为筛选出策勒黑羊种质资源繁殖和抗逆性状分子标记和相关基因,本研究以100只无亲缘关系的策勒黑羊为研究对象,基于Illumina ovine SNP 50 K bead chip进行基因分型;用Plink1.90对基因组数据进行质量控制;对有效SNPs计算哈代-温伯格值,...为筛选出策勒黑羊种质资源繁殖和抗逆性状分子标记和相关基因,本研究以100只无亲缘关系的策勒黑羊为研究对象,基于Illumina ovine SNP 50 K bead chip进行基因分型;用Plink1.90对基因组数据进行质量控制;对有效SNPs计算哈代-温伯格值,选择从小到大排列后前1%的分子标记,参考绵羊基因组(Oar_v4.0)进行注释,对注释到的基因进行GO和KEGG分析。结果表明:1)共获得480个SNPs,417个候选基因,其中,繁殖性状基因13个、抗逆性状相关基因30个;2)繁殖性状相关的基因有SOX9、GTF2A1、GNAQ等,抗逆性相关的基因有TMEM154、ZNF70、CREB3L2等。综上,本研究解析了策勒黑羊繁殖和抗逆性状基因的遗传规律,特别是对抗逆性相关候选基因研究,发现策勒黑羊群体携带抗肺炎相关的分子标记,为策勒黑羊保种和改良提供了分子水平的参考。展开更多
文摘为筛选出策勒黑羊种质资源繁殖和抗逆性状分子标记和相关基因,本研究以100只无亲缘关系的策勒黑羊为研究对象,基于Illumina ovine SNP 50 K bead chip进行基因分型;用Plink1.90对基因组数据进行质量控制;对有效SNPs计算哈代-温伯格值,选择从小到大排列后前1%的分子标记,参考绵羊基因组(Oar_v4.0)进行注释,对注释到的基因进行GO和KEGG分析。结果表明:1)共获得480个SNPs,417个候选基因,其中,繁殖性状基因13个、抗逆性状相关基因30个;2)繁殖性状相关的基因有SOX9、GTF2A1、GNAQ等,抗逆性相关的基因有TMEM154、ZNF70、CREB3L2等。综上,本研究解析了策勒黑羊繁殖和抗逆性状基因的遗传规律,特别是对抗逆性相关候选基因研究,发现策勒黑羊群体携带抗肺炎相关的分子标记,为策勒黑羊保种和改良提供了分子水平的参考。