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小鼠NPC细胞RFX1ChIP-Seq数据分析
1
作者
刘晓杰
赵志虎
+2 位作者
赵小英
张文斗
刘选明
《湖南大学学报(自然科学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期59-65,共7页
利用NCBI数据库中小鼠Embryonic Stem Cells(ESC)与Neural ProgenitorCells(NPC)的基因芯片结果及NPC时期的RFX1ChIP-Seq数据,进行有关RFX1的分析,结果表明:RFX1结合位点富集在1,2,4,5,7,9,11染色体上,Y染色体上最少,其他染色体上比较均...
利用NCBI数据库中小鼠Embryonic Stem Cells(ESC)与Neural ProgenitorCells(NPC)的基因芯片结果及NPC时期的RFX1ChIP-Seq数据,进行有关RFX1的分析,结果表明:RFX1结合位点富集在1,2,4,5,7,9,11染色体上,Y染色体上最少,其他染色体上比较均衡;在基因组中结合位点分布区域主要在基因的promoter区域,约有53.2%,其次是intergentic,占22.5%,body区域,占13.1%,enhancer区域,占11.2%.说明RFX1是以结合在基因的promoter区为主要形式对目的基因进行调控.同时在DAVID数据库中用生物信息学方法探索了RFX1靶基因的生物学功能分类.
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关键词
神经先祖细胞
RFX1
ChIP—Seq
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职称材料
题名
小鼠NPC细胞RFX1ChIP-Seq数据分析
1
作者
刘晓杰
赵志虎
赵小英
张文斗
刘选明
机构
湖南大学生物学院
军事医学科学院生物工程研究所
出处
《湖南大学学报(自然科学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期59-65,共7页
基金
国家863计划资助项目(20070349669)
国家自然科学基金资助项目(30871374
+2 种基金
31071119
31030026)
国家重点基础研究发展计划资助项目(2009CB825602)
文摘
利用NCBI数据库中小鼠Embryonic Stem Cells(ESC)与Neural ProgenitorCells(NPC)的基因芯片结果及NPC时期的RFX1ChIP-Seq数据,进行有关RFX1的分析,结果表明:RFX1结合位点富集在1,2,4,5,7,9,11染色体上,Y染色体上最少,其他染色体上比较均衡;在基因组中结合位点分布区域主要在基因的promoter区域,约有53.2%,其次是intergentic,占22.5%,body区域,占13.1%,enhancer区域,占11.2%.说明RFX1是以结合在基因的promoter区为主要形式对目的基因进行调控.同时在DAVID数据库中用生物信息学方法探索了RFX1靶基因的生物学功能分类.
关键词
神经先祖细胞
RFX1
ChIP—Seq
Keywords
neural progeitor cells
rfxi
ChIP-Seq
分类号
Q341 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
小鼠NPC细胞RFX1ChIP-Seq数据分析
刘晓杰
赵志虎
赵小英
张文斗
刘选明
《湖南大学学报(自然科学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2013
0
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职称材料
已选择
0
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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