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转基因大豆非同源对照模板QC-PCR检测方法的建立
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作者 徐景升 阙友雄 +2 位作者 李峰 陈华墙 陈如凯 《生物技术通报》 CAS CSCD 2007年第5期156-159,共4页
建立了转基因大豆CP4EPSPS基因的非同源对照模板QC-PCR检测方法。非同源竞争对照构建方法如下:利用CP4EPSPS基因特异引物,以大肠杆菌基因组DNA为异源模板,在低严谨度PCR扩增,回收适宜DNA片段并克隆到pMD-8载体上。该片段与CP4EPSPS基因... 建立了转基因大豆CP4EPSPS基因的非同源对照模板QC-PCR检测方法。非同源竞争对照构建方法如下:利用CP4EPSPS基因特异引物,以大肠杆菌基因组DNA为异源模板,在低严谨度PCR扩增,回收适宜DNA片段并克隆到pMD-8载体上。该片段与CP4EPSPS基因相应序列除两端引物序列完全相同外,其他部分没有同源性。 展开更多
关键词 竞争定量PCR 非同源对照 CP4EPSPS 转基因检测
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QC-PCR测定HIV-Ⅰ型DNA含量
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作者 曾常茜 邢晓秋 刘雅琴 《北华大学学报(自然科学版)》 CAS 2001年第1期32-34,共3页
目的为人类免疫缺陷病毒(HIV)含量测定提供一种定量的方法.方法以HIV-Ⅰ型感染小鼠,用竞争性定量多聚酶链式反应(Quantitative Competitive Polymerase Chain Reaction,QC-PCR)和增强化学发光法测定HIV含量.结果用QC-PCR方法测定HIV含... 目的为人类免疫缺陷病毒(HIV)含量测定提供一种定量的方法.方法以HIV-Ⅰ型感染小鼠,用竞争性定量多聚酶链式反应(Quantitative Competitive Polymerase Chain Reaction,QC-PCR)和增强化学发光法测定HIV含量.结果用QC-PCR方法测定HIV含量简单、快速、准确而且无污染.结论QC-PCR可作为HIV DNA测定的新方法,是AIDS早期诊断、疗效观察及愈后判断的监控手段. 展开更多
关键词 竞争性定量多聚酶链式反应 人类免疫缺陷病毒 定量 测量 诊断
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应用QC-PCR技术研究高效菌株Rhodococcus ruber Em1在废水处理中的作用 被引量:1
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作者 黄玲 李习武 +3 位作者 李旭东 刘双江 刘志培 谭周亮 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期307-312,共6页
应用竞争性定量PCR(QC-PCR)技术,对石化废水处理系统中投加的高效芳烃降解菌株Rhodococcus ruber Em1数量变化趋势及其作用进行了分析。持续5个月从处理系统中不定期采集活性污泥样品,进行Em1菌株定量测定和处理系统的效果分析。结果表... 应用竞争性定量PCR(QC-PCR)技术,对石化废水处理系统中投加的高效芳烃降解菌株Rhodococcus ruber Em1数量变化趋势及其作用进行了分析。持续5个月从处理系统中不定期采集活性污泥样品,进行Em1菌株定量测定和处理系统的效果分析。结果表明,基于16S rRNA基因的特异引物具菌种水平的特异性,用其扩增污泥总DNA,并对产物克隆测序,所扩增的产物中62.2%为Em1菌株16S rRNA基因片段。检测得到活性污泥样品中含Em1菌株数量范围为3.4×105~4.3×108CFU/g,表明所投加的高效降解菌在处理系统中长期稳定存活并繁殖;Em1菌量与COD去除量之间的相关性系数(R2)高达0.89,表明Em1菌量与系统的处理效果具有明显的正相关性。这些结果说明,投加的Em1菌株在高浓度多环芳烃等污染物存在的条件和复杂菌群环境中,仍能长期稳定地存活并繁殖,在废水处理系统中发挥重要的作用。 展开更多
关键词 废水处理 高效菌 生物强化技术 QC—PCR 作用分析
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非培养手段分析珠江口淇澳岛海岸带沉积物中的古菌多样性 被引量:11
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作者 姜丽晶 彭晓彤 +1 位作者 周怀阳 王风平 《海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期114-122,共9页
利用古菌16SrDNA特异引物对珠江口淇澳岛海岸带沉积物中古菌的多样性及垂直分布特征进行研究。结果表明珠江口淇澳岛海岸带沉积物中古菌多样性丰富,大部分为新的不可培养古菌;泉古菌在整个沉积物柱中是优势菌群,约占81%;古菌多样性随沉... 利用古菌16SrDNA特异引物对珠江口淇澳岛海岸带沉积物中古菌的多样性及垂直分布特征进行研究。结果表明珠江口淇澳岛海岸带沉积物中古菌多样性丰富,大部分为新的不可培养古菌;泉古菌在整个沉积物柱中是优势菌群,约占81%;古菌多样性随沉积物深度增加而增加,区系结构也随深度变化而呈现出明显的不同,在表层沉积物中,88%的序列属于Ⅰ型海洋泉古菌(MGⅠ),而在中层和底层检测到的古菌序列大部分与不可培养的富含甲烷的环境序列有最高的同源性,并且有15%的克隆子序列属于甲烷八叠球菌目(Methanosarcinales)和甲烷微菌目(Methanomicrobiales)。QC-PCR结果表明珠江口淇澳岛海岸带沉积物中古菌含量丰富[(1.93±0.60)×106^(6.45±0.25)×10716S rDNA拷贝/g],呈现随深度增加含量增加的趋势。 展开更多
关键词 珠江口 沉积物 古菌 16S RDNA qc-pcr
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降解多环芳烃的菌株Gordonia sp.He4的分离鉴定及其在菲污染土壤修复过程中的动态变化 被引量:21
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作者 刘磊 李习武 +1 位作者 刘双江 刘志培 《环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第3期617-622,共6页
从石油污染土壤中分离得到1株降解石油烃类污染物的He4菌株.该菌株能够以正十六烷、苯、萘、蒽、菲和芘作为唯一的碳源生长.经过对其形态特征、生理生化、以及16SrRNA基因序列分析,该菌株初步鉴定为Gordoniasp..通过分析其16SrRNA基因序... 从石油污染土壤中分离得到1株降解石油烃类污染物的He4菌株.该菌株能够以正十六烷、苯、萘、蒽、菲和芘作为唯一的碳源生长.经过对其形态特征、生理生化、以及16SrRNA基因序列分析,该菌株初步鉴定为Gordoniasp..通过分析其16SrRNA基因序列,设计引物并构建了竞争性模板.通过竞争性定量PCR(quantitative competitive-PCR)分析了该菌株在含有菲的污染土壤中数量的变化.结果表明,部分菌株He4在土壤中转变为不可培养状态,采用传统的稀释涂布菌落计数法(CFU)无法对其进行定量,而通过QC-PCR能够较准确地测定土壤中微生物的动态变化. 展开更多
关键词 多环芳烃 生物降解 生物修复 QC—PCR
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小毛莨内酯对结核病人颗粒裂解肽基因表达的作用 被引量:21
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作者 詹莉 戴华成 +3 位作者 杨治平 易著文 舒平 陈世明 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第4期405-408,共4页
目的 研究小毛莨内酯 (Ternatolide ,Tern)对健康成人 ,初诊未治、耐药肺结核病人及儿童结核患儿周围血淋巴细胞 (PBL)体外活化后颗粒裂解肽 (granulysin ,GLS)mRNA表达的作用 ,探索其抗结核菌的分子免疫学机理。方法 采用反转录聚合... 目的 研究小毛莨内酯 (Ternatolide ,Tern)对健康成人 ,初诊未治、耐药肺结核病人及儿童结核患儿周围血淋巴细胞 (PBL)体外活化后颗粒裂解肽 (granulysin ,GLS)mRNA表达的作用 ,探索其抗结核菌的分子免疫学机理。方法 采用反转录聚合酶链反应半定量 (QC RT PCR)方法 ,测定不同剂量的Tern对以上 4组人群PBL颗粒裂解肽mRNA表达水平的影响。结果 当Tern在 10 0mg·L-1,2 0 0mg·L-1浓度时 ,均能诱导以上 4组人群体外活化的PBLGLSmRNA的表达 ,且各组诱导表达水平无显著差异。结论 Tern可能是通过提高CTL的效应分子GLSmRNA表达的水平 ,杀灭胞内致病菌MTB ,其诱导作用呈现剂量依赖性。 展开更多
关键词 小毛莨内酯 猫爪草 颗粒裂解肽 QC-RT-PCR 结构 休眠菌 基因表达
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耐热菌的竞争定量PCR检测方法优化与建立 被引量:10
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作者 李建科 冯再平 仇农学 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期375-381,共7页
【目的】研究苹果浓缩汁中耐热菌(Alicyclobacillusacidoterrestris)的定量PCR快速检测法。【方法】通过引物设计、PCR扩增及凝胶纯化试剂盒回收,构建并获得耐热菌的PCR竞争模板;用获得的竞争模板作为定量内标物建立耐热菌的竞争定量PCR... 【目的】研究苹果浓缩汁中耐热菌(Alicyclobacillusacidoterrestris)的定量PCR快速检测法。【方法】通过引物设计、PCR扩增及凝胶纯化试剂盒回收,构建并获得耐热菌的PCR竞争模板;用获得的竞争模板作为定量内标物建立耐热菌的竞争定量PCR(QC-PCR)检测体系。【结果】经对建立的QC-PCR检测体系优化,目标模板检测灵敏度由5×104个分子/PCR体系,提高到50个分子/PCR体系,竞争模板和目标模板分子共扩增可检测到5×102个目标模板分子/PCR体系,并能从人工回添苹果浓缩汁样品中定量检测到5×103cfu/PCR体系的耐热菌,整个检测时间为4~5h,比传统的细菌培养皿培养记数法时间(4~5d)大大缩短。【结论】本研究建立的耐热菌竞争定量PCR检测法特异、快速,可作为微生物PCR竞争模板构建和建立竞争定量PCR的方法学参考,也可用于商品果汁和苹果浓缩汁工业化生产中耐热菌的快速检测和质量安全控制。 展开更多
关键词 耐热菌 苹果浓缩汁 竞争定量PCR
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应用循环逆转录PCR技术检测丙型肝炎病毒RNA 被引量:3
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作者 陈燃 伍迪 +2 位作者 唐榕 汪进 毛裕民 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第3期266-269,共4页
循环逆转录 (circulatoryreversetranscription ,CRT)是线性增长逆转录cDNA产量的一种新技术。为了将该技术用于检测HCVRNA ,通过改变CRT的循环次数 ,结合竞争PCR ,作出标准曲线。采用 16次CRT加 34次循环PCR检测了 136例HCVELISA阳性、... 循环逆转录 (circulatoryreversetranscription ,CRT)是线性增长逆转录cDNA产量的一种新技术。为了将该技术用于检测HCVRNA ,通过改变CRT的循环次数 ,结合竞争PCR ,作出标准曲线。采用 16次CRT加 34次循环PCR检测了 136例HCVELISA阳性、5 4例HCVELISA阴性和 10 8例临床可疑病人全血标本 ,并与逆转录PCR(RT -PCR)和巢式PCR (NT -PCR)的检测结果相比较 ,显示HCVRNA总检出率分别为 :5 7 9%、35 6 %、5 8 6 %。结果提示 ,CRT -PCR是一种简便有效的提高RNA检测灵敏度的方法 。 展开更多
关键词 循环逆转录 RT-PCR HCV 竞争定量PCR 丙型肝炎病
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宿根矮化病菌的竞争定量PCR检测方法建立 被引量:4
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作者 王恒波 郭晋隆 +3 位作者 陈平华 阙友雄 陈如凯 许莉萍 《热带作物学报》 CSCD 2009年第10期1511-1516,共6页
利用宿根矮化病菌的特异检测引物,构建竞争定量PCR检测的非同源模板,建立宿根矮化病菌的竞争定量PCR检测方法。实验中非同源模板(竞争模板)构建是采用PCR方法对大肠杆菌基因组进行低严谨度扩增,回收合适的DNA片段并将其构建到T-esay载体... 利用宿根矮化病菌的特异检测引物,构建竞争定量PCR检测的非同源模板,建立宿根矮化病菌的竞争定量PCR检测方法。实验中非同源模板(竞争模板)构建是采用PCR方法对大肠杆菌基因组进行低严谨度扩增,回收合适的DNA片段并将其构建到T-esay载体上,通过测序和序列比对,除两端引物序列完全相似外,其余部分没有同源性,因此可以作为定量检测的非同源模板。通过计算非同源模板的拷贝数,进行竞争定量PCR检测宿根矮化病,建立宿根矮化病菌的标准竞争曲线和直线回归方程。本研究建立的竞争定量PCR检测方法操作简单、特异性和敏感性高,适合于宿根矮化病菌的检测,并可为其它病菌竞争定量PCR检测方法的建立提供参考。 展开更多
关键词 甘蔗 宿根矮化病菌 非同源模板 竞争定量PCR 检测
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鸭坦布苏病毒竞争定量PCR检测方法的建立与应用 被引量:5
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作者 袁朋 王斌 +4 位作者 许传田 杨少华 黄庆华 张秀美 张琳 《山东农业科学》 2015年第3期113-117,共5页
在现行PCR检测鸭坦布苏病毒(DTMUV)方法的基础上,设计制备DTMUV竞争模板并以其为定量内标物建立竞争定量PCR(QC-PCR)体系。该体系特异性强、灵敏性高,竞争模板和目标模板可在400个分子/μL的水平上共扩增。临床应用结果表明,建立的体系... 在现行PCR检测鸭坦布苏病毒(DTMUV)方法的基础上,设计制备DTMUV竞争模板并以其为定量内标物建立竞争定量PCR(QC-PCR)体系。该体系特异性强、灵敏性高,竞争模板和目标模板可在400个分子/μL的水平上共扩增。临床应用结果表明,建立的体系能够满足简单快速确定病毒含量的要求。 展开更多
关键词 鸭坦布苏病毒 竞争定量PCR 定量检测
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猪圆环病毒2型竞争定量PCR检测方法的建立及应用 被引量:1
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作者 司兴奎 郭鑫 杨汉春 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第10期1115-1117,共3页
根据猪圆环病毒2型(PCV2)BF的序列设计引物,扩增472bp的ORF2部分基因片段,并克隆到pGEM-T载体中,构建含PCV2-ORF2部分基因片段的重组质粒。利用XbaⅠ限制性内切酶消化后获得共用同1对引物但缺失196bp的竞争重组子。通过重组质粒与竞争... 根据猪圆环病毒2型(PCV2)BF的序列设计引物,扩增472bp的ORF2部分基因片段,并克隆到pGEM-T载体中,构建含PCV2-ORF2部分基因片段的重组质粒。利用XbaⅠ限制性内切酶消化后获得共用同1对引物但缺失196bp的竞争重组子。通过重组质粒与竞争重组子间的竞争定量PCR方法(qc-PCR),建立猪PCV2-ORF2的标准竞争曲线和直线回归方程,并对PCV2试验感染猪血清中PCV2核酸的动态变化进行了研究。 展开更多
关键词 猪圆环病毒2型 竞争定量PCR 病毒含量
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聚合酶链反应检测结核杆菌的质量控制探讨
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作者 韩纪举 张显忠 +2 位作者 孙思才 亓云法 曹洪林 《泰山医学院学报》 1996年第3期183-185,共3页
应用PCR技术,同时设立各种质量控制实验,对53例结核病人痰标本中结核杆菌的检测分析结果显示:通过设立各种质量控制实验,可以提高PCR技术的灵敏度(PCR—TB阳性检出率由49.06%增加到66.04%)、特异性及结... 应用PCR技术,同时设立各种质量控制实验,对53例结核病人痰标本中结核杆菌的检测分析结果显示:通过设立各种质量控制实验,可以提高PCR技术的灵敏度(PCR—TB阳性检出率由49.06%增加到66.04%)、特异性及结果的可信度。避免各种抑制因子造成假阴性,使PCR技术得到进一步完善。 展开更多
关键词 质量控制 聚合酶链反应 结核病 结核杆菌
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免疫缺陷性皮肤病
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《中国医学文摘(皮肤科学)》 1998年第3期146-148,共3页
981387 检测艾滋病患者外周血HIV-1 DNA水平的竞争性PCR方法的建立/范雪莉(四军大西京医院)…//中国皮肤性病学杂志.-1997,11(6).-325 建立竞争性定量PCR(QC-PCR)方法检测外周血单个核细胞(PBMC)中的前病毒含量。结果表明,这种... 981387 检测艾滋病患者外周血HIV-1 DNA水平的竞争性PCR方法的建立/范雪莉(四军大西京医院)…//中国皮肤性病学杂志.-1997,11(6).-325 建立竞争性定量PCR(QC-PCR)方法检测外周血单个核细胞(PBMC)中的前病毒含量。结果表明,这种QC-PCR反应敏感性及重复性均极好,同样适合于高浓度的靶序列的检测,8份艾滋病患者的PBMC DNA标本经该方法检测也得到较好结果。作者认为,QC-PCR是一种较为理想的HIV-1 展开更多
关键词 艾滋病防治 中国性 缺陷性 外周血单个核细胞(PBMC) qc-pcr 静脉吸毒者 云南省 卫生防疫站 中国皮肤性病学杂志 蛋白印迹法
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HSV/AAV嵌合病毒法制备rAAV/hFⅨ及其安全性检测 被引量:3
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作者 陈立 邹蓓艳 +4 位作者 陈浩明 伍志坚 吴小兵 卢大儒 薛京伦 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2003年第10期1054-1058,共5页
构建了由CMV启动子调控的人凝血因子Ⅸ小基因的重组腺相关病毒载体, 并通过HSV/AAV杂合辅助病毒的方法大量制备成重组腺相关病毒颗粒(rAAV/hFⅨ). 经Southern dot blot及QC-PCR法测定, 滴度达到3.6 × 1012 vg(病毒基因组)/mL. 将rA... 构建了由CMV启动子调控的人凝血因子Ⅸ小基因的重组腺相关病毒载体, 并通过HSV/AAV杂合辅助病毒的方法大量制备成重组腺相关病毒颗粒(rAAV/hFⅨ). 经Southern dot blot及QC-PCR法测定, 滴度达到3.6 × 1012 vg(病毒基因组)/mL. 将rAAV/hFⅨ病毒以7.5 × 1011 vg/只直接注射到血友病B小鼠股四头肌中, 检测到人Ⅸ因子最高表达量达到387 ng/mL血浆, 持续表达时间12周. 血浆中产生的抗体情况与表达曲线相吻合. 实验结果表明, 采用HSV/AAV杂合辅助病毒法能够有效解决AAV载体的大量制备问题, QC-PCR法检测重组腺相关病毒的滴度比传统的点杂交法更加快速准确. RT-PCR检测表明重组AAV中没有野生型HSV的污染, PCR检测表明重组AAV注射后, 重组AAV病毒仅存在于注射点附近的肌肉中, 未见扩散. 展开更多
关键词 重组腺相关病毒载体 凝血因子 IX小基因 杂合病毒 HSV/AAV嵌合病毒法 血友病B qc-pcr
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Preparation of rAAV/hFⅨ by HSV/AAV hybrid helper virusand evaluation of its safety
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作者 CHENLi CHENHaoming +4 位作者 ZOUBeiyan WUZhijian WUXiaobing LUDaru XUEJinglun 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2003年第13期1369-1374,共6页
The recombinant adeno-associated viral vector with human coagulation Factor Ⅸ minigene which wasregulated by CMV promoter was constructed. Largequantity of recombinant adeno-associated viral particles (rAAV/ hFⅨ) wa... The recombinant adeno-associated viral vector with human coagulation Factor Ⅸ minigene which wasregulated by CMV promoter was constructed. Largequantity of recombinant adeno-associated viral particles (rAAV/ hFⅨ) was prepared by the HSV/AAV hybrid helper virus method. Southern dot blot assay and QC-PCR indicated that the titer of the virus was 3.6×1012 v.g./mL. It demonstrated that this method can effectively overcome the hurdles of mass production of AAV vector. Followed by anintramuscular injection of viral vectors (7.5×1011 v.g./mouse) in the quadriceps femoris, an elevation of human Factor Ⅸexpression in the plasma of hemophilia B mice was detected (387 ng/mL) and persisted more than 12 weeks. The level of anti-virus antibody in plasma aligned with the Factor Ⅸexpression curve. The QC-PCR method is easier and moreaccurate than traditional dot hybridization fordetermination of the titer of recombinant adeno-associated virus. Moreover, there are no HSV particles existing inproduced AAV assayed by RT-PCR. AAV is the only virus that has been amplified from AAV-injected muscle by PCR. 展开更多
关键词 rAAV/hFⅨ HSV/AAV 重组体 辅助病毒 血友病 基因治疗
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