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一个新的枳NAC基因cDNA全长的克隆及其亚细胞定位分析
被引量:
1
1
作者
韩键
王化坤
+2 位作者
宋长年
上官林飞
冷翔朋
《江西农业学报》
CAS
2012年第3期1-6,共6页
以拟南芥的NAC1 cDNA序列作为模板,对柑橘EST数据库进行同源检索筛选,利用生物信息学方法克隆了柑橘NAC1基因的cDNA序列。以枳(Poncirus trifoliata)花的cDNA为模板,根据以上cDNA序列设计特异性引物,利用5'RACE和3'RACE技术,分...
以拟南芥的NAC1 cDNA序列作为模板,对柑橘EST数据库进行同源检索筛选,利用生物信息学方法克隆了柑橘NAC1基因的cDNA序列。以枳(Poncirus trifoliata)花的cDNA为模板,根据以上cDNA序列设计特异性引物,利用5'RACE和3'RACE技术,分别获得了NAC1基因的5'和3'末端,序列拼接后获得枳的NAC1 cDNA全长,命名为Pt-NAC1。Pt-NAC1全长为1351 bp,含有1个1047 bp完整的开放读码框(ORF),5'末端起始密码子ATG起始于25 bp,3'末端非翻译区为280 bp。该cDNA推导编码348个氨基酸,与苹果、拟南芥、杨树中相应序列的同源性分别为64.8%、57.0%、61.3%。生物信息学分析结果表明:Pt-NAC1 cDNA序列中有miRNA164的识别位点,还有高度保守的NAC结构域。构建Pt-NAC1亚细胞定位载体35S-GW-GFP-FJ619349,用基因枪转化洋葱表皮细胞,亚细胞定位结果表明:Pt-NAC1均定位于细胞膜中。
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关键词
枳
pt-nac1
基因克隆
亚细胞定位
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职称材料
题名
一个新的枳NAC基因cDNA全长的克隆及其亚细胞定位分析
被引量:
1
1
作者
韩键
王化坤
宋长年
上官林飞
冷翔朋
机构
南京农业大学园艺学院
江苏省太湖常绿果树技术推广中心
出处
《江西农业学报》
CAS
2012年第3期1-6,共6页
基金
教育部科学技术研究重点项目(109084)
江苏省2009年度高校研究生科研创新计划项目(CX09B_238Z)
文摘
以拟南芥的NAC1 cDNA序列作为模板,对柑橘EST数据库进行同源检索筛选,利用生物信息学方法克隆了柑橘NAC1基因的cDNA序列。以枳(Poncirus trifoliata)花的cDNA为模板,根据以上cDNA序列设计特异性引物,利用5'RACE和3'RACE技术,分别获得了NAC1基因的5'和3'末端,序列拼接后获得枳的NAC1 cDNA全长,命名为Pt-NAC1。Pt-NAC1全长为1351 bp,含有1个1047 bp完整的开放读码框(ORF),5'末端起始密码子ATG起始于25 bp,3'末端非翻译区为280 bp。该cDNA推导编码348个氨基酸,与苹果、拟南芥、杨树中相应序列的同源性分别为64.8%、57.0%、61.3%。生物信息学分析结果表明:Pt-NAC1 cDNA序列中有miRNA164的识别位点,还有高度保守的NAC结构域。构建Pt-NAC1亚细胞定位载体35S-GW-GFP-FJ619349,用基因枪转化洋葱表皮细胞,亚细胞定位结果表明:Pt-NAC1均定位于细胞膜中。
关键词
枳
pt-nac1
基因克隆
亚细胞定位
Keywords
Poncirus trifoliata
pt-nac1
Gene cloning
Subcellular localization
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一个新的枳NAC基因cDNA全长的克隆及其亚细胞定位分析
韩键
王化坤
宋长年
上官林飞
冷翔朋
《江西农业学报》
CAS
2012
1
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