实时荧光定量PCR检测鼻咽癌组织中PTCH-1和SMO基因的表达

目的:检测Hedgehog信号通路基因PTCH-1和SMO在鼻咽癌(NPC)组织中的表达及其生物学意义。方法:利用实时荧光定量PCR分别检测32例鼻咽癌组织及32例鼻咽炎组织中PTCH-1和SMO基因的表达情况。根据Livak(2-△△Ct)法进行相对定量表达分析,以鼻咽炎组织为对照,计算鼻咽癌组织中PTCH-1和SMO表达水平。结果:在所检测的全部鼻咽癌组织和鼻咽炎组织中PTCH-1和SMO都有表达。与鼻咽炎组织相比,有75%(24/32)鼻咽癌组织的PTCH-1基因表达水平下调,有68.8%(22/32)鼻咽癌组织的SMO表达水平上调,差异均具有统计学意义(P<0.05)。此外,有18.7%(6/32)鼻咽癌组织PTCH-1基因表达水平上调,有15.6%(5/32)鼻咽癌组织SMO基因表达水平下调,差异均无统计学意义(P>0.05)。结论:在鼻咽癌中SMO基因普遍具有较高的表达水平,PTCH-1基因的表达水平则相对较低,而SMO基因表达水平的上调及PTCH-1基因表达水平的下调,可引起Hedgehog信号通路在鼻咽癌中的异常激活,Hedgehog信号通路的异常激活可能与鼻咽癌的发生发展过程相关。

非小细胞肺癌中PTCH1-3’-UTR调控的lncRNAs的ceRNA网络（英文）

目的研究PTCH1-3’-UTR对lnc RNAs表达水平的影响,通过调控网络的分析,提示PTCH1-3’-UTR的功能。方法通过芯片筛选非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中调控PTCH1-3’-UTR的lnc RNAs,并对部分结果进行荧光定量PCR验证。通过GO和KEGG通路分析调控PTCH1-3’-UTR的lnc RNAs可能的生物学功能。通过TCGA数据分析调控PTCH1-3’-UTR的lnc RNAs与NSCLC患者生存率的直接关系。结果荧光定量PCR验证了PTCH1-3’-UTR上调表达的lnc RNAs(LOC100507547,FAM41C,DOCK4-AS1,AC009305.1,KLF7-IT1,RP11-749H20.1,LINC01511)。GO和KEGG通路分析结果显示,调控PTCH1-3’-UTR的lnc RNAs与一系列的生物过程,包括基因转录、信号转导、蛋白质转运、翻译延伸以及钙信号通路、Jak-STAT信号通路、p53信号通路、胰岛素信号通路有关。TCGA数据分析的结果表明,调控PTCH1-3’-UTR的lnc RNAs中,NSCLC患者中高表达lnc RNA-CDKN2BAS或FAM66D者预后较差,而高表达lnc RNA-LINC00240、LOC400027、ABCC6P2或FLJ10038者可能预示高存活率。结论本研究结果提示了PTCH1-3’-UTR的功能,调控PTCH1-3’-UTR的lnc RNA可作为NSCLC预后标志物。

原发性肝细胞癌组织Shh和Ptch-1与Gli-2表达及生物学意义的研究

目的:探讨原发性肝细胞癌(HCC)Sonic hedgehog信号通路信号肽Shh、膜受体Ptch-1和核转录因子Gli-2的表达及其生物学意义。方法:将44例HCC组织及其相应的癌旁肝组织制成含88个微组织的组织芯片,采用免疫组织化学方法分别检测了Shh、Ptch-1和Gli-2在两种组织中的表达情况。结果:在HCC组织中,Shh与Ptch-1阳性率(63.6%和45.5%)均显著高于癌旁肝组织(36.4%和25.0%),P均<0.05。Gli-2在HCC中表达阳性率(68.2%)显著高于癌旁肝组织(38.6%),P<0.01;且与HCC的组织学分级以及侵袭性相关,P均<0.05;与肿瘤大小和HBV感染无关。结论:增强的Gli-2活性导致细胞异常增殖,其所引起的Shh信号通路的过度激活可能促进HCC的发生和发展。

Hedgehog信号通路蛋白在肝内胆管细胞癌中的表达

目的 研究Hedgehog（Hh）信号通路相关蛋白（Gli 1,Ptch-1和Shh）在肝内胆管细胞癌（intrahepatic cholangio carcinoma,ICC）中的表达及意义.通过对ICC和癌旁组织中Hh通路相关蛋白（Gli 1、Ptch-1和Shh）的表达进行检测,探讨其与ICC临床病理特征之间的关系及意义.方法 免疫组化法对43例ICC组织及癌旁组织进行Gli 1、Ptch-1和Shh蛋白的检测;Real-time RT-PCR检测12例ICC组织和癌旁组织中mRNA的表达,并与患者临床病理特征进行相关性分析.结果 43例ICC组织中,Gli 1、Ptch-1和Shh阳性表达率分别为74.4%（32/43）、69.8% （30/43）,和62.8%（27/43）,与癌旁组织表达比较差异具有统计学意义（P值分别为0.003、0.006和0.008）;三者的表达与肿瘤的大小有关（P值分别为0.039、0.044和0.047）;三者的表达与肿瘤的分化程度相关（P值分别为0.026,0.039和0.049）;三者的表达与淋巴结转移具有相关性（P均〈0.05）.Real-time PCR结果显示,12例ICC组织中均有Gli 1、Ptch-1和Shh的表达,且基因表达水平均高于癌旁正常组织（P均=0.001）.结论 Hedgehog信号通路的相关蛋白在ICC组织中高表达,其异常激活可能与肝内胆管细胞癌发生密切相关.Gli 1、Ptch-1和Shh的表达可能与肿瘤的生长和转移密切相关.