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杏NBS基因家族鉴定及其对果实抗病性的影响
被引量:
3
1
作者
秦兆辉
张俊环
+4 位作者
杨丽
张美玲
王玉柱
姜凤超
孙浩元
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期321-331,共11页
【目的】探讨杏果实发育过程中NBS基因家族的表达规律,为果实抗病机制研究提供理论指导。【方法】运用生物信息学方法进行NBS基因家族鉴定与转录组分析。【结果】在串枝红杏基因组中共鉴定到155个NBS抗病基因,主要分为CNL型(126个)和NL...
【目的】探讨杏果实发育过程中NBS基因家族的表达规律,为果实抗病机制研究提供理论指导。【方法】运用生物信息学方法进行NBS基因家族鉴定与转录组分析。【结果】在串枝红杏基因组中共鉴定到155个NBS抗病基因,主要分为CNL型(126个)和NL型(29个),45%的基因主要分布在1号与2号染色体上,顺式作用元件较多且大多属于激素调控元件,发现1个杏特有的基序CNBS-1。NBS基因在不同品种发育过程中的基因表达模式类似,但在表达量上存在较大差异。8个NBS基因在串枝红果实发育的4个时期表达量均显著高于同时期大白杏,表明这些基因可能与串枝红果实抗病性高于大白杏有关。【结论】获得8个NBS差异表达基因,主要与抗致病疫霉病原与霜霉病原有关,为杏果实抗病育种提供理论指导。
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关键词
杏(
prunus
armeniaca
l
.)
NBS基因家族
抗病育种
生物信息学
下载PDF
职称材料
题名
杏NBS基因家族鉴定及其对果实抗病性的影响
被引量:
3
1
作者
秦兆辉
张俊环
杨丽
张美玲
王玉柱
姜凤超
孙浩元
机构
北京市农林科学院林业果树研究所
农业农村部华北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室
出处
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期321-331,共11页
基金
国家重点研发计划项目(2019YFD1001203
2018YFD1000606-4)
+2 种基金
北京市农林科学院青年基金(QNJJ201925)
北京市林业果树科学研究院基金(LGYJJ202002)
国家林业和草原局杏工程技术研究中心。
文摘
【目的】探讨杏果实发育过程中NBS基因家族的表达规律,为果实抗病机制研究提供理论指导。【方法】运用生物信息学方法进行NBS基因家族鉴定与转录组分析。【结果】在串枝红杏基因组中共鉴定到155个NBS抗病基因,主要分为CNL型(126个)和NL型(29个),45%的基因主要分布在1号与2号染色体上,顺式作用元件较多且大多属于激素调控元件,发现1个杏特有的基序CNBS-1。NBS基因在不同品种发育过程中的基因表达模式类似,但在表达量上存在较大差异。8个NBS基因在串枝红果实发育的4个时期表达量均显著高于同时期大白杏,表明这些基因可能与串枝红果实抗病性高于大白杏有关。【结论】获得8个NBS差异表达基因,主要与抗致病疫霉病原与霜霉病原有关,为杏果实抗病育种提供理论指导。
关键词
杏(
prunus
armeniaca
l
.)
NBS基因家族
抗病育种
生物信息学
Keywords
Apricot(
prunus armeniaca l
.)
NBSgenefami
l
y
Disease-resistantbreeding
Bioinformatics
分类号
S662.2 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
杏NBS基因家族鉴定及其对果实抗病性的影响
秦兆辉
张俊环
杨丽
张美玲
王玉柱
姜凤超
孙浩元
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
3
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