基于PubMed数据库2017—2022年数据的信息计量分析

文章以PubMed数据库2017—2022年关于删失数据研究领域的科研文献数据为分析对象,从基本描述性统计、发文趋势、期刊载文量、作者发文量、语义地图分析等角度进行了知识计量分析及可视化分析,根据分析结论整理该领域近几年的研究热点和主题演变过程,为该领域科研人员进行研究提供参考。

基于PubMed数据库的临床药学工作切入点的文献计量分析

目的:基于文献可视化分析,探讨临床药学研究的发展趋势。方法:利用BICOMB 2.0和VOSviewer 1.6.16软件,对PubMed数据库自建库起至2023年4月7日发表的临床药学相关文献进行提取统计和可视化分析。结果:最终纳入文献4 609篇,其中我国学者发文量为174篇。我国学者总体发文量呈递增趋势;发文量较多的机构包括中国药科大学、浙江大学医学院附属第一医院、北京大学医学部、上海交通大学医学院附属仁济医院以及首都医科大学附属北京朝阳医院。国内临床药学研究热点问题较单一,涉及医院药学服务、成年人的用药管理和回顾性研究等领域。结论:临床药学在我国起步晚但发展迅速,发展前景广阔。

基于文本挖掘技术的脑卒中文献计量分析:以PubMed数据库为例

目的回溯并勾勒2010年-2020年全球脑卒中领域研究的主题演化历程与时空分布规律。方法从PubMed数据库中获取2010年-2020年脑卒中相关文献,利用R 4.1.2的pubmedR软件包批量抓取文献基本信息,通过quanteda软件包构建语料库,使用结构主体模型进行分析,并运用ggplot2软件包进行国家或地区合作网络分析。结果全球脑卒中研究2010年-2013年为快速增长期,增长率为11.94%~17.60%;2014年-2018年为增长平缓期,增长率为3%~4%左右;2019年-2020年再次快速增长,增长率为12.81%、17.96%。中国内地地区在2012年、2020年增长率分别为102.99%、43.85%,在全球两个阶段的高速增长期中均做出了较大贡献。基于文献摘要文本,共归纳出11个主题类别,其中“临床研究”与“卒中康复”占较大比重,合计热度值为46.66%。我国近年研究热点主要集中在“分子遗传病学”与“动物实验”。结论全球脑卒中研究热度持续增长,主题类别逐渐丰富。我国需进一步加强脑卒中前端预防和后端康复研究,优化防治策略。

在PubMed,MEDLINE中搜索时,可用国际刊号1009-2137作为《中国实验血液学杂志》刊名输入

上网后,输入http://www. ncbi. nlm. nih. gov/pubmed网站名,立即出现Pub Med主页。在首页的左上方“Search PubMed for”标题后面的检索框中,可按以下几个途径,输入搜索词。以前介绍用《中国实验血液学杂志》刊名搜索,输入journal of experimental hematology,或输入zhongguo shi yan xue ye xue za zhi,字数过多,太麻烦。但有一个简便的输入法,即输入《中国实验血液学杂志》的国际标准连续出版物号ISSN,即输入1009-2137就行了。

在PubMed,MEDLINE中搜索时,可用国际刊号1009-2137作为《中国实验血液学杂志》刊名输入

上网后,输入http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed网站名,立即出现PubMed主页。在首页的左上方“Search Pub Med for”标题后面的检索框中,可按以下几个途径,输入搜索词。以前介绍用《中国实验血液学杂志》刊名搜索,输入journal of experimental hematology,或输入zhongguo shi yan xue ye xue za zhi,字数过多,太麻烦。但有一个简便的输入法,即输入《中国实验血液学杂志》的国际标准连续出版物号ISSN,即输入1009-2137就行了。

GOPubMed:基于GO和MeSH的信息检索与分析研究

GOPubMed是一种基于PubMed的结果可视化和后处理类型的智能搜索引擎。从工作原理、关键技术以及扩展功能3个方面对其性能进行解析。研究显示,GOPubMed利用基于语义网的语义分类工具——GO(Gene Ontology,基因本体)和MeSH,对PubMed检索结果进行分类,帮助用户快速地找出最相关的命中文献,实现语义网与生物医学信息检索的完美结合,并能对检索结果从多角度进行可视化统计分析。

基于PubMed数据源的生物医学文献检索工具应用特点

从检索方式和检索结果处理两个方面比较12种基于PubMed数据源的医学文献检索工具的应用特点,并从改变检索界面、相关性排序和检索结果聚类3个方面总结这类检索工具的创新之处,指出Entrez/PubMed自身新的改进。

基于GoPubMed有关高原病研究文献的信息分析

依托Pub Med数据库,采用Go Pub Med进行检索,从研究内容、发文作者、地区分布、发文时间等方面分析有关高原病的研究文献,获得高原病研究的主题内容、年代、地区分布、期刊、核心作者等信息,并利用结构方程模型对高原病研究文献量的影响因素进行分析,探索与高原病研究的相关趋势,最后提出了借鉴印度德里的经验,将我国相对分散的高原病研究资源进行适当集中,加强国内外科研人员的相互协作,加大高原医学研究的支持力度,在进行大规模非战争军事行动(如救灾)时应结合我国高原、高山地貌比例高、高原人口较多、地质灾害多发等特点,将我国的高原病救治机构适当向高原腹地前移等建议。

利用GoPubMed对针灸治疗腰痛英文文献的计量分析

【目的】了解针灸治疗腰痛的英文文献分布特点和主要研究方向,为腰痛的治疗和研究提供参考。【方法】利用Go Pub Med工具以及文献计量学方法和聚类分析法,对Pub Med数据库中针灸治疗腰痛的英文文献从其发表年代、国家分布、期刊收录情况、核心著者及合作者、高频主题词等方面进行分析。【结果】共检索出英文文献345篇。针灸治疗腰痛的英文文献数量在2007年和2010年2次达到高峰,之后趋于平稳。国外开展针灸治疗腰痛的国家有29个,其中美国的发文数量最多,达到59篇,占总发文量的17.1%,居于首位;中国排名第二,发文总数44篇,占12.8%。针灸治疗腰痛的英文文献主要收录于核心期刊。核心著者及合作者检索结果显示针灸治疗腰痛的研究多由团队合作完成。高频主题词共有20个,反映了针灸治疗腰痛研究的热点。【结论】运用Go Pub Med从文献计量角度对针灸治疗腰痛的英文文献进行分析,其结果提示国外研究热点主要集中在腰痛的治疗研究和腰痛的调查研究方面;国内临床科研工作者应加强向世界推广针灸在临床、科研研究中的成果,促进针灸和中医药走向世界。

拓展PubMed教学内容

通过介绍GoPubMed、h指数和F1000因子,拓展文献检索课的教学内容,提高文献资源的利用效率。

GoPubMed——Google时代生命科学的搜索利器

简要说明了GoPubMed与PubMed的关系与不同,重点介绍GoPubMed的主要检索功能。

基于PubMed筛选高质量文献的两种方法

PubMed是美国国家图书馆（NLM）下属的国家生物技术信息中心（NCBI）研发的文摘数据库,少数可查看全文.作为生物医学领域影响力最大的数据库之一,PubMed以其数据更新快,可免费使用,查全率高等优势受到医学科研工作者的青睐.

PubMed及其衍生数据库在医药领域的应用

本文对PubMed在医药领域的特色功能进行了介绍,对比了PubMed与其衍生数据库在功能方面的异同,探索了使用PubMed进行检索的基本策略,并通过案例分析了上述数据库在医药领域专利审查和研发查新中的特点和优势。

基于PubMed的免费文献评价指标分析

以嵌合抗原受体(chimeric antigen receptor,CAR)T细胞为例,收集PubMed中截止2016年12月31日所有相关的研究型英文文献,分别记录每篇文献在WOS、PubMed Central(PMC)、Europe PubMed Central(EPMC)、Patent Lens(PL)的引用次数及其Altmetric得分(Altmetric attention score,AAS),并分析这些评价指标在文献中的分布情况。超过75%的EPMC高引用和PMC高引用文献同时也为WOS高引用文献;临床试验在高AAS文献中占最大比例;WOS高被引论文和WOS热点论文与所有高引用指标及高AAA文献分布不一致。PubMed来源的免费评价指标能呈现大部分WOS高引用文献,PL引用频次和AAS是评价文献的重要补充指标。

基于PubMed和EMBASE 2008-2012年粪菌移植研究文献计量分析

目的:分析2008-2012年国际粪菌移植文献概貌,了解粪菌移植研究现状。方法:从时间、国家、机构、来源期刊和写作体裁等方面分析PubMed和EMBASE数据库收录的近5年粪菌移植相关论文,并采用共词分析法分析了高频主题词。结果:粪菌移植文献近5年数量有所增长。美国在粪菌肺移植研究领域具有领先优势,加拿大、英国、澳大利亚、荷兰也有开展和研究,我国粪菌移植研究几乎空白。相关研究机构中,美国机构占58.33%。发文量2篇以上的作者,有7位来自美国。刊载粪菌移植研究论文最多的期刊是American Journal of Gastroenterology。临床粪菌移植研究高频主题词涉及艰难梭菌、伪膜性肠炎、复发、治疗结果等。结论:近5年来国际临床粪菌移植文献量逐年上升,美国是粪菌移植研究大国,粪菌移植对复发性艰难梭菌相关肠炎、治疗结果是临床主要关注点,粪便供者的选择、粪便剂型的制备、给药方式等是临床次级关注点。

基于bdPubMed的糖尿病肾病文献计量分析

针对国内用户使用PubMed的缺陷,介绍了基于PubMed开发的本地化数据分析工具bdPubMed,分析了糖尿病肾病文献的主题、高影响论文、指纹共词,展示了bdPubMed的功能。

PubMed:一个重要的生物医学论文数据库系统的简介

PubMed是美国国立医学图书馆下属的国家生物技术信息中心开发的大型数据库系统,向全球公众免费提供生物医学论文的题录检索服务。为了让更多的读者了解PubMed数据库,以利于科研人员更好的利用该数据库,该文着重介绍了PubMed数据库所提供的文献检索方式。

Medline/PubMed对生物医学期刊的选刊标准和收录程序

对Medline/PubMed的选刊标准及收录程序作一综述,并为我国生物医学期刊进入Medline/PubMed检索系统提出一些具体的建议和措施。

PubMed系统的主要服务功能

对PubMed系统的自动词语匹配功能、Cookies交互功能、链接功能、原文传递功能等进行了系统介绍和评价 ,为国内的系统开发者和系统应用者提供参考和借鉴。

PubMed主题词检索与自由词检索的检索效率比较研究

PubMed检索系统是由美国NCBI研制推出的免费医学文献检索系统,由于其资源权威而丰富,检索功能强大,界面友好,一直以来,都是很多医学工作者查找文献必选的检索系统。PubMed提供了多种检索方法,因此对这些检索方法进行比较,对于提高用户的检索效率是十分必要的。本文通过对PubMed检索系统所提供的主题词检索、自由词检索这两种用户常用的检索方式进行选词测试,比较它们的检索效率,从而了解这两种检索方法的特点,并为用户进行检索提供建议。