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大麦HvRBR基因克隆与序列分析
被引量:
1
1
作者
王颜
王际睿
+1 位作者
郑有良
魏育明
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第8期1554-1562,共9页
【目的】从栽培大麦(Hordeum vulgare)中分离并克隆对植物细胞周期起负调控作用的RBR(retinoblastoma-related),鉴定大麦RBR(HvRBR)分子特征,明确其与同源基因间的亲缘关系和分类地位,为探索动、植物生长发育过程中细胞增殖和分化相关...
【目的】从栽培大麦(Hordeum vulgare)中分离并克隆对植物细胞周期起负调控作用的RBR(retinoblastoma-related),鉴定大麦RBR(HvRBR)分子特征,明确其与同源基因间的亲缘关系和分类地位,为探索动、植物生长发育过程中细胞增殖和分化相关调控途径的研究提供理论依据。【方法】通过对植物RBR生物信息学分析,根据RBR保守区域序列设计通用引物,采用PCR方法从栽培大麦DNA和苗期总cDNA中分别分段克隆,获得特征序列后在DNAMAN软件下进行序列分析、多重序列比对并构建系统树。【结果】从栽培大麦籽粒皱缩突变材料GSHO1854中获得全长为5547bp的大麦HvRBR序列(GU121481),其cDNA编码区(GU121480)全长3179bp,包含一个编码975个氨基酸的开放阅读框。由其推导的氨基酸序列与已报道的RBR蛋白序列有较高的一致性。在A、B保守区之间有一个间隔区,虽然同源性较低,但是所有氨基酸序列的相似位点都包含一个半胱氨酸残基,这说明该半胱氨酸残基形成的分子内或分子间二硫键可能对整个RBR蛋白的结构和功能产生重要的影响。系统进化分析表明HvRBR与水稻同源性最高(84.3%),与苜蓿、拟南芥等双子叶植物的同源性较低(50%)。【结论】首次从大麦中得到与植物细胞周期起调控、细胞增殖和分化相关的RBR蛋白编码基因HvRBR。对栽培大麦籽粒皱缩突变材料GSHO1854的HvRBR进行了分子克隆和鉴定,并通过系统进化分析将HvRBR归为植物RBR家族C亚族。
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关键词
大麦
rbr
蛋白
全编码区cDNA
序列分析
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职称材料
RBR在植物生长发育中的作用研究进展
2
作者
苏华英
张汉马
南文斌
《中国农学通报》
2018年第17期39-46,共8页
植物胚后发育中新器官的形成受细胞分裂和分化的严格调控,植物RBR(RB-Related)是人类神经胶质瘤易感蛋白(RB)的同源蛋白,它作为细胞增殖的负调控因子,已被证明广泛参与一系列植物生长发育的调控过程。为深入了解其作用机理,笔者归纳了...
植物胚后发育中新器官的形成受细胞分裂和分化的严格调控,植物RBR(RB-Related)是人类神经胶质瘤易感蛋白(RB)的同源蛋白,它作为细胞增殖的负调控因子,已被证明广泛参与一系列植物生长发育的调控过程。为深入了解其作用机理,笔者归纳了不同植物中RBR蛋白的表达调控特征;综述了拟南芥RBR1参与调节细胞周期和生长发育过程的作用机制研究进展;提出了RBR1以蛋白质相互作用为主要调控方式的调控网络,并分析了今后有待阐明的问题和研究方向,以期为RBR相关的研究提供参考。
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关键词
rbr
蛋白相互作用
细胞分裂
细胞分化
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职称材料
三七茎叶总皂苷促血管新生抗缺血性脑卒中的作用机制
3
作者
余慧芳
肖海燕
+4 位作者
谢皓辰
刘树森
刘金羽
王敏
孙桂波
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第14期4735-4746,共12页
目的探究三七茎叶总皂苷改善缺血性脑卒中、促进缺血性脑卒中损伤后血管新生作用及机制。方法采用网络药理学技术预测三七茎叶总皂苷促进缺血性脑卒中损伤后血管新生可能的机制,利用分子对接技术对筛选出的核心靶点与主要成分的结合进...
目的探究三七茎叶总皂苷改善缺血性脑卒中、促进缺血性脑卒中损伤后血管新生作用及机制。方法采用网络药理学技术预测三七茎叶总皂苷促进缺血性脑卒中损伤后血管新生可能的机制,利用分子对接技术对筛选出的核心靶点与主要成分的结合进行初步验证。雄性SD大鼠随机分为假手术组、模型组及三七茎叶总皂苷低、中、高剂量(73、146、292mg/kg)组和3-正丁基苯酞(3-n-butylphthalide,NBP,60 mg/kg)组,每组20只。建立大鼠脑中动脉阻塞/再灌注(middle cerebral artery occlusion/reperfusion,MCAO/R)模型,给药7 d后取材。每隔1 d对大鼠进行神经功能评分;通过2,3,5-氯化三苯基四氮唑(2,3,5-triphenyltetrazolium chloride,TTC)染色、苏木素-伊红(hematoxylin-eosin,HE)染色观察大鼠脑梗死体积及脑神经细胞形态状况;通过激光多普勒血流仪观察大鼠梗死脑侧血流恢复情况;通过光学相干断层扫描血管成像观察大鼠脑微血管新生状况;通过ELISA和Western blotting测定与血管新生相关蛋白表达。结果网络药理学分析显示,共收集到60个三七茎叶总皂苷活性成分和297个关键靶点,与血管新生和缺血性脑卒中取交集后得到64个交集靶点,并且三七茎叶总皂苷主要成分与这些核心靶点均有较好结合力。三七茎叶总皂苷促进血管新生改善缺血性脑卒中的关键通路主要富集在磷脂酰肌醇3-激酶(phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,Akt)、缺氧诱导因子-1α(hypoxia inducible factor-1α,HIF-1α)等通路。动物实验结果显示,与模型组比较,三七茎叶总皂苷能够显著降低MCAO/R大鼠神经功能评分(P<0.01),改善大鼠神经功能,降低大脑梗死体积(P<0.01、0.001),减少脑组织损伤,恢复梗死脑侧脑血流(P<0.05、0.01、0.001),促进梗死脑侧皮层微血管密度(P<0.05、0.01、0.001),提高血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)、碱性成纤维细胞生长因子(basic fibroblast growth factor,bFGF)水平和HIF-1α、PI3K、p-Akt/Akt蛋白表达(P<0.05、0.01、0.001)。结论三七茎叶总皂苷能够显著改善MCAO/R大鼠脑损伤,有效促进MCAO/R大鼠缺血脑区血管新生,促血管新生机制可能与提高MCAO/R大鼠大脑中VEGF、bFGF、HIF-1α表达和激活PI3K/Akt通路有关。
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关键词
三七茎叶总皂苷
缺血性脑卒中
血管新生
网络药理学
缺氧诱导因子-1α
磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B通路
人参皂苷Rb_(1)
人参皂苷RD
人参皂苷Rg_(1)
人参皂苷RE
三七皂苷R_(1)
原文传递
题名
大麦HvRBR基因克隆与序列分析
被引量:
1
1
作者
王颜
王际睿
郑有良
魏育明
机构
四川农业大学农学院/小麦研究所
农业部西南作物种质资源利用重点开放实验室
出处
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第8期1554-1562,共9页
基金
国家"863"计划项目(2006AA10Z179)
文摘
【目的】从栽培大麦(Hordeum vulgare)中分离并克隆对植物细胞周期起负调控作用的RBR(retinoblastoma-related),鉴定大麦RBR(HvRBR)分子特征,明确其与同源基因间的亲缘关系和分类地位,为探索动、植物生长发育过程中细胞增殖和分化相关调控途径的研究提供理论依据。【方法】通过对植物RBR生物信息学分析,根据RBR保守区域序列设计通用引物,采用PCR方法从栽培大麦DNA和苗期总cDNA中分别分段克隆,获得特征序列后在DNAMAN软件下进行序列分析、多重序列比对并构建系统树。【结果】从栽培大麦籽粒皱缩突变材料GSHO1854中获得全长为5547bp的大麦HvRBR序列(GU121481),其cDNA编码区(GU121480)全长3179bp,包含一个编码975个氨基酸的开放阅读框。由其推导的氨基酸序列与已报道的RBR蛋白序列有较高的一致性。在A、B保守区之间有一个间隔区,虽然同源性较低,但是所有氨基酸序列的相似位点都包含一个半胱氨酸残基,这说明该半胱氨酸残基形成的分子内或分子间二硫键可能对整个RBR蛋白的结构和功能产生重要的影响。系统进化分析表明HvRBR与水稻同源性最高(84.3%),与苜蓿、拟南芥等双子叶植物的同源性较低(50%)。【结论】首次从大麦中得到与植物细胞周期起调控、细胞增殖和分化相关的RBR蛋白编码基因HvRBR。对栽培大麦籽粒皱缩突变材料GSHO1854的HvRBR进行了分子克隆和鉴定,并通过系统进化分析将HvRBR归为植物RBR家族C亚族。
关键词
大麦
rbr
蛋白
全编码区cDNA
序列分析
Keywords
barley
rbr protein
full length coding region of cDNA
sequence analysis
分类号
S512.3 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
RBR在植物生长发育中的作用研究进展
2
作者
苏华英
张汉马
南文斌
机构
重庆师范大学生命科学学院/重庆市植物环境适应分子生物学重点实验室
出处
《中国农学通报》
2018年第17期39-46,共8页
基金
国家重点研发计划"七大农作物育种专项"(2016YFD0100706)
重庆市教委科学技术研究项目"植物硝态氮肥信号响应的生物基础研究"(KJ1600303)
文摘
植物胚后发育中新器官的形成受细胞分裂和分化的严格调控,植物RBR(RB-Related)是人类神经胶质瘤易感蛋白(RB)的同源蛋白,它作为细胞增殖的负调控因子,已被证明广泛参与一系列植物生长发育的调控过程。为深入了解其作用机理,笔者归纳了不同植物中RBR蛋白的表达调控特征;综述了拟南芥RBR1参与调节细胞周期和生长发育过程的作用机制研究进展;提出了RBR1以蛋白质相互作用为主要调控方式的调控网络,并分析了今后有待阐明的问题和研究方向,以期为RBR相关的研究提供参考。
关键词
rbr
蛋白相互作用
细胞分裂
细胞分化
Keywords
rbr
protein
interaction
cell division
cell differentiation
分类号
Q946 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
三七茎叶总皂苷促血管新生抗缺血性脑卒中的作用机制
3
作者
余慧芳
肖海燕
谢皓辰
刘树森
刘金羽
王敏
孙桂波
机构
中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所
哈尔滨商业大学药学院
广东药科大学中药学院
出处
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第14期4735-4746,共12页
基金
中国医学科学院医学与健康科技创新工程项目(2022-I2M-2-001)
国家重点研发计划项目(2023YFD2201802)。
文摘
目的探究三七茎叶总皂苷改善缺血性脑卒中、促进缺血性脑卒中损伤后血管新生作用及机制。方法采用网络药理学技术预测三七茎叶总皂苷促进缺血性脑卒中损伤后血管新生可能的机制,利用分子对接技术对筛选出的核心靶点与主要成分的结合进行初步验证。雄性SD大鼠随机分为假手术组、模型组及三七茎叶总皂苷低、中、高剂量(73、146、292mg/kg)组和3-正丁基苯酞(3-n-butylphthalide,NBP,60 mg/kg)组,每组20只。建立大鼠脑中动脉阻塞/再灌注(middle cerebral artery occlusion/reperfusion,MCAO/R)模型,给药7 d后取材。每隔1 d对大鼠进行神经功能评分;通过2,3,5-氯化三苯基四氮唑(2,3,5-triphenyltetrazolium chloride,TTC)染色、苏木素-伊红(hematoxylin-eosin,HE)染色观察大鼠脑梗死体积及脑神经细胞形态状况;通过激光多普勒血流仪观察大鼠梗死脑侧血流恢复情况;通过光学相干断层扫描血管成像观察大鼠脑微血管新生状况;通过ELISA和Western blotting测定与血管新生相关蛋白表达。结果网络药理学分析显示,共收集到60个三七茎叶总皂苷活性成分和297个关键靶点,与血管新生和缺血性脑卒中取交集后得到64个交集靶点,并且三七茎叶总皂苷主要成分与这些核心靶点均有较好结合力。三七茎叶总皂苷促进血管新生改善缺血性脑卒中的关键通路主要富集在磷脂酰肌醇3-激酶(phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,Akt)、缺氧诱导因子-1α(hypoxia inducible factor-1α,HIF-1α)等通路。动物实验结果显示,与模型组比较,三七茎叶总皂苷能够显著降低MCAO/R大鼠神经功能评分(P<0.01),改善大鼠神经功能,降低大脑梗死体积(P<0.01、0.001),减少脑组织损伤,恢复梗死脑侧脑血流(P<0.05、0.01、0.001),促进梗死脑侧皮层微血管密度(P<0.05、0.01、0.001),提高血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)、碱性成纤维细胞生长因子(basic fibroblast growth factor,bFGF)水平和HIF-1α、PI3K、p-Akt/Akt蛋白表达(P<0.05、0.01、0.001)。结论三七茎叶总皂苷能够显著改善MCAO/R大鼠脑损伤,有效促进MCAO/R大鼠缺血脑区血管新生,促血管新生机制可能与提高MCAO/R大鼠大脑中VEGF、bFGF、HIF-1α表达和激活PI3K/Akt通路有关。
关键词
三七茎叶总皂苷
缺血性脑卒中
血管新生
网络药理学
缺氧诱导因子-1α
磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B通路
人参皂苷Rb_(1)
人参皂苷RD
人参皂苷Rg_(1)
人参皂苷RE
三七皂苷R_(1)
Keywords
total saponins in stems and leaves of Panax notoginseng(Burk.)F.H.Chen
ischemic stroke
angiogenesis
network pharmacology
hypoxia inducible factor-1a
phosphatidylinositol 3-kinase/
protein
kinase B pathway
ginsenoside
rbr
ginsenoside Rd
ginsenoside Rgl
ginsenoside Re
notoginsenoside R1
分类号
R285.5 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大麦HvRBR基因克隆与序列分析
王颜
王际睿
郑有良
魏育明
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2010
1
下载PDF
职称材料
2
RBR在植物生长发育中的作用研究进展
苏华英
张汉马
南文斌
《中国农学通报》
2018
0
下载PDF
职称材料
3
三七茎叶总皂苷促血管新生抗缺血性脑卒中的作用机制
余慧芳
肖海燕
谢皓辰
刘树森
刘金羽
王敏
孙桂波
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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