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CyclinE干扰RNA对肝癌HepG2细胞增殖和蛋白质组的影响 被引量:4
1
作者 王文礼 刘婷 《内蒙古医学院学报》 2008年第4期229-235,共7页
目的:研究siRNA对HepG2细胞株cyclinE表达的抑制及细胞生长的影响,并用双向凝胶电泳和质谱技术分析鉴定转染前后细胞内差异表达的蛋白质。方法:构建质粒表达载体pU6-cyclin E-shRNA,稳定转染肝癌HepG2细胞株,获得HepG2-cyclin EshRNA细... 目的:研究siRNA对HepG2细胞株cyclinE表达的抑制及细胞生长的影响,并用双向凝胶电泳和质谱技术分析鉴定转染前后细胞内差异表达的蛋白质。方法:构建质粒表达载体pU6-cyclin E-shRNA,稳定转染肝癌HepG2细胞株,获得HepG2-cyclin EshRNA细胞系,RT-PCR检测cyclinE mRNA表达,MTT测定细胞的增殖活性,流式细胞仪检测细胞周期。裂解、抽提HepG2-cyclin EshRNA细胞和G1期肝癌HepG2细胞全蛋白,用双向电泳技术进行分离后,用Proxpress2D分析软件对两组细胞全蛋白质表达谱进行差异分析,并应用MALD I-TOF-MS和数据库搜索鉴定差异显著的蛋白点。结果:HepG2-cyclin E-shRNA细胞与转染空质粒HepG2细胞和未转染的HepG2细胞相比,生长速度减慢,出现G0/G1期细胞增多,G2/M和S期细胞减少。双向电泳后软件分析G1期肝癌HepG2细胞株平均检测到435±51(n=3)个蛋白点,HepG2-cyclinEshRNA细胞376±44(n=3)个,匹配分析,筛选出两组间差异6倍及以上且出现频率大于等于50%的蛋白点20个。应用质谱鉴定出角蛋白19、波形蛋白、神经多肽h3等8个G1期HepG2细胞高表达蛋白点。结论:在HepG2细胞株中,导入cyclinE干扰RNA,可有效抑制cyclinE的表达,进而使细胞增殖减缓,逆转其恶性表型。两组细胞蛋白质谱有明显差异,鉴定出G1期HepG2细胞高表达蛋白点8个,这些蛋白的高表达引起肿瘤的基因修饰异常、分化异常、增殖紊乱,肿瘤侵袭转移。 展开更多
关键词 肝癌HePG2细胞 RNA 干扰 cyclin e 蛋白质组 2-De 质谱
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AspC基因导入前后E·coli BL21蛋白质组的解析 被引量:1
2
作者 杨雪莲 严明 +1 位作者 许琳 方志翔 《生物加工过程》 CAS CSCD 2005年第4期49-53,共5页
为了考察表达天冬氨酸转氨酶工程菌在转基因前后蛋白质水平的差异变化,采用固相pH梯度-SDS聚丙烯酰胺双向凝胶电泳对转基因前后的大肠杆菌(E.coliBL21)的总蛋白进行分离,银染、显色后,使用2D蛋白质图象分析系统Image Master 2D Platinum... 为了考察表达天冬氨酸转氨酶工程菌在转基因前后蛋白质水平的差异变化,采用固相pH梯度-SDS聚丙烯酰胺双向凝胶电泳对转基因前后的大肠杆菌(E.coliBL21)的总蛋白进行分离,银染、显色后,使用2D蛋白质图象分析系统Image Master 2D Platinum 5.0和SWISS-2D PAGE蛋白质组数据库对双向电泳图谱进行分析,识别了近600个蛋白点,比较分析了与苯丙氨酸合成途径相关的关键蛋白的差异,初步探讨了AspC基因的导入后大肠杆菌蛋白质水平的精细调控。 展开更多
关键词 双向凝胶电泳 蛋白质组 天冬氨酸转氨酶 大肠杆菌
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Cyclin E干扰RNA对人卵巢癌HO-8910细胞蛋白质组表达的影响
3
作者 刘瑞平 赵鹏伟 白瑞霞 《南昌大学学报(医学版)》 CAS 2016年第1期41-45,共5页
目的使用RNA干扰技术阻断人卵巢癌HO-8910细胞中Cyclin E的表达,分析Cyclin E表达受抑制后产生的一些效应,采用双向凝胶电泳和质谱技术分析鉴定转染前后细胞内差异表达的蛋白质,探讨Cyclin E在人卵巢癌细胞增殖中的作用,以期为人卵巢癌... 目的使用RNA干扰技术阻断人卵巢癌HO-8910细胞中Cyclin E的表达,分析Cyclin E表达受抑制后产生的一些效应,采用双向凝胶电泳和质谱技术分析鉴定转染前后细胞内差异表达的蛋白质,探讨Cyclin E在人卵巢癌细胞增殖中的作用,以期为人卵巢癌发生、发展、诊断与治疗提供有价值的资料。方法构建质粒表达载体pU6-Cyclin E-siRNA,同时设立阴性对照组和空白对照组。采用脂质体转染法稳定转染卵巢癌HO-8910细胞,G418筛选阳性克隆细胞;噻唑蓝(MTT)法检测细胞生长曲线的改变;RT-PCR法比较转染前后Cyclin E mRNA的表达量的变化;双向凝胶电泳-图像分析-质谱技术-数据库搜索,比较转染前后蛋白质组表达的变化,鉴定差异显著的蛋白点。结果 1)成功构建了Cyclin E干扰RNA的重组质粒并获得稳定转染组细胞HO-8910-Cyclin E siRNA。2)稳定转染组HO-8910-Cyclin E siRNA细胞与阴性对照组HO-8910-neo细胞和空白对照组相比,细胞生长速度减慢,Cyclin E mRNA表达水平降低。3)通过双向电泳-图像分析-质谱技术得到稳定转染组低表达蛋白5个,经数据库搜索分别是锌指蛋白ZFP-36、波形蛋白、肿瘤拒绝抗原gp96、未知蛋白、DNA校正蛋白酶Ⅱ。结论Cyclin E干扰RNA干扰后卵巢癌HO-8910细胞Cyclin E基因的表达明显降低,细胞增殖能力减弱。差异表达的蛋白质参与细胞的增殖、细胞信号转导调节,并与肿瘤的发生、发展、诊断密切相关。 展开更多
关键词 CYCLIN e 卵巢癌细胞 RNA 干扰 蛋白质组学
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人肺鳞癌组织及癌旁组织蛋白质双向电泳图谱的差异分析 被引量:2
4
作者 李萃 陈主初 +8 位作者 肖志强 吴晓英 詹显全 李茂玉 冯雪萍 章晓鹏 李建玲 陈平 梁宋平 《癌症》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第1期28-35,共8页
背景与目的:肺鳞癌的发生发展是一个多因素、多步骤的过程,虽然从基因和转录水平已对肺癌进行了许多成功的研究,但其癌变机制仍不十分明确,目前尚缺乏有效的用于肺鳞癌早期诊断和预后监测的特异性分子标志物。本研究的目的是利用蛋白质... 背景与目的:肺鳞癌的发生发展是一个多因素、多步骤的过程,虽然从基因和转录水平已对肺癌进行了许多成功的研究,但其癌变机制仍不十分明确,目前尚缺乏有效的用于肺鳞癌早期诊断和预后监测的特异性分子标志物。本研究的目的是利用蛋白质组学方法,建立分辨率高和重复性好的人肺鳞癌组织及其癌旁正常支气管上皮组织的双向凝胶电泳图谱,并识别鉴定其差异表达的蛋白质。方法:利用固相pH梯度(immobilizedpHgradient,IPG)双向凝胶电泳(two-dimensionalelectrophoresis,2-DE),分离人肺鳞癌组织及癌旁正常支气管上皮组织的总蛋白质,用图像分析软件比较分析,以识别差异表达的蛋白质;应用质谱仪(massspectrometry)得到相应的肽质指纹图谱(peptidemassfingerprint,PMF),然后搜索数据库鉴定部分差异蛋白质点。结果:(1)建立双向凝胶电泳图谱:癌组织和癌旁正常支气管上皮组织3块凝胶的平均蛋白质点数分别为1349±67和1297±73,平均匹配的点数分别为1235±48和1183±56,匹配率达91.5%和91.2%;同一癌组织的3块胶在蛋白质点位置上有较好的重复性,不同胶间蛋白质点在等电聚焦(Isoelectricfocusing,IEF)方向的偏差是(0.873±0.125)mm,在十二烷基磺酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳SDS-PAGE方向上的偏差为(1.025±0.213)mm。(2)肽质指? 展开更多
关键词 肺鳞癌 癌旁组织蛋白质 双向电泳图谱 差异分析 鳞癌组织
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用于蛋白质分析的毛细管等电聚焦-电喷雾质谱接口的改进 被引量:3
5
作者 许崇峰 宋浩威 +3 位作者 杨原 王谦 王洪海 许云敏 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2002年第6期1035-1037,共3页
An important interface modification for capillary isoelectric focusing mass spectrometry(CIEF MS) is reported. A capillary needle with a sheath flow tube pre mounted in one device serves as both the CIEF cathodic end ... An important interface modification for capillary isoelectric focusing mass spectrometry(CIEF MS) is reported. A capillary needle with a sheath flow tube pre mounted in one device serves as both the CIEF cathodic end and the ESI interface. The needle was inserted into the cathode reservoir at the focusing stage, and then removed to the front of sampler orifice of MS at the detection stage. Therefore, the shut off of the high voltage is not necessary and a better focusing protein zone is maintained during the ESI stage. The optimization of the experimental condition has been investigated and the two dimensional image of the E. coli proteins has been obtained, which is comparable with that from a 2D gel. 展开更多
关键词 蛋白质 毛细管等电聚焦-质谱 接口 分离 鉴定 大肠杆菌 蛋白质组学
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植物蛋白质组学研究进展 被引量:58
6
作者 梁宇 荆玉祥 沈世华 《植物生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期114-125,共12页
蛋白质组学是后基因组时代功能基因组学研究的新兴学科和热点领域。该文简要介绍了蛋白质组学产生的科学背景、研究方法和研究内容。蛋白质组学研究方法主要有双向聚丙烯酰胺凝胶电泳 (2D_PAGE)、质谱(Mass_spectrometric)技术、蛋白质... 蛋白质组学是后基因组时代功能基因组学研究的新兴学科和热点领域。该文简要介绍了蛋白质组学产生的科学背景、研究方法和研究内容。蛋白质组学研究方法主要有双向聚丙烯酰胺凝胶电泳 (2D_PAGE)、质谱(Mass_spectrometric)技术、蛋白质芯片 (Proteinchips)技术、酵母双杂交系统 (Yeasttwo_hybridsystem)、植物蛋白质组数据库等。其应用的范围包括植物群体遗传学、在个体水平上植物对生物和非生物环境的适应机制、植物的发育和组织器官的分化过程 ,以及不同亚细胞结构在生理生态过程中的作用等诸多方面。 展开更多
关键词 双向电泳 质谱 蛋白质组 植物蛋白质组学
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运用蛋白质组学方法研究肾阳虚异病同证的思路与方法 被引量:14
7
作者 黄黎明 梁恒 《上海中医药杂志》 北大核心 2005年第5期44-46,共3页
探讨运用蛋白质组学技术研究肾阳虚异病同证的思路与方法。分析蛋白质组学与证候的内在联系,采用双向电泳(2-DE) +质谱(MS) +数据库的蛋白质组解决方案及药理学实验方法,探求肾阳虚证的蛋白质学本质。
关键词 证候 肾阳虚 异病同证 蛋白质组 双向电泳
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蛋白质组学研究技术及其在果树学中的应用 被引量:12
8
作者 曹尚银 张秋明 +1 位作者 郭俊英 陈玉玲 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期138-142,共5页
蛋白质组研究是当今生命科学发展的一个新的增长点,它能阐明基因组所表达的真正执行生命活动的全 部蛋白质的表达规律和生物功能。简要介绍了蛋白质组学产生的科学背景、研究方法和研究内容。蛋白质组学研究 方法主要有双向聚丙烯酰胺... 蛋白质组研究是当今生命科学发展的一个新的增长点,它能阐明基因组所表达的真正执行生命活动的全 部蛋白质的表达规律和生物功能。简要介绍了蛋白质组学产生的科学背景、研究方法和研究内容。蛋白质组学研究 方法主要有双向聚丙烯酰胺凝胶电泳(2D-PAGE)、质谱(Mass-spectrometric)技术、蛋白质芯片(Protein chips)技术、酵母 双杂交系统(Yeast two-hybrid system)、双向高效柱层析和生物信息学等。其应用的范围包括植物群体遗传学、在个体 水平上植物对生物和非生物环境的适应机制、植物的发育和组织器官的分化过程,以及不同亚细胞结构在生理生态 过程中的作用等诸多方面。同时展望了植物蛋白质组学研究前景以及蛋白质组学技术在果树学中的应用前景。 展开更多
关键词 蛋白质组学 双向电泳 生物质谱 双向高效柱层析 生物信息学 果树学
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猪源大肠杆菌 O157:H7与 O157的差异蛋白质组学分析 被引量:5
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作者 谢宇舟 密克 +7 位作者 李军 陈泽祥 许力干 杨威 闭炳芬 禤雄标 潘艳 胡帅 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期531-537,共7页
为了阐述O157:H7与O157的致病力差异与蛋白质表达差异之间的关系,我们利用双向电泳技术和质谱技术对大肠杆菌两类菌株之间进行蛋白质组学差异分析。菌体蛋白经双向电泳技术分离后,利用软件Image Master TM2DPlatinum7.0对所得双向电泳... 为了阐述O157:H7与O157的致病力差异与蛋白质表达差异之间的关系,我们利用双向电泳技术和质谱技术对大肠杆菌两类菌株之间进行蛋白质组学差异分析。菌体蛋白经双向电泳技术分离后,利用软件Image Master TM2DPlatinum7.0对所得双向电泳图谱进行差异分析并借助质谱技术对差异蛋白质点进行鉴定,获得了背景清晰、分辨率高、重复性好的菌体总蛋白的双向电泳图谱。两样品图谱差异分析结果表明,共确定了28个有效的蛋白质差异点(Av.ratio>2.0,ANOVA<0.05),经质谱鉴定将这28个差异点注释成23种蛋白质。对得到注释的23种蛋白质进行功能分类,发现7类蛋白质与致病性密切相关,即溶菌酶抑制剂、通用应激蛋白、LuxS、鞭毛蛋白以及3种外膜蛋白。本结果将为进一步研究O157:H7菌株的致病因子,探究O157:H7与其它大肠杆菌菌株的致病力差异,以及建立快速鉴别诊断O157:H7的试剂盒提供重要的依据。 展开更多
关键词 大肠杆菌 肠出血性大肠杆菌 O157 H7 O157 蛋白质组学 差异表达
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双向电泳联合免疫印迹技术分析日本血吸虫成虫可溶性抗原 被引量:3
10
作者 郑辉 吴赟 +3 位作者 余轶婧 钟政荣 罗庆礼 沈继龙 《临床输血与检验》 CAS 2009年第2期107-112,共6页
目的建立及优化日本血吸虫成虫的蛋白质组学分析方法,寻找可溶性蛋白组分中与免疫应答相关的特异性成虫抗原。方法纯化日本血吸虫成虫可溶性蛋白,应用双向电泳(2D-E)结合免疫印迹技术(Western blotting),获得相应的电泳图谱和免疫印迹图... 目的建立及优化日本血吸虫成虫的蛋白质组学分析方法,寻找可溶性蛋白组分中与免疫应答相关的特异性成虫抗原。方法纯化日本血吸虫成虫可溶性蛋白,应用双向电泳(2D-E)结合免疫印迹技术(Western blotting),获得相应的电泳图谱和免疫印迹图谱,应用PDQuest8.0双向电泳图像分析软件对图像进行分析比对,鉴别特异性抗原。结果血吸虫成虫可溶性蛋白经双向电泳后,考马斯亮蓝G250染色,电泳图谱显示约152个主要蛋白斑点。分子量(Mr)分布约为14~114kD;等电点(pI)主要集中在4.9~9.5。进一步的Western blotting鉴定结果显示:实验组图像可见的抗原抗体反应点数目约57个,对照组为0。结论双向电泳联合免疫印迹技术是成功分析蛋白质组学的技术关键,该技术为寻找日本血吸虫特异性抗原开辟了新途径。 展开更多
关键词 日本血吸虫 蛋白质组学 成虫特异性抗原 双向电泳 免疫印迹
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小鼠腹水瘤巨噬细胞对大肠杆菌O157免疫应答的膜蛋白质组学研究 被引量:1
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作者 张国林 杨天赐 +1 位作者 黄建伟 王三英 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期596-601,共6页
采用膜亚蛋白质组学方法研究小鼠腹水瘤巨噬细胞Raw 264.7对致病性大肠杆菌O157的免疫应答反应,筛选并鉴定到24个差异表达的膜蛋白质.这些膜蛋白质与细胞免疫、细胞周期、细胞发育、细胞骨架、细胞生长等有关.在蛋白质水平上对巨噬细胞... 采用膜亚蛋白质组学方法研究小鼠腹水瘤巨噬细胞Raw 264.7对致病性大肠杆菌O157的免疫应答反应,筛选并鉴定到24个差异表达的膜蛋白质.这些膜蛋白质与细胞免疫、细胞周期、细胞发育、细胞骨架、细胞生长等有关.在蛋白质水平上对巨噬细胞与大肠杆菌间的相互作用关系进行了一些探索性研究,为进一步揭示机体对病原反应的作用机制提供理论基础. 展开更多
关键词 细胞微生物学 蛋白质组学 巨噬细胞 大肠杆菌
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高原脑水肿患者血浆的蛋白质组学研究 被引量:3
12
作者 张元元 段瑞峰 汪海 《中国应用生理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期180-184,共5页
目的:高原脑水肿是急性高原病的重症表现之一,其发病机制尚不完全清楚。本实验目的是应用蛋白质组学方法研究高原脑水肿发病时血浆蛋白质表达的变化,为研究高原脑水肿发病分子机制以及高原脑水肿的预防、诊断及治疗提供重要的分子标志... 目的:高原脑水肿是急性高原病的重症表现之一,其发病机制尚不完全清楚。本实验目的是应用蛋白质组学方法研究高原脑水肿发病时血浆蛋白质表达的变化,为研究高原脑水肿发病分子机制以及高原脑水肿的预防、诊断及治疗提供重要的分子标志物。方法:应用二维凝胶电泳(2D)结合质谱的方法比较了一例高原脑水肿(HACE)患者与高原肺水肿(HAPE)和轻型急性高原反应(mAMS)患者血浆蛋白表达的差异,对差异蛋白进行鉴定,最后用ELISA方法检测载脂蛋白E含量。结果:我们检测到HACE与HAPE患者血浆比较有6个差异蛋白质点,HACE与mAMS患者血浆比较也有6个差异蛋白质点,质谱鉴定结果显示两组比较中都有载脂蛋白E含量变化,ELISA检测结果与二维凝胶电泳结果一致。结论:本实验首次将蛋白质组学技术应用到高原脑水肿研究中,并且发现了可能与高原脑水肿发病密切相关的载脂蛋白E,该蛋白对于研究高原脑水肿发病分子机制以及疾病的预防、诊断及治疗的意义有待进一步研究。 展开更多
关键词 高原脑水肿 高原肺水肿 急性高原反应 蛋白质组学 载脂蛋白e
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腋窝淋巴结转移与无转移乳腺浸润性导管癌患者癌组织中差异表达蛋白的筛选与验证 被引量:3
13
作者 杨亮 许文婷 +6 位作者 赵倩 吴涛 迪力夏提·金汗 李丹 杜露 王波 朱丽萍 《山东医药》 CAS 2019年第29期5-8,共4页
目的采用蛋白质组学技术分析乳腺浸润性导管癌组织的蛋白谱,寻找腋窝淋巴结转移与无转移患者的差异表达蛋白。方法选择行乳腺癌改良根治术的原发乳腺浸润性导管癌患者12例,其中腋窝淋巴结转移7例,腋窝淋巴结未转移5例。术中留取乳腺癌... 目的采用蛋白质组学技术分析乳腺浸润性导管癌组织的蛋白谱,寻找腋窝淋巴结转移与无转移患者的差异表达蛋白。方法选择行乳腺癌改良根治术的原发乳腺浸润性导管癌患者12例,其中腋窝淋巴结转移7例,腋窝淋巴结未转移5例。术中留取乳腺癌组织、癌旁组织和正常乳腺组织标本,提取组织样本中的蛋白,采用二维凝胶电泳法分析淋巴结转移和未转移乳腺癌组织的差异表达蛋白位点,蛋白表达量的差异倍数>2.0或<0.5且具有重复性时认为是差异表达蛋白位点(以癌旁组织和正常乳腺组织标本做对照,排除个体差异的影响);采用二维凝胶电泳结合基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱对筛选出来的差异蛋白位点进行质谱鉴定。另取164例乳腺浸润性导管癌组织(其中腋窝淋巴结转移66例、无腋窝淋巴结转移98例),采用免疫组化SP法检测腋窝淋巴结转移与无转移患者癌组织中的差异表达蛋白。结果12例乳腺癌组织中,腋窝淋巴结转移和未转移乳腺癌组织共检出差异表达蛋白87个,其中差异表达最显著的6个蛋白分别是核基质结合区结合蛋白1(SATB1)、埃兹蛋白(Ezrin)、微管解聚蛋白(Stathmin)、E-钙黏附蛋白(E-cadherin)、Maspin蛋白、肿瘤转移抑制基因蛋白(KAI-1)。164例乳腺浸润性导管癌组织中,腋窝淋巴结转移乳腺癌组织Ezrin、KAI-1阳性表达率均高于未转移乳腺癌组织,E-cadherin蛋白阳性表达率低于未转移乳腺癌组织(P均<0.05)。结论乳腺浸润性导管癌腋窝淋巴结转移与无转移患者癌组织中Stathmi、KAI-1、E-cadherin蛋白表达存在差异,这些蛋白可能在淋巴结转移过程中发挥一定作用,可能作为评价乳腺癌淋巴转移的标志物。 展开更多
关键词 乳腺癌 淋巴结转移 蛋白质组学 二维凝胶电泳 埃兹蛋白 微管解聚蛋白 钙黏附蛋白
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大鼠挤压伤解压后各时间点蛋白质组学差异 被引量:1
14
作者 吴超 张赛 +2 位作者 张椿钰 王恺 程明 《解放军医药杂志》 CAS 2020年第1期16-22,共7页
目的通过对挤压伤大鼠血清进行检测,筛选出相关差异表达蛋白,了解疾病的发展及转归,为挤压伤的临床治疗提供依据。方法将大鼠随机分为对照组(C组)、0 h组(Z组)、12 h组(T组)、72 h组(S组),每组10只,使用自研挤压平台对大鼠进行挤压造模... 目的通过对挤压伤大鼠血清进行检测,筛选出相关差异表达蛋白,了解疾病的发展及转归,为挤压伤的临床治疗提供依据。方法将大鼠随机分为对照组(C组)、0 h组(Z组)、12 h组(T组)、72 h组(S组),每组10只,使用自研挤压平台对大鼠进行挤压造模,运用iTRAQ技术对大鼠血清进行蛋白质组学检测,并运用蛋白组学分析方法对结果进行分析。结果本实验共鉴定出568个蛋白,汇总筛选出变化趋势相同的蛋白共得到110个共同差异蛋白。剔除变化小于1.5倍(包括1.5倍)的蛋白,得到上调蛋白18个,下调蛋白11个。STRING网络互作分析得到Pkm、Pgam2、Aldoa、Pygm、Serpina3n、Hp、A2m、Fgg、Fn1、Lcn2、Adssl1、Pvalb、Serpina6、Afm处于关键节点。差异蛋白KEGG通路富集结果糖酵解/糖异生、胰高血糖素信号通路、碳代谢、癌症中的中枢碳代谢均为与糖代谢有关的通路。结论糖酵解对挤压伤的进展有重要意义,相关糖代谢酶类Aldoa、Pgam2、Pkm及14-3-3蛋白ε、维生素E结合蛋白可能对判断疾病进程有一定参考价值,CK作为既往血液指标与疾病进程相关。血清白蛋白可能在治疗挤压伤中有一定作用。 展开更多
关键词 挤压伤 血清蛋白组学 糖酵解 碳代谢 维生素e结合蛋白 大鼠 Wistar
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钙黏蛋白E与糖尿病肾病的相关性研究 被引量:4
15
作者 姜洪娟 柳刚 +1 位作者 迟翔宇 张玄 《中华肾脏病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期351-355,共5页
目的应用蛋白质组学技术筛选糖尿病肾病(DN)患者尿液的相关差异蛋白,检测差异蛋白钙黏蛋白E(E-cadherin)在DN患者尿液及肾组织中的表达,以期发现新的DN相关差异蛋白。方法选择本院经肾活检确诊的1型DN(TIDN)和2型DN(T2DN)患者... 目的应用蛋白质组学技术筛选糖尿病肾病(DN)患者尿液的相关差异蛋白,检测差异蛋白钙黏蛋白E(E-cadherin)在DN患者尿液及肾组织中的表达,以期发现新的DN相关差异蛋白。方法选择本院经肾活检确诊的1型DN(TIDN)和2型DN(T2DN)患者各12例,同时选择肾病综合征(NS)患者及健康志愿者各12例作为对照。应用2DE/MS比较蛋白质组学技术筛选DN患者及对照组人群尿中的DN相关差异蛋白。采用Western印迹法验证尿中差异蛋白的表达,免疫组织化学法检测肾组织中差异蛋白的表达。结果2DE/MS结果显示,与NS组和健康对照组相比,T1DN组和T2DN组患者有1个差异蛋白点的蛋白丰度呈异常升高,经鉴定为E-cadherin。Western印迹结果显示,与NS和健康对照组相比,TIDN和T2DN组患者尿液中E-cadherin表达明显增高(均P〈0.01)。免疫组化结果显示,E-cadherin主要表达于肾小管上皮细胞的细胞膜和细胞质,其在DN肾脏中的表达较健康对照组显著降低(P〈0.05)。结论DN患者尿液中E-cadherin蛋白特异性升高,可作为一种新的DN相关差异性蛋白。 展开更多
关键词 糖尿病肾病 蛋白质组学 尿液 钙黏蛋白e
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戊型肝炎病毒感染HepG2细胞蛋白质组学研究
16
作者 毕艳红 崔成成 +3 位作者 杨臣臣 井申荣 曾韦锟 黄芬 《医学分子生物学杂志》 CAS 2015年第1期1-6,共6页
比较人肝癌细胞系HepG2细胞感染和未感染HEV后细胞内蛋白质表达谱的变化,为初步探索HEV在宿主细胞内感染机制及致病机理奠定基础。方法RT.nPCR和免疫荧光确认HEV感染HepG2细胞后.利用同位素标记相对和绝对定量(isobarictagsforrelat... 比较人肝癌细胞系HepG2细胞感染和未感染HEV后细胞内蛋白质表达谱的变化,为初步探索HEV在宿主细胞内感染机制及致病机理奠定基础。方法RT.nPCR和免疫荧光确认HEV感染HepG2细胞后.利用同位素标记相对和绝对定量(isobarictagsforrelativeandabsolutequantitation,iTRAQ)技术比较HEV感染组与未感染组HepG2细胞蛋白质表达差异。结果HEV感染导致328种蛋白发生变化,与未感染组相比,262种蛋白表达上调,66种蛋白表达下调。结论HEV感染HepG2细胞导致大量蛋白差异表达.功能预测表明这些蛋白涉及到宿主的物质代谢、细胞信号转导、免疫蛋白、细胞骨架成分等方面,为今后研究HEV感染机制和致病机理奠定基础。 展开更多
关键词 戊型肝炎病毒 HePG2细胞系 蛋白质组学
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基于蛋白组学尿道下裂患儿的差异蛋白特点分析及相关蛋白ZEB1的表达
17
作者 农一敏 张宝欣 乌日尼勒图 《临床泌尿外科杂志》 CAS 2021年第4期288-292,共5页
目的:基于蛋白组学观察尿道下裂患儿的差异蛋白特点,并分析相关蛋白ZEB1的表达。方法:收集我院2018年6月—2019年12月泌尿外科44例尿道下裂患儿外周血标本,同时收集44例健康体检儿童血液样本。取两组患儿血浆样本,提取总蛋白,进行二位... 目的:基于蛋白组学观察尿道下裂患儿的差异蛋白特点,并分析相关蛋白ZEB1的表达。方法:收集我院2018年6月—2019年12月泌尿外科44例尿道下裂患儿外周血标本,同时收集44例健康体检儿童血液样本。取两组患儿血浆样本,提取总蛋白,进行二位凝胶电泳分离和图像分析,筛选出差异蛋白,利用质谱技术进行鉴定,并运用RT-PCR方法测定相关蛋白ZEB1mRNA的表达。结果:共筛选出44个差异表达蛋白,通过质谱分析和数据库检索论证,其中上调32个蛋白,下调12个蛋白;上调前5的蛋白有转录因子HES-1、膜联蛋白A3、E盒结合锌指蛋白1、锌指蛋白12和蓬乱蛋白,下调前5的蛋白则有锌转运蛋白10、肌球蛋白9、重组人碱性成纤维细胞生长因子受体2、胰岛素样生长因子2及肌球蛋白12。GO功能分析显示,差异蛋白主要参与了碱基化合物合成、细胞代谢、DNA转录、RNA代谢等生物学过程。KEGG通路分析表明这些蛋白主要集中在信号通路Th17细胞、Jak-STAT信号通路、Wnt信号通路等。通过STRING数据库构建差异蛋白相互作网络分析发现,差异蛋白ZEB1与STAT3、STAT6、CDH1、EB2、CDH2、CTBP1、SUMO1和TP53BP1关系较为密切。尿道下裂患儿血浆中ZEB1 mRNA表达量为(1.04±0.14),显著高于健康对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论:运用蛋白组学方法明确了尿道下裂患儿血清差异蛋白质的表达,ZEB1在尿道下裂发生过程中具有重要作用。 展开更多
关键词 蛋白组学 尿道下裂 e盒结合锌指蛋白1
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致肾盂肾炎大肠杆菌132的比较蛋白质组学研究
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作者 郭丽茹 陈锦英 +1 位作者 杨东靖 董杰 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第11期967-971,共5页
目的研究致肾盂。肾炎大肠杆菌(UPEC)132与UPEC J96及非致病性大肠杆菌K-12MG1655的蛋白质组表达差异。方法采用双向凝胶电泳技术(2-DE)比较UPEC 132、UPEC J96与非致病性大肠杆菌K-12MG1655的菌体蛋白表达图谱差异,差异蛋白用胰... 目的研究致肾盂。肾炎大肠杆菌(UPEC)132与UPEC J96及非致病性大肠杆菌K-12MG1655的蛋白质组表达差异。方法采用双向凝胶电泳技术(2-DE)比较UPEC 132、UPEC J96与非致病性大肠杆菌K-12MG1655的菌体蛋白表达图谱差异,差异蛋白用胰蛋白酶进行胶内酶切,肽混合物使用基质辅助激光解吸-电离飞行时间质谱仪(MALDI—TOF—MS)进行质谱分析,将肽质量指纹谱数据输入互联网上的蛋白质数据库进行检索。结果UPEC132识别蛋白点数(466±11)明显高于Ecoli K-12 MG1655(338±15),也高于UPEC J96(382±12);3菌株共有的蛋白点为298个,2株UPEC共有的蛋白点为56个,UPEC 132特有的蛋白点为89个。MALDI—TOF—MS分析获得UPEC132特异的及显著上调表达的蛋白点22个,涉及毒力因子、物质代谢转运、蛋白合成调节、生物氧化及未知功能的多种蛋白质。结论UPEC菌株与非致病性大肠杆菌间的蛋白质组存在差异,UPEC 132与J96蛋白质组间也有显著不同,为其致病机制的深入研究提供线索。 展开更多
关键词 致肾盂肾炎大肠杆菌 比较蛋白质组学 临床研究 生物氧化
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UPLC/Q-TOF-MS法对凝血酶冻干粉中的蛋白组分进行鉴定和定量分析 被引量:1
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作者 徐小玲 胡远华 《中国新药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第11期1321-1325,1329,共6页
目的:建立UPLC/Q-TOF-MS法鉴定市售凝血酶冻干粉中的蛋白组分并进行定量。方法:样品经胰蛋白酶消化后的多肽混合物,用超高效液相色谱进行分离,并在线进入ESI—Q—TOF—MS检测,获得的肽段一级母离子和碎片离子的高分辨准确质量数据... 目的:建立UPLC/Q-TOF-MS法鉴定市售凝血酶冻干粉中的蛋白组分并进行定量。方法:样品经胰蛋白酶消化后的多肽混合物,用超高效液相色谱进行分离,并在线进入ESI—Q—TOF—MS检测,获得的肽段一级母离子和碎片离子的高分辨准确质量数据(MS^E方法),经ProteinLynx Global Server(PLGS2.4)软件蛋白质谱库检索,确定其中的蛋白组分,再以Hi3非标记蛋白定量方法对各蛋白组分进行定量,得到质量百分比定量结果。结果:在以猪血为原料生产的26批凝血酶冻干粉中,鉴定出人血白蛋白和21种猪源蛋白,其中,有1家企业的3批样品中鉴定出猪和人血浆成分,其余23批次样品均为猪血浆成分;样品中的猪凝血酶含量在1.9%~43.7%之间。在以牛血为原料生产的3批凝血酶冻干粉中共鉴定出17种牛源蛋白;样品中的牛凝血酶含量在49.4%~77.6%之间。结论:UPLC/Q-TOF—MS法灵敏度高,选择性好,通过一次分析可对凝血酶冻干粉中蛋白组分同时进行定性和定量,并可获得有关工艺相关的数据信息如来源和种属等,可用于本品的工艺研究以及质量控制研究。该法可以作为同类生化药物质量研究和组分分析的方法。 展开更多
关键词 凝血酶冻干粉 UPLC Q—TOF—MS MS^e 蛋白鉴定 Hi3定量 非标记定量 定量蛋白组学
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