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植物病原细菌Pseudomonas syringae pv.tomato基因组中的信号肽分析 被引量:12
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作者 刘雅婷 李正跃 +2 位作者 朱有勇 李成云 李永忠 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期959-964,共6页
应用SignaIP 3.0对植物病原细菌Pseudomonas syringae pv.tomato DC3000菌株基因组中的细菌染色体全部5 615个ORFs进行了分析,确定其中679个ORFs所编码蛋白质的N-端有信号肽序列,其中已经命名并有注释的有107个ORFs.信号肽的长度以19~3... 应用SignaIP 3.0对植物病原细菌Pseudomonas syringae pv.tomato DC3000菌株基因组中的细菌染色体全部5 615个ORFs进行了分析,确定其中679个ORFs所编码蛋白质的N-端有信号肽序列,其中已经命名并有注释的有107个ORFs.信号肽的长度以19~31个氨基酸居多,其中最多的是23个氨基酸的信号肽.具有信号肽的ORFs编码蛋白的长度大多为101~400个氨基酸之间.同时,对组成信号肽的氨基酸种类作了系统的分析,发现组成信号肽的氨基酸中非极性氨基酸占48.54%,极性氨基酸占18.67%,带负电荷氨基酸占24.54%,带正电荷氨基酸仅占8.00%,出现最多的3种氨基酸依次为亮氨酸、丙氨酸和丝氨酸,最少的氨基酸是异亮氨酸,在切割位点-1端的氨基酸中83.21%均为丙氨酸,在切割位点后3位的氨基酸中最多的氨基酸也是丙氨酸.通过分析确定628个分泌类信号肽,36个信号肽具有RR-motif的保守区段,15个脂蛋白类信号肽,未发现Prepiln-like信号肽和Bacteriocin and Pheromone信号肽. 展开更多
关键词 pseudomonas syringae pv.tomato ORF 信号肽 RR-motif 脂蛋白
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引起梨花枯和芽枯的Pseudomonas syringae pv.syringae病原细菌鉴定 被引量:8
2
作者 邱文 徐福寿 +5 位作者 谢关林 徐丽慧 怀雁 李斌 余山红 钱军 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第9期2657-2662,共6页
【目的】明确在中国发生的梨花枯和芽枯的确切病原菌。【方法】用普通细菌学方法、电镜观察、Koch氏病原假说测定、Biolog、脂肪酸分析、PCR及与标准对照菌株的比较。【结果】从16个病样中分离获得12菌株,6株代表菌株显示出与Pseudomona... 【目的】明确在中国发生的梨花枯和芽枯的确切病原菌。【方法】用普通细菌学方法、电镜观察、Koch氏病原假说测定、Biolog、脂肪酸分析、PCR及与标准对照菌株的比较。【结果】从16个病样中分离获得12菌株,6株代表菌株显示出与Pseudomonas syringaepv.syringae3株标准对照菌株相似的致病反应,它们的Biolog和脂肪酸分析的相似度分别为0.57~0.86和0.58~0.81,PCR和序列测定结合上述结果证实了P.syringaepv.syringae为该病的病原菌。【结论】首次证实了中国梨树上的花枯和芽枯可由P.syringaepv.syringae引起。 展开更多
关键词 梨花枯 梨芽枯 pseudomonas syringae pv.syringae 证实
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烟草野火病菌Pseudomonas syringae pv.tabaci yuexi-1信号肽预测及分析 被引量:5
3
作者 王铁霖 李晶 +1 位作者 杨玉文 赵廷昌 《中国烟草学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第1期92-100,共9页
利用Signal P 4.0、Lipo P 1.0及TMHMM v2.0对烟草野火病菌Pseudomonas syringae pv.tabaci yuexi-1菌株基因组中信号肽的数量、长度和氨基酸组成进行了预测及分类。结果确定其中432个ORFs(Open reading frame)所编码的N端有信号肽序... 利用Signal P 4.0、Lipo P 1.0及TMHMM v2.0对烟草野火病菌Pseudomonas syringae pv.tabaci yuexi-1菌株基因组中信号肽的数量、长度和氨基酸组成进行了预测及分类。结果确定其中432个ORFs(Open reading frame)所编码的N端有信号肽序列,占全部ORFs的8.81%。其中351条分泌型信号肽(SPI),81条脂蛋白型信号肽(SPII)。在分泌型信号肽中,信号肽的长度为11~42个氨基酸,以长度为22个氨基酸的信号肽最多。同源性分析结果显示,具有相同信号肽序列的不同蛋白序列之间是高度保守的。该研究提供了野火病原菌致病因子的备选基因,提高该病菌致病因子的筛选效率。 展开更多
关键词 pseudomonas syringae pv.tabaci 信号肽 Signal P 4.0 Lipo P 1.0 TMHMM v2.0
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陕西省猕猴桃细菌性溃疡病菌(Pseudomonas syringae pv.actinidiae)Rep-PCR的遗传多样性分析 被引量:12
4
作者 高小宁 郑州 +2 位作者 赵志博 秦虎强 黄丽丽 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期340-349,共10页
【目的】由丁香假单胞猕猴桃致病变种(Pseudomonas syringae pv.actinidiae,Psa)引起的溃疡病是猕猴桃生产中最具毁灭性的病害,明确病菌的群体遗传特性将对了解病害发生规律和防治策略的制定具有重要理论意义。【方法】采用ERIC-PCR(ent... 【目的】由丁香假单胞猕猴桃致病变种(Pseudomonas syringae pv.actinidiae,Psa)引起的溃疡病是猕猴桃生产中最具毁灭性的病害,明确病菌的群体遗传特性将对了解病害发生规律和防治策略的制定具有重要理论意义。【方法】采用ERIC-PCR(enterobacterial repetitive inter-genic consensus)和BOX-PCR指纹技术分析了陕西省猕猴桃主要栽培区Psa的遗传特性。【结果】ERIC-PCR聚类结果显示,相似系数为0.626时,72个Psa菌株被分为6个类群,其中供试菌株中的75.7%属于第Ⅱ类群,且菌株无明显的采集地和寄主品种的聚类。BOX-PCR指纹聚类分析可将86个Psa菌株分为8个类群(相似系数为0.668),其中第Ⅰ类群菌株数量最多,占供试菌株数量的69.8%,其地理来源为眉县、周至、杨凌及其全部的意大利供试菌株,其中来源眉县的81.6%的菌株都聚集在该类群;菌株未表现出明显的寄主品种类群。【结论】陕西省猕猴桃溃疡病菌基因组存在丰富的遗传多样性;ERIC-PCR和BOX-PCR多态性分析技术可为我国Psa基因多样性的研究提供一个有效途径。 展开更多
关键词 猕猴桃细菌性溃疡病菌 ERIC-PCR BOX-PCR 遗传多样性
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烟草野火病菌(Pseudomonas syringae pv.tabaci)对烟草细胞内5种防御酶系统的影响 被引量:22
5
作者 阚光锋 张广民 +1 位作者 房保海 刘萍 《山东农业大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2002年第1期28-31,共4页
定期测定了感病品种红花大金元接种烟草野火病菌后叶片内 5种酶活性的动态变化 ,研究结果表明 :烟草接种病菌后 ,SOD活性先上升 ,后在 8d下降 ,低于对照 ;POD活性接种后在 1d略低于对照 ,后上升较快 ,10d达到高峰 ,此后一直高于对照 ;PP... 定期测定了感病品种红花大金元接种烟草野火病菌后叶片内 5种酶活性的动态变化 ,研究结果表明 :烟草接种病菌后 ,SOD活性先上升 ,后在 8d下降 ,低于对照 ;POD活性接种后在 1d略低于对照 ,后上升较快 ,10d达到高峰 ,此后一直高于对照 ;PPO活性在接种后 1d低于对照 15 .8% ,但此后上升 ,16d达到高峰 ,18d下降低于对照 ;CAT活性变化与POD相似 ,接种 1d低于对照 ,但此后一直高于对照 ,并于 6d达到高峰 ,10d虽有所下降 ,但接着升高 ;PAL活性与CAT、POD变化相似 ,接种后 1d活性低于对照 2 8.3% ,其后上升 ,10d达到高峰 ,是对照的 2 .11倍 。 展开更多
关键词 烟草 烟草野火病菌 超氧化物歧化酶 过氧化物酶 过氧化氢酶 烟草细胞 防御酶
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云南烟草野火病病原细菌(Pseudomonas syringae pv.tabaci)鉴定 被引量:7
6
作者 刘雅婷 张世珖 +1 位作者 李永忠 杨焕文 《云南农业大学学报》 CAS CSCD 2002年第1期4-9,共6页
对云南省各大烟区烟草叶片上引起褪绿晕圈的病原细菌从形态学、培养性状、生理生化反应、抗菌素反应、抗血清反应、遗传性状等方面进行了鉴定。结果表明 :该菌为烟草野火病菌 [Pseudomonassyringaepv .tabaciWolf&Foser (1917)Young... 对云南省各大烟区烟草叶片上引起褪绿晕圈的病原细菌从形态学、培养性状、生理生化反应、抗菌素反应、抗血清反应、遗传性状等方面进行了鉴定。结果表明 :该菌为烟草野火病菌 [Pseudomonassyringaepv .tabaciWolf&Foser (1917)Young ,Dye&Wilkie (1978) ]。 展开更多
关键词 烟草 野火病 病原菌 鉴定
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吉林省大豆细菌性斑点病菌(Pseudomonas syringae pv.glycinea)生理小种鉴定结果初报 被引量:6
7
作者 张佳环 高洁 袁美丽 《吉林农业大学学报》 CAS CSCD 1993年第4期24-27,共4页
自1989年至1992年的四年间,在吉林省的长春、公主岭、吉林、白城、通化等地区的各大豆品种上分离到大豆细菌性斑点病菌的菌株146个,接种在7个国际鉴别寄主上,即Aeme,Chippwwa,Flambeau,Harosoy,Lindarin,Merit,Norchief,观察其抗感反应... 自1989年至1992年的四年间,在吉林省的长春、公主岭、吉林、白城、通化等地区的各大豆品种上分离到大豆细菌性斑点病菌的菌株146个,接种在7个国际鉴别寄主上,即Aeme,Chippwwa,Flambeau,Harosoy,Lindarin,Merit,Norchief,观察其抗感反应。将测定结果与国际上已鉴定的9个生理小种在这7个鉴别寄主上的反应相对照,发现有98个菌株属4号生理小种,占总菌株数的67.1%,为主要菌株;4个菌株属2号生理小种;1个菌株属7号生理小种。经反复测定,发现两个新的生理小种,定名为10号和11号生理小种。 展开更多
关键词 大豆 细菌性 斑点病菌 生理小种
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烟草野火病菌(Pseudomonas syringae pv.tabaci)诊断试剂盒的制备及应用 被引量:3
8
作者 刘雅婷 张世珖 +1 位作者 李永忠 王绍坤 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期302-306,共5页
本研究通过筛选致病力强的烟草野火病菌株作为抗原 ,制备了烟草野火病菌特异性的抗血清 ,研制出SPA ELISA、间接 ELISA 2种诊断试剂盒 ,使检测真正作到了简便、快速、灵敏、准确。同时 ,应用这 2种诊断试剂盒对从田间及温室中采集的土... 本研究通过筛选致病力强的烟草野火病菌株作为抗原 ,制备了烟草野火病菌特异性的抗血清 ,研制出SPA ELISA、间接 ELISA 2种诊断试剂盒 ,使检测真正作到了简便、快速、灵敏、准确。同时 ,应用这 2种诊断试剂盒对从田间及温室中采集的土壤、烟株根围、田间杂草、种子进行检测 ,明确了云南烟草野火病的初侵染源主要为种子和根围。 展开更多
关键词 烟草 野火病菌 抗原 特异性 抗血清 诊断试剂盒 研制技术
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hrpZ_(Psg12) Gene of Pseudomonas syringae pv.glycinea can Enhance Pathogenicity of the Pathogen on Soybean and Cause the Hypersensitive Response of Tobacco
9
作者 张佳环 李娟 高洁 《Plant Diseases and Pests》 CAS 2011年第3期9-13,共5页
[ Objective ] The paper was to confirrm the effect of hrpZpsg12 gene on the pathogenicity of Pseudomonas syringae pv. glycinea. [ Method ] hrpZpsg12 gene was cloned from P. syringae using PCR method. The knockout plas... [ Objective ] The paper was to confirrm the effect of hrpZpsg12 gene on the pathogenicity of Pseudomonas syringae pv. glycinea. [ Method ] hrpZpsg12 gene was cloned from P. syringae using PCR method. The knockout plasmid pKNOCK-Cm with suicide characteristics and cosmid pUFR034 with complementation func- tion were used to construct the mutation vector pKNOCK477-7 and complementary vector pUFR1026-68 of hrpZpsg12 gene, the mutant 477-1 and the functional com- plementation unit 1026-5 of the gene was also screened out. Three strains including wild-type Psg12, mutant 477-1 and complementary unit 1026-5 were simultane- ously inoculated into soybean leaves and tobacco leaves, then pathogenicity determination and hypersensitive reaction analysis were carried out. [ Result] All the inoculated leaves of soybean and tobacco produced reaction lesion. However, the sizes of reaction lesion were different. The lesion in the leaves inoculated with Psgl2 was relatively large, while the lesion in the leaves inoculated with 477-1 was relatively small; the lesion of complementary unit 1026-5 was similar to wild- type Psgl2. Analysis of reproduction quantity of bacteria in lesions showed that the reproduction quantity of wild-type Psg12 was the highest, while that of mutant 477-1 was the lowest. The reproduction quantity of complementary unit 1026-5 was similar to that of wild-type Psg12. [ Conclusion] hrpZpsg12 gene could enhance the pathogenicity of P. syrimgae on Soybean and produce hypersensitive response in tobacco. 展开更多
关键词 pseudomonas syringae pv. glycinea hrpZpsg2 gene Mutant PaTHOGENICITY China
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桑细菌性疫病菌[Pseudomonas syringae pv.mori(Boyer and lambert)Young et al]的冰核活性研究
10
作者 肖崇刚 《西南农业大学学报(自然科学版)》 CSCD 1993年第4期333-336,共4页
对不同桑园桑疫病菌(Pseudomonas syringae pv.mori(Boyer andlambert)Young et al)菌株的冰核活性测定表明,冰核活性细菌占17.8%.冰核活性菌不能利用山梨醇,但能产生硫化氢;而无冰核活性菌株则相反.
关键词 桑疫病菌 冰核活性细菌 病原细菌
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Functional identification of phenazine biosynthesis genes in plant pathogenic bacteria Pseudomonas syringae pv. tomato and Xanthomonas oryzae pv. oryzae 被引量:1
11
作者 LI Wen XU You-ping +4 位作者 Jean-Pierre Munyampundu XU Xin QI Xian-fei GU Yuan CAI Xin-zhong 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2016年第4期812-821,共10页
Phenazines are secondary metabolites with broad spectrum antibiotic activity and thus show high potential in biological control of pathogens. In this study, we identified phenazine biosynthesis (phz) genes in two ge... Phenazines are secondary metabolites with broad spectrum antibiotic activity and thus show high potential in biological control of pathogens. In this study, we identified phenazine biosynthesis (phz) genes in two genome-completed plant pathogenic bacteria Pseudomonas syringae pv. tomato (Pst) DC3000 and Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo) PXO99A. Unlike the phz genes in typical phenazine-producing pseudomonads, phz homologs in Pst DC3000 and Xoo PXO99A consisted of phzC/D/E/F/G and phzC/E1/E2/F/G, respectively, and the both were not organized into an operon. Detection experiments demonstrated that phenazine-l-carboxylic acid (PCA) of Pst DC3000 accumulated to 13.4 IJg L-1, while that of Xoo PXO99A was almost undetectable. Moreover, Pst DC3000 was resistant to 1 mg mL-1 PCA, while Xoo PXO99A was sensitive to 50 IJg mL ~ PCA. Furthermore, mutation of phzF blocked the PCA production and significantly reduced the pathogenicity of Pst DC3000 in tomato, while the complementary strains restored these phenotypes. These results revealed that Pst DC3000 produces low level of and is resistant to phenazines and thus is unable to be biologically controlled by phenazines. Additionally, phz-mediated PCA production is required for full pathogenicity of Pst DC3000. To our knowledge, this is the first report of PCA production and its function in pathogenicity of a plant pathogenic P. syringae strain. 展开更多
关键词 PaTHOGENICITY phenazine biosynthesis genes phenazine-l-carboxylic acid plant pathogenic bacteria pseudomonas syringae pv. tomato Xanthomonas oryzae pv. oryzae
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Pear Blossom Blast Caused by Pseudomonas syringae pv. syringae in China 被引量:1
12
作者 QIU Wen HUAI Yan +5 位作者 XU Fu-shou XU Li-hui XIE Guan-lin LI Bin YU Shan-hong LIU Jun-ying 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2008年第9期1091-1096,共6页
This study was done to determine the causal organism of the pear blossom and bud blast in China. It was identified by a bacteriological test, electro-microscopic observation, Koch's postulate test, Biolog, fatty acid... This study was done to determine the causal organism of the pear blossom and bud blast in China. It was identified by a bacteriological test, electro-microscopic observation, Koch's postulate test, Biolog, fatty acid methyl esters (FAMEs), and a polymerase chain reaction (PCR) test, and compared with the standard reference strains. Six representative strains out of 20 pathogenic bacterial isolates from 16 diseased samples showed characteristics similar to three standard strains of Pseudomonas syringae pv. syringae from Belgium. They were identified as P. syringae pv. syringae with a Biolog similarity of 0.57-0.86 and FAMEs similarity of 0.58-0.81. The bacterium was reisolated from the symptomatic plants and blossoms. Identification as P. syringae pv. syringae was confirmed by using PCR primers and sequence tests, and compared with the above-mentioned results. The data supported the fact that the pear blossom and bud blast in China could be caused by P. syringae pv. syringae. 展开更多
关键词 pear blossom blast pear bud blast pseudomonas syringae pv. syringae confirmation
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Identification of QTLs Associated with Resistance to Pseudomonas syringae pv.Glycinea in Soybean(Glycine max(L.)Merr)
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作者 Mei Hong-yao Liu Yang +2 位作者 Pan Xiao-cheng Su An-yu Wu Xiao-xia 《Journal of Northeast Agricultural University(English Edition)》 CAS 2021年第2期1-14,共14页
Soybean bacterial spot disease caused by Pseudomonas syringae pv.Glycinea which is a bacterial disease seriously affects soybean yield.Ten soybean germplasms and recombinant inbred lines(RILs)population were used to i... Soybean bacterial spot disease caused by Pseudomonas syringae pv.Glycinea which is a bacterial disease seriously affects soybean yield.Ten soybean germplasms and recombinant inbred lines(RILs)population were used to identify the resistant trait after inoculated with P.sg(P.sgneau001)in this study.High-density genetic mapping was obtained by specific length amplified fragment sequencing(SLAF-seq)of 149 RILs population which was derived from the crossing between Charleston and Dongnong594.The results indicated that 10 germplasm resources had four resistant germplasms included highly resistant cultivar Charleston,four susceptible varieties included Dongnong594 and two moderately resistant cultivars.Five quantitative trait locus(QTLs)were detected in RILs population by the composite interval mapping(CIM)method,and located on Linkage Group(LG)D1b(chromosome two),LG C2(chromosome six)and LG H(chromosome 12),respectively.LOD scores ranged from 2.68 to 4.95 and the phenotypic variation percentage was from 6%to 11%.Six candidate genes were detected,according to the result of gene annotation information.Four of them had relationship with protein kinase activity,protein phosphorylation and leucine rich repeat(LRR)transmembrane protein,which had high expression after inoculated with P.sg by qRT-PCR. 展开更多
关键词 SOYBEaN QTL mapping pseudomonas syringae pv.Glycinea bacterial spot disease candidate gene
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Establishment of a Loop-mediated Isothermal Amplification Method for Rice Bacterial Leaf Brown Spot Disease
14
作者 Zhang Jun-hua Wang Liang +8 位作者 Zhang Yao Ni Zhe Xu Xiao-feng Yang Ming-xiu Peng Li-li Yang Xin Wang Yi-han Jiang Xiao-jiao Haseeb Younis 《Journal of Northeast Agricultural University(English Edition)》 CAS 2023年第1期13-19,共7页
Rice bacterial leaf brown spot disease caused by Pseudomonas syringae pv.syringae(Pss)is a major disease on rice.In recent years,Pss has emerged worldwide,seriously affecting rice production.It is very important to es... Rice bacterial leaf brown spot disease caused by Pseudomonas syringae pv.syringae(Pss)is a major disease on rice.In recent years,Pss has emerged worldwide,seriously affecting rice production.It is very important to establish a rapid detection method of Pss for the diagnosis and prevention of this disease.In order to robust and accurately diagnose the rice bacterial leaf brown spot disease in the field and laboratory,an assay system for the Pss was developed in this study,and the specific sequence of hrcN was used as the target,based on loop-mediated isothermal amplification(LAMP).The best detection system was MgSO 48 mmol·L^(-1),Bst DNA polymerase 8 U,dNTP 1.4 mmol·L^(-1),the ratio of internal and outer primers was 2:1,the reaction temperature was 63℃,the reaction time was 45 min,and the lowest sensitivity was 104 CFU·mL^(-1).This results provided an accurate and robust method for laboratory and field diagnosis of bacterial leaf brown spot disease of rice. 展开更多
关键词 pseudomonas syringae pv.syringae loop-mediated isothermal amplification a rapid detection method
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Integrated Green Prevention and Control Techniques for Kiwifruit Canker Disease in "Guichang" Kiwifruit in Xiuwen County, Guizhou Province
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作者 Miao LI Xian WEI +4 位作者 Rong WU Shouying TANG Suran WAN Liqian JIANG Song BAI 《Agricultural Biotechnology》 CAS 2023年第5期30-34,42,共6页
Kiwifruit canker disease seriously affects the yield and quality of"Guichang"kiwifruit in Xiuwen County,Guizhou Province.In order to scientifically,safely,greenly and efficiently prevent and control the dise... Kiwifruit canker disease seriously affects the yield and quality of"Guichang"kiwifruit in Xiuwen County,Guizhou Province.In order to scientifically,safely,greenly and efficiently prevent and control the disease,theory was combined with prevention and control techniques to optimize existing prevention and control techniques,so as to improve the production yield and quality of kiwifruit.Specifically,biocontrol strains targeting local kiwifruit canker disease were screened,and reduced and mixed use of agrochemicals with improved efficiency was studied;and the effects and application techniques of disease resistance inducers and bioorganic fertilizers in inducing systemic disease resistance in kiwifruit trees were explored,and finally,an integrated green prevention and control scheme for kiwifruit canker disease that is suitable for kiwifruit production areas in Guizhou Province and has strong operability was proposed.This study provides technical support for green,efficient,standardized production technical services and sustainable and healthy development of kiwifruit industry. 展开更多
关键词 KIWI pseudomonas syringae pv.actinidiae(Psa) SYMPTOM Occurrence rule Integrated control
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番茄细菌性叶斑病菌RPA检测技术 被引量:18
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作者 魏梅生 田茜 +2 位作者 赵文军 李桂芬 孔君 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期150-153,共4页
番茄细菌性叶斑病菌(Pseudomonas syringae pv.tomato,Pst)是我国进境植物检疫性有害生物,可随种子进行远距离传播。快速简便的检测对于防止该病害的扩散传播具有重要意义。依据番茄细菌性叶斑病菌的hrpZPst基因序列,设计并筛选出特异... 番茄细菌性叶斑病菌(Pseudomonas syringae pv.tomato,Pst)是我国进境植物检疫性有害生物,可随种子进行远距离传播。快速简便的检测对于防止该病害的扩散传播具有重要意义。依据番茄细菌性叶斑病菌的hrpZPst基因序列,设计并筛选出特异性扩增引物,建立了番茄细菌性叶斑病菌的重组酶聚合酶等温扩增(RPA)检测方法。该方法可从10种不同的植物病原细菌中特异性地检测到3个参试番茄细菌性叶斑病菌株。对病菌DNA的检测灵敏度为75fg/μL,与PCR凝胶电泳相当。该方法扩增核酸时间短、效率高、对设备的要求低,适合于基层简易实验室的快速检测。本文为该病原菌的检测提供了新方法。 展开更多
关键词 番茄细菌性叶斑病菌 重组酶聚合酶扩增 RPa 等温扩增 检测
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不同猕猴桃品种RAPD分析及其与抗溃疡病的关系 被引量:10
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作者 李淼 檀根甲 +3 位作者 李瑶 丁克坚 产祝龙 承河元 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期41-46,共6页
对不同猕猴桃品种的分子生物学试验表明:猕猴桃的DNA浓度在920μg/mL符合RAPD分析的要求。通过60个随机引物的PCR扩增,报道了6个不同品种和类型猕猴桃种质资源的RAPD多态性,计算了它们之间的遗传距离,构建了聚类图,并讨论了其亲缘关系... 对不同猕猴桃品种的分子生物学试验表明:猕猴桃的DNA浓度在920μg/mL符合RAPD分析的要求。通过60个随机引物的PCR扩增,报道了6个不同品种和类型猕猴桃种质资源的RAPD多态性,计算了它们之间的遗传距离,构建了聚类图,并讨论了其亲缘关系。聚类分析图反映出来源于安徽省主要猕猴桃产区的6个样品可以分为3组,其中抗病与感病的相对较为集中,由此可推断出现这种聚类的原因可能是由于它们基因组中有相同的DNA片段。抗病品系都有一条1 458 bp DNA片段,而感病品系均没有该带。故该片段可能与猕猴桃植株抗溃疡病相关。RAPD多态性从分子水平上反映出了猕猴桃种质资源不同品种及不同类型间复杂的遗传背景,为抗病育种的亲本选配提供了依据,也为合成猕猴桃抗溃疡病探针并用于检测猕猴桃抗溃疡病种质和分子标记辅助育种奠定了基础。 展开更多
关键词 猕猴桃 品种 溃疡病 RaPD 抗病性
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黄瓜叶片细菌性角斑病侵染初期cDNA文库分析 被引量:5
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作者 刘关君 王丽娟 +1 位作者 秦智伟 孟令波 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2009年第10期1042-1048,共7页
文章以接种细菌性角斑病原菌48h的抗病品种‘D0462’黄瓜叶片为材料,构建了黄瓜叶片cDNA文库,文库插入片段大小为0.45~2.1kb之间,平均长度为1kb。随机选取2966个克隆进行测序,共拼接出2352个假定独立转录本(TUTs),其中包括282个重叠群(... 文章以接种细菌性角斑病原菌48h的抗病品种‘D0462’黄瓜叶片为材料,构建了黄瓜叶片cDNA文库,文库插入片段大小为0.45~2.1kb之间,平均长度为1kb。随机选取2966个克隆进行测序,共拼接出2352个假定独立转录本(TUTs),其中包括282个重叠群(Contigs),2070个单拷贝EST(Singlets)。经BlastX分析共获得已知功能和未知功能基因1848个,无序列相似性新基因504个。文库中含有大量防御/抗病基因,如金属硫蛋白、谷胱甘肽-S-转移酶、泛素、β-1,3-葡聚糖酶、锌指蛋白和半胱氨酸蛋白酶等,这些基因很可能参与了植物与病原菌互作过程。 展开更多
关键词 黄瓜 叶片 CDNa文库 细菌性角斑病
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生防放线菌TGNBSA5的鉴定及其活性物质的研究 被引量:9
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作者 黄以超 颜霞 +3 位作者 王建华 高小宁 王惠 黄丽丽 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第8期26-31,37,共7页
牛蒡内生放线菌TGNBSA5对猕猴桃溃疡病菌有较好拮抗作用。为开发该生防菌的生物防治价值,采用生理生化活性测定、形态观察及16SrDNA序列分析,并经发酵培养后,发酵液采用乙酸乙酯萃取、柱层析和薄层层析、HPLC检测等方法分离纯化抑菌活... 牛蒡内生放线菌TGNBSA5对猕猴桃溃疡病菌有较好拮抗作用。为开发该生防菌的生物防治价值,采用生理生化活性测定、形态观察及16SrDNA序列分析,并经发酵培养后,发酵液采用乙酸乙酯萃取、柱层析和薄层层析、HPLC检测等方法分离纯化抑菌活性组分。结果表明,该内生放线菌为链霉菌属的孢杆链霉菌(Streptomyces sporovirgulis),经紫外和NMR鉴定活性组分之一为苯甲醇。孢杆链霉菌为第一次从植物中分离获得,且活性组分苯甲醇的明确将为猕猴桃溃疡病的防治提供理论依据。 展开更多
关键词 猕猴桃溃疡病菌 内生放线菌 菌株鉴定 活性物质
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利用EMA-qPCR建立快速检测猕猴桃溃疡病菌活菌的方法 被引量:13
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作者 周大祥 殷幼平 +1 位作者 王中康 熊书 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期143-148,共6页
利用叠氮溴乙锭(ethidium monoazide bromide,EMA)与实时荧光定量PCR技术相结合(EMA-qPCR),建立了一种有效快速检测猕猴桃溃疡病菌活菌的方法。以猕猴桃溃疡病菌ITS序列为检测靶标,菌体经EMA渗透处理,再进行qPCR特异性扩增。结果显示,q... 利用叠氮溴乙锭(ethidium monoazide bromide,EMA)与实时荧光定量PCR技术相结合(EMA-qPCR),建立了一种有效快速检测猕猴桃溃疡病菌活菌的方法。以猕猴桃溃疡病菌ITS序列为检测靶标,菌体经EMA渗透处理,再进行qPCR特异性扩增。结果显示,qPCR检测灵敏度为2cfu;当EMA的浓度为2.0μg/mL时,能有效抑制1.0×10~7 cfu/mL经高温灭活的死菌的扩增,对活菌的扩增没有影响。当活菌数在1.0×10~1~1.0×10~5 cfu范围内,每个qPCR反应体系中活菌数与Ct值呈线性相关(R^2=0.988)。不同温度处理活菌菌悬液后用EMA-qPCR检测猕猴桃溃疡病菌的存活情况并与平板计数法进行比较,结果表明待检样品可在4℃和20℃短期保存。对疑似带病猕猴桃材料进行EMA-qPCR检测,结果表明能减少猕猴桃溃疡病菌PCR的假阳性结果。本研究建立的EMAqPCR方法是一种有效检测猕猴桃溃疡病菌活菌的方法,能有效避免PCR检测实际样品可能造成的假阳性结果。 展开更多
关键词 猕猴桃溃疡病菌 叠氮溴乙锭 实时荧光定量PCR 活菌检测
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