登录号:JQ991011.1)设计引物,以感染Bm NPV(广西宜州分离株)2 h的5龄家蚕幼虫中肠组织提取的DNA为模板,建立二温式PCR检测Bm NPV的方法,最终确定的最佳反应体系为:10×PCR buffer 1.5μL,5 mmol/L Mg Cl22μL,2.5mmol/L d NTP 0.5μL,10μmol/L上、下游引物各1μL,5 U/μL Taq DNA聚合酶0.1μL,18 ng/μL模板DNA 1μL,加水至总体积15μL。确定的最佳反应条件为:94℃预变性3 min;95℃15 s,延伸和退火温度合并为62℃30 s,共25个循环。按上述条件PCR扩增得到大小约309 bp的特异性片段,测序结果与已知polh基因序列的相似度为100%。与普通PCR检测方法比较,采用二温式PCR方法对样本的检测时间节省1.5 h,反应特异性强,灵敏度高(能被检测的最小感病组织基因组DNA的质量浓度为1.8 pg/μL),并且选择最初2 h感病的幼虫中肠组织为检测材料,因而可用于家蚕血液型脓病的早期诊断。 展开更多
关键词 家蚕核型多角体病毒 多角体蛋白基因 二温式PCR 反应条件
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棉铃虫核型多角体病毒多角体蛋白基因的克隆和核苷酸序列分析 被引量:12
9
作者 王根 张传溪 +2 位作者 贡成良 金伟 吴祥甫 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 1997年第1期83-87,共5页
棉铃虫核型多角体病毒多角体蛋白基因的克隆和核苷酸序列分析王根张传溪贡成良金伟吴祥甫(中国科学院上海生物化学研究所,上海200031)关键词棉铃虫,核型多角体病毒,多角体蛋白基因,核苷酸序列,同源性棉铃虫Hel... 棉铃虫核型多角体病毒多角体蛋白基因的克隆和核苷酸序列分析王根张传溪贡成良金伟吴祥甫(中国科学院上海生物化学研究所,上海200031)关键词棉铃虫,核型多角体病毒,多角体蛋白基因,核苷酸序列,同源性棉铃虫Helicoverpa(Heliothi... 展开更多
关键词 昆虫病毒 棉铃虫 核型多角体病毒 蛋白基因
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THE CLONING, SEQUENCING AND EXPRESSION OF THE LdMNPV POLYHEDRIN GENE 被引量:2
10
作者 林同 张传溪 +3 位作者 安成才 王志英 刘宽余 苑华毅 《Entomologia Sinica》 CSCD 2002年第4期47-52,共6页
LdMNPV-NEFU isolate collected from the forestry farm of Northeast Forestry University was purified and the genomic DNA of LdMNPV was extracted. The LdMNPV polyhedrin gene was cloned by PCR. The results showed that the... LdMNPV-NEFU isolate collected from the forestry farm of Northeast Forestry University was purified and the genomic DNA of LdMNPV was extracted. The LdMNPV polyhedrin gene was cloned by PCR. The results showed that the sequence was an open reading frame (ORF) of 735bp capable of encoding 245 amino acids. The polyhedrin gene sequences of the LdMNPV-NEFU isolate and a Canada strain, LdMNPV-G differed in 5 bases. The polyhedrin gene of the LdMNPV-NEFU isolate contained C, G, T, C and G at 54, 109,379, 508 and 701 sites from the start codon, but the LdMNPV-G isolate contained G, C, C, T and T at the corresponding sites respectively. The same amino acids were encoded by the two ORF sequences, with the exception that Asp and His are encoded by GAC on the polyhedrin gene sequence of the LdMNPV-NEFU isolate and by CAC in the LdMNPV-G isolate. The LdMNPV polyhedrin gene was expressed in E.coli BL21 (DE3) by the pT7-7 plasmid vector. 展开更多
关键词 LdMNPV polyhedrin gene CLONE sequence EXPRESSION
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茶尺蠖核型多角体病毒多角体蛋白基因核苷酸序列及其在Baculoviridae中的地位(英文) 被引量:7
11
作者 张传溪 胡萃 吴祥甫 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 1999年第3期365-371,共7页
茶尺蠖核型多角体病毒(EoSNPV)基因组的polh和egt基因区约14.2kb的酶切图谱被构建.egt基因位于polh基因上游约4.8kb处,但转录方向与polh基因相反.EcoRⅤ-L片段polh基因及其旁侧的1... 茶尺蠖核型多角体病毒(EoSNPV)基因组的polh和egt基因区约14.2kb的酶切图谱被构建.egt基因位于polh基因上游约4.8kb处,但转录方向与polh基因相反.EcoRⅤ-L片段polh基因及其旁侧的1125核苷酸序列被测定.polh基因编码区长738核苷酸,可编码246氨基酸的多肽.起始密码子ATG上游是一个富含AT(AT占71.2%)的启动子区,在-52核苷酸处有杆状病毒晚期基因启动子转录起始基序ATAAG.在终止密码子下游208核苷酸有一个poly(A)信号,AATAAA.但EoSNPVpolh基因起始密码子ATG相邻核苷酸序列为GTAATGT,其-3是个G,这与已知的16种其它杆状病毒polh基因-3位置均是A不相同.在分析了EoSNPV和HaSNPV多角体蛋白基因核苷酸序列的基础上,通过MALIGN程序,比较了目前已发表的26种杆状病毒包涵体蛋白的序列,EoSNPV与黄杉毒蛾核型多角体病毒(OpSNPV)的同源性为最高,核苷酸序列的同源性为83.0%,氨基酸序列达94.7%;与其它20种鳞翅目NPV的同源性也很高,核苷酸序列同源性为72.6%~81.9%,氨基酸序列为83.7%~93? 展开更多
关键词 EoSNPV 多角体蛋白基因 杆状病毒 分子进化
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SINPV基因组酶切图谱及多角体基因的序列分析 被引量:6
12
作者 魏永杰 龙綮新 +1 位作者 陈尚武 王珣章 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 1999年第2期88-92,共5页
用限制性内切酶EcoRI、XabI、XhoI、BamHI、PstI、SacI、HidnⅢ、Smal酶解斜纹夜蛾核多角体病毒广州株基因组DNA,分别得到26、26、24、20、13、17、9、1条片段,并算得基因组平均... 用限制性内切酶EcoRI、XabI、XhoI、BamHI、PstI、SacI、HidnⅢ、Smal酶解斜纹夜蛾核多角体病毒广州株基因组DNA,分别得到26、26、24、20、13、17、9、1条片段,并算得基因组平均大小为136.0kbp。以AcNPV多角体基因的部分读码框为探针,经Southem杂交将SINPV多角体基因定位于XbaIO片段上。将此片段克隆并序列分析,结果表明SINPV的多角体基因位于XbaI O片段的XbaI-SalI 0.8kbp片段上,其开放读码框为750bp,编码一249aa的蛋白质,与SpliNPV相同,为目前所发现的最长的多角体基因。SINPV多角体蛋白Mr=29236,其氨基酸序列与其它核多角体病毒的多角体蛋白氨基酸序列有高度的同源性。 展开更多
关键词 斜纹夜蛾 核型多角体病毒 限制性内酶 图谱
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家蚕核型多角体病毒的PCR检测及其部分序列分析 被引量:6
13
作者 刘吉平 王永宾 +1 位作者 魏建影 辛锦兰 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期664-669,共6页
为研究应用PCR技术进行家蚕核型多角体病毒广东株的敏感性检验以及探讨不同地理株系的基因水平的相互关系,本文通过对家蚕核型多角体病毒BmNPV广东株的人工繁殖与纯化,引用了一对根据多角体蛋白基因设计的引物phy35/phy36,对BmNPV的基... 为研究应用PCR技术进行家蚕核型多角体病毒广东株的敏感性检验以及探讨不同地理株系的基因水平的相互关系,本文通过对家蚕核型多角体病毒BmNPV广东株的人工繁殖与纯化,引用了一对根据多角体蛋白基因设计的引物phy35/phy36,对BmNPV的基因组模板DNA进行了PCR扩增,并对其产物进行测序分析。结果显示,PCR技术均可扩增检测出3×108个/mL至3×102个/mL不同浓度的BmNPV模板DNA,特异目标片段大小约为680bp,且扩增带的亮度随着病毒液浓度的降低而减弱,说明应用引物phy35/phy36进行PCR方法可以有效地应用于检测BmNPV病毒感染的家蚕。同时,测序获得了BmNPV广东株多角体蛋白polyhedrin基因674bp大小的片段,GC含量为46.4%。经过BLAST比对分析,与BmNPV泰国株的相似性为99%,暗示家蚕BmNPV广东株与泰国株的BmNPV(登录号AY779044)亲缘关系非常相近,两者可能属于BmNPV的不同地理株系。通过系统发育树的进一步分析发现,家蚕核型多角体病毒广东株polyhedrin基因部分序列与家蚕NPV分离株S9多角体蛋白基因(DQ231336)关系很近。 展开更多
关键词 家蚕 BmNPV基因组 polyhedrin基因 PCR
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SlNPV多角体蛋白基因的序列分析 被引量:4
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作者 魏永杰 龙綮新 陈尚武 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 1998年第6期91-93,共3页
SlNPV多角体蛋白基因的开放读码框为750bp,编码249个氨基酸的蛋白质,是目前所发现的最长的多角体蛋白基因.SlNPV多角体蛋白Mr=29236,其氨基酸序列与其它核多角体病毒的多角体蛋白氨基酸序列有高度同源性.
关键词 SlNPV 多角体蛋白基因 DNA 序列分析 杆状病毒
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柞蚕NPV核多角体蛋白基因核苷酸序列分析及其mRNA转录起始点的确定 被引量:8
15
作者 张春发 范琦 +3 位作者 刘淑珊 李文利 王林美 李广泽 《蚕业科学》 CAS CSCD 1992年第2期77-87,共11页
采用DNA双脱氧法,对所克隆的载有ApNPV核多角体蛋白基因片段进行了核苷酸序列分析,并与AcNPV和BmNPV核多角体蛋白基因序列进行了比较。结果表明,ApNPV核多角体蛋白结构基因由735个核苷酸编码序列(编码245个氨基酸)组成,其序列与AcNPV和B... 采用DNA双脱氧法,对所克隆的载有ApNPV核多角体蛋白基因片段进行了核苷酸序列分析,并与AcNPV和BmNPV核多角体蛋白基因序列进行了比较。结果表明,ApNPV核多角体蛋白结构基因由735个核苷酸编码序列(编码245个氨基酸)组成,其序列与AcNPV和BmNPV的核多角体蛋白基因编码序列相比同源性较高,分别为79.6%和81.6%;但其5′端和3′端两侧翼序列与AcNPV和BmNPV相比差异显著,特别是控制该基因表达的5′端启动子部分调控序列(nt—2~—61):AcNPV与BmNPV完全相同,而ApNPV在此区域却有20个核苷酸序列发生变异,并且在对该基因表达起决定性作用的8个高度保守核苷酸序列(nt—44~—51),有两处发生自然突变。经核苷酸序列推测出的ApNPV核多角体蛋白氨基酸序列与AcNPV、BmNPV核多角体蛋白氨基酸序列的差异,同其三者之间的核苷酸序列的差异的比率降低10%。采用引物延伸法,对ApNPV核多角体蛋白mRNA转录起始点进行了测定,确定其位于该基因调控序列12个核苷酸高保守区的nt—50位点与AcNPV相似。 展开更多
关键词 柞蚕 核多角体病毒 蛋白基因
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家蚕核型多角体病毒株系的分子鉴定初探 被引量:3
16
作者 唐芬芬 邵榆岚 +5 位作者 钟健 张永红 黄平 董占鹏 廖鹏飞 白兴荣 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期1030-1035,共6页
来自不同地域或蚕区的家蚕核型多角体病毒(Bm NPV)对家蚕的致病力存在较大差异,出现明显的株系分化现象。对Bm NPV流行株系鉴定是病害监测与防控的重要基础。以最早完成基因组测序的Bm NPV-T3株的多角体蛋白基因(polh)序列与其他6个Bm ... 来自不同地域或蚕区的家蚕核型多角体病毒(Bm NPV)对家蚕的致病力存在较大差异,出现明显的株系分化现象。对Bm NPV流行株系鉴定是病害监测与防控的重要基础。以最早完成基因组测序的Bm NPV-T3株的多角体蛋白基因(polh)序列与其他6个Bm NPV株系进行同源基因序列及氨基酸序列的BLAST比对,结果表明不同株系的Polh氨基酸序列高度同源,相似度达到99.94%;再以Bm NPV-T3株的143个开放阅读框序列为参照,对不同Bm NPV株系的基因组序列进行双序列比对,发现不同株系重复阅读框基因(bro)家族成员的组成、序列及拷贝数存在差异,且分布位置呈现多样性。初步认为,高度保守的polh基因可用于Bm NPV病毒的鉴定,而相对保守的bro家族基因可作为Bm NPV病毒株系分子鉴定的依据。 展开更多
关键词 家蚕核型多角体病毒 株系 多角体蛋白基因 杆状病毒重复阅读框基因
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双基因双重组AcNPV的构建及其杀虫活性 被引量:2
17
作者 裴子飞 肖化忠 +2 位作者 齐义鹏 王福山 朱应 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第4期451-456,共6页
质粒 pAcIEneo携带杆状病毒极早期基因IE1启动子驱动的新霉素抗性基因 (neo) ,经酶切回收后插入到质粒pAc34DZ1的SacI位点上 ,构建成多角体外膜蛋白基因 (pe)失活的转移载体 pAc34DZ2。我们曾构建了一个多角体完整 (ocu+ )的表达苏云金... 质粒 pAcIEneo携带杆状病毒极早期基因IE1启动子驱动的新霉素抗性基因 (neo) ,经酶切回收后插入到质粒pAc34DZ1的SacI位点上 ,构建成多角体外膜蛋白基因 (pe)失活的转移载体 pAc34DZ2。我们曾构建了一个多角体完整 (ocu+ )的表达苏云金杆菌 (Bt)截短cryIAb基因的重组病毒 (1)vAcPhBtT。为了改进这一重组病毒的杀虫效率 ,将转移载体 pAc34DZ2与重组病毒 (1)vAcPhBtTDNA共转染Sf9细胞 ,进行第二次同源重组。由于neo基因的表达 ,用G4 18筛选得到重组病毒 (2 )vAcPhBtTPE-;Southernblot证明vAcPhBtTPE-的构建是正确的 ,经SDS PAGE分析 ,重组病毒 (2 )仍然能在昆虫细胞中表达 80kD的Bt截短毒蛋白 ,但不表达 34kD的多角体外膜蛋白。电镜观察重组病毒 (2 )无多角体外膜 ,碱解时病毒粒子释放的速度快于重组病毒 (1)。以重组病毒 (2 )感染甜菜夜蛾三龄幼虫 ,LC50 比野生型病毒小了接近 1倍 ,LT50 提前近 2d。 展开更多
关键词 重组杆状病毒 PE 生物防治 杀虫活性
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昆虫病毒多角体蛋白对病毒粒子的异源包装 被引量:3
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作者 黄永秀 齐义鹏 李晓锋 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 1995年第1期88-92,共5页
昆虫病毒多角体蛋白对病毒粒子的异源包装黄永秀,齐义鹏,李晓锋(武汉大学病毒研究所,武昌430072)关键词杆状病毒,异源包装,多角体蛋白基因昆虫杆状病毒(BV)的多角体蛋白基因(ocu),是一个非必需极晚期高表达基因... 昆虫病毒多角体蛋白对病毒粒子的异源包装黄永秀,齐义鹏,李晓锋(武汉大学病毒研究所,武昌430072)关键词杆状病毒,异源包装,多角体蛋白基因昆虫杆状病毒(BV)的多角体蛋白基因(ocu),是一个非必需极晚期高表达基因。目前,已用首稽尺蠖核型多角体病毒... 展开更多
关键词 杆状病毒 异源包装 多角体蛋白基因 昆虫病毒
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中国棉铃虫单粒包埋核型多角体病毒多角体蛋白基因的序列分析 被引量:15
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作者 陈新文 胡志红 +4 位作者 JustM.Vlak(DepartmentofVirology WageningenAgriculturalVniversity Binnenhaven11 7609PDWageningen TheNetherlands) 《中国病毒学》 CSCD 1997年第4期346-353,共8页
以AcMNPV的多角体蛋白基因为探针,定位了中国棉铃虫单粒包理核型多角体病毒(HaSNPV)的多用体蛋白基因。序列测定表明,HaSNPV的多角体蛋白基因编码区为738个核苷酸,编码246个氨基酸,预计蛋白质分子量为29kDa。同源性分析表明,HaS... 以AcMNPV的多角体蛋白基因为探针,定位了中国棉铃虫单粒包理核型多角体病毒(HaSNPV)的多用体蛋白基因。序列测定表明,HaSNPV的多角体蛋白基因编码区为738个核苷酸,编码246个氨基酸,预计蛋白质分子量为29kDa。同源性分析表明,HaSNPV与美洲棉铃虫单粒包理核型多角体病毒(HzSNPV)具有最高的同源性,在整个阅读框架中只有4个碱基的差异,其中第179位碱基的变化导致唯一的氨基酸变化,这种变化并未导致其二级结构的改变。此外,两种病毒该基因的启动子结构也完全一样。HaSNPV与其它的SNPV和MNPV的同源性明显要低。结果预示HaSNPV与HzSNPV可能为同种病毒的不同变种。 展开更多
关键词 棉铃虫病毒 核型多角体病毒 多角体蛋白 基因
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茶毛虫核型多角体病毒(EpNPV)多角体蛋白基因的定位及克隆 被引量:8
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作者 常国辉 陈绳亮 +1 位作者 罗保君 李天宪 《中国病毒学》 CSCD 2001年第4期390-392,共3页
The polyhedrin gene of EpNPV was located on Hin d III E, Xba I B, Eco RI J, Kpn I A, Pst I F, Bam H I G fragments under stringent condition(68℃,in water),by using the DIG labeled Bam H I F fragment of AcMNPV DNA as t... The polyhedrin gene of EpNPV was located on Hin d III E, Xba I B, Eco RI J, Kpn I A, Pst I F, Bam H I G fragments under stringent condition(68℃,in water),by using the DIG labeled Bam H I F fragment of AcMNPV DNA as the probe.In order to sequence the EpNPV polyhedrin gene,the Bam H I G fragment was cloned into pTZ19R vector.Then the fragment was digested by Xba I? Hin d III,and subcloned into pTZ19R. 展开更多
关键词 茶毛虫核型多角体病毒 多角体蛋白基因定位 克隆
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