我国不同地区猪源致泻性大肠杆菌的多重PCR鉴定及2b-RAD序列分析

为了解我国不同地区屠宰生猪肉品中致泻性大肠杆菌污染情况及系统进化关系,降低由其带来的公共卫生危害,将近几年分离自华北、华东、华中及西南地区猪屠体表面的283株大肠杆菌进行了致泻性大肠杆菌多重PCR鉴定及2b-RAD测序分型。多重PCR鉴定结果显示,共检出36株致泻性大肠杆菌,检出率为12.7%,其中西南地区检出率(26.92%)高于华北(13.33%)、华东(10.57%)和华中(10.81%)地区;5种致泻类型中,产肠毒素大肠杆菌(ETEC)、肠致泻性大肠杆菌(EPEC)、肠聚集性大肠杆菌(EAEC)、肠出血性大肠杆菌(EHEC)和肠侵袭性大肠杆菌(EIEC)的占比分别为33.33%、30.56%、25.00%、5.56%和5.56%。将致泻性大肠杆菌进行2b-RAD测序,种群聚类分析显示,这36株致泻菌可分为8个亚群;系统发生树分析显示,亲缘关系较近菌株的致泻类型基本一致,分离时间也比较接近,而且来自同一地区菌株的亲缘关系相对较近。可见,我国屠宰生猪肉品中污染的致泻性大肠杆菌以ETEC、EPEC和EAEC类型为主,其流行分布有一定的地域差异,且其亲缘关系呈一定的时空特异性。本研究为精准防控生猪屠宰环节致泻性大肠杆菌污染,保障肉品卫生安全提供了科学数据和技术支撑。

多色荧光STR新位点在诊断染色体数目中的应用研究

目的应用13、18、21号染色体上18个STR新位点(D21S11L、D21S1409、D21S1809、D21S2052、D21S1994、D21S1446、D21S1435、D21S11D21S1442、D21S1809、D21S1432、D13S800、D13S886、D13S796、D18S877、D18S851、D18S847、D18S847),了解新位点在诊断染色体数目中的应用价值。方法在50例正常人血清标本和5例21-三体综合征患者血清标本中,通过PCR扩增基因测序的方法,用SPSS12.0软件直接计算新位点杂合度(H)和多肽信息含量(PIC),并对13、18、21染色体数目进行诊断。结果 13号染色体中STR位点H0.6-0.74,PIC0.65-0.7。18号染色体中STR位点H0.69-0.81,PIC0.68-0.8。21号染色体中STR位点H0.7-0.87,PIC0.63-0.84。21、13、18染色体,二倍体检出率为100%。在5例21-三体阳性标本中,三倍体检出率为100%。结论 STR新位点杂合度和信息含量高,可在诊断21、13、18染色体数目中被应用。

基于线粒体COI序列对云南地区柚喀木虱单倍型的鉴定

【目的】研究采自云南的柚喀木虱Cacopsylla citrisuga Yang&Li种群的遗传多样性.【方法】利用线粒体细胞色素C氧化酶亚基I基因(COI)条形码片段对采自云南瑞丽和石屏的柚喀木虱样本进行描述,并进行遗传距离和系统发育分析.【结果和结论】经鉴定共得到2种单倍型C1和C2,瑞丽种群的单倍型均为C1,而石屏的种群分化出了2种单倍型C1和C2.分析表明,柚喀木虱的最大序列分歧度特别低,仅为0.16%.此COI片段能很好地区分柚喀木虱与同属的其他几种木虱.