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Improved Nucleic Acid Spot Hybridization Technique for Detection of Potato Spindle Tuber Viroid(PSTVd)
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作者 Qiu Cai-ling Lu Dian-qiu +9 位作者 Liu De-fu Shi Jiao-xu Bao Liu-yuan Ma Zhong-lian Liu Li Feng Zhen-yue Huang Xian-min Jiang Rui Chen Yue Wang Shi-min 《Journal of Northeast Agricultural University(English Edition)》 CAS 2022年第1期26-32,共7页
Potato spindle tuber viroid(PSTVd)disease is one of the major diseases that threatens potato production.Therefore,an advanced,rapid and sensitive detection technology is needed to detect the disease for better control... Potato spindle tuber viroid(PSTVd)disease is one of the major diseases that threatens potato production.Therefore,an advanced,rapid and sensitive detection technology is needed to detect the disease for better control.In order to establish an easier nucleic acid spot hybridization(NASH)method,some studies were tried as the followings:(1)the pre-hybridization step of nucleic acid spot hybridization(NASH)was omitted compared with ordinary way;(2)RNA extraction(phenol extraction and Ames buffer extraction)methods were compared;(3)fixed RNA by UV lamp and oven compared with UV cross-linker;(4)hybridized the RNA in shaking incubator and so on.The results showed that RNA extracted by Ames buffer was more effective than by the phenol extraction method.Besides,the result of hybridization without pre-hybridization step was better than that with 1.5 h of pre-hybridization.The more important discovery was that the shaking incubator could replace the hybridization oven and the ordinary UV lamp could replace the UV cross-linker.After a long term repeated research and testing,a new hybridization system that could rapidly detect the PSTVd by improved NASH technique merely using common instruments and equipment was established. 展开更多
关键词 potato spindle tuber viroid(pstvd) nucleic acid spot hybridization(NASH) pre-hybridization RNA extraction detection technology
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Detection of Potato Spindle Tuber Viroid, and Its Impact on Growth, Production of Tomatoes in Greenhouse
2
作者 Haniyeh Mohamed Algamodi Jaber Abdullah Khalil +1 位作者 Taher Ahmed Abouhliqh Khaled Ojdj 《Journal of Agricultural Science and Technology(B)》 2012年第8期940-949,共10页
The viability of most tomato varieties cultivated in Libya have been tested to infect with potato spindle tuber viroid/potatoes (PSTVd) and its impact on growth and production of some of these varieties, which were ... The viability of most tomato varieties cultivated in Libya have been tested to infect with potato spindle tuber viroid/potatoes (PSTVd) and its impact on growth and production of some of these varieties, which were mechanically inoculated with Libyan isolate of viroid PSTVd as follows: Vlkato, Sankarh, Lebda, Jasmine, Kenza and Hana. The percent of incidence were 95.95%, 90%, 90.80%, 80% and 20%, respectively. The following varieties have been contagious mechanically with viroid of PSTVd: Vlkato, zahra, Toria, Lebda, Hoda, Farwa, Alkaraz, Naziha, Rim Star and Kartika. The percent of incidence were 95.95%, 85%, 85.80%, 80%, 70.40%, 0.0%, 0.0%, respectively. The varied symptoms of wrinkle, twist, warp, swell the veins of the leaves, dark brown spots formation and a large yellow spots turned into white patches. Also the effect of the Egyptian isolate viroid PSTVd in the growth and production of varieties Jasmine, Lebda, Soberhalim, and treasure No. 185 had been studied, as the average rates of decline in the production of the fruits tomatoes/tomato 43.4% and 17% length of plants, and in the fresh weight and dry root of the sum of 35% and 37% respictively. 展开更多
关键词 potato spindle tuber viroid the infection of tomato plants nucleic acid PCR.
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往复双向电泳法(R-PAGE)检测马铃薯纺锤块茎类病毒(PSTVd)核酸制备的改进 被引量:2
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作者 黄元璜 《黑龙江农业科学》 2003年第4期28-30,共3页
双向往返电泳(R-PAGE)法是检测马铃薯纺锤块茎类病毒(PSTVd)的有效手段,本试验通过对该方法中马铃薯纺锤块茎类病毒核酸提取步骤的改进,提高了核酸纯度,使检测结果更为准确、清晰,且灵敏度高。
关键词 往复双向电泳法 R-PAGE 检测 马铃薯纺锤块茎类病毒 pstvd 核酸制备
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马铃薯纺锤块茎类病毒(PSTVd)脱除技术研究进展
4
作者 邱彩玲 陈悦 +5 位作者 冯振月 刘德福 高艳玲 张威 蒙元燕 黄先敏 《植物检疫》 2024年第1期8-13,共6页
马铃薯纺锤块茎类病毒(PSTVd)是影响马铃薯生产、育种和种质资源保存的重要病原。脱除PSTVd是其防控的重要手段之一。本文综述了PSTVd的发生情况及其危害以及主要脱除技术。同时分析了PSTVd脱除工作中存在的主要问题及其难以脱除的可能... 马铃薯纺锤块茎类病毒(PSTVd)是影响马铃薯生产、育种和种质资源保存的重要病原。脱除PSTVd是其防控的重要手段之一。本文综述了PSTVd的发生情况及其危害以及主要脱除技术。同时分析了PSTVd脱除工作中存在的主要问题及其难以脱除的可能机制,并提出了意见和建议,以期为PSTVd防控提供借鉴。 展开更多
关键词 马铃薯纺锤块茎类病毒 脱除 进展
原文传递
我国在防治马铃薯类病毒病中存在的问题及防治对策 被引量:11
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作者 邱彩玲 吕典秋 +6 位作者 董学志 魏琪 刘尚武 王绍鹏 宿飞飞 李勇 白艳菊 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第10期140-144,共5页
马铃薯纺锤块茎类病毒病(Potato spindle tuber viroid,PSTVd)是威胁我国马铃薯生产的重要病害之一,已经给我国的马铃薯生产造成了严重影响,导致了经济损失。在防治该病害方面存在着脱除难,检测不到位,脱毒种薯质量控制体系不健全,监管... 马铃薯纺锤块茎类病毒病(Potato spindle tuber viroid,PSTVd)是威胁我国马铃薯生产的重要病害之一,已经给我国的马铃薯生产造成了严重影响,导致了经济损失。在防治该病害方面存在着脱除难,检测不到位,脱毒种薯质量控制体系不健全,监管力度不够等问题。今后,要加大PSTVd脱毒技术的研究,选用健康的马铃薯作为原始材料,严格执行隔离制度,完善脱毒马铃薯种薯质量控制体系,加大种薯质量监管力度等措施,控制马铃薯纺锤块茎类病毒病,确保我国马铃薯产业健康、稳定发展。 展开更多
关键词 马铃薯纺锤块茎类病毒 问题 防治
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基于RNA杂交的马铃薯纺锤块茎类病毒检测芯片 被引量:5
6
作者 谷宇 杜志游 +2 位作者 郎秋蕾 陈集双 何农跃 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2006年第11期2106-2109,共4页
报道了一种检测植物类病毒RNA的新方法———RNA杂交芯片技术,即将cDNA芯片技术与RNA斑点杂交技术相结合,将马铃薯样品的总RNA直接固定在玻片上,用荧光标记制备检测马铃薯纺锤块茎类病毒(PSTVd)的特异探针,探针与芯片杂交后分析杂交信... 报道了一种检测植物类病毒RNA的新方法———RNA杂交芯片技术,即将cDNA芯片技术与RNA斑点杂交技术相结合,将马铃薯样品的总RNA直接固定在玻片上,用荧光标记制备检测马铃薯纺锤块茎类病毒(PSTVd)的特异探针,探针与芯片杂交后分析杂交信号以确定相应的样品有无PSTVd侵染.参照膜杂交的方法,确定了RNA芯片的制备条件,并用以检测了马铃薯样品的PSTVd侵染情况,检测结果与RT-PCR结果相符,阳性产物经克隆测序证实为PSTVd. 展开更多
关键词 RNA芯片杂交 斑点杂交 CDNA芯片 马铃薯纺锤块基类病毒(pstvd)
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特异切割马铃薯纺锤形块茎类病毒负链的多价核酶的构建和体外活性测定 被引量:8
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作者 邓文生 杨希才 +1 位作者 康良仪 田波 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第4期370-373,共4页
根据锤头型核酶的作用模式 ,设计、合成并克隆了特异切割马铃薯纺锤形块茎类病毒 (PSTVd)负链RNA不同区域位点的双价和三价锤头型核酶基因。通过体外转录 ,将PSTVd负链RNA分别与双价和三价核酶混合 ,37℃温育 2h。结果表明 ,双价核酶和... 根据锤头型核酶的作用模式 ,设计、合成并克隆了特异切割马铃薯纺锤形块茎类病毒 (PSTVd)负链RNA不同区域位点的双价和三价锤头型核酶基因。通过体外转录 ,将PSTVd负链RNA分别与双价和三价核酶混合 ,37℃温育 2h。结果表明 ,双价核酶和三价核酶均表现出较高的切割活性 ,其中双价核酶处理的切割产物的大小与理论值相符合。三价核酶虽表现出较高的切割活性 ,但只是其中一价核酶在起作用。讨论了二价和三价核酶的应用前景。 展开更多
关键词 马铃薯纺锤形块茎类病毒 锤头型核酶 特异切割
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用生物素标记的cDNA探针检测马铃薯纺锤块茎类病毒 被引量:12
8
作者 张鹤龄 曹先维 +1 位作者 IlseBalbo LuisF.Salazar 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 1989年第1期72-76,共5页
用生物素-11-dUTP通过缺口平移将克隆于pST-B5和pST-B14质粒中的马铃薯纺锤块茎类病毒(Potato spindle tuber viroid,PSTV)cDNA进行标记,制备了生物素标记的PSTV-cDNA探针,在硝酸纤维素膜上进行核酸斑点杂交(Nucleic acid spot hybridiz... 用生物素-11-dUTP通过缺口平移将克隆于pST-B5和pST-B14质粒中的马铃薯纺锤块茎类病毒(Potato spindle tuber viroid,PSTV)cDNA进行标记,制备了生物素标记的PSTV-cDNA探针,在硝酸纤维素膜上进行核酸斑点杂交(Nucleic acid spot hybridization,NASH),检测了提纯的PSTV-RNA,带有PSTV全序列的质粒及感染PSTV的马铃薯植株提取液,前两者可检出的最低含量分别为8pg/斑点和0.35pg/斑点。以生物素标记的pST-B14和pST-B5为探针检测感染PSTV的马铃薯植株提取汁液。可测出的最高稀释倍数分别为126和162~243。 展开更多
关键词 马铃薯类病毒 生物素标记 cDNA探测
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乌鲁木齐地区马铃薯纺锤块茎类病毒的检测与序列分析 被引量:6
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作者 董代幸 罗明 +4 位作者 王丽丽 韩剑 唐德贤 冯世强 岳仲海 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第9期38-42,65,共6页
根据马铃薯纺锤块茎类病毒(PSTVd)基因序列设计合成1对引物,对新疆乌鲁木齐地区马铃薯田间感病植株进行一步法RT-PCR检测,扩增出251 bp大小的目标片段,而健康植株无此扩增产物。将目的片段克隆到pGM-T载体上并进行序列测定,构建系统... 根据马铃薯纺锤块茎类病毒(PSTVd)基因序列设计合成1对引物,对新疆乌鲁木齐地区马铃薯田间感病植株进行一步法RT-PCR检测,扩增出251 bp大小的目标片段,而健康植株无此扩增产物。将目的片段克隆到pGM-T载体上并进行序列测定,构建系统进化树分析各分离物间的分子差异性。结果表明马铃薯纺锤块茎类病毒乌鲁木齐分离物与国内外已报道毒株的核酸序列同源性达93.6%~99.2%。 展开更多
关键词 马铃薯纺锤块茎类病毒 乌鲁木齐分离物 一步法RT-PCR 检测 序列分析
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马铃薯纺锤块茎类病毒检测技术比较与选择 被引量:4
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作者 邱彩玲 吕文河 +3 位作者 魏琪 吕典秋 李学湛 白艳菊 《中国马铃薯》 2013年第6期362-364,共3页
马铃薯纺锤块茎类病毒(PSTVd)是威胁我国马铃薯生产的重要病害之一,目前有多种技术可应用于PSTVd的检测,如生物学方法、电子显微镜技术、往返聚丙烯酰胺凝胶电泳(R-PAGE)、核酸斑点杂交(NASH)、RT-PCR和FQ RT-PCR。这些方法各有利弊,互... 马铃薯纺锤块茎类病毒(PSTVd)是威胁我国马铃薯生产的重要病害之一,目前有多种技术可应用于PSTVd的检测,如生物学方法、电子显微镜技术、往返聚丙烯酰胺凝胶电泳(R-PAGE)、核酸斑点杂交(NASH)、RT-PCR和FQ RT-PCR。这些方法各有利弊,互相补充,构成了PSTVd的检测技术体系。日常工作中,应根据自身条件及目的等科学地选择适宜的检测技术,确保脱毒种薯/种苗的质量。 展开更多
关键词 马铃薯纺锤块茎类病毒(pstvd) 检测技术 比较与选择
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部分发展中国家马铃薯纺锤块茎类病毒病情况调查 被引量:4
11
作者 邱彩玲 刘尚武 +6 位作者 王绍鹏 张抒 宿飞飞 李勇 王文重 王亚洲 吕典秋 《中国马铃薯》 2010年第6期364-365,共2页
马铃薯类病毒病是威胁世界马铃薯生产的主要病害之一,更影响着发展中国家马铃薯产业的发展。2008~2010年,黑龙江省农业科学院植物脱毒苗木研究所连续3年举办了马铃薯病害检测技术国际培训班,对部分发展中国家从事马铃薯工作的人员进行培... 马铃薯类病毒病是威胁世界马铃薯生产的主要病害之一,更影响着发展中国家马铃薯产业的发展。2008~2010年,黑龙江省农业科学院植物脱毒苗木研究所连续3年举办了马铃薯病害检测技术国际培训班,对部分发展中国家从事马铃薯工作的人员进行培训,在培训过程中进行了马铃薯类病毒方面的问卷调查,调查结果显示:这些发展中国家对马铃薯纺锤块茎类病毒比较了解,发病较重的国家不多,但总体检测水平不高,甚至不进行马铃薯类病毒的检测,多数国家不重视马铃薯纺锤块茎类病毒病的防治工作。因此,马铃薯纺锤块茎类病毒病是发展中国家的隐患。 展开更多
关键词 马铃薯 纺锤块茎类病毒 调查
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福建省马铃薯纺锤块茎类病毒快速检测及序列分析 被引量:1
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作者 李华伟 罗文彬 +7 位作者 纪荣昌 许泳清 张鸿 李国良 刘中华 邱永祥 邱思鑫 汤浩 《福建农业学报》 CAS 北大核心 2015年第10期984-988,共5页
为检测福建省马铃薯纺锤块茎类病毒及了解其分子变异情况,以感染马铃薯纺锤块茎类病毒的植株为试验材料,提取RNA,反转录cDNA,利用设计合成的特异性引物进行RT-PCR检测,扩增产物经回收纯化后克隆和测序。结果表明,PCR扩增出359bp的特异片... 为检测福建省马铃薯纺锤块茎类病毒及了解其分子变异情况,以感染马铃薯纺锤块茎类病毒的植株为试验材料,提取RNA,反转录cDNA,利用设计合成的特异性引物进行RT-PCR检测,扩增产物经回收纯化后克隆和测序。结果表明,PCR扩增出359bp的特异片段,将扩增产物经回收和纯化并进行克隆与测序,测序结果经BLAST比对后,该片段为PSTVd基因序列,PSTVd分离物命名为Fujian PTSTd(KM588065.1),与国内外报道的PSTVd分离物同源性达98%以上。该分离物与弱毒株系(M14814.1)、中间株系(AY492084.1)和强毒株系(U23058.1)比对,有11个核苷酸具有多态性,其中5个发生在致病区。不同国家和地区序列进化树分析表明,该分离物与我国北方及欧美国家分离物亲缘关系最近,与新西兰分离物亲缘关系最远。 展开更多
关键词 福建省 马铃薯 马铃薯纺锤块茎类病毒 RT-PCR 检测
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马铃薯纺锤块茎类病毒对马铃薯育种工作的影响 被引量:2
13
作者 邱彩玲 范国权 +7 位作者 高艳玲 张威 张抒 申宇 王绍鹏 刘尚武 吕典秋 白艳菊 《中国马铃薯》 2016年第1期39-42,共4页
简要介绍了马铃薯纺锤块茎类病毒(Potato spindle tuber viroid,PSTVd)的危害和发生情况,重点阐述了PSTVd对马铃薯育种工作的影响,并针对该问题进行了分析,最后提出了一些建议,如做好隔离防护,彻底进行PSTVd检验,对环境及器具进行消... 简要介绍了马铃薯纺锤块茎类病毒(Potato spindle tuber viroid,PSTVd)的危害和发生情况,重点阐述了PSTVd对马铃薯育种工作的影响,并针对该问题进行了分析,最后提出了一些建议,如做好隔离防护,彻底进行PSTVd检验,对环境及器具进行消毒处理以及实生种子经贮藏3~5年后再播种。 展开更多
关键词 马铃薯纺锤块茎类病毒(pstvd) 马铃薯育种 影响
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榆林地区马铃薯纺锤块茎类病毒的RT-PCR检测与序列分析 被引量:2
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作者 冯光惠 杜虎平 +1 位作者 李夏隆 亢福仁 《山西农业科学》 2014年第10期1047-1050,1059,共5页
以陕西省榆林地区种植2~3代的马铃薯叶片为材料,首先用Trizol法提取马铃薯叶片总RNA,以已公布的马铃薯纺锤块茎类病毒(PSTVd)基因序列设计合成一对特异引物,反转录合成cDNA,通过RT-PCR扩增目的DNA片段,琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物;... 以陕西省榆林地区种植2~3代的马铃薯叶片为材料,首先用Trizol法提取马铃薯叶片总RNA,以已公布的马铃薯纺锤块茎类病毒(PSTVd)基因序列设计合成一对特异引物,反转录合成cDNA,通过RT-PCR扩增目的DNA片段,琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物;然后回收纯化扩增产物并进行克隆和测序,采用DNAstar软件分析序列一致性。电泳结果表明,在榆林地区的马铃薯叶片中均扩增到与预期大小一致的目的片段,说明这些马铃薯均感染了PSTVd;序列分析表明,10个不同采样点PSTVd的目的片段大小为250~251 bp,只是单个碱基之间的转换或缺失,PSTVd在榆林地区几乎没有发生变异,与国内外其他15个地区已报道的序列一致性在82.3%~99.5%之间。 展开更多
关键词 马铃薯 纺锤块茎类病毒 RT-PCR检测 序列分析
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马铃薯生产中马铃薯纺锤块茎类病毒的综合防治 被引量:2
15
作者 邱彩玲 范国权 +9 位作者 申宇 马纪 高艳玲 张威 张抒 胡林双 芦娜 韩树新 白艳菊 吕典秋 《中国马铃薯》 2017年第3期154-159,共6页
马铃薯纺锤块茎类病毒是影响中国马铃薯生产重要的检疫性病害。该病害具有广泛的自然寄主,可侵染马铃薯、番茄和辣椒等重要作物。该病害可通过植物学种子、花粉或卵细胞、无性繁殖以及机械等方式传播。马铃薯纺锤块茎类病毒可造成马铃... 马铃薯纺锤块茎类病毒是影响中国马铃薯生产重要的检疫性病害。该病害具有广泛的自然寄主,可侵染马铃薯、番茄和辣椒等重要作物。该病害可通过植物学种子、花粉或卵细胞、无性繁殖以及机械等方式传播。马铃薯纺锤块茎类病毒可造成马铃薯产量降低,块茎畸形、变小,商品性和商品薯率下降。该病害主要可通过培育抗病品种、使用脱毒种薯、加强种质资源和种薯卫生管理、加强检验检疫以及实行马铃薯种薯质量认证制度等措施进行综合防治。 展开更多
关键词 马铃薯 马铃薯纺锤块茎类病毒 综合防治
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马铃薯纺锤形块茎类病毒基因的化学合成与克隆
16
作者 郭蜀光 张婕 +3 位作者 闵永洁 彭小忠 谢毅 王启松 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 1991年第2期180-182,共3页
马铃薯纺锤形块茎类病毒(Potato spindle tuber viroid,PSTV)是一种由359个核苷酸组成的植物类病毒。本文介绍用化学法合成PSTV基因的工作。将整个基因分成173、168和18bp 3个片段,对两个大片段分别进行克隆,最后得到含有PSTY基因的单链... 马铃薯纺锤形块茎类病毒(Potato spindle tuber viroid,PSTV)是一种由359个核苷酸组成的植物类病毒。本文介绍用化学法合成PSTV基因的工作。将整个基因分成173、168和18bp 3个片段,对两个大片段分别进行克隆,最后得到含有PSTY基因的单链DNA。 首先,根据PSTV的核苷酸序列得到其cDNA,将整个cDNA分成A、B、C3段,分别为1-173、174-341和342-359。为了下一步将cDNA转录到RNA的研究,在每一个片段的3’ 展开更多
关键词 PSTV 化学合成基因 克隆
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利用往返电泳法(R-PAGE)检测马铃薯纺锤块茎类病毒技术要点
17
作者 邱彩玲 《中国马铃薯》 2014年第4期233-234,共2页
目前国内普遍采用的往返电泳法是检测马铃薯类病毒的主要方法之一,但该方法存在灵敏度低,重复性差等问题。因此,针对上述问题总结出一些技术要点:(1)保证植物生长环境及正确取样;(2)提高凝胶中RNA的浓度和质量;(3)控制好反向电泳的温度... 目前国内普遍采用的往返电泳法是检测马铃薯类病毒的主要方法之一,但该方法存在灵敏度低,重复性差等问题。因此,针对上述问题总结出一些技术要点:(1)保证植物生长环境及正确取样;(2)提高凝胶中RNA的浓度和质量;(3)控制好反向电泳的温度和时间;(4)及时更换染色液。 展开更多
关键词 往返电泳 马铃薯类病毒 技术要点
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以马铃薯ND2 mRNA为内对照双重RT-PCR法检测马铃薯纺锤块茎类病毒 被引量:4
18
作者 马恢 谢晓亮 +2 位作者 尹江 温春秀 吴志明 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期1213-1216,共4页
根据马铃薯纺锤块茎类病毒(PSTVd)基因序列设计特异引物,采用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)技术进行PSTVd检测研究。为避免由于提取的RNA降解或者RT-PCR反应质量不高所造成的假阴性问题,在检测过程中引入马铃薯线粒体NADH脱氢酶ND2亚基... 根据马铃薯纺锤块茎类病毒(PSTVd)基因序列设计特异引物,采用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)技术进行PSTVd检测研究。为避免由于提取的RNA降解或者RT-PCR反应质量不高所造成的假阴性问题,在检测过程中引入马铃薯线粒体NADH脱氢酶ND2亚基基因mRNA为内对照,该内对照的一个引物跨越了该基因内含子区域,只对剪接后的mRNA进行特异扩增而不扩增其本身DNA。利用内对照引物和PSTVd特异引物进行双重RT-PCR检测,分别扩增出190 bp的内对照基因特异片段和360 bp的PSTVd特异条带,与预期引物设计大小一致。引入的内对照可以较好地监控PSTVd的RT-PCR检测过程。 展开更多
关键词 马铃薯 马铃薯纺锤块茎类病毒 双重RT-PCR 马铃薯线粒体 NADH ND2 MRNA
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用聚合酶链式反应(PCR)检测马铃薯纺锤块茎类病毒 被引量:9
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作者 何小源 周广和 +2 位作者 成卓敏 王立阳 陈剑波 《中国病毒学》 CSCD 1992年第3期362-366,共5页
用DNA合成仪合成两个马铃薯纺锤块茎类病毒(Potato spindle tuber viroid, PSTVd)特异性引物,从感病的马铃薯块茎组织的核酸抽提液中,用反转录酶合成PSTVd eDNA,然后用PCR法进行扩增,扩增产物用电泳检测,建立了用PCR法检测PSTVd的新方... 用DNA合成仪合成两个马铃薯纺锤块茎类病毒(Potato spindle tuber viroid, PSTVd)特异性引物,从感病的马铃薯块茎组织的核酸抽提液中,用反转录酶合成PSTVd eDNA,然后用PCR法进行扩增,扩增产物用电泳检测,建立了用PCR法检测PSTVd的新方法。结果表明,该方法特异性强,灵敏度可达0.15pg,比现有其它检测方法高,而且样品用量少。 展开更多
关键词 马铃薯 纺锤块类病毒 聚合酶链反应
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马铃薯纺锤块茎类病毒内蒙古分离株的克隆及序列分析 被引量:1
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作者 王建 迟胜起 +2 位作者 韩磊 张剑峰 梁文星 《中国马铃薯》 2016年第1期31-38,共8页
采用内蒙古自治区采集的感染马铃薯纺锤块茎类病毒(Potato spindle tuber viroid,PSTVd)的马铃薯材料,克隆了PSTVd的全长基因,命名为内蒙古分离株(PSTVd-IM),对其序列进行分析。结果表明,该序列大小为359 bp,其与俄罗斯的PSTVd分离株(EF... 采用内蒙古自治区采集的感染马铃薯纺锤块茎类病毒(Potato spindle tuber viroid,PSTVd)的马铃薯材料,克隆了PSTVd的全长基因,命名为内蒙古分离株(PSTVd-IM),对其序列进行分析。结果表明,该序列大小为359 bp,其与俄罗斯的PSTVd分离株(EF044305.1)序列吻合。将该分离物与国内外已经报道的PSTVd株系进行了比较,构建了系统进化树,确定了其分类地位;通过序列比对和二级结构分析,发现PSTVd-IM与已报道的PSTVd三类致病类型株系:强株系(U23058.1)、中间株系(AY937179.1)和弱株系(M14814.1)的同源性分别为97.78%,98.61%和99.44%;且与这三种类型株系在中央保守区、致病区和可变区结构域存在差异,说明这些结构域可能与其致病性相关。PSTVd-IM的序列与二级结构分析有利于明确其来源及致病性的差异位点,对于PSTVd的致病机制的研究具有重要意义。 展开更多
关键词 马铃薯纺锤块茎类病毒 反转录-聚合酶链式反应 序列分析
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