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Identification of a pleiotropic QTL cluster for Fusarium head blight resistance,spikelet compactness,grain number per spike and thousand-grain weight in common wheat 被引量:3
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作者 Wenjing Hu Derong Gao +3 位作者 Sen Liao Shunhe Cheng Jizeng Jia Weigang Xu 《The Crop Journal》 SCIE CSCD 2023年第2期672-677,共6页
Simultaneously improving Fusarium head blight(FHB)resistance and grain yield is challenging in wheat breeding.The correlations between spikelet compactness(SC),grain number per spike(GNS),thousandgrain weight(TGW)and ... Simultaneously improving Fusarium head blight(FHB)resistance and grain yield is challenging in wheat breeding.The correlations between spikelet compactness(SC),grain number per spike(GNS),thousandgrain weight(TGW)and FHB resistance remains unclear in common wheat.Identification of major quantitative trait loci(QTL)conferring FHB resistance and yield components,and development of breeder-friendly markers for the QTL are prerequisites for marker-assisted selection(MAS).Here,a recombinant inbred line(RIL)population derived from a cross between a resistant cultivar Yangmai 12(YM12)and a susceptible cultivar Yanzhan 1(YZ1)was used to map QTL for FHB resistance and yield components.A total of 22 QTL were identified;among these,six are likely to be new for corresponding traits.A QTL cluster(Qclu.yas-2D)for FHB type II resistance,SC,GNS,and TGW was detected on chromosome 2D.Breeder-friendly kompetitive allele-specific PCR(KASP)markers flanking the interval of Qclu.yas-2D were developed and validated in a diverse panel of 166 wheat cultivars and advanced lines.The YM12 alleles of Qclu.yas-2D significantly increased FHB resistance,SC,and GNS but decreased TGW in the validation population.The KASP markers developed for Qclu.yas-2D have great potential for breeding high-yielding wheat cultivars with enhanced FHB resistance. 展开更多
关键词 Fusarium graminearum KASP marker qtl cluster Triticum aestivum
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基于高密度遗传图谱的芝麻籽粒品质相关性状QTL定位
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作者 崔承齐 刘艳阳 +4 位作者 杜振伟 武轲 江晓林 郑永战 梅鸿献 《河南农业科学》 北大核心 2023年第9期66-77,共12页
芝麻是我国重要的优质油料作物,对芝麻籽粒品质性状进行数量性状位点(QTL)定位对定向培育高品质芝麻品种具有重要意义。以豫芝4号为母本、孟加拉小籽为父本,分别构建F2、F2:3、BC1和BC1F2群体,结合特异位点扩增片段(SLAF)标记和简单重... 芝麻是我国重要的优质油料作物,对芝麻籽粒品质性状进行数量性状位点(QTL)定位对定向培育高品质芝麻品种具有重要意义。以豫芝4号为母本、孟加拉小籽为父本,分别构建F2、F2:3、BC1和BC1F2群体,结合特异位点扩增片段(SLAF)标记和简单重复序列(SSR)标记构建F2和BC1遗传图谱,以F2:3、BC1和BC1F23个群体的表型数据为基础,进行脂肪、蛋白质、芝麻素、芝麻林素含量等4个品质性状的QTL作图分析。结果表明,在F2:3群体中共检测到16个QTL,解释表型变异的5.08%~27.12%,其中仅有1个主效QTL qOC_10-1在2个环境中被重复检测到,分别解释表型变异的9.62%和27.12%。在BC1和BC1F2群体中共检测到35个QTL,其中3个主效QTL qOC_4-1、qOC_10-2和qSmin_7-2在3个环境中被重复检测到,分别解释表型变异的8.08%~12.42%、11.95%~12.60%和4.24%~10.56%;3个主效QTL qSmin_8、qSmol_5-2和qSmol_7-2在2个环境被重复检测到,分别解释表型变异的13.36%~26.75%、11.44%~14.33%和5.77%~12.38%。经过对2个图谱进行整合和比对分析,共发现10个QTL簇,其中QTL簇loci4、loci7、loci8和loci10均与多个性状相关联,并且均至少包含1个主效QTL,其对应的最大表型变异解释率分别为12.42%、12.38%、26.75%和27.12%。 展开更多
关键词 芝麻 品质性状 高密度遗传图谱 数量性状位点 qtl
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水稻光合色素含量的变异分析及QTL定位
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作者 胡超 刘玲 +3 位作者 熊佳铭 袁红亮 于玉凤 王悦 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期383-388,共6页
以光合色素含量差异较大的籼稻RT和籼稻SC及其杂交衍生的RIL群体为材料,运用相关分析、主成分分析、聚类分析等方法对4个光合色素性状(叶绿素a、叶绿素b、叶绿素a/b和总叶绿素)进行综合分析和QTL定位。相关性分析结果表明,4个光合色素... 以光合色素含量差异较大的籼稻RT和籼稻SC及其杂交衍生的RIL群体为材料,运用相关分析、主成分分析、聚类分析等方法对4个光合色素性状(叶绿素a、叶绿素b、叶绿素a/b和总叶绿素)进行综合分析和QTL定位。相关性分析结果表明,4个光合色素性状间均呈极显著正相关,叶绿素a与总叶绿素含量的相关系数最高。主成分分析结果表明,对光合色素含量影响较大的性状有叶绿素a和总叶绿素含量。聚类分析结果表明,可将239个株系分为3大类群,第Ⅰ类群、第Ⅱ类群、第Ⅲ类群的平均光合色素含量依次降低。运用复合区间作图法共检测到4个与控制光合色素性状相关的QTL,分布于水稻第4和第8染色体上,LOD值为2.01~3.14,表型贡献率的分布范围为4.52%~7.08%,加性效应均为正值,其中,在第8染色体RM6155至RM23446区间发现1个QTL簇,聚集了控制叶绿素a、叶绿素a/b和总叶绿素3个性状的QTL,该区间是影响光合色素性状的1个重要染色体区域,检测到的qChla-8、qChla/b-4、q Chla/b-8和qChlt-8可能为调控光合色素的新QTL位点。 展开更多
关键词 水稻 光合色素 主成分分析 聚类分析 qtl定位
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玉米八个产量相关性状的QTL鉴定 被引量:6
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作者 曹晓良 翟立红 +2 位作者 刘瑞响 陶勇生 张祖新 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期1-8,共8页
以玉米优良自交系‘农系531’和‘SIL8’为亲本构建200个F2:3家系,利用复合区间作图法对8个产量性状进行QTL鉴定。8个性状共检测到34个QTL,单个QTL的表型贡献率为5.21%~26.62%不等,累计解释各个性状的表型变异为21.33%~74.10%。分布于... 以玉米优良自交系‘农系531’和‘SIL8’为亲本构建200个F2:3家系,利用复合区间作图法对8个产量性状进行QTL鉴定。8个性状共检测到34个QTL,单个QTL的表型贡献率为5.21%~26.62%不等,累计解释各个性状的表型变异为21.33%~74.10%。分布于第1、3、4、5、6染色体上16个QTL形成6个QTL富集区,且表型贡献率最大的QTL均位于富集区内。共检测到26对上位性互作,其中QTL间互作1对,QTL与背景间互作8对,背景间互作17对,所解释的表型变异为5.98%~15.93%不等,累计解释各性状的表型变异为15.93%~61.64%。多数产量相关性状的遗传基础非常复杂,上位性在产量相关性状形成的遗传控制中具有重要的作用。QTL富集区对于数量性状的遗传分析与作物遗传改良具有重要意义。 展开更多
关键词 玉米(Zea mays L ) 数量性状基因座位 上位性 qtl富集区
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花生荚果大小和重量相关性状的QTL定位分析 被引量:5
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作者 周小静 雷永 +10 位作者 夏友霖 漆燕 晏立英 任小平 黄莉 罗怀勇 刘念 陈伟刚 陈玉宁 廖伯寿 姜慧芳 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期869-877,共9页
荚果相关性状是花生产量构成的重要成分。为解析花生产量及产量相关性状的遗传基础,挖掘稳定存在的QTL,以荚果大小和重量存在显著差异的中花5号和ICGV 86699及以其为亲本衍生的包含166个株系的重组自交系群体为材料,对3个荚果相关性状... 荚果相关性状是花生产量构成的重要成分。为解析花生产量及产量相关性状的遗传基础,挖掘稳定存在的QTL,以荚果大小和重量存在显著差异的中花5号和ICGV 86699及以其为亲本衍生的包含166个株系的重组自交系群体为材料,对3个荚果相关性状中荚果长、荚果宽在5个环境,百果重在6个环境下进行性状考察,并结合群体的基因分型数据进行QTL定位分析。共检测到9个荚果长QTL、10个荚果宽QTL和12个百果重QTL。有10个QTL在多个环境被重复检测到,其中6个QTL在不同地点重复检测到,为稳定表达QTL,且稳定表达的QTL中5个(qPLB06.2、qPLB06.3、qPWB06.2、qHPWB04.3、qHPWB06.3)在至少1个环境中贡献率超过10%。共发现5个QTL簇,其中位于B06上的QTL簇Ⅳ和Ⅴ,均在多个环境下检测到稳定调控荚果长、荚果宽和百果重的QTL共定位,表明这些荚果相关性状具有明显的遗传相关性。 展开更多
关键词 花生 荚果 qtl定位 稳定qtl qtl
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小麦-冰草衍生后代3558-2穗部相关性状的遗传分析和QTL定位 被引量:19
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作者 卢翔 张锦鹏 +3 位作者 王化俊 杨欣明 李秀全 李立会 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期86-91,共6页
从普通小麦Fukuho与冰草(Agropyron cristatum,2n=4x=28,PPPP)Z559的衍生系中发现3558-2具有小穗数、小穗粒数和穗粒数多的优异性状。为了揭示衍生系3558-2优异性状的遗传特征,本研究对其与小麦品种京4841间的282个F2单株的穗长、小穗... 从普通小麦Fukuho与冰草(Agropyron cristatum,2n=4x=28,PPPP)Z559的衍生系中发现3558-2具有小穗数、小穗粒数和穗粒数多的优异性状。为了揭示衍生系3558-2优异性状的遗传特征,本研究对其与小麦品种京4841间的282个F2单株的穗长、小穗数、小穗粒数、穗粒数等穗部相关性状进行了遗传分析和QTL定位。主基因+多基因混合遗传模型分析结果显示小麦穗部相关性状都符合数量性状特征。利用单标记分析将穗部相关性状的QTL主要定位于小麦1A染色体上,同时发现在小麦的2A、5B和5D染色体上也有QTL分布。通过加密标记重点构建了1A染色体短臂的遗传连锁图,利用复合区间作图法解析了小麦1AS染色体上的穗部相关性状的QTL效应,发现在1A染色体上存在与穗长、小穗数、小穗粒数和穗粒数相关的重要QTL各1个,解释变异度分别为14.41%、5.15%、14.84%和10.87%。本研究发现在3558-2的1AS染色体上成簇分布着涉及穗长、小穗数、小穗粒数和穗粒数重要性状的QTL,这一结果对指导进一步研究与利用3558-2具有重要意义。 展开更多
关键词 小麦 穗部相关性状 qtl 基因簇
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番茄分子遗传图谱构建和晚疫病抗性基因簇ph-3的QTL分析 被引量:4
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作者 黄晓梅 许向阳 +2 位作者 李景富 陈秀玲 徐艳辉 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第10期3571-3580,共10页
【目的】挖掘番茄晚疫病抗性基因紧密连锁的分子标记,为番茄抗晚疫病种质资源的利用及分子标记辅助选择育种提供理论和实践依据。【方法】利用含番茄晚疫病抗性基因ph-1,2,3的L3708(Lycopersicon.pimpinellifolium)为父本,感病的优良品... 【目的】挖掘番茄晚疫病抗性基因紧密连锁的分子标记,为番茄抗晚疫病种质资源的利用及分子标记辅助选择育种提供理论和实践依据。【方法】利用含番茄晚疫病抗性基因ph-1,2,3的L3708(Lycopersicon.pimpinellifolium)为父本,感病的优良品系04968(L.esculentum)为母本培育的260个F2单株为图谱构建群体,通过AFLP、SSR2种分子标记进行遗传分析,构建分子遗传图谱。根据苗期接种番茄晚疫病病原菌生理小种T1,2的抗性反应,利用复合区间作图法,进行QTL定位。【结果】构建了包含12个连锁群的分子遗传图谱,其中包含3个SSR标记和149个AFLP标记。该图谱覆盖整个基因组总长度1443.07cM,平均图距9.50cM。检测到了5个与抗性基因簇ph-3相关的QTL位点,其中Qph3-1位于第3连锁群上,可以解释的表型变异为26.59%。Qph3-2位于第1染色体上,可以解释的表型变异为54.86%,Qph3-3、Qph3-4和Qph3-5,位于第9连锁群上,可以解释的表型变异分别为9.24%、10.27%和36.49%。QTL遗传效应表现为加性和显性。【结论】所得5个分子标记可作为选育抗晚疫病番茄品种的重要分子标记辅助选择工具。 展开更多
关键词 番茄 遗传图谱 SSR AFLP 抗晚疫病基因簇ph-3 qtl
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小麦QTL富集区QC-4BS重要农艺性状基因的精细定位及Rht1基因的效应分析 被引量:1
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作者 丁梦云 刘天相 +5 位作者 孙宇慧 柴乖强 高欣 王军 王中华 李春莲 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第3期262-267,共6页
为了探明位于小麦4BS染色体上的一个QTL富集区QC-4BS重要农艺性状的遗传效应,对QC-4BS重要农艺性状基因进行了精细定位,并分析了位于QC-4BS内的Rht1基因对小麦株高(PH)、穗粒数(KNPS)、千粒重(TKW)、蛋白质含量(GPC)及容重(TW)等性状的... 为了探明位于小麦4BS染色体上的一个QTL富集区QC-4BS重要农艺性状的遗传效应,对QC-4BS重要农艺性状基因进行了精细定位,并分析了位于QC-4BS内的Rht1基因对小麦株高(PH)、穗粒数(KNPS)、千粒重(TKW)、蛋白质含量(GPC)及容重(TW)等性状的遗传效应。结果表明,QC-4BS主要位于小麦4BS染色体的IWA1846至IWA4662标记区间,长度为11.9cM,对应的物理距离约为15.17 Mb,其中控制PH的QTL为Rht1基因,距离IWA1846标记约7.16 Mb;控制GPC和KNPS的位点接近IWA482标记;控制TW的位点接近基因Rht1。Rht1基因除了具有明显的降低小麦PH的效应外,也可影响小麦的某些产量及品质性状,具体表现为增加小麦KNPS,降低TKW、GPC及TW。 展开更多
关键词 小麦 基因定位 qtl富集区 Rht1基因
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小麦纹枯病抗源的遗传多样性及抗性基因位点SSR标记分析 被引量:5
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作者 刘颖 张巧凤 +6 位作者 付必胜 蔡士宾 蒋彦婕 张志良 邓渊钰 吴纪中 戴廷波 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期1671-1681,共11页
为揭示小麦纹枯病抗源的遗传多样性,发掘优异的抗性种质,利用沟带接种法对前期筛选出的88份抗性种质进行了3年田间抗性鉴定,鉴定出抗或中抗纹枯病的小麦种质32份。利用分布于全基因组的SSR标记对这些抗源进行了遗传多样性分析,59个SSR... 为揭示小麦纹枯病抗源的遗传多样性,发掘优异的抗性种质,利用沟带接种法对前期筛选出的88份抗性种质进行了3年田间抗性鉴定,鉴定出抗或中抗纹枯病的小麦种质32份。利用分布于全基因组的SSR标记对这些抗源进行了遗传多样性分析,59个SSR标记共检测到308个等位变异,每个标记可以检测到2~13个等位基因,平均5.2个;多态性信息含量(PIC)的变异范围为0.12~0.89,平均为0.61,表明材料的遗传丰富度较高。根据聚类分析和主成分(PCA)分析,32份小麦纹枯病抗源按照遗传相似系数可划分为2个组群,国外引进品种和国内改良品种聚为一类,国内农家品种聚为一类,并且与地理分布特征相符。利用与纹枯病抗性QTL紧密连锁的14个SSR标记对32份抗源进行基因型分析,发现与抗性QTL连锁的2BS上的Xwmc154和7DS上的Xbarc126普遍存在,可用于分子标记辅助选择。在武农148、陕983、陕农78、Coker 983、H-Line、Mason和Compair中仅检测到一个已报道的抗病QTL,而在Tyalt中没有检测到已知抗病QTL,这些材料有可能携带新的纹枯病抗性基因/QTL,可以在育种中加以利用。 展开更多
关键词 小麦 纹枯病 遗传多样性 聚类分析 PCA分析 qtl
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Molecular dissection of genetic basis of significant correlation among five morphological traits in rice(Oryza sativa L.) 被引量:1
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作者 ZHANG YuShan WANG JianBo +1 位作者 XU CaiGuo XING YongZhong 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2010年第27期3154-3160,共7页
To enhance understanding of the genetic basis of trait correlation in rice,a recombinant inbred line(RIL)population(F6 and F7) from a cross between Zhenshan97 and HR5 was employed to identify main quantitative trait l... To enhance understanding of the genetic basis of trait correlation in rice,a recombinant inbred line(RIL)population(F6 and F7) from a cross between Zhenshan97 and HR5 was employed to identify main quantitative trait loci(QTLs)and epistatic QTL(E-QTL).Highly significant positive correlations were detected among five traits of heading date(HD),plant height(PH),panicle length(PL),flag leaf length(FLL)and flag leaf width(FLW)in 2 environments.Four to 8 main QTLs were detected for an individual trait.No E-QTL was detected for PH.One,4,4 and 5 E-QTLs were detected for FLL,HD,FLW and PL,respectively.Each E-QTL individually explained less than 3%of trait variation except E-QFll1.Comparison of QTL results was made in order to dissect the genetic basis of trait correlation.We found that main QTLs with pleiotropic effects and QTL clusters were the main genetic basis of trait correlation.No E-QTL had pleiotropic effects.E-QTL played an important role in the genetic basis of individual trait,but it made a little contribution to trait correlation. 展开更多
关键词 形态性状 遗传基础 ORYZA 水稻 解剖 qtl检测 qtlS 电子邮件
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Genetic dissection of root morphological traits as related to potassium use efficiency in rapeseed under two contrasting potassium levels by hydroponics
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作者 Xiaoling Dun Jiaqin Shi +3 位作者 Huiping Liu Jie Wang Xinfa Wang Hanzhong Wang 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS CSCD 2019年第6期746-757,共12页
To reveal the genetic basis of potassium use efficiency(KUE) in rapeseed, root morphology(RM), biomass and KUE-related traits were measured in a recombinant inbred line population with 175 F7 lines that were subjected... To reveal the genetic basis of potassium use efficiency(KUE) in rapeseed, root morphology(RM), biomass and KUE-related traits were measured in a recombinant inbred line population with 175 F7 lines that were subjected to high-potassium(HK) and low-potassium(LK) treatments by hydroponics. A total of 109 significant QTLs were identified to be associated with the examined traits. Sixty-one of these QTLs were integrated into nine stable QTLs. The higher heritability for RM and biomass traits and lower heritability for KUE-related traits, as well as nine stable QTLs for RM traits and only two for KUE-related traits,suggested that regulating RM traits would be more effective than selecting KUE traits directly to improve KUE by markerassisted selection. Furthermore, the integration of stable QTLs identified in the HK, LK, high-nitrogen(HN) and low-nitrogen(LN) conditions gave 10 QTL clusters. Seven of these clusters were classified into major QTLs that explained 7.4%–23.7% of the total phenotypic variation. Five of the major QTL clusters were detected under all of the treated conditions, and four clusters were specifically detected under the LK and LN conditions. These common and specific QTL clusters may be useful for the simultaneous improvement of multiple traits by marker-assisted selection. 展开更多
关键词 Brassica NAPUS L. ROOT traits potassium efficiency qtl mapping qtl cluster
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